Prunus dulcis (almond): 117628105
Help
Entry
117628105 CDS
T07328
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g22760
Organism
pdul
Prunus dulcis (almond)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
PPR_long
E_motif
TPR_7
TPR_1
RTP1_C1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117628105
NCBI-ProteinID:
XP_034216362
LinkDB
All DBs
Position
5:8281883..8284062
Genome browser
AA seq
578 aa
AA seq
DB search
MNPNGPNLVFLLNKSITLNQLKQIHAPIITNGLNELQSLLLRQVLHSNFTYSRTIAQYVH
QILHNLQNPDDFSWGCAIRFFSLHFQYKTALSLYVQIKRLGLCPTSFAVSSALRACARIV
HKVGGISIHAQIHKYGFCGCVYVQTALVDLYSKLGDMETARKVFDGMTEKNVVSWNSILS
GYLKAGNMEEAQVVFDEIPNKDVVSWNSMVSGYARIGNMDKAFFLFQQMPERSSASWNAM
ISGFADCGRMESARSIFDSMPLRNKVSWIAMISGYSKCGNVESARQVFDQMSEKDVLSFN
AMIACYAQNSQPKDALELFNQILKREVNIQPNEMTLASVISASSQLGDLKFGLWIETYMS
KDGIELDDHLATALLDLYTKCGDIERAYKLFHGLKKRDVVAYSAMILGCGINGKAVDATK
MFEEMVSAQICPNSVTYTGLLTAYNHAGLVEEGYRCFNSMNDHGVEPSGDHYGIMVDLLG
RAGQFDKALELIRSMPMQPQAGVWGALLLACSLHNNVELGEIAARNCFKLEPDKSGYYAL
LANIYASAERWDDARRLRKVMEKKGFTKIPGCSWMQSI
NT seq
1737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccaaatggtccaaatctagtatttttactgaataaaagtataaccttgaaccaa
ctaaaacaaatccatgcacccattatcaccaatggccttaacgagcttcagagcctcttg
ctccgccaagtcctccactcaaatttcacttactctagaactatagctcagtatgtgcac
caaatccttcacaatttgcaaaacccagatgacttttcatggggttgtgccattcgtttc
ttctctctgcatttccagtacaaaacggctttgtctctttacgttcaaatcaaaaggcta
ggactgtgcccaactagttttgctgtgtcctcagctctaagggcatgtgctaggattgta
cataaggtgggtgggatttcaatccatgcccagattcataagtatgggttttgcggctgt
gtttatgtacaaactgcccttgtggacttgtattctaaactgggtgacatggaaactgca
cggaaggtgtttgatggaatgacagagaagaatgtggtttcttggaattctatcttatct
gggtatttgaaagctgggaatatggaagaggctcaggtggtgtttgatgagattccgaat
aaggatgttgtgtcttggaattcaatggtttcggggtatgcaagaataggaaatatggac
aaggcgtttttcttgtttcaacaaatgccagagaggagttcagcttcttggaatgcaatg
attagtggttttgcggattgtggaagaatggaatcggcacgaagcatttttgattccatg
ccattaagaaataaagtttcttggattgccatgattagcgggtactcaaaatgcggcaat
gttgagtctgctcgtcaagtctttgatcagatgagtgagaaagatgtgctttcgtttaat
gccatgatagcttgctatgcgcaaaatagtcaaccaaaggatgcccttgagctgttcaac
cagatacttaaacgggaggtgaatattcaaccgaatgagatgactttggcgagtgttata
tctgctagttcacaactgggagatttgaaatttgggttatggattgagacatatatgagt
aaggatggaattgaattagatgatcatttggctactgctttacttgacttgtacacaaaa
tgtggagacattgaaagggcatataagttgtttcatggcttgaaaaagagagatgtagtt
gcttattcggcgatgatcttgggttgcggcataaatggtaaggcagttgatgcaaccaag
atgtttgaggagatggtaagcgcccaaatttgcccaaattcagtcacatacactgggcta
ctaactgcctataaccatgctggtttggttgaagaaggctaccgatgctttaattcaatg
aatgaccatggagttgagccttcaggcgatcattatgggatcatggtcgaccttttaggc
agggcaggacagttcgacaaagcacttgagctaataaggagcatgccgatgcaacctcaa
gctggggtgtggggagctttgcttcttgcttgctcattacacaacaatgttgagcttgga
gagattgccgctcggaattgctttaaattggagcctgataaaagcggttattatgctctt
cttgctaacatttatgcttctgctgagagatgggacgatgcgaggagattgagaaaggtt
atggagaagaaaggattcaccaagattcctgggtgtagctggatgcaatcaatttga
DBGET
integrated database retrieval system
