KEGG   Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_12695
Entry
D0907_12695       CDS       T05890                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pdj  Pseudoalteromonas lipolytica
SSDB
Motif
Pfam: Collagen NHL LVIVD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXV66871
UniProt: A0AAD0S2N3
LinkDB
Position
2821000..2823156
AA seq 718 aa
MALHTHTDSTLTKFTLCALTLAVLLGVSGCSGDDGKDGAMGAQGVAGQDGADGANGVDGQ
DGTNGTDGSDGMDGNDGAPGFAAATFILANNGQENAGTVNVINQNAAKLSSFNTGANEGV
VFDSLGNLVQAADSGNGAISTVCQILSRGDGGMYNSDVDRMISGTNSTLVNPKGITISNK
HGLIFAADFNGMQVTVFGKEAAGDVAPLASTVTDAKPWDLTYDEINDRLYVALTNGDVAV
YDNYVMGGFAATPARTITPSDETGAKISVNLHGISLESHTNKLVLSDVGSASDATDGALF
VISNASQADGMVTVDRHIAGPMSMLGNPVDISLTGSDLRVAEKSNDAVLVFSNIFAGDSG
DIAPDLVTATTKPESITPTVMHNGMQDSSDSVMINMPLLGVAVSSNPAVLGATTGQISRI
NAPLTAELASYNASQTIESVAFDKSGTSYATYDNATTSIGGLVISNKVATHRDGDTFTTS
QDRLITGANTGIISPKGIDVASDNGMVFVAEFNATTPGILIFSSCATGNVSPLMTLTANG
GARPWDVDYDPATDKAFVALTNGTVAVFDEVKSKLMAGMTTITGEDRLITPASGGTAFAA
PTNLHGIDYDPLSDSLIVSDVGSAADATDGKIYVLNNASKASGLTNVSVNIAGPASQLGN
PVDIMYTGNHLYVAEKSNGLVMRFDNILNSPSGDIAATVSYSFTAPESVAILPAWLNH
NT seq 2157 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atagcactacatactcacacagattcaacactaacaaaatttactctttgtgcattaaca
ctagccgtgttactcggcgtaagtggatgtagtggtgacgacggtaaagacggtgcgatg
ggtgctcagggtgttgcaggtcaagatggtgctgacggagccaatggcgttgacggtcaa
gatggtacaaatggcactgatggttcagacggtatggatggtaacgatggtgcacccggt
tttgcagctgccacctttattctcgctaataatggccaagaaaatgcggggacagtcaat
gttatcaatcaaaatgccgctaagctttcaagttttaacactggggcaaatgaaggtgtc
gtattcgacagtttaggtaaccttgtacaagcagccgattcgggcaatggggcaatcagc
acagtgtgtcagattctcagccgaggtgatggcgggatgtataacagtgacgttgataga
atgatatcaggtacaaacagcaccttagtcaaccccaaaggcatcactatttcaaacaag
cacgggctaatttttgctgctgactttaatggtatgcaagtaacagtgttcggtaaagaa
gccgcaggagatgttgcaccactggccagcacagtgacagacgcaaaaccgtgggattta
acctacgatgaaattaacgaccgattatacgttgcactcactaatggtgatgtggccgta
tatgataactatgtgatgggcggctttgcagctacacccgcgcggacaattacccctagc
gatgaaaccggcgccaaaatatcagtgaaccttcatggcatctcgcttgaatcacatact
aataaattagtgctctctgatgtaggaagtgcatctgatgcaaccgacggtgcactcttt
gttatttcaaatgcatcacaggctgatggcatggtcacagttgaccgccatatcgcaggc
ccaatgtctatgcttggcaatccggttgatattagtctgacaggcagtgatttacgtgtt
gccgaaaaatcaaatgatgccgtactcgtgtttagcaatattttcgctggtgacagcggt
gatattgctcctgacttagtgacagcaaccacaaagcctgaatcaatcacacctacagtc
atgcacaatggtatgcaagatagctctgacagcgtcatgattaacatgccattattgggc
gttgctgtcagtagtaacccagctgtactaggcgctacaaccggtcaaattagtcgtatt
aatgcccccttgactgcagagcttgccagctataatgcaagtcaaaccattgaaagtgtc
gccttcgacaaatcagggacaagctatgccacgtacgataatgcaacgacatcaataggc
ggtctcgttatctcgaacaaagtagcaacccatcgtgatggcgacacatttacaaccagc
caagacaggctaatcactggagcaaatacaggtatcatttcacctaaaggtatcgatgtg
gcctctgataatggcatggtatttgtggctgaatttaatgccacaacccctggtatttta
atcttttcgagctgtgcaacgggcaatgttagcccactcatgactttaacagccaacggc
ggtgctcgcccatgggatgttgattatgaccctgcaacagacaaagcatttgttgccctg
actaatggcacagttgcagtatttgacgaagtgaaaagcaaattaatggcaggcatgaca
accatcactggagaagaccgtttgatcacaccagcatccggcggtacggcgtttgcagcg
ccaactaaccttcatggtattgattatgatcctctaagtgattcattgatagtgtcagat
gtaggcagtgcagccgatgctaccgacggtaaaatttacgtgttaaataacgcatcaaaa
gcaagcggcttaaccaatgtaagcgtcaacattgcagggcctgctagtcagcttggtaac
cccgttgatattatgtatacaggcaaccatttatatgtcgctgaaaagtcgaatggtttg
gtaatgcgcttcgataatattttaaatagcccaagtggtgatattgccgcgactgtgagt
tactcattcacggcaccagagtcagtggctattttaccggcttggcttaaccattaa

DBGET integrated database retrieval system