Pediococcus damnosus: ADU72_0283
Help
Entry
ADU72_0283 CDS
T04321
Name
(GenBank) Adhesion exoprotein
Organism
pdm
Pediococcus damnosus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG
KxYKxGKxW_sig
MucBP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMV66232
UniProt:
A0ABN4N648
LinkDB
All DBs
Position
complement(123742..126978)
Genome browser
AA seq
1078 aa
AA seq
DB search
MNNRQRKLKRLKLLQDTGQAKEHFKMYKVRKSWLFAGITVLFFGTGVFFGHPTAYAATEA
DTSSKTPITEVASSSSSSESSGSESAASDGTKSSETDAVTSSSNDKSSSNASSAATSTDR
TALASSSTAQKTGSSATSSATSSNGSSAASSSVVSDQNKSSNVTSSVATSSKNSSAETTS
SKASDVVTKEAVPSYRTASVKSLATDAVAPSATEKAVDPVNTGSLDGTNPAGANAATSNL
TADDIPDSFETTGAAAITSTPGTITLTNGKEQNGSYVFDNQVDTSQKFTLTGSYSSTAYN
GTGGGLGIIIQPVDPQNAGNNSNTTADVGIDGLKSTTFVGRDFYVDSSKNDTTWNHLTIR
PTDANGNMVLTPLANVTPGANQTAAVTKGEYYVLTWTPTSVDETTGTVTGTLNYTSYLDA
AHTTSVQSTGNVVTTLSRAVSLAAFGATGGTAGTQTATVTAFTGTRVTMPVVVHYVDQSG
APISTDNTITVNVGSTFGAGANTLDSNTATSGIYQAKAIDGYTFGAATDPVTVVNTNIDT
SATNEITVTYLKNAGTQTVSYDNVPTGATGNFSTQTQQATEASTIDATKETAKGYDAVNV
TQIPGYTSMVSINGATAAAMTTIPAVAAGAADETDVVTYVANQASITVNYVDYFGNPIKT
GTTTFTGNYGDVDNLTTNATTAVAIDGYTLGATDAVNVPATKVSFILDADGNVIATDASG
NPVTSITLTYKTNVTASVSGTRVYDGLDGQDNGATSEQDDYKNLTFVLTDSKGNVLVSNI
DASDIENDAIYYKSADVGKYPGVVNVTGKNLALFKAANPQYDFLSVNSGDYTITAAPVTA
TVTSGGTATKVYDGTAISDYVPSVVFARTDGGTLTPNEGTNLLDQIPAWTSADFTYSLNG
KTVANPTDVGIYKIEFSDAGLAKLAAAKNFAITPVYLGTYTIAAANATATLSTPSFAYDG
TNASAETGLFATVSVTAGTGDDGGSTVMVALTSNDVTFATDGMDAATYDYSLTAAGLATV
QNAVKNYTLTNDNVTSGSVTIDKANATITVDDDAFDYDGASHSIPDGKVNITGAVGDE
NT seq
3237 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatcgtcaaagaaaattgaaacgtttgaaattattacaggatacgggacaggct
aaggaacattttaagatgtataaagtgcgaaaaagttggctgtttgccggcataactgtt
ttgtttttcggaacgggcgttttctttggccatccgacagcatatgctgccactgaggca
gatactagctcgaaaacaccgataacggaagttgcaagcagcagttcttcgtccgaaagt
tctgggagtgagtctgctgcaagtgatggaacaaagagtagtgagactgatgcagtaaca
agtagttcaaatgataagtcgagttctaatgcaagctcggcagctacttcaacagataga
actgctttagcgtcaagcagtacagcacagaaaacaggttcctctgcaacaagctcagca
acttcttcaaatggatcaagtgctgctagttctagtgttgtatccgatcagaacaaatcg
tcgaatgtaaccagttcagttgccacctcaagtaagaatagttcagcagaaacaacaagt
tcaaaggcaagcgatgttgttacaaaagaagctgttccatcatatagaactgcgtcagtt
aagtctttggctacggatgcagtagcaccctcagcaactgaaaaagcggttgatccagtt
aatacaggtagtctagatggcacaaatcccgctggtgcgaatgcagctactagtaatctg
actgcagatgatattccagattcatttgagactactggtgcagccgctataacgagtact
cctggtacaattacactgacgaatggcaaagaacaaaatggttcttatgtttttgataac
caagtggatacctcgcaaaagtttacgcttactggtagttattcaagtactgcttataat
ggcactggtggtggattaggcatcattattcagccggttgacccgcaaaatgctggtaat
aactcgaatacgacagctgatgtaggaattgatggactaaagagcacaacttttgttggt
cgtgatttctatgttgatagttccaaaaatgatacgacttggaatcatcttacaattcgc
ccaacggacgccaatggaaatatggtattgacaccgctagctaatgttacaccgggtgca
aatcagacggctgctgtgacgaagggcgaatattatgtattgacttggacacctacaagt
gttgatgaaacaacgggtactgtgacgggaacgttgaactacacatcttatttggatgca
gctcatacaacaagtgttcaatctactggaaacgttgttactacgttaagtcgggcagtg
tcattggctgcatttggtgcaactggtggtacagcaggcacacaaacggctacagttacg
gcatttacaggaactcgtgtgacaatgccggttgtggttcattacgtagatcaaagtggt
gctccaatttcaactgacaataccattaccgttaacgttggttctacttttggagcaggt
gctaatactttagatagtaatacagctacttctggtatttatcaggcaaaggcaatagat
ggttatacatttggtgcggctactgatcctgtgacggttgttaataccaatattgatacg
agcgctactaatgagattacggttacttatttaaaaaacgctgggactcaaacggttagc
tatgataatgtacctactggtgcaactggcaatttttcaactcaaacccagcaggccaca
gaagcatcaactattgatgcaaccaaagaaactgctaaagggtatgacgcagtaaatgtt
actcagatacctggctatacatcaatggtcagcataaacggggcaactgcggctgcaatg
acaacaattccggcagtagcagctggtgcagctgatgaaacagatgttgtgacctacgtt
gctaatcaggcatcaatcacggttaattacgtagattattttggtaacccaattaaaaca
ggtaccactacgtttacaggcaattatggtgatgtagataatttgacgacaaatgcaact
actgctgtcgccattgacggttacacgttgggcgccactgatgcagtcaatgttcctgcg
acaaaagtttcatttatacttgatgcagatggtaacgtcatcgcaacggatgccagtggt
aatccagttacttcgattacgctaacctacaaaactaatgtaacggcaagtgtttcgggt
acccgggtttatgatggtcttgatggtcaagataatggtgctactagtgaacaggatgat
tataaaaatttaacgtttgtacttactgattcaaagggtaatgtattggttagcaatata
gatgcgtctgacatagaaaacgatgctatctattataaatcggctgatgttgggaagtac
cctggtgttgttaatgttacagggaaaaacctggcactttttaaggcggcgaacccgcag
tatgattttttgagcgttaactcaggtgattacacaattactgccgcaccagtcaccgca
accgttacgtcaggcggtacagcgacaaaagtttatgatggcacggctatttccgactac
gtaccgagcgttgtttttgcacgaactgacggcggcacgttaacacctaatgaaggtacc
aatctacttgatcagatacccgcttggacatccgctgatttcacatattcactgaatggg
aaaacagttgctaatcctacagatgtgggaatttacaaaattgaatttagtgatgcaggt
ttagctaagttggcagctgccaaaaattttgcaattacgcccgtgtatttaggcacctac
acaattgcggcggccaacgcaacggcgacgttaagcacaccaagtttcgcttacgatggt
actaacgcgagtgctgaaactggtttatttgctactgtttcagttacagctggaactgga
gatgacggtggttcaacagttatggttgcattgaccagcaatgatgtcacgtttgctacg
gatggtatggatgcagcaacttatgattatagtttaactgctgctggtttagctactgtt
caaaatgctgttaaaaattatacgttgacaaatgacaatgtgacaagtgggtcggttaca
attgataaagccaacgcgacaattacggtagatgatgatgcctttgattatgatggcgca
agtcattctattccagacggtaaagtcaacattactggcgccgtcggcgatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
