Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_08380
Help
Entry
D0907_08380 CDS
T05890
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
pdj
Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdj02000
]
D0907_08380
Transporters [BR:
pdj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D0907_08380
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Phage-tail_3
fn3
Ig_J
Collagen
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV65283
LinkDB
All DBs
Position
1828952..1836148
Genome browser
AA seq
2398 aa
AA seq
DB search
MSKVVDTVVDTGGDLFGIGRSLFDKTVGALWDSLTPDVPEEDLATLAKGLQKGIDQPRRI
TFGRDRVGGVIAHQAEIERDKKKFVQMVVLINGAPIDALEEIYIADKPLTEYPSESWDYE
LSDGRHTTANSKAVAKMAGWTAAHIGYGQAHIFVEFENNREVFPDGISDTEFLIRGARVW
DPRDTNQNPDDETTWLWSQNAVLCALHYVRFYGAHEVPFERLPLEWWIAAINVCDEEAEF
TDKDGNITTEPRYTTNGSFTFTTKPLDVLNQLESCFAGKIFRQMGQWYVRVGAWYGNPTY
TINADDVHGNIKIKWHADLRDRANVVRATFTDPEQNYERTDAPPVISSAYQTRDNQILEK
SITLPFVRSSTTAQRLATIHLEQTRLGEIELPLKHKGLAAAVGRTVYLNLPGESITNKIY
RVTERRFRLDGGVTLMCIEDGPGLWGDNLIPGAQDLTPNSDYLVGRPKPIFDVRVTIDGD
GNGIVKWNHPTPLAVHEYDVEFIHASSSEPVFKTTVTYTQVTIPKLALGEYTARISARNI
FGQRSDTVGVQFSVLTPSIPVVHVLADYNQITLTAELAAAGIGTQFEWEFLGTTAQPQSG
ERVLAQIYNRIGLKSETEYNFRVRSVNHLGSSAWVDVSATTTTVDLTEFINELPLTRLSQ
EAQNLINDINQQVDRLRPETENNLPSLIAKNIDAITGLAEKVEVIDAENPNNLQSQLAQS
NSKINELERVTEVLDASKNNSLPALIKINQIAIESQRLQQQDLGLSVLNVTAAYTNWRNE
YERRAFNNERLIDAAVYVDPDTGTIVNRAFAYTDESFNSAQLLIEGAESKITLNAKQLAQ
SQNRITQAEATLKLQAGQITQRATYAEVEGQIAGALAALQPAYSWQFNTGVEGFTGADSH
HAQGYIVATNPVSTPVISYDATENPMFRLRVRKHTGSIWKGNITFNGSATPLHLPEPTTD
EWETLTLDATGTNGYVGIITSLAFDLGSCDIDFIEVGKRGANDLALADITARTTTLENDI
NARTGIMAQYATTAWVNALGFQTQSNVQTLIDSFNTQYNISAVLQAFSDNNTILKANAAQ
SWIDGANATIRDQVTSILNNEDGVNQRIASAEQSLDAIKGEISQSVTQISGLELDVKEQG
LADILQAYNQLQQDKDLAEQGYSLAVANEKLTAVTNDVSSLATQQLELAGAFAQNQAYLT
SLNQAFANERSARSSTERELRAEITREGERSVAQANERLEATVGYCIDADGNRVDEVDAL
ACIAAGHEWVAGPLVELINNYTAVFVGAQGFQTASNVQQFISTFDGEHGITATIQQINDD
GVIEAAKEAQQWINAADGTITNLITQFVNRPNGINDSIALAEEQIRANADDLSTEVTARE
QLSARMGEAEADLISLDEAIITEQQARASMGSQLRIEFQNQDLAMLATANEFTRAVTGYC
VDAQGNRVDEDDAIACETAGHTWVDGPAVQRAVEISAAWVTLKGFQTQSNVQQSLNTFDA
TYKVSATLQQFADNDTLQKANNAQQFINGAEAYIAQRITAYNAQEDGVDAKFSDVQERLD
AAEGTISTSIVQIQGLSLAQQATDLNAVIAAYNALIRDNELAELDIKAAFANEKLQAQTT
EFESLAQQQLELAALFNDSQAIITSLNQAVSNQYQSSVIRDQRYQATFDSVSARFSGVTT
AIATIDEANTVRDEEFESFVADTIAQFDEVTETFASQDQAFSTLQQTLTAKINEDTAAAK
NEAVSIAQEYTRTAVGHCINAEGQITSENDAVQCVANGGSWVNGPLAEFIANMQISDGEN
SASIKQLRQLFTTVDGKLVARGGWTLDNNGRVVGIAGYNDGEVGNLDLIGDVIRQGVMVG
ETFVPTSYVDNSDPANPVHIFKGRLVLGDGHAVSNLDDIKAQDGKDGSDGQDGLNGKDGI
TPSFSTNPDGSYTISNGTEHITIRDGEDAPIPTVTNNGDGTYTVTDGEGNSVIVKDGQDG
YTPVKGTDYFDGNDGSFVSYIFRSSLTKPTTPTGGTFNGTSETFPTYWADTPVYIDGQIT
WVSKTRWHLLNNTWTNTSWSSPVEYIIKGDKGADGQNGADGQDGLNGQNGQDGADGSRGS
IAVDVATSSGTWSDSVANANVPGSPVIHDRVTIYKSSDPSIQTTKRFNGSSWVSYALQVH
GDALIDGTVDGRVFRANTRIESPRIDLIGGAFMKIELASGFGPDNLWYWYGPKIMSNGLP
NLNALSKANGIEWKDTAGNAYFGGAITAGVLSTALSTTNLSATASVTIGPFGSNGGTIDI
VCSLLATSNASGHSDTSPSAPPAPTYTINLYEYINGGWLSRKSQTFTGNSSVSSEYDFES
RKYIWSTSQSCSGSFTYTDNKLNTSNRTYKLSITARTGFQTSGSYDPSQKLTLISQED
NT seq
7197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaagttgtcgataccgttgtagacacaggcggcgacttattcggtattggtcgc
agtctctttgataaaacggtgggtgcgctatgggactcacttactcctgatgtgcctgaa
gaagacttagccacacttgctaagggcttacaaaaaggcatagaccaaccgcgccgtatc
acttttggccgtgaccgtgttggtggtgttattgcacaccaggcggaaattgaacgcgat
aaaaagaaatttgttcaaatggtggtgctgattaatggtgccccaattgatgccctcgaa
gaaatctacattgctgataagccgcttactgagtacccaagtgaaagctgggactatgaa
ttaagtgatggccgccatacaactgcgaacagtaaagccgttgctaaaatggcaggttgg
acagcagcacacattgggtatggccaagcgcatatctttgttgagtttgaaaataaccgt
gaagtctttccagatggtattagcgatactgagtttttaattcgcggtgcccgggtgtgg
gaccctcgcgacacaaatcaaaacccagatgatgaaaccacctggctttggtcacaaaac
gcggtgttatgtgccctgcactatgtacgtttctatggcgcgcatgaagtcccttttgag
cgcttaccccttgaatggtggattgcggccattaacgtatgtgatgaagaggccgagttt
actgataaagacggcaatatcaccactgagccacgttatacaacaaacggcagttttacc
tttaccacgaaaccccttgatgtattgaaccaacttgaatcctgttttgcgggtaagatt
tttaggcaaatgggccaatggtatgtgcgtgttggtgcttggtatggcaacccgacatac
accattaatgcagatgatgttcacggcaacattaagattaaatggcatgccgatttacgc
gaccgcgccaatgtggttcgcgctacatttaccgaccccgagcaaaactacgagcgcaca
gatgcgccaccggtgatatcttcggcataccagacgcgtgataaccagatattagaaaag
tcgataactttaccgtttgttagaagcagtaccacagcacagcgattggctaccatacac
ctagagcaaacacgcttaggtgaaattgaattaccccttaaacacaaaggcttggccgct
gcagttggtagaactgtttacttaaacttacctggtgaatcgattaccaataaaatctac
cgtgtgacagagcgccgctttcgtttagatggcggcgtaacgctaatgtgtatcgaagat
ggcccaggcttatggggtgataacttaataccaggcgcacaagatttaaccccaaacagt
gattatttagtgggccgtccgaagcctatttttgatgtacgggtgacgattgatggcgat
ggaaacggcattgtaaagtggaaccaccctacaccactggctgtgcatgaatacgatgtt
gagtttattcacgcctcatccagtgagcccgtcttcaaaacaacagtaacgtacacacaa
gtcaccatccctaagcttgcccttggtgaatacaccgcacgtattagcgctagaaatatt
tttggccaacgctctgatacggtcggtgtgcagtttagtgtgcttaccccatcgataccg
gttgtgcatgtacttgctgattacaatcaaattaccctgacagccgagcttgctgctgca
ggcattggtacacagtttgaatgggagttcttagggacaaccgcacagccgcaatcgggt
gaacgtgttttagcacagatttataaccgcattggtttgaagagcgaaacggaatacaac
tttagagtacgcagtgtgaaccacttaggttcatccgcgtgggtggatgtatcggccacc
acgacgacagtcgacttaaccgagtttattaatgagcttccccttacgcgtttaagccag
gaagcacaaaatttaattaacgatattaatcagcaagtcgaccgtttacgccctgagact
gagaataacttaccttcgctcattgctaagaatattgatgcgattacgggccttgctgaa
aaagtagaggtcattgatgcagagaacccgaacaacttacaaagccagcttgcacaatca
aacagtaaaataaatgagttagaacgtgttaccgaagtactggatgcatcaaagaacaac
agcctccctgcactgattaaaatcaatcaaattgctattgaaagccagcgcctacagcaa
caggatttaggcttaagtgttttaaatgtgacagcagcctataccaattggcgcaatgag
tatgagcgcagagcctttaacaatgagcgattaatcgatgcagctgtgtatgttgatcca
gataccggcaccatcgttaaccgtgcatttgcctacacagatgaaagctttaacagtgcg
cagctacttattgaaggcgctgaaagtaaaatcacgctgaacgcgaagcaactagcgcaa
tcacaaaaccgtattacacaagctgaagcaacgttaaagcttcaagcaggtcaaattaca
cagcgtgctacgtatgccgaagtcgaagggcaaattgccggtgcccttgcggcattacaa
cctgcgtacagttggcaatttaacacgggggttgaagggtttacgggtgcagatagccac
catgcccaaggttatattgtggccaccaaccctgtctctacaccggtaattagctacgat
gccactgaaaacccgatgtttaggttacgtgtgcgaaagcatactggctcaatatggaaa
ggcaatatcacgtttaatggcagcgctaccccacttcatttaccagagccaacaacggat
gaatgggaaacgttgacccttgatgcaaccggcacaaatgggtatgtaggtataattacc
agccttgcgtttgatttaggctcctgtgacattgattttattgaagtaggaaaacgtggc
gcgaatgacttagcccttgctgatattaccgcgcgcacgacaacacttgaaaatgatatc
aatgcccgcaccggtatcatggcgcagtacgcaacaacagcctgggttaatgcgcttggg
tttcaaacacaaagtaatgtgcaaaccttaattgactcgtttaatacccaatacaatatt
agtgcggtattacaggcattttcagacaacaacaccattttaaaagcgaacgctgcacaa
tcatggattgatggcgcaaacgccactatacgcgaccaagttaccagtattctaaacaat
gaagatggcgtaaatcagcgcatagcgagtgccgagcaaagtttagatgcgattaaaggc
gaaatcagccaaagcgtaacgcaaataagcggccttgaactggatgtaaaagagcaaggt
ttagcagatatccttcaagcgtataaccagttacagcaagacaaggatttagccgagcaa
ggatatagcttagctgttgctaatgaaaagctaacggctgttacgaatgacgttagctca
ttagcgacgcagcaattagagttagccggtgcttttgcacaaaaccaagcctatttaaca
agcttaaatcaagcctttgctaatgaacgttcagcacgaagcagcaccgaacgtgagtta
agagctgaaattacccgagaaggcgaacgctcagttgcccaagcaaacgaacggcttgag
gcgactgtgggatattgtatcgatgcagatggaaaccgcgttgatgaagttgatgcccta
gcctgtattgccgctggccatgaatgggtagcaggtccattagttgagctaattaacaac
tacacagcagtatttgttggtgcgcaaggcttccaaaccgcgtctaacgtacagcaattc
attagtacatttgacggtgagcatggcattacagcaacaatccagcaaattaacgatgac
ggtgttattgaagctgctaaagaagcccagcaatggatcaacgcagcggatgggacaatt
actaatttaattactcagttcgtaaatagaccgaacggtataaatgattcaatcgcgttg
gctgaagaacaaattcgcgctaatgcggatgacctatcgactgaagtaacagcacgtgag
caattaagtgcgcgtatgggcgaagctgaagctgacttaatatcgttagatgaagccatt
atcactgaacagcaagcccgtgccagtatgggatcgcaacttcgcatcgagtttcaaaac
caagacttagcaatgctcgctacggcaaacgagtttacccgggcagtcactggctattgt
gtagatgcacaaggcaaccgtgttgatgaggatgatgccattgcatgtgaaacagctggc
catacgtgggttgatggtccagccgtgcaacgtgccgttgaaattagtgcggcgtgggtt
actctgaaaggtttccaaactcaaagtaacgtacagcaatcacttaatacgtttgatgct
acgtataaagtcagcgcgaccctgcagcagtttgctgataatgacacacttcaaaaagcc
aacaatgcccaacagtttattaatggtgcagaggcttacattgcgcagcgcattacggca
tataacgcacaagaagacggtgtagacgccaagttttcagacgtacaagagcgcttagat
gccgctgaaggcacaatatcaacgagtattgtacagatccaaggtttgagcttggcgcaa
caagcaaccgacttaaacgcagtgatagctgcgtataatgccttaattcgtgataacgaa
cttgcagagctcgacattaaagcggcctttgcgaacgaaaagcttcaagcgcaaacaact
gagtttgaaagcctggcacaacagcagcttgagcttgcagcactattcaatgacagccaa
gcaattattacgagcttaaatcaagcggtatctaaccaatatcaatcgagcgtaatacgc
gaccaacgttatcaagcaacgtttgatagtgttagcgcccgttttagtggtgttacaacg
gccatagcgacgattgatgaagctaacacagttcgtgatgaagagtttgaatcgtttgtt
gctgacacaatcgcgcaatttgatgaagtaaccgaaacctttgccagtcaagaccaagcc
tttagcaccctgcagcaaacgctgacagcaaaaataaatgaagacaccgcagcggcaaaa
aacgaagcagtatcaatcgcacaagagtacacccgtactgccgttggacattgtataaat
gccgagggccaaataaccagcgaaaatgatgctgttcaatgtgtggccaatggtggttca
tgggttaatggtccgcttgctgagttcattgccaatatgcaaattagtgatggtgaaaac
agcgcgagcattaaacaactacgccaattgtttacgacggtagacggtaaactagttgcg
cgtggtggttggacgcttgataacaacggtcgcgtggtggggattgcgggttataacgat
ggagaagtaggcaacctcgacttgattggtgatgtgatccgccaaggtgtgatggtaggt
gagacctttgtaccaacctcatacgttgacaactcagacccagctaatcctgtgcatata
ttcaaaggccgtttagtactgggtgacggccacgctgttagcaaccttgacgatatcaaa
gcgcaagacggtaaagacgggtcggatggtcaagatggcctaaacggcaaagacggtatt
accccttcattctcaacgaatcctgatggctcttacacaattagtaatggtaccgagcac
ataacaatacgcgatggtgaagatgctcccataccgactgtcactaataacggggatggc
acctacacagtgacagatggtgaaggtaatagtgtcattgttaaagatggtcaagacggt
tacacccccgttaaaggcaccgattactttgatgggaatgacggcagctttgttagctac
atatttagatcatcattaactaaacccactaccccaacaggcggtacatttaatggcaca
tctgaaaccttcccaacttattgggctgatacgcctgtctatatcgatggacaaattacc
tgggtgtctaaaacacgttggcacttactaaataatacctggactaatacaagttggtct
tcgcctgttgaatacatcattaaaggtgataaaggtgctgatgggcaaaatggcgctgat
ggccaagatggtttaaatgggcagaatggacaagacggcgctgatggtagtcgaggctct
attgctgttgatgttgcaacgtcttcaggtacttggtctgattcagtcgcaaatgcaaat
gtacctggctcccctgttattcacgatcgtgtcacgatttacaaatcatccgaccccagt
attcaaacaacaaaacgctttaatggctcgtcttgggtaagttatgccctgcaagtgcat
ggcgatgcactcattgatggcacagttgatgggcgtgttttcagagcgaatacccgcatt
gaatcaccgcgtattgacctaataggtggcgcgttcatgaaaattgaacttgccagtggc
tttgggcctgataatttgtggtattggtacggccctaaaattatgagtaatggcttgcct
aatctcaatgccctatcaaaagcaaatggtattgaatggaaagataccgctggtaacgcc
tattttggtggagccattacagctggtgtactaagtacagcgctatctacaacgaattta
tcagccacagcgagcgttacaattggtcccttcggctcaaatggcggcactatcgacatt
gtgtgctctttattggctacatcaaatgcaagtggccacagcgatacatcgccatccgcc
ccgcctgccccgacatacactatcaacttatatgaatacatcaatggcggttggctatct
cgtaagtcacaaacattcacgggaaatagcagtgtatccagtgaatatgactttgaatct
agaaagtatatttggtcaacgagtcaaagttgctcaggttctttcacgtacacagacaac
aaactaaacacatccaaccggacctacaaactttcaattacagctcgtacagggtttcaa
acatccggtagttacgatccatcacaaaaattaaccttaatatcgcaagaggactaa
DBGET
integrated database retrieval system