Photobacterium damselae subsp. damselae: CAY62_08565
Help
Entry
CAY62_08565 CDS
T04927
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K26063
(R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase [EC:1.1.-.-]
Organism
pds
Photobacterium damselae subsp. damselae
Pathway
pds00310
Lysine degradation
pds01100
Metabolic pathways
pds01120
Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pds00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00310 Lysine degradation
CAY62_08565
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FAD-oxidase_C
FAD_binding_4
Fer4_8
BBE
Fer4_20
TilS
ORC6_2nd
Fer4_9
Fer4_4
Fer4_18
Fer4_7
Fer4_10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARR49615
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(1854647..1857742)
Genome browser
AA seq
1031 aa
AA seq
DB search
MLPALSQQEALEPTVLAYLTQLENMGFSGDVETSYASRLTVSTDNSIYQQLPQAVVFPKS
LQDLSLLGQAAAAPHFQAIRFSPRGGGTGTNGQSLTSGIVVDLSRHLNQILEINIDQQYV
RVQTGVIKDQLNDALRPLGYFFSPDLSTSNRATIGGMINTDASGQGSLKYGKTSDHVLGL
TAVFADGSILETAPQSPPHYQSPSIEEREDPVETELSFAQQGLQVTAEICAQYRSAIVAK
FPPLNRFLTGYDLKHVYNDDLSQFDLTRLLCGAEGSLAFIAEAKLNITPIPKARTLVNIK
YDSFDAALRHAPMMVEANALSVETIDSTVLNLAKQDIVWTTVSDLLTDVPNKELLGINMV
EYASADEQENGQQVQLLCQKLDQLIADNQAGIIGYQICDDLASINRIYTMRKKAVGLLGA
TKGSRKPIAFAEDTCVPPEHLADFIAEFRQLLDSHQLQYGMFGHVDAGVLHVRPALDMCD
PAQELLMKQLSDHVVALVAKYGGLMWGEHGKGFRSQYGPEFFGAELFTQLRTIKAAFDPD
NRMNPGKICTPLGCDESLVQVDGLKRGTFDRQIPITTRDSFKQAMECNGNGLCFNYDTSS
PMCPSMKVSSDRRHSPKGRAGLVREWLRQLAANGISAEQLEQELLSQKPSVKAIIERWKN
SFGSQRHQYDFSHEVMEAMNGCLACKACASQCPIKVDVPSFRSRFMHIYYSRYQRPAKDY
LVAHIETMLPVMAKAPSLVNGFIKPNWSKKLTAKTLGYIDTPLLSVPTLAERLDGHHATH
FDLTWLQALSDTERQNYVLIVQDPFTSFYEAGVVYDFVELIAKLGKKPMLVPFKPNGKAQ
HIKGFLRQFSQTAANTAEFLNQLAQLNIPMVGVDPALVLCYRDEYKEILAEKRGDFEVKL
AHEWLLTILAERQEKPTLIDNQPWYLFAHCTEKTKLPNAEKEWGTIFAHFGLQLESVAVG
CCGMAGTFGHEQDKLEISKQVYQLSWQPNIEKLDTDRCLATGYSCRSQVKRFEKIQFKHP
VQAILSQLKHR
NT seq
3096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttacctgcactatcacagcaagaagcgctagagcctactgttctagcctatctaaca
caattagaaaatatggggttttcaggtgatgtggaaacctcttatgccagtcgattaaca
gtttcaaccgataacagtatttatcagcaattgcctcaagcggttgtgtttcctaaatca
cttcaagatctgtctttattgggacaagcggctgccgctccccattttcaagcaattcga
ttttctccgcgcggtggtggtacgggaaccaatggacagtcgctcacctctgggatcgtg
gtggatctctcgcggcatctaaatcagatattagagatcaatattgatcaacagtatgtc
agagtgcaaaccggagtgatcaaagatcagctcaatgatgcactgcgtcctttgggctac
tttttctcaccggatctatcgactagtaatcgtgcaaccataggtggaatgattaatacc
gatgcttcaggtcaaggttcactaaaatacggaaagacatctgatcatgtattggggtta
acggcggtatttgctgatggttcaatactggaaactgcgccgcaatcgccaccgcactat
cagtcaccatcgattgaagaacgtgaagatccagtagaaacagagctctcttttgctcag
caagggttacaggttactgctgagatttgtgctcagtaccgctctgccattgtggcaaaa
tttccaccgctgaatcgttttttaactggttacgatttaaaacacgtttataacgacgat
ctgagtcagtttgatttaacccgtttattgtgcggtgctgaaggatctttggcttttatt
gctgaagcgaaattaaatatcacaccaataccaaaagcacggacgttggtgaatattaaa
tacgacagttttgatgccgcactacgccatgctcctatgatggtagaagccaatgctctc
tcggttgagaccattgattccactgtattaaatctggcaaagcaagatattgtttggacg
accgtgagcgatcttttaacggatgtgccaaataaagagctgcttggtattaatatggtg
gagtatgccagtgctgatgagcaagaaaatggtcagcaagttcagttattatgccaaaag
ctcgatcaactgatagccgacaaccaagccggtattattggttatcaaatttgtgatgat
ctggccagtatcaaccgtatttatacgatgcgtaaaaaagcggtaggtctacttggtgcc
acgaaaggaagccgtaagccaattgcttttgctgaagatacctgtgttccaccagagcat
ctggccgattttattgccgagtttcgtcaactgctcgacagccatcaattgcaatatggc
atgtttggccacgttgatgccggggtactgcacgttcggccagccttagatatgtgcgat
ccagctcaagagctattaatgaagcagctatcagatcacgttgtagcgctggtggcgaaa
tatggtggcttaatgtggggagagcatggtaaaggatttcgctctcaatatgggcctgag
ttttttggtgcggaattgtttactcagttacgcacgattaaagcggcatttgacccagat
aatcgtatgaacccagggaagatttgtactcctttggggtgtgatgagtcattggttcaa
gttgatggcctaaaaaggggaacgtttgaccgccaaattccaataaccacgcgtgatagc
tttaaacaagcgatggaatgtaacggtaatgggctctgttttaattatgacaccagctcg
ccaatgtgcccttcgatgaaagttagctccgaccgtcgtcattcacctaaaggacgggca
gggcttgttcgtgaatggttgcgacaattggctgcaaacggtatttctgccgagcagtta
gaacaagagctactaagccaaaagccatcagtaaaagcgatcattgaacgctggaaaaac
agctttggctctcaacgtcatcagtatgatttctctcatgaagtgatggaagcgatgaat
ggctgtttggcttgtaaagcgtgtgctagccaatgccccatcaaagtggatgttcctagc
ttccgctctcgctttatgcatatttactacagtcgttatcagcgtccagccaaagattat
ttggtggcccatatcgaaacgatgttacctgttatggcaaaagcaccgagcttagtgaat
ggatttattaagcctaattggtcgaaaaagcttactgccaaaacattaggctatattgat
acaccgcttttatcggtgccaacattagctgagcgcttagatggacatcatgcaacccac
tttgatttaacttggctccaagctctctctgatactgagcgacaaaattacgtgcttatt
gtgcaagacccgtttaccagtttttatgaagctggcgtggtgtatgacttcgttgaactt
attgcgaaattaggtaaaaaacctatgttagtgccctttaaacccaatggtaaggcacaa
catatcaaaggctttttacgtcaatttagccaaactgcggctaatacggctgagtttctt
aatcaactggcgcagctaaatattcctatggttggggtcgatcctgctttagttttatgt
tatcgcgatgaatataaagaaattttggcagaaaagcgtggcgattttgaagttaaattg
gcccatgaatggttactgacgattttagctgagcgtcaagaaaagccaacgctaatcgat
aatcaaccttggtatctatttgctcattgtacggaaaaaactaagctaccaaatgcagaa
aaagagtgggggacaatctttgctcattttggtttacaattagaatcggtcgcggttgga
tgttgcggcatggcagggacgtttggtcatgaacaagataaattggagatatcaaagcag
gtttatcagctaagttggcaacctaatatcgaaaaactggatactgatcgttgtttggca
acaggatattcatgtcgaagccaagtaaaacgatttgaaaagattcagtttaagcatcct
gttcaggctattctttctcagttaaagcaccgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
