KEGG   Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_08380
Entry
D0907_08380       CDS       T05890                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
pdj  Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pdj02000]
    D0907_08380
Transporters [BR:pdj02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   D0907_08380
SSDB
Motif
Pfam: Phage-tail_3 fn3 Ig_J Collagen Ig_J_second
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXV65283
LinkDB
Position
1828952..1836148
AA seq 2398 aa
MSKVVDTVVDTGGDLFGIGRSLFDKTVGALWDSLTPDVPEEDLATLAKGLQKGIDQPRRI
TFGRDRVGGVIAHQAEIERDKKKFVQMVVLINGAPIDALEEIYIADKPLTEYPSESWDYE
LSDGRHTTANSKAVAKMAGWTAAHIGYGQAHIFVEFENNREVFPDGISDTEFLIRGARVW
DPRDTNQNPDDETTWLWSQNAVLCALHYVRFYGAHEVPFERLPLEWWIAAINVCDEEAEF
TDKDGNITTEPRYTTNGSFTFTTKPLDVLNQLESCFAGKIFRQMGQWYVRVGAWYGNPTY
TINADDVHGNIKIKWHADLRDRANVVRATFTDPEQNYERTDAPPVISSAYQTRDNQILEK
SITLPFVRSSTTAQRLATIHLEQTRLGEIELPLKHKGLAAAVGRTVYLNLPGESITNKIY
RVTERRFRLDGGVTLMCIEDGPGLWGDNLIPGAQDLTPNSDYLVGRPKPIFDVRVTIDGD
GNGIVKWNHPTPLAVHEYDVEFIHASSSEPVFKTTVTYTQVTIPKLALGEYTARISARNI
FGQRSDTVGVQFSVLTPSIPVVHVLADYNQITLTAELAAAGIGTQFEWEFLGTTAQPQSG
ERVLAQIYNRIGLKSETEYNFRVRSVNHLGSSAWVDVSATTTTVDLTEFINELPLTRLSQ
EAQNLINDINQQVDRLRPETENNLPSLIAKNIDAITGLAEKVEVIDAENPNNLQSQLAQS
NSKINELERVTEVLDASKNNSLPALIKINQIAIESQRLQQQDLGLSVLNVTAAYTNWRNE
YERRAFNNERLIDAAVYVDPDTGTIVNRAFAYTDESFNSAQLLIEGAESKITLNAKQLAQ
SQNRITQAEATLKLQAGQITQRATYAEVEGQIAGALAALQPAYSWQFNTGVEGFTGADSH
HAQGYIVATNPVSTPVISYDATENPMFRLRVRKHTGSIWKGNITFNGSATPLHLPEPTTD
EWETLTLDATGTNGYVGIITSLAFDLGSCDIDFIEVGKRGANDLALADITARTTTLENDI
NARTGIMAQYATTAWVNALGFQTQSNVQTLIDSFNTQYNISAVLQAFSDNNTILKANAAQ
SWIDGANATIRDQVTSILNNEDGVNQRIASAEQSLDAIKGEISQSVTQISGLELDVKEQG
LADILQAYNQLQQDKDLAEQGYSLAVANEKLTAVTNDVSSLATQQLELAGAFAQNQAYLT
SLNQAFANERSARSSTERELRAEITREGERSVAQANERLEATVGYCIDADGNRVDEVDAL
ACIAAGHEWVAGPLVELINNYTAVFVGAQGFQTASNVQQFISTFDGEHGITATIQQINDD
GVIEAAKEAQQWINAADGTITNLITQFVNRPNGINDSIALAEEQIRANADDLSTEVTARE
QLSARMGEAEADLISLDEAIITEQQARASMGSQLRIEFQNQDLAMLATANEFTRAVTGYC
VDAQGNRVDEDDAIACETAGHTWVDGPAVQRAVEISAAWVTLKGFQTQSNVQQSLNTFDA
TYKVSATLQQFADNDTLQKANNAQQFINGAEAYIAQRITAYNAQEDGVDAKFSDVQERLD
AAEGTISTSIVQIQGLSLAQQATDLNAVIAAYNALIRDNELAELDIKAAFANEKLQAQTT
EFESLAQQQLELAALFNDSQAIITSLNQAVSNQYQSSVIRDQRYQATFDSVSARFSGVTT
AIATIDEANTVRDEEFESFVADTIAQFDEVTETFASQDQAFSTLQQTLTAKINEDTAAAK
NEAVSIAQEYTRTAVGHCINAEGQITSENDAVQCVANGGSWVNGPLAEFIANMQISDGEN
SASIKQLRQLFTTVDGKLVARGGWTLDNNGRVVGIAGYNDGEVGNLDLIGDVIRQGVMVG
ETFVPTSYVDNSDPANPVHIFKGRLVLGDGHAVSNLDDIKAQDGKDGSDGQDGLNGKDGI
TPSFSTNPDGSYTISNGTEHITIRDGEDAPIPTVTNNGDGTYTVTDGEGNSVIVKDGQDG
YTPVKGTDYFDGNDGSFVSYIFRSSLTKPTTPTGGTFNGTSETFPTYWADTPVYIDGQIT
WVSKTRWHLLNNTWTNTSWSSPVEYIIKGDKGADGQNGADGQDGLNGQNGQDGADGSRGS
IAVDVATSSGTWSDSVANANVPGSPVIHDRVTIYKSSDPSIQTTKRFNGSSWVSYALQVH
GDALIDGTVDGRVFRANTRIESPRIDLIGGAFMKIELASGFGPDNLWYWYGPKIMSNGLP
NLNALSKANGIEWKDTAGNAYFGGAITAGVLSTALSTTNLSATASVTIGPFGSNGGTIDI
VCSLLATSNASGHSDTSPSAPPAPTYTINLYEYINGGWLSRKSQTFTGNSSVSSEYDFES
RKYIWSTSQSCSGSFTYTDNKLNTSNRTYKLSITARTGFQTSGSYDPSQKLTLISQED
NT seq 7197 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctaaagttgtcgataccgttgtagacacaggcggcgacttattcggtattggtcgc
agtctctttgataaaacggtgggtgcgctatgggactcacttactcctgatgtgcctgaa
gaagacttagccacacttgctaagggcttacaaaaaggcatagaccaaccgcgccgtatc
acttttggccgtgaccgtgttggtggtgttattgcacaccaggcggaaattgaacgcgat
aaaaagaaatttgttcaaatggtggtgctgattaatggtgccccaattgatgccctcgaa
gaaatctacattgctgataagccgcttactgagtacccaagtgaaagctgggactatgaa
ttaagtgatggccgccatacaactgcgaacagtaaagccgttgctaaaatggcaggttgg
acagcagcacacattgggtatggccaagcgcatatctttgttgagtttgaaaataaccgt
gaagtctttccagatggtattagcgatactgagtttttaattcgcggtgcccgggtgtgg
gaccctcgcgacacaaatcaaaacccagatgatgaaaccacctggctttggtcacaaaac
gcggtgttatgtgccctgcactatgtacgtttctatggcgcgcatgaagtcccttttgag
cgcttaccccttgaatggtggattgcggccattaacgtatgtgatgaagaggccgagttt
actgataaagacggcaatatcaccactgagccacgttatacaacaaacggcagttttacc
tttaccacgaaaccccttgatgtattgaaccaacttgaatcctgttttgcgggtaagatt
tttaggcaaatgggccaatggtatgtgcgtgttggtgcttggtatggcaacccgacatac
accattaatgcagatgatgttcacggcaacattaagattaaatggcatgccgatttacgc
gaccgcgccaatgtggttcgcgctacatttaccgaccccgagcaaaactacgagcgcaca
gatgcgccaccggtgatatcttcggcataccagacgcgtgataaccagatattagaaaag
tcgataactttaccgtttgttagaagcagtaccacagcacagcgattggctaccatacac
ctagagcaaacacgcttaggtgaaattgaattaccccttaaacacaaaggcttggccgct
gcagttggtagaactgtttacttaaacttacctggtgaatcgattaccaataaaatctac
cgtgtgacagagcgccgctttcgtttagatggcggcgtaacgctaatgtgtatcgaagat
ggcccaggcttatggggtgataacttaataccaggcgcacaagatttaaccccaaacagt
gattatttagtgggccgtccgaagcctatttttgatgtacgggtgacgattgatggcgat
ggaaacggcattgtaaagtggaaccaccctacaccactggctgtgcatgaatacgatgtt
gagtttattcacgcctcatccagtgagcccgtcttcaaaacaacagtaacgtacacacaa
gtcaccatccctaagcttgcccttggtgaatacaccgcacgtattagcgctagaaatatt
tttggccaacgctctgatacggtcggtgtgcagtttagtgtgcttaccccatcgataccg
gttgtgcatgtacttgctgattacaatcaaattaccctgacagccgagcttgctgctgca
ggcattggtacacagtttgaatgggagttcttagggacaaccgcacagccgcaatcgggt
gaacgtgttttagcacagatttataaccgcattggtttgaagagcgaaacggaatacaac
tttagagtacgcagtgtgaaccacttaggttcatccgcgtgggtggatgtatcggccacc
acgacgacagtcgacttaaccgagtttattaatgagcttccccttacgcgtttaagccag
gaagcacaaaatttaattaacgatattaatcagcaagtcgaccgtttacgccctgagact
gagaataacttaccttcgctcattgctaagaatattgatgcgattacgggccttgctgaa
aaagtagaggtcattgatgcagagaacccgaacaacttacaaagccagcttgcacaatca
aacagtaaaataaatgagttagaacgtgttaccgaagtactggatgcatcaaagaacaac
agcctccctgcactgattaaaatcaatcaaattgctattgaaagccagcgcctacagcaa
caggatttaggcttaagtgttttaaatgtgacagcagcctataccaattggcgcaatgag
tatgagcgcagagcctttaacaatgagcgattaatcgatgcagctgtgtatgttgatcca
gataccggcaccatcgttaaccgtgcatttgcctacacagatgaaagctttaacagtgcg
cagctacttattgaaggcgctgaaagtaaaatcacgctgaacgcgaagcaactagcgcaa
tcacaaaaccgtattacacaagctgaagcaacgttaaagcttcaagcaggtcaaattaca
cagcgtgctacgtatgccgaagtcgaagggcaaattgccggtgcccttgcggcattacaa
cctgcgtacagttggcaatttaacacgggggttgaagggtttacgggtgcagatagccac
catgcccaaggttatattgtggccaccaaccctgtctctacaccggtaattagctacgat
gccactgaaaacccgatgtttaggttacgtgtgcgaaagcatactggctcaatatggaaa
ggcaatatcacgtttaatggcagcgctaccccacttcatttaccagagccaacaacggat
gaatgggaaacgttgacccttgatgcaaccggcacaaatgggtatgtaggtataattacc
agccttgcgtttgatttaggctcctgtgacattgattttattgaagtaggaaaacgtggc
gcgaatgacttagcccttgctgatattaccgcgcgcacgacaacacttgaaaatgatatc
aatgcccgcaccggtatcatggcgcagtacgcaacaacagcctgggttaatgcgcttggg
tttcaaacacaaagtaatgtgcaaaccttaattgactcgtttaatacccaatacaatatt
agtgcggtattacaggcattttcagacaacaacaccattttaaaagcgaacgctgcacaa
tcatggattgatggcgcaaacgccactatacgcgaccaagttaccagtattctaaacaat
gaagatggcgtaaatcagcgcatagcgagtgccgagcaaagtttagatgcgattaaaggc
gaaatcagccaaagcgtaacgcaaataagcggccttgaactggatgtaaaagagcaaggt
ttagcagatatccttcaagcgtataaccagttacagcaagacaaggatttagccgagcaa
ggatatagcttagctgttgctaatgaaaagctaacggctgttacgaatgacgttagctca
ttagcgacgcagcaattagagttagccggtgcttttgcacaaaaccaagcctatttaaca
agcttaaatcaagcctttgctaatgaacgttcagcacgaagcagcaccgaacgtgagtta
agagctgaaattacccgagaaggcgaacgctcagttgcccaagcaaacgaacggcttgag
gcgactgtgggatattgtatcgatgcagatggaaaccgcgttgatgaagttgatgcccta
gcctgtattgccgctggccatgaatgggtagcaggtccattagttgagctaattaacaac
tacacagcagtatttgttggtgcgcaaggcttccaaaccgcgtctaacgtacagcaattc
attagtacatttgacggtgagcatggcattacagcaacaatccagcaaattaacgatgac
ggtgttattgaagctgctaaagaagcccagcaatggatcaacgcagcggatgggacaatt
actaatttaattactcagttcgtaaatagaccgaacggtataaatgattcaatcgcgttg
gctgaagaacaaattcgcgctaatgcggatgacctatcgactgaagtaacagcacgtgag
caattaagtgcgcgtatgggcgaagctgaagctgacttaatatcgttagatgaagccatt
atcactgaacagcaagcccgtgccagtatgggatcgcaacttcgcatcgagtttcaaaac
caagacttagcaatgctcgctacggcaaacgagtttacccgggcagtcactggctattgt
gtagatgcacaaggcaaccgtgttgatgaggatgatgccattgcatgtgaaacagctggc
catacgtgggttgatggtccagccgtgcaacgtgccgttgaaattagtgcggcgtgggtt
actctgaaaggtttccaaactcaaagtaacgtacagcaatcacttaatacgtttgatgct
acgtataaagtcagcgcgaccctgcagcagtttgctgataatgacacacttcaaaaagcc
aacaatgcccaacagtttattaatggtgcagaggcttacattgcgcagcgcattacggca
tataacgcacaagaagacggtgtagacgccaagttttcagacgtacaagagcgcttagat
gccgctgaaggcacaatatcaacgagtattgtacagatccaaggtttgagcttggcgcaa
caagcaaccgacttaaacgcagtgatagctgcgtataatgccttaattcgtgataacgaa
cttgcagagctcgacattaaagcggcctttgcgaacgaaaagcttcaagcgcaaacaact
gagtttgaaagcctggcacaacagcagcttgagcttgcagcactattcaatgacagccaa
gcaattattacgagcttaaatcaagcggtatctaaccaatatcaatcgagcgtaatacgc
gaccaacgttatcaagcaacgtttgatagtgttagcgcccgttttagtggtgttacaacg
gccatagcgacgattgatgaagctaacacagttcgtgatgaagagtttgaatcgtttgtt
gctgacacaatcgcgcaatttgatgaagtaaccgaaacctttgccagtcaagaccaagcc
tttagcaccctgcagcaaacgctgacagcaaaaataaatgaagacaccgcagcggcaaaa
aacgaagcagtatcaatcgcacaagagtacacccgtactgccgttggacattgtataaat
gccgagggccaaataaccagcgaaaatgatgctgttcaatgtgtggccaatggtggttca
tgggttaatggtccgcttgctgagttcattgccaatatgcaaattagtgatggtgaaaac
agcgcgagcattaaacaactacgccaattgtttacgacggtagacggtaaactagttgcg
cgtggtggttggacgcttgataacaacggtcgcgtggtggggattgcgggttataacgat
ggagaagtaggcaacctcgacttgattggtgatgtgatccgccaaggtgtgatggtaggt
gagacctttgtaccaacctcatacgttgacaactcagacccagctaatcctgtgcatata
ttcaaaggccgtttagtactgggtgacggccacgctgttagcaaccttgacgatatcaaa
gcgcaagacggtaaagacgggtcggatggtcaagatggcctaaacggcaaagacggtatt
accccttcattctcaacgaatcctgatggctcttacacaattagtaatggtaccgagcac
ataacaatacgcgatggtgaagatgctcccataccgactgtcactaataacggggatggc
acctacacagtgacagatggtgaaggtaatagtgtcattgttaaagatggtcaagacggt
tacacccccgttaaaggcaccgattactttgatgggaatgacggcagctttgttagctac
atatttagatcatcattaactaaacccactaccccaacaggcggtacatttaatggcaca
tctgaaaccttcccaacttattgggctgatacgcctgtctatatcgatggacaaattacc
tgggtgtctaaaacacgttggcacttactaaataatacctggactaatacaagttggtct
tcgcctgttgaatacatcattaaaggtgataaaggtgctgatgggcaaaatggcgctgat
ggccaagatggtttaaatgggcagaatggacaagacggcgctgatggtagtcgaggctct
attgctgttgatgttgcaacgtcttcaggtacttggtctgattcagtcgcaaatgcaaat
gtacctggctcccctgttattcacgatcgtgtcacgatttacaaatcatccgaccccagt
attcaaacaacaaaacgctttaatggctcgtcttgggtaagttatgccctgcaagtgcat
ggcgatgcactcattgatggcacagttgatgggcgtgttttcagagcgaatacccgcatt
gaatcaccgcgtattgacctaataggtggcgcgttcatgaaaattgaacttgccagtggc
tttgggcctgataatttgtggtattggtacggccctaaaattatgagtaatggcttgcct
aatctcaatgccctatcaaaagcaaatggtattgaatggaaagataccgctggtaacgcc
tattttggtggagccattacagctggtgtactaagtacagcgctatctacaacgaattta
tcagccacagcgagcgttacaattggtcccttcggctcaaatggcggcactatcgacatt
gtgtgctctttattggctacatcaaatgcaagtggccacagcgatacatcgccatccgcc
ccgcctgccccgacatacactatcaacttatatgaatacatcaatggcggttggctatct
cgtaagtcacaaacattcacgggaaatagcagtgtatccagtgaatatgactttgaatct
agaaagtatatttggtcaacgagtcaaagttgctcaggttctttcacgtacacagacaac
aaactaaacacatccaaccggacctacaaactttcaattacagctcgtacagggtttcaa
acatccggtagttacgatccatcacaaaaattaaccttaatatcgcaagaggactaa

DBGET integrated database retrieval system