Photobacterium damselae subsp. damselae: CAY62_00230
Help
Entry
CAY62_00230 CDS
T04927
Name
(GenBank) ligand-gated channel
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
pds
Photobacterium damselae subsp. damselae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pds00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pds02000
]
CAY62_00230
Transporters [BR:
pds02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CAY62_00230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARR48184
LinkDB
All DBs
Position
I:50808..52637
Genome browser
AA seq
609 aa
AA seq
DB search
MKKSFLAVSVATLCSSFTPLAFAADDVDSNDVMVVTANRFAQPLKTVIAPISVVTKEEID
AIQAKSMAEVLRLLPGIQVVSGGLGQNTEVYVRGTSSKHLLVMINGVRIGSATLGSADFS
QIPLTGIERIELIRGSRAALYGSDAIGGVLNIITAYQPGEQQVQATVSGGSEGYYQVGAS
AAGQIGTEGWGKLAIRTEGNDGFSARQLPYEQDKDGFTSKNAVAELGRHLGDNWKVSLQG
YFHKGKNEYDDADFFGNNKPNPRAENELYNIAGKANYSTERYTSELTLAQNQDKAKNYND
IEVGSEIKTTRLLANWQNHYQVNENWQIGGGTEWHRDKVSNSTQQYSKDQRDNAAFYLTS
IYKLQDWQFEGSARTDDNQSYGRHNTWQLGSSYQITPEVKSYASVGTAFKAPTFNDLYWP
VSGNPDLQPEESTNYELGLSGHHQLLDWSVTAYRNDIDQLIAWAPNATGMWIPQNVDKAK
IKGGELTTGFATGPIYHDISYDYLEPEDAATGNQLIRRSKHNAKWRMSYLLDDWQFDVNT
IYHGSSYEDATNKQKMDAYTLVDLAASYYMTEHLTLRGRIGNLFDADYQTRTSYNTPERT
YYATATYQF
NT seq
1830 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatcttttttagcagtgtcagtagcgacgctgtgctcttcctttacaccgtta
gcttttgctgctgatgatgtcgattctaatgatgttatggtagtaacggccaaccgcttt
gctcaacctttaaaaaccgttattgctcctatctcagttgtaacaaaagaagaaattgat
gcgattcaggcaaaatcaatggcagaagtcctgcgcttgttgcctgggattcaagtggtt
tctggtggcttggggcaaaataccgaagtgtatgttcgtggtacttctagtaaacactta
ttggtgatgatcaatggtgtccgtattggtagtgcgacattaggtagtgctgactttagc
cagatccctcttaccggtattgaacgtattgaactaattcgtggttctcgtgcagcgcta
tatggttcagatgcgattggaggagtcttaaatatcattaccgcttatcaaccaggtgag
caacaagtacaggcgaccgtgagtggcggcagtgaaggttattatcaggttggagcttct
gctgcaggacaaatcggtactgaaggttggggtaagttagctattcgaacagaaggtaat
gatggtttctcagcgcgtcaactgccttatgagcaagataaagatggctttacgagtaaa
aatgctgttgctgagctagggcgtcatctgggtgataattggaaagtgagcctacaagga
tatttccataaaggtaaaaacgaatacgatgatgcggacttttttggcaataacaaacca
aatccgagagcggagaatgagctttataacattgcaggtaaagccaactattcgacggag
cgttacacgagtgaactaacccttgctcaaaaccaagataaagcgaaaaactacaatgac
attgaagttggaagtgagattaaaactacccgtcttctagcaaactggcaaaaccactat
caagtgaatgagaattggcaaattggtggtggaacagaatggcaccgcgataaagtttcg
aacagtactcagcaatacagcaaagatcaacgcgacaatgcagctttctatttaacgtct
atctataaattacaagattggcagtttgaaggcagtgctcgtactgatgataaccaaagc
tatggtcggcataatacttggcagttagggtcatcttatcaaatcacaccagaagtaaag
tcttacgcaagtgtgggtaccgcttttaaagcaccgacatttaatgatctgtattggcct
gttagtggtaacccagacctgcaaccggaagagtctactaattatgagttagggttaagt
ggtcatcatcaattgttagattggagtgttacagcttaccgcaatgatattgaccaattg
atagcttgggcccctaatgcaacgggtatgtggattccacaaaatgtggacaaagctaaa
attaaagggggtgagctcacaactgggtttgcaacaggccctatctatcacgatatcagt
tatgattatctagagccggaagacgcggcaacaggaaatcaattaatccgtcgctctaaa
cataatgctaagtggcgtatgagctatctgcttgatgattggcagtttgatgtgaatact
atttatcatggtagcagttatgaagatgcgaccaataagcaaaaaatggatgcttatacg
ctggtggatctagcagcaagttactatatgacagagcaccttacactgcgtggccgtatt
ggtaatctgtttgatgcagattatcagactcgtacgagctataacactccagagcgtact
tattacgcaacagcaacgtatcaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
