Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_07240
Help
Entry
D0907_07240 CDS
T05890
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pdj
Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdj02000
]
D0907_07240
Transporters [BR:
pdj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D0907_07240
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV65067
UniProt:
A0AAD0RZG6
LinkDB
All DBs
Position
1584536..1587325
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MSMFKPSILTLALTAAGLNSFVAYAAEEDQKTKNDNVEVIEVKGFRGSVVESINTKRFTP
EVVESISAEDIGKLPDSSIAESIARLPGLTAQRLDGRASRVSVRGFSENESATTFNGREQ
VSIGDNRGVEFDLYPSEIMSGVTVYKTPSAGIEAEGIAGVIDMQTVKPLSKGEQVIMFNG
QYEQTGFDKLNPDGDDKGFRGTVSYIDQFADDTIGVAFAYNTMSSPNQEKRWNSWGYPEF
TGEDGNTYSILGGAKPFVRSSTLERDSAMLVIEAAPNDRLNMTFDALYVDFSDEKILRGI
EVPFAWGQGTIDPSSAVVDADSGFITSAVTEGQRVVVRNDYEERNAELTQFGFNTKYDIN
DEWSVEFDASRSEVERQIWSIESYSGTGRGDANGVADTIGYVFDGGNTGAQFSHNLDYSD
YDLIQLGGPLSWGASAALNDKYGLTDTPYQNTAQDGFINAPEINDELSTLKLAASKVLDN
AYISRVSFGMSYRDREKSKVSEGYFMTLKDFSLDNPGMLSIPEQYRLGSASLDFIGMGNM
VAYDTNGLVNDGYYNLLQESLTDQKHKTQSWTVQEEVTAIFAQADINAELGSIPVTGNIG
ARYVRTEQSSQGFAANTVDGLVVVTPTDISHDYSHFLPSLNLSFAIDEEQTIRFGAAKTI
SRARLDEMNASVNASYSQQPDENGNFWNVSGGNPKLEPKEATGFDLSYENYFHEEGYFAA
AFFYKDITQWIFDGTYEIDMSGVADPSTGEIPASSTGTGSGKVNGGSGDLWGYELSLTLP
FTMFSDSLDGFGLIASHTGVEQDITDQNGNDYELPGLSDQIDSLTVYFERNGFQARTSMR
KRSDFKGDVYGLGFATTQVDIKGETIWDAQIGYDFAEAGIQGLENLSVTFQVQNITEEPF
TSLQGDNALQVRDYQDYGRTFLLGFSYKL
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctatgttcaaaccaagtatattaactctggctttaacagccgcaggtttaaatagc
tttgtagcgtatgctgcagaagaagaccaaaaaacaaaaaacgataacgttgaagttatc
gaagtaaaaggttttcgtggcagtgttgtagaatctattaacacgaaacgcttcactcct
gaagttgttgagtcaatctcagcagaagatatcggtaaattacctgattcatcaattgca
gaatcaatcgcacgccttcctggccttacagcacaacgtctagatggtcgtgctagtcgc
gtaagtgtgcgtggtttcagtgaaaacgaaagtgcaacaacatttaacggtcgtgagcaa
gtatcaattggcgataaccgcggtgttgagtttgacctttacccatcagaaataatgagc
ggcgtaacggtatacaaaacaccaagcgcaggtatcgaagcggaaggtattgctggtgta
atcgacatgcaaactgttaagcctttaagtaaaggcgagcaagttatcatgtttaatggc
caatatgagcaaacaggttttgataaattaaacccagacggtgacgataaaggtttccgt
ggtacggtttcatacattgatcagtttgctgatgacaccatcggtgttgcatttgcttac
aacacaatgagctcacctaaccaagagaaacgctggaattcatggggttatccagaattt
acgggtgaagatggtaacacttattctattttaggtggggcaaagcctttcgtacgttca
tcaacgcttgagcgtgattcagcaatgctcgttattgaagcagcaccgaatgaccgcctt
aatatgacatttgatgctctttacgtagatttttctgacgagaaaatccttcgtggtatt
gaagtaccattcgcttggggtcaaggaacaatcgatcctagctctgcagttgtagatgca
gattctggttttatcacaagtgcagtaacagaaggccagcgtgttgttgttcgtaacgac
tatgaagagcgtaatgcagaactaacccagtttggtttcaatactaaatacgatattaat
gacgaatggtcagttgagtttgatgcgagtcgttcagaagttgagcgtcaaatttggagt
atcgagagttattcaggtacaggccgcggtgatgcaaatggtgttgctgatacgattggt
tatgtttttgacggtggcaataccggagcgcagttctcacataatcttgattacagtgat
tatgatctaattcaattaggtggtcctttatcatggggtgcaagcgctgcattgaatgac
aagtatggtttgacagatacgccatatcagaatacagcccaagatggttttatcaatgca
ccagaaatcaacgatgaattaagcacactaaaacttgctgcaagcaaggtgttagataac
gcgtatatcagccgtgtttcatttggtatgtcttaccgtgaccgtgagaagagtaaagtg
tctgaaggttacttcatgacattaaaagacttctctttagacaatccaggtatgttatca
attcctgaacagtatcgtttaggaagtgcaagccttgattttatcggtatgggtaacatg
gttgcttacgatacgaacggcttagtaaatgatggttattataaccttttacaagaaagt
ttaacggatcaaaaacacaaaacacaatcgtggacagtgcaagaagaagtaaccgccatt
tttgcgcaagctgacattaatgctgaacttggctctattcctgtaacaggtaatattggt
gctcgttatgtaagaaccgagcaatcttcgcaaggttttgctgcaaacacggtggatgga
ctcgttgttgttacgccaacagacatcagtcatgactacagtcatttcttaccaagctta
aacttatcgtttgcaattgatgaagagcaaacaatacgctttggtgctgcgaaaacgatt
tctcgtgcgcgtttagatgaaatgaatgcatcagtgaacgcatcttacagtcaacagcca
gatgaaaatggcaacttttggaatgtgtcaggtggtaatcctaaacttgagccaaaagag
gcaacaggttttgatttaagttacgaaaactacttccatgaagaagggtactttgcagca
gcatttttctacaaagatatcactcagtggatttttgatggtacatatgaaatcgacatg
agtggtgtggcggacccatctacaggtgaaatcccagcttcatctacaggtacaggttct
ggtaaagttaatggtgggtcaggtgatctttggggttatgagctttcattaacactaccg
ttcactatgtttagtgattcactggatggttttggtttaatcgcaagccatactggtgtt
gagcaggatattacagaccaaaatggtaatgattatgagttacctggattatcggaccaa
atcgatagcttgaccgtgtactttgaacgtaatggtttccaagcgcgtactagcatgcgt
aaacgtagcgactttaagggcgatgtttatggtttaggctttgcaacaacgcaagttgat
atcaaaggcgaaacaatttgggatgcgcaaatcggctatgattttgcagaagctggtatc
caaggtctcgaaaacttgagtgttactttccaagtgcaaaacatcacagaagagccgttc
acgtctctacaaggtgataacgcactgcaagtacgtgattaccaagactacggtcgtaca
ttcctgttaggtttcagctacaagctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system