KEGG   Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_11030
Entry
D0907_11030       CDS       T05890                                 
Name
(GenBank) pilin biogenesis protein
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
pdj  Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:pdj02044]
    D0907_11030
   02035 Bacterial motility proteins [BR:pdj02035]
    D0907_11030
Secretion system [BR:pdj02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   D0907_11030
Bacterial motility proteins [BR:pdj02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   D0907_11030
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1 VWA_2 PQQ_2 MapZ_EC1 Trypan_PARP
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXV65758
UniProt: A0AAD0S182
LinkDB
Position
complement(2416627..2419926)
AA seq 1099 aa
MKMKTLVRSILTGFVTCMVTAVYAEDIELYVNYNVKTNEKPRVLLIFDTSGSMAFSTATG
KSCGYSSYTGYVVCPDSRLGVAKSAITSLVDNNDDIDFGLMRFNSTNGGYVLAGIGSSSS
SLKTAISVLPADGGTPLTETLWEAYLYITGQSLYYGEKVNEAWRDTSVETKVRRGSKRKP
KYSYTYISPFDTTEEAKRCDNSVNVIYMTDGDPSSGSDNEQDGEISDLYKSYFGSNLSGS
DKIAGVYLHKLAQIIHGTEDVKVDLFPSTSDIHETGRVYTIGFGSGMSKDGKRLLSETAD
LGGGQYLHADTAEQLSKALKNTITRIREVNDTFTSPSIANNNVDQTRSREGIYYAMFYPE
TGARWRGNLKKLKVSGDEIVDLDGKPALNADGLIAKGAKTFWLPDNTAPDGNIVQEGGAN
LMLSNLSSRTIYTDAGSAGLVDFTKSTVSTALGGDLAAALKFNLTTATSVNSLTLGLLST
ELDKTIKWSRGIDVDDEDGDGSTSDQRQDIFGDPLHSKPVTIDYGNDDVRILIGTNAGYL
HFFQDKNDVLKESWAFIPSSLYKIIKPLRENQEKSKVYGVDGPISVFFDDKNGDGVVNGT
DRVWAFFGLRRGGNNYYGLDITNPDSPRLMWGGPIIGGTGDFKELAQSWSKPTVTYINLK
GYENRPLLVFGAGYDTNKDNVLRSEDTKGRGIYIVDAQSGKKVWALTSSENGFAGKHSIA
SDISVLDSDYDGYTDRLYASDTGGDVWRIDMPSNSPTSTESPWTHFKLASLGSALASQDR
RFFYKPMVARTMFSKVSETDVNGKSVKTRIDTPFDAVLLGSGNRSKPTGTTTSDQLFMIR
DINTVTRSFQSDEIPAAITQANLMNMDADPFGNALDSVDKFTDLEVELGQYHGWYYNLLA
AGEKSLAASTVIGGVAYFTSYAPASSTETANQCSLTGGSGSLYAFHLHYGTKVYDSLKFT
TSNDVPDTPQLYFGVGDSCVDSNNNGFCDETPDPENPDPENPDPEDPNPEDPNPEDPDPD
NPDVIKDTDEKVKEMSQFLTIGPGLKGEQNPFKVKEIQGPGLTVKDGKIQLVNDATPIGF
GFKTQQTYIYKREVNDKSN
NT seq 3300 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatgaaaacgttagtgcgcagtatactgactggttttgtaacctgtatggttact
gcagtgtatgctgaagacatagagctatacgttaactataatgtgaaaacaaatgaaaaa
ccgcgtgttttacttatttttgacacttctggaagtatggcattttctactgcaacgggt
aaaagttgtggctacagcagctacacgggctatgttgtgtgcccagacagtcgtcttggt
gtagcaaaaagtgcgattacaagcttagtagataacaatgacgatattgatttcggtttg
atgcgttttaatagcacaaatggcggttatgtattagctggaataggctcgtcatcttca
tccttgaagacagccatttctgtactacctgctgacggggggacccctttaacagagacg
ctttgggaagcctatttatacattacgggtcaaagtttgtattacggagaaaaagttaat
gaggcttggcgagacacgtcagtagagacaaaagtcagaagggggtcaaagcgtaaacca
aaatacagttatacatatatctctccatttgataccacagaggaagcaaaacgctgtgat
aactctgttaatgttatttatatgacagatggtgacccctcttcaggctcagataatgag
caagatggagaaatcagtgatctctataaatcttatttcggtagcaatttaagcggctct
gataaaattgcgggtgtttatttacacaagcttgcgcagattattcatggcactgaagat
gttaaagtggatttgtttccttcaacatctgatattcatgaaacagggcgggtgtatacg
attggctttggtagcggtatgagtaaggatggtaaacgcttattatcagaaaccgctgat
ttaggcggtggtcagtatcttcatgctgacactgcagaacaattatcaaaagctttaaaa
aatacgataacacgcatacgcgaagtaaatgatacttttacttcaccttctattgcgaat
aataatgttgatcaaacacgcagtcgtgaaggtatttattatgcaatgttttacccagaa
accggtgctcggtggcgtggaaatcttaaaaagttgaaagtgtcaggcgatgaaatcgtt
gatttggatggaaagccggcattaaacgctgatggtttgattgcaaaaggggcaaagaca
ttttggttaccagataatacagcaccagacgggaacattgttcaggaaggtggtgcaaat
cttatgttatcaaacctatcatcgcggaccatttataccgatgccgggagcgctgggtta
gttgattttactaagtcgacagtttctacggcactaggtggcgacttagcggcagcgtta
aagtttaatttaactacagcaacaagtgtcaattcgttgactcttgggctcttatcgacc
gagttagataaaacgatcaagtggagccgaggaatagatgtggatgatgaagacggtgat
ggcagtaccagtgatcaacgacaagatatttttggtgatcctctgcactcaaaacctgtg
acaattgattacggtaatgatgatgtgcgcattttaattggcaccaatgcaggttaccta
cacttttttcaagataaaaatgatgtattaaaagaaagctgggcttttatacccagtagc
ttatacaaaattattaaaccattacgagagaatcaagaaaaatcaaaggtctatggtgtt
gatggacctatttctgtgttctttgatgataaaaatggtgatggagttgtaaatggcact
gatcgtgtttgggcgttttttggcttaagacgtggcggcaataattattatggactggat
attacaaacccagattcacctcgactcatgtgggggggaccgattattggtggaacggga
gactttaaagaacttgcgcaatcatggtctaaacctacggtgacatacattaacttaaaa
gggtatgaaaatcgaccactgcttgtttttggtgcagggtacgacaccaataaagacaat
gttctgcgttctgaagatacaaaagggcgcggtatttatattgttgatgcacagagcggc
aaaaaagtgtgggctttaacgtcgagtgaaaatggctttgcaggtaaacacagtattgct
tctgatattagtgttttggattctgattatgacggttacactgatcgattatatgcatcc
gacaccggcggtgatgtatggcgtattgatatgccttcaaatagcccaacgagcacagaa
agtccttggacacacttcaaacttgcgagtttaggcagtgcacttgcatctcaagatcgt
cgtttcttttataaaccgatggttgcgagaacaatgtttagtaaggtctctgaaacagac
gtaaatggtaagtcggttaaaacacgtattgataccccctttgatgcagtattactaggt
agtgggaatcgctctaaaccaacgggcaccacaacgagtgatcaattgtttatgatccgc
gatatcaatacagtaacacgctcattccaaagcgatgagattccagcggcgatcacccag
gctaatttaatgaatatggatgctgacccgtttggtaatgcacttgatagtgtagataaa
tttaccgatttagaagttgaattaggtcaataccatggttggtattataaccttctagcg
gctggtgaaaaatcactggcagcaagcacggttattggaggagtcgcttatttcaccagt
tacgcacccgcttcttcaacagaaacagcgaatcagtgttcattaacagggggctcaggg
agtttatatgcgttccacttacactacggtacaaaagtgtatgatagtctaaaatttacg
acctcaaatgatgtacctgatacacctcagctttatttcggtgttggtgatagctgtgtt
gatagtaataataatggtttttgtgatgaaaccccggatcctgaaaacccggatcctgaa
aacccggatcctgaagacccgaatcctgaagacccgaatcctgaagacccggatcctgat
aacccagatgtgatcaaagatacagacgaaaaagtcaaagagatgagtcagttcttaacc
ataggaccaggtcttaaaggcgagcaaaacccctttaaagtgaaagaaatacaaggtccg
ggtttaacggttaaagatggaaaaatacaactggttaatgatgcaactccgattggtttt
ggttttaaaacacagcaaacctatatttataagcgagaagtaaatgacaagagtaactaa

DBGET integrated database retrieval system