Prunus dulcis (almond): 117616155
Help
Entry
117616155 CDS
T07328
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: pentatricopeptide repeat-containing protein At2g04860
Organism
pdul
Prunus dulcis (almond)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
Alpha-amyl_C2
PPR_3
Alpha-amylase
E_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117616155
NCBI-ProteinID:
XP_034201271
LinkDB
All DBs
Position
1:33911679..33917527
Genome browser
AA seq
1108 aa
AA seq
DB search
MNFLLSFCFCLCVSRLPSFATPAVLFQGFNWDSSKKGGWYNSLKTTIPELTSSGITHVWL
PPPSHSHGTEGYDPGRLYDLDASSYGNKDELKSLIATMHEKGIKAIADIVLNHRSAVKQD
DNGIWSIFEGGTEDGRLDFNASLICRDDNDHPFGTGNPDTGDNFPYTADVDHTNPRLQTE
LSDWLNWLKTDIGFDGWRLDYVIGYGSSFTKLYMEKTSPEFAVAEYWRGNISKGQDGKLD
QNQDAHRNEIVNWIEAAGGVVTAFDLTTKYILNVAVEGELWRLKDSNGKPPGLIGIKPES
AVTFIDNHDTWSQGLLPFPDDKVLLGYAYILTHPGTPSIFYDHFFDWGWPKEPIRNLTAI
RARNGINSRSSVTILAAEADLYMANIDDKIIMKIGPRLGLGDLDPTKSNFHVATSGQDFA
VWEKNXTRKKKASCTSSSSSSSSPALNSLNVKREANQIHTHLLKSGVDRFMYVSTALLDL
YMKLGCVRNAHRLFDDMPDRDVVSWNALICGFSRNGCDFEALKLFVQMCKEGFFPHQTTL
VSLVPSCGRQELVSQGKSIHGFGIKAGLYSDSHVKNALTSMYAKCADLEAAEHLFEEIVE
KSVVSWNTMIGAYGQNGFFDEAVLAFKRMQEENVPANLVTMVSLLSANADPESTHCHATK
TGLVNDASVITSLICQYATRRNTESGKLLYKSLPQKNLVSLTALMSSYTEKGDLFQVMSC
FAHLQQLEMKLDAVAMVCILHGMKDPMDFRLGLAFHAYGLKSGLSADSLVANGLISLYSR
FDKIETAFSLLSEIHEKTLISWNSLISGCVQAGRPSDALEVFFQMKMSGHSPDAITISSL
LSGCCQLGYLQFGERLHNYILRNNLEVEDFVGTALIDMYIKCGRIEHAERVFKSIEEPCL
ATWNSMISGYSLYGLEHEALACFSEMQKQGIKPDKITFLGVLAACTHGGLVQEGRKHFQI
MREQFNMVPDLQHYACMVGLFGRAGLFEEALMFIRNMEMEPDFAVWATLLSACCIHQEVK
LGEYVARKLFFLDSNNGGFFVLMSNLYAVKGMWDEVARVREMMRESGGDGCSGISVIEMT
SLEDMNVNLSSSKSSLNANAWQPLLSLY
NT seq
3327 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttctcctttcgttctgcttttgcctctgcgtttctcgtttgccctccttcgca
actccagctgtgttatttcaggggttcaattgggattcaagtaaaaaaggaggatggtac
aactccctcaagaccaccattcccgaactcactagctctggaattacccatgtctggctt
cctcctccttctcactctcatggaactgagggatacgacccgggaaggctatacgatctc
gatgcatcaagctacggaaataaggacgaattgaagtccctgattgctactatgcatgag
aagggaatcaaagccatcgctgacattgtgttaaaccacagatcagctgtcaaacaagac
gataatggaatatggagcatctttgaaggtggaacagaagacggacgtcttgacttcaat
gcctcattgatctgcagagatgacaatgaccatccttttggaactggaaatccagacaca
ggggacaactttccttacactgctgatgtggaccacaccaatccaaggctacaaaccgag
ctctctgattggttgaattggttgaaaactgatatagggtttgatggatggaggttggat
tatgtgattggatatggctccagcttcaccaagctctacatggaaaagacttcaccagaa
tttgcagttgctgagtattggcgtgggaacatttcaaaagggcaggatggcaaacttgac
cagaaccaagatgcacataggaatgaaatagtgaattggatcgaggctgctggtggcgtt
gtcacggcgttcgatttgacaaccaagtacatcttgaatgttgctgtggagggtgagcta
tggaggctcaaggattctaatggaaaaccaccaggtttgattgggatcaaaccagaaagt
gctgtaacatttattgacaatcatgacacttggtctcagggacttttgcctttcccagat
gacaaagtcctgcttggatatgcttacattctcacccatcctgggaccccaagcatattc
tatgatcacttctttgactgggggtggccaaaggagcctatacgcaatttgactgcaatt
agggcaaggaatggaataaattccaggagcagtgtgactattttagctgccgaggctgat
ctatatatggccaacattgatgacaagattatcatgaagattgggccaagattgggcctt
ggagaccttgatcccacaaagtcaaacttccacgttgccaccagtggacaagacttcgct
gtttgggagaaaaattgaactagaaagaagaaagcttcctgtacttcttcttcttcttct
tcctcctccccagctttaaattccctgaatgttaaaagagaagcaaatcagattcatacc
cacttgctaaaatcgggtgttgaccgattcatgtatgtgagtactgctcttcttgatttg
tatatgaaactgggatgtgttagaaatgctcataggctgtttgatgatatgcctgacaga
gacgttgtctcttggaatgcgttgatttgtgggttttcgcgaaatgggtgtgattttgaa
gcgttgaaactctttgttcaaatgtgtaaagagggattttttcctcatcagacgactttg
gttagtttggttccatcttgcggtaggcaagagttggtttctcaagggaaatctattcat
gggtttggaattaaggcgggcctttattctgattctcatgtgaagaatgctcttacctca
atgtatgctaaatgtgcagatttggaggcggcagagcatttgtttgaggagatagttgag
aagagtgtagtttcttggaatactatgattggtgcttatggacaaaatggcttctttgat
gaggcagtgcttgcctttaaacgaatgcaagaggaaaatgttccagccaatctggtgacc
atggtaagccttctgtcagcaaatgccgatccagagtctacccattgtcatgccactaaa
actggtcttgtcaatgatgcttctgtaattacttcattaatttgccaatatgcaacacgc
aggaacacagaatccggcaaacttctttacaagtcattgcctcagaagaacttggtttcc
ctaactgcacttatgtcaagctatactgagaaaggtgacctgtttcaggtgatgtcgtgt
tttgctcacttgcagcagttagaaatgaagcttgatgcagttgctatggtttgcatcctt
catgggatgaaagatcccatggactttcgtcttggacttgcttttcatgcttatgggcta
aagagtgggttgagtgctgattctttggttgcaaatgggttgataagcctgtactcgagg
tttgacaagatagaaactgctttctctttactttctgagatacatgagaaaacattgatt
agttggaattctttgatatcgggctgtgtacaagctggaaggccaagtgatgccctagag
gtttttttccaaatgaaaatgtctggacacagtccagatgccattaccatctctagctta
ctatcaggttgttgccagcttgggtacttgcaatttggggagaggcttcataactatatc
ctaagaaacaatctcgaagtggaagattttgttggaactgctcttatagacatgtacatc
aagtgtggaagaatagagcatgctgaaagggtgtttaagagcatcgaagaaccgtgcttg
gcaacatggaactcaatgatctcgggttatagcttatatgggttagaacatgaagctctt
gcttgcttctcagaaatgcaaaagcaggggataaagcctgataaaataacttttttggga
gttttagcggcttgtactcatggaggtcttgttcaggagggaagaaaacatttccaaatc
atgagggaacagttcaacatggtgccagatttgcaacactatgcttgcatggttggtctc
tttggtcgtgctggcttgttcgaggaggcattaatgttcatcagaaatatggaaatggag
cccgatttcgcagtgtgggcaaccttgctgagtgcttgttgcatccatcaagaggtgaag
cttggggaatatgttgccagaaagttgtttttcttggacagtaacaatggtggattcttt
gtgttgatgtcaaatctttatgcggttaaaggaatgtgggatgaagtagctagggtgagg
gagatgatgagagagagtggaggggatggctgttcaggaattagtgttattgagatgact
tcattggaagacatgaatgtaaacttaagctcgagcaagtctagtttgaatgcaaatgct
tggcaacctctactctctctatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
