Prevotella denticola: HMPREF9137_0149
Help
Entry
HMPREF9137_0149 CDS
T01459
Name
(GenBank) YD repeat protein (3 repeats)
Organism
pdn
Prevotella denticola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TcdB_toxin_midN
DUF6443
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEA21204
LinkDB
All DBs
Position
163295..165880
Genome browser
AA seq
861 aa
AA seq
DB search
MLRSVTLPFGGHIHISYEQTTPSYDLPGRRWVMSSVETTGGYKENGAVRSRNTFEYSGGY
RDRRERDFYGFKQVRTNQIDTENGDRLYRYSVQTYGKNRDYYAHGLVTSEYLYTADGKKL
QGAVYDYDLKTLAVGNNMTDAVVFPALKTLVQSNFDEASGDSLSVAVSNTYDDYGNLQGY
KETTTAYSLEANINYHKIADKYIVSVPSHIAVSSGGKTYRERSTKVDGNGEITEIMLHNG
DKPSVYNMTYDGYGNITRMTKPENYNHQRMFYAYTYDDLYHSLVTSVKDAYGYSSSTAYD
GLWNAPSVTTDLNGQKMEYTYDALGRQQTIRAPYEIESGQPFTIRFEYFPAERKAHTIHY
SKEGNIDTYTFADSLMRAVQTKQTGVVWSGGSNQKVSIVSGRAVIDAFGRNIAAYYPMTE
SHGNIGTYNHATGDLQAKTEYDAHDRTMSVTLADGSVTRTAYSIGSHDGEPMLQTTVTDA
LGRHAESYTDAKGRNRETVQHARGEDITVKYSYDPVGQVMTVQHPNGRETKYAYDLLGRK
LMVNHPDAGETDMTYDAAGNLLTKLTAELRKSISDKGCISYTYDFERLHEVLYPENLFNR
VTYTYGKAGDKYNRAGRLALVEDASGGEAYYYGRQGEVTKTVRTVMASVADIRTYVYGAT
YDSWNRVQTMTYPDGEVVTYHYNAAGQVERLTSNKQGRQSVIVDRIGYDKEGHTVYTKLG
NGTETTYAYDRQRERLQVMNLTADGQTVMENRYRYDAVDNILGITNATDPTSLTKLNKAK
LGGRSSHTYEYDELNRLIHASGKAKRASYDMVMSFGRMSEPLTKVQKVDSTTIAKSYNFA
YKYEDSNHSTATMSMDATAQT
NT seq
2586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcgctccgtgacgcttcctttcggcggacatatccatatcagctatgagcagaca
actccaagttacgacctgccgggacgccgctgggtgatgtcatcggttgagacgacaggc
ggatacaaagagaacggagcagtacgaagcaggaacacctttgaatacagcgggggctac
cgtgaccgccgtgagcgtgacttctatggtttcaagcaggtacgtaccaatcagatagac
actgagaatggtgatagactctatcggtactccgtacagacttatggtaagaacagggat
tactatgcgcatggacttgttacgagtgaatatctctataccgctgatggaaagaaactg
cagggagctgtctatgactacgacctgaagacactcgccgttggtaataatatgactgat
gctgttgtcttccctgccctaaagacactcgttcaaagtaactttgatgaagccagtggg
gacagtctttcggttgctgtcagcaatacttacgatgactatggtaacctacagggatat
aaggagactacaacagcctatagtttagaggcaaacattaactatcataagatagccgac
aagtatattgtcagtgttccgagccatattgctgtcagcagtggcggtaagacttaccgt
gaacgcagcacgaaggtggacggaaacggtgagataacggagatcatgctccataacggt
gacaagccttctgtctataacatgacttacgatggctatggtaacatcacacgcatgacg
aagccggagaactataaccatcagcgtatgttctatgcttatacctatgacgacctctat
catagtcttgtgacaagtgtcaaggatgcctacggctatagctctagtacggcttatgat
ggtctttggaatgctccgtctgtaacgaccgaccttaacgggcagaagatggaatacacc
tacgatgcactgggcagacaacagacaatccgtgctccgtatgagatagagagcggtcag
ccatttactatccgctttgagtacttccctgcagaacgtaaggcacataccattcattat
tctaaggaaggcaacatagatacctatacctttgccgactcgctgatgcgtgccgtccag
acgaagcagacaggtgtggtctggtctggtggcagcaatcaaaaggtctccatcgtcagt
ggaagggctgttatcgatgcctttggacgtaatattgcggcttattacccaatgacggag
agccatggtaacatcggaacttacaaccatgctacaggtgatctgcaggcaaagacagag
tatgatgcgcacgaccgtaccatgagtgttacgcttgctgatggcagtgtgacacgcaca
gcctacagtatcggtagccatgacggtgaaccaatgcttcagacaacggtcacggatgca
ctgggacgacatgcggagagctatacggatgccaagggacgcaaccgtgaaacggtgcag
catgctcgtggtgaggatatcacggtgaagtacagctatgaccctgtcggacaggtgatg
acggttcagcatcctaacggcagggagacgaagtatgcctatgacttgcttggtcgcaaa
ctgatggtgaaccatcctgatgctggtgaaacggatatgacctatgatgcggcaggtaac
ctcctgacgaaactcacggcagaacttaggaagtcgatatctgacaagggctgcatatct
tacacctacgacttcgagcgactccatgaggtgctttatcctgaaaacctcttcaaccgt
gttacttatacctatggtaaggctggcgataaatataaccgtgccggtcgtcttgccctc
gttgaggatgcgagtggcggtgaagcctactactacggtcgacagggtgaggtgacgaag
actgtacgtacagttatggcgagtgtggcggatattaggacttatgtctatggtgctacc
tatgatagctggaaccgtgtgcagacgatgacttatcctgatggtgaagtggtgacctat
cactacaatgctgctggacaggtggagcgtctgacgagcaataaacagggacggcagagc
gttattgttgacagaataggttacgacaaggaggggcatacggtctatacgaaacttggt
aacggcacggagacgacctatgcctacgacaggcagcgtgaacgtctgcaggtgatgaac
cttacagcggacggtcagactgtgatggaaaacagatatcgctatgatgctgtggataat
atcctcggtattacgaatgctaccgacccaacgtcgctgacgaaactcaacaaggcgaag
ttaggaggaaggagttcgcatacgtatgagtatgacgagctgaaccgccttattcatgca
agcggtaaggctaagcgtgcatcgtatgatatggtgatgtcgttcggacggatgagtgag
ccgctgactaaggtacagaaggtggactcaacgacaattgctaagtcttataacttcgct
tataaatatgaggacagtaaccattcgacggcaacaatgtctatggatgcaacggctcaa
acgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
