Photobacterium damselae subsp. damselae: CAY62_04295
Help
Entry
CAY62_04295 CDS
T04927
Name
(GenBank) Na+/H+ antiporter
KO
K18218
tetracycline resistance efflux pump
Organism
pds
Photobacterium damselae subsp. damselae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pds00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pds02000
]
CAY62_04295
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
pds01504
]
CAY62_04295
Transporters [BR:
pds02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CAY62_04295
Antimicrobial resistance genes [BR:
pds01504
]
Gene variants
Tetracycline resistance genes
Transporters
CAY62_04295
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Na_H_antiporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARR50675
LinkDB
All DBs
Position
I:931821..933416
Genome browser
AA seq
531 aa
AA seq
DB search
MNFVDYSHSLVSILPPLVALSLAILTRRVLISLGAGIVLGALLLTDFSLGNTFSYLKQTA
TELFVVDGDLNYSNLSILLFLVLLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTKIKSKRGAKLLAAF
LGIFIFVDDYFNSLAVGAIARPVTDRFYVSRAKLAYVVDSTAAPMCVIMPASSWGAYIIT
LIGGILVSHGVTEYSPLSAFMTLAPMNFYAIFALAMVFVVAWFQWDVGPMKKHEMAASHG
RGFDEGDSLDEAKALDEELEIKESDKGRVGDLVWPILVLIFATFFFMIYTGNEGLAAAGK
PFDILGAFENTNVGKSLVLGGTLGLICVLIPVLRQRLPMADVTSTLWIGAKSMFGAILIL
LFAWSIGSVIGDIQTGKYLSTLVQGNINPMLLPVILFCLSGIMAFSTGSSWGTFGIMLPI
AGDLAGATDITLMLPMLAGVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPYAL
SVAFVSAVGFLVLGITDSLPVSFLAATLTFVVMCLGLSWWSRRPVSSTSAA
NT seq
1596 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactttgtagattattcccattctttagtatccatcttaccgcctctggtagcgtta
agcttggctattctgacacgtcgtgtattaatttcattaggtgctggtattgtacttggt
gctttactgttaaccgacttttcattaggcaacaccttttcgtatttaaagcagacggcg
accgaactttttgttgtcgatggcgacctaaattatagcaatttaagcattttgctattc
cttgttttattaggtatgacaacggcactattaactttatctggcggtacacgagcattt
gctgagtgggctcagactaaaattaagagtaagcgtggtgcaaaactactggctgcattt
ttaggtattttcatttttgttgacgactattttaatagcctagcagtaggtgcgattgca
cgtcccgttactgaccgattctatgtatctcgagcaaaactggcttatgttgttgattca
acagcagcacctatgtgtgtaattatgcctgcatcaagctggggtgcttatatcattacc
ttgattggtggcattttagtttctcacggtgtaactgagtactcaccattaagtgcattt
atgacactggctccaatgaacttctatgcaatcttcgccttagcaatggtctttgtggtt
gcttggttccagtgggatgtgggtccaatgaagaagcatgaaatggctgcaagtcatggt
cgaggctttgatgaaggtgattctcttgatgaagcaaaagcattagatgaagagcttgaa
attaaagagagtgataaaggtcgagtaggcgatttagtatggcctatcttagtccttatt
tttgctaccttcttctttatgatttataccggtaatgaaggtcttgcagcagcaggtaag
ccatttgatatcctaggcgcatttgaaaacactaatgtaggtaagtcacttgttcttggt
ggtacgttaggtttgatttgtgtacttattccggtacttcgtcagcgtttacctatggct
gatgtaacaagtacgctatggattggtgcgaaatctatgtttggtgctattttaatcctg
ctatttgcttggagcatcggcagtgtgattggcgatattcaaacaggtaagtacttatca
accttagttcaaggtaatattaacccaatgctattacctgttattttattctgtttgtct
ggcattatggcattctctacgggctcatcatggggtacgtttggcatcatgcttcctatc
gcaggtgatcttgcaggggccacggatattacgttaatgcttcctatgcttgcaggtgtc
cttgctggtgctgtatttggtgatcactgctcaccaatttctgatacaacgattttgtct
tcaacaggcgcgcgttgtcatcatattgatcatgttgcgacacagctcccgtatgcttta
tcagtggcgtttgtttctgctgtaggtttccttgttttaggtattacagattcactacca
gtgagtttcttagcggcaacgttgaccttcgttgtgatgtgtttgggtctgtcttggtgg
tctcgtcgcccggtatcaagcactagcgctgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
