Prunus dulcis (almond): 117632224
Help
Entry
117632224 CDS
T07328
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pdul
Prunus dulcis (almond)
Pathway
pdul03015
mRNA surveillance pathway
pdul03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdul00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
117632224
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
117632224
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pdul03041
]
117632224
Spliceosome [BR:
pdul03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
117632224
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117632224
NCBI-ProteinID:
XP_034221550
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(3624282..3628212)
Genome browser
AA seq
484 aa
AA seq
DB search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NT seq
1455 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgggatgtacggtcaagagggtggcgatggcgcccctccgccatatggatccagc
ggcagtggtggctatggtggctctggaggctacggaagcggtggtggaggctatggaggt
ggtggtggaggtggaggatatggaggaggtagtggtggtggttatggaggtaagggcggc
gatggaggtggttacggcggtggaggccgtggtggacgaggtggtggaggttatggcggc
ggtggtggtcgaggcggaggatatcaaggaggagatcgcggtggccgaggtgccgaccgt
ggtggtggtggcagaggtggccgcggtggcagcggaagagatggtgattggctttgccct
aacccaggctgtgggaatttgaactttgcaagaagagttgagtgtaacaagtgtggaacg
ccctctcctgcgggtggcggtggtgatcgtggcggcggcagtggcggcggcggttataat
aggggaggaagtggtgggggctatggtggtaaccgtggcggtagaggtggtaattatgat
gggggtcgaagtagtaactatgaaggaggtaaaagtagcagttatgatggaggcagaggg
ggtaattttgatggtagaggtggaggtggtagtagaggtggttcttatggcagtaaccaa
ggaagagatgatggtgggtacggtcaggttcctccacatgcgccgccgtcctatggtgca
gctggaggcaattacccaccatcttacaatgctagttatggaacagatgcagttcctcct
cctacaagctatactggtgggcctacatcatatcccccatcctatggtggtcctgcgggt
ggttatgctggtgatggtccgggtgatgcaaggagtggtggccgaggtggccctcctgct
aaatatgatggtggttatggtgccggtggtcgaggtggatatggtggtgctgctacggaa
gccccagctaaggtgaagcaatgcgaccagaattgtgatgaaacttgtgacaatgctaga
atctacatatcaaacttgccaccagatgttactgttgacgaactgcagcagctttttgga
ggcattggacaagtgggaagaatcaagcaaaaacgtggctataaggaccaatggccatac
aatatcaaaatatacacagatgaatcgggaaaaaacaaaggcgatgcatgtttagcatat
gaagatccgtctgctgcacattcagctggtgaattttacaatgattacgagttaaggggc
tataagatcaatgttgcgatggcagagaggtcggcacctagggctccgcttgaccagggg
cggcatactgatttatttttctgtgcaaacagcggtggtagaggtggatatgggggcggt
gggcgcagggataattatagagatggtggacctgatagacatcaacatggcggaaaccgt
gcacgtccttattga
DBGET
integrated database retrieval system
