Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_00190
Help
Entry
D0907_00190 CDS
T05890
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pdj
Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdj02000
]
D0907_00190
Transporters [BR:
pdj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D0907_00190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV63808
UniProt:
A0AAD0RX28
LinkDB
All DBs
Position
50899..53034
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MRYSPLLLAVLASFSGFSVAENQQTSDQNEIEKIDVIGRAFSLYRPTESSFGTRTNTPIE
KIPQSIQILPQELINDQAARQITDLYSNIAGVNGFSYSGVTFRGFRQDEILYDGVKGDPF
NGFAVPQLFNIEQVAVLKGPAGAIYGSGNPGGIINYVTKKPTFTEKHSIEVELGNDDFIS
GALESTGPLSDSLDNHAYRVGLYRDSEKPFRANTSSDNTIVDLGYTWLISSATELTTQYT
YIEQELGGARLRGVPADDNGHFITDISWNHNEATDFQNVEAHVYQAILKHDINDVWRTDI
TARYFDNKEVQNYHEPRGLVDTNGDGIVDWSHREFRDQLRENTGFSLTANAVAEFIFANM
QHQVLFGSDWYEHDFESVYRTATQQSKGGPVPGLDLQDPEYGLTSRDDYDLNAITPRLGS
THSTRFGAYVQDQLDVTANWSITAGLRYDRFEDKDELNQTEFSDSDVTYRVGTSYNINDT
FFPYALYGTGFVPQSASDQETAKGGPFAPETSRINEVGLRTKLVDDSLAVNMAAYDIVRK
NILQPSLLGDVAGDGVDDLVAVGEVQSKGFELEVVGDITERWVVTASYAYNDTRITKAND
SIRNQIPNSDKFANAPQNTLGIWTRYELPRVSSSISAGLDYVDEQLSLGGQRVQPYTIYN
MAWQTTLNNWQWQLSVKNVFDKEYASSGFIERTGHFPGEPRRVYLSAKYSF
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgctattctcctttattattagctgttctcgcgagtttttctggtttttcagttgct
gagaatcaacaaacgtcagatcaaaatgaaatcgaaaaaattgatgtaatagggcgtgct
ttttctttatatcgaccaaccgagtcaagcttcggtacccgcactaatacgccgattgaa
aagatcccacagtctattcaaattttgccacaggagctgattaacgatcaggctgcccga
cagattaccgatttatacagtaatattgccggtgtaaatggttttagttattcaggtgta
acatttcgtggttttcgccaagatgaaattttatatgatggtgtcaaaggcgatccattc
aacggctttgccgttccacaattatttaatattgaacaagttgcggtgttaaaagggcct
gcgggtgctatatacggtagcggtaatccaggtggcattattaattatgtaaccaagaag
ccaacttttactgaaaagcacagtattgaagtcgagcttggtaatgatgactttattagt
ggcgcattagaaagtacagggcccttgagtgactcattagataatcatgcttatcgtgtt
ggtttgtatcgtgattcagaaaaaccatttcgcgctaataccagcagtgataatacgatt
gttgatcttggttatacttggctgataagcagcgcaacagagcttacaacgcaatatacg
tatatagagcaagaattagggggagcacgccttcgtggggtgcctgctgatgataatggg
cattttattacggatattagctggaatcataatgaagcgactgatttccaaaatgttgag
gcgcatgtttatcaagctattttaaaacacgacattaatgatgtatggcgtacggatatt
acagcacgttattttgataataaagaagtgcaaaattaccatgagccaagagggcttgtg
gataccaatggcgatggcattgttgattggagtcaccgcgaatttcgtgatcaacttcgt
gaaaatacagggtttagcttaaccgctaatgcggtagctgagtttatatttgctaatatg
caacaccaggtcttatttggtagtgattggtatgagcatgatttcgaaagtgtttaccgc
acagctacgcaacaaagtaaaggagggcctgtccctgggcttgaccttcaagatcccgag
tatggtttaacgtctcgcgatgattatgatctcaatgctattacacccagacttggcagt
actcatagcacacgctttggtgcttatgtgcaagaccaacttgatgtcactgccaactgg
agcataaccgcggggttaagatacgatcgctttgaagacaaagatgagttaaatcagacc
gagttttctgatagcgatgtcacttatcgtgtcggcaccagttacaatattaatgatact
ttctttccttacgccttatatggtactggttttgtaccacaaagtgccagcgatcaagaa
acagccaagggcggaccttttgctcctgaaacaagtcgtataaatgaggtgggcttaaga
acgaagcttgttgatgatagcttagctgtgaatatggccgcttatgacattgtgcgcaaa
aatattctgcaacccagtttgttgggtgatgttgcaggcgatggggttgatgatttagtg
gccgtcggcgaagtgcaaagtaaagggtttgaactcgaagtggttggtgatattaccgag
cgttgggttgtgacagcaagttatgcctataatgatacccgtatcactaaagccaatgac
agcatacgtaatcaaattcctaacagtgataagtttgccaatgcgccgcaaaataccctg
ggtatttggacacgctatgaactacctcgcgtatcgtcatctatttctgcaggtttagac
tatgttgatgagcagcttagcttgggcggacaacgtgttcaaccttacactatctacaat
atggcatggcaaacgaccttaaataactggcaatggcagctatcagttaaaaatgtgttt
gataaagaatatgcaagcagtggctttattgaacgtacggggcattttcccggtgagcca
cgccgtgtttatttaagtgctaaatacagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
