Entry |
|
Name |
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X1
|
KO |
K22128 | piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2 |
|
Organism |
pdul Prunus dulcis (almond)
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:pdul00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:pdul04131]
117636475
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:pdul04040]
117636475
Membrane trafficking [BR:pdul04131]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
117636475
Ion channels [BR:pdul04040]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
117636475
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
8:19298318..19311905
|
AA seq |
2485 aa
MGRFLGGFVLPLLLLTAAFINWSLLSLVDLVAFLLILFNAPKIGFHFGRRLLLLWLIVIF
SLFVIFSQVIYLVIWAIEGNKWIGAGAWWANLIGFMILQSWKSPSVLYFLLLQLSVVAVA
LVDLYGNRFGLVSSCDSCWGRFSSAVERLICSHLRVASCLLLPAIQLVVGISHPSWVSLP
FFIGSCVGLVDWSLTSNFLGLFRWWKPFHLYAGFNIVLLYVYQLPVEFPDMLQWIADFIG
LFKITLHSDWTEVCSSLSLLLFYIMLSCVKCDLEEMDFILSMKENNLTEQLLPSKHSFFI
RESRSGVRHTNVLLTGAVFRTFSINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASVCAFGLLAYVGYI
IYAFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVAFAFLNWKIGKNTDIWEMVGLWHYPIP
GFFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLCLSDEDGRFSNDNSTVEGEGETKVLIVATIAWGL
RKSSRAIMLLLIFLIAMKPGFIHAVYVIFFLIYLLSHNISRKIRQSLILLCEVHFALLYI
IQINPISDTLERKGSLSAEVLSQLGLLQHESSWDFLKIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSA
IVQHTPSRPVGFSILKAGLNKSVLLSVYASSAIKYSHDNPSYERRIALFLSAIGQKFLSV
YRSCGTYIAFLTILLTVYLVRPNYVSFGYIFLLLAWIIGRQLVERTKKRLWFPLKAYAIV
VFIFIYSLSSFRSIEVWLSRLIDLHFYLGYDSEASSLENVWESLAVLIVMQLYSYERRQS
RYNKSDDADVLEFGVLGFIKRFVVWHSNKILFIAVFYASLSPISTFGFLYLLGLVICSTL
PKASRIPSKLFLVYTGFLVTAEYLFQMWGRQAAMFPGQKHSNISLLLGFRVFKPGFWGLE
FGLRGKVLVIAACTLQYNVFRWLEKMPSTILNKGKWEEPCPLFVSAEDANINSSIPSEEN
KPSTDSEALSVKREGARSHSWPFFSPGLSESHNPMSPRAGGSEGSSSNKYSFGYIWGSTK
ESHKWNKKRILTLRKERFETQKLISKIYLKFWMENMFNLFGLEINMIALLLASFALLNAI
SLVYIALLATCIILNRHIIRKIWPILVFLFASILILEYFAIWKSMWPSNHPDETNARCHD
CWKISTMYFSYCKYCWLGLIVDDPRMLISYFAVFMFACFKLRADRLSGFSVSSTYRQMIS
QRKNIFVWRDLSFETKSMWTFFDYLRLYCYCHLLDLVLALVLITGTIEYDILHLGYLAFA
LVFFRVRLEILKKRNKIFKFLRIYNFALIVLSLAYQSPFVGEFCAGKCETVDYIFEMIGL
YKYDYGFRITARSALVEIVIFMVVSLQSYMFSSQEFDNVSRYLEAEQIGAIVREQEKKAA
WKTAQLKHIRESEEKKHQRNLQVEKMKSEMLNLQIQLHSMNSVTNCGDSPPVSEGLRRRR
STSLNSNNDAGTPDKEGLPMKKEQILKEDSLYPYELHQSPATVNMENPTVVESMKDSMES
FHCEITEVEDVTDGVLFYSSEKKEKVKGQAKESPLISAVHLIGDGVSQVQSIGNQAVNNL
VSFLNIEQESDINEHSSVEDGVYDEMESQNTKYMCFNRSSSLQSDTSSDPTSLQLGRIFR
HIWSQMRSNNDIVCYCCFVIVFLWNFSLLSMVYLAALFLYALCVNSGPSYIFWVIMLIYT
EVYILLQYLYQIIIQHWGLSVASDLLREWGFPAHKITSSFVVSSLPLFLVYLFTLIQSSI
TAKDGEWMSSTDFDFYRRSAFHGKEVPVSYSWSEKTKELLHIMGNAIKLIIRSFFRYWES
LTQGADSPPYFIQVSMDVRSWPDDGIQPERIESGVNQLLRIIHDERCKQKTPTPCPFASR
VHVQSIERSQENANVALVVFEVVYASPITECASVEWYNSLTPAADVAKEILQAQNAGFVE
EIGFPYPILSVIGGGKRDVDLYAYVFGADLTVFFLVAIFYQSVIKNKSEFLDVYQLEDQF
PKEFVFILMIIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIFYLFNLILFTYSVTEYAWHMEPSHQHAG
GLALRAIFLAKAVSLALQAIQLRHGIPHKSTLYRQFLTSEISRINYLGYRLYRALPFLYE
LRCALDWSCTTTSLTMYDWLKLEDIHASLYLVKCDAVLNRAKHKQGEKQTKMTKCCNGIC
LFFILICVIWAPMLMYSSGNPTNIENPIKDASVQVDIKTASGRLSLYQTTLCKKLQWDKL
NSDVNLDPKGYLDTYNQKDVQLICCEADASTLWLIPNVVQTRFIQSLDWDTHMDISFTWV
LSRGRPKGKEVVKYERSVDPQDLPKQSDVQKVLNGSINSFRIYNVYSRYFRVTGSGDVRP
LELEDNFVSADLVINRANYIWWSFHDINSSDVNGCGGLRGPMAIIVSEETPPEGILGDTL
SKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGV
EEVLYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD |
NT seq |
7458 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggggagatttcttggcgggtttgtgttgcctctgctgctgctaacagctgcttttatc
aactggagcttgctctcccttgttgatttggtagcatttcttcttattctatttaatgca
ccaaaaataggatttcattttggaaggaggcttttattattgtggctcattgtcatattt
tctttatttgttattttttctcaagtgatatatcttgttatatgggctattgagggaaat
aaatggattggagcaggtgcttggtgggcaaatcttattggattcatgatattgcagtca
tggaaatctccctctgtgctatattttttgctcttacaactatcagtcgtagctgttgct
ttagttgatttgtatggaaacagatttggtcttgtttcatcgtgtgattcatgttggggt
cgattttcgtcagctgttgaacgattaatttgttctcatcttagggttgcttcctgcttg
ctgttgcctgccattcagctggttgttggaattagccatccctcatgggtttctctacca
ttttttattgggagctgcgttggtcttgtagattggtctttgacaagcaattttttagga
cttttcaggtggtggaagccttttcacttgtatgcaggcttcaacattgtcttgctttat
gtgtatcagctacctgtggagtttccagacatgttacaatggatagctgatttcattggt
ctgttcaagataactttacattcggattggactgaagtttgttcaagcttatctctttta
cttttctacatcatgctatcctgtgttaaatgtgatctagaggaaatggattttatttta
tccatgaaagaaaataacttgaccgagcaacttcttccttcgaagcattcattttttatt
cgtgaatctagatctggtgtaaggcataccaatgttttgttgacgggagcagttttccgg
acctttagtatcaacttcttcacatatggattcccggtgtccttgtttgctctttctttt
tggagttttcattttgcaagtgtttgtgcattcgggctacttgcatatgttggctacatc
atatatgccttcccttccttattccgtttgcatcgactgaatgggctgcttcttgtcttc
attctcttgtgggctgttagcacatatattttcaatgtagcatttgcattcctgaattgg
aaaattgggaagaacacggacatatgggagatggttgggttgtggcattatcccatacct
ggattctttctgcttgcacagttctgtcttggaatattggttgccttgggtaatcttgtg
aacaactcagttttcctttgcctgtctgatgaggatgggcgattttcaaatgacaacagc
actgtagaaggtgagggagagaccaaagtattgattgtggccacaattgcttggggactg
cgcaaaagctctcgagctatcatgctgttactgatatttctcattgccatgaaacctggt
ttcatccatgctgtgtatgtgatattctttttgatatatcttttgagccacaacattagc
agaaagatacgccagtctttgattctcctatgtgaggttcactttgcactattgtatatc
attcagattaatccgatctctgatactttggagcgaaaaggctctttgagtgcagaagtt
ttatcacagttaggtctccttcaacatgaaagctcgtgggattttttgaaaatagctttg
cttgcttgcttctgtgcaattcataaccatggttttgaaatgctgttttcattctcagca
attgtgcagcatacccctagccgtccagttggatttagcattttgaaagctggcctgaac
aaatcagttttgttgtcagtgtatgcctcctcagccattaagtacagccatgataatcct
tcttatgaaagaagaatagcattattcctcagtgctattgggcagaagtttttatctgtg
taccgatcatgtggaacctacattgccttccttactattctccttactgtatacctggtg
agacccaattatgtatcatttgggtacatattccttctccttgcttggataattggaaga
caacttgttgagagaacgaaaaagcgcctttggttcccattgaaagcatatgcaattgtg
gtgtttatctttatctatagcttgagcagtttccgcagcattgaggtttggttgtccagg
ttaatagaccttcatttctatctaggctatgactcagaagcttcatctttggaaaatgtt
tgggaatccctagcagtcttgattgtgatgcaactttatagctatgagaggagacaaagc
aggtataacaagtcagatgatgctgatgtgttagaatttggagtgcttgggtttataaag
cggtttgtcgtttggcacagcaacaagatcttgtttattgcagtattctatgcatcttta
tctccaattagtacatttggatttttgtatctacttggccttgtcatctgttcaacttta
cctaaagcttcacggatcccgtctaaattattcttggtttacacaggatttctagtaaca
gctgagtatctttttcagatgtggggtagacaggctgcaatgtttcctggacaaaagcac
tctaatatttcccttcttttgggtttccgtgtatttaaacctggattttggggtctagaa
ttcggcttgagaggaaaagtgctggtgattgctgcgtgtacccttcaatataatgttttc
cgctggttggagaagatgccaagtactatcctaaacaaaggaaagtgggaagagccttgt
ccattgtttgtctcagcagaagatgccaatattaattcttccatccctagtgaggaaaac
aagccatcaacagattctgaagcactttctgtgaaacgagaaggggctaggagccattca
tggccatttttctccccaggtttatcggaatcccataatcctatgtcccctagagcagga
ggttctgagggtagtagcagtaacaagtactcatttgggtacatttggggcagcaccaag
gagagtcataagtggaacaagaaacggattcttaccttgagaaaggagagatttgaaaca
cagaagcttatctcaaaaatctatctgaaattctggatggaaaatatgttcaacctcttt
ggtcttgagataaacatgattgcattgcttcttgcaagctttgctttgttgaatgccatt
tctttggtatacattgcgttacttgctacttgtattattttgaatcggcatattatacgt
aagatatggcccatacttgttttcctgtttgcatccattctcatcctcgagtactttgcc
atctggaagagtatgtggccttcaaatcatcctgatgagactaatgcacgttgccatgat
tgctggaaaatctcaactatgtatttcagttactgcaagtactgttggttaggacttatt
gttgatgatccgcgaatgcttatcagctattttgctgtcttcatgtttgcttgtttcaaa
cttcgtgctgaccgtttgtccggcttctcggtgtcatcaacttaccgtcaaatgatatct
caacgtaaaaatatatttgtgtggagagacctctcgtttgaaaccaaaagcatgtggacc
ttctttgactacctgaggctttactgctactgccacctattggatcttgtgctagcattg
gttttgattactggaaccattgagtatgacattctgcaccttggttatcttgcttttgcg
ctggttttctttcgggtgagacttgaaatcctaaagaagaggaacaagatattcaagttc
ttgcgaatatacaattttgctcttattgttctttctcttgcatatcaatctccctttgtg
ggggagttttgtgctggaaagtgtgagacggtagattacatatttgagatgattggactt
tataagtatgactatgggtttcggattactgcaagatccgctctggttgaaattgtcata
tttatggtggtatcacttcagtcatatatgttttcctcccaagaatttgataatgtttct
cgatatcttgaagctgagcaaattggtgccattgtgcgtgagcaagaaaagaaagctgcc
tggaaaactgcacagttaaaacacattcgtgaatccgaggagaagaaacaccagcgcaac
ctgcaagtggagaaaatgaaatcagagatgctcaacctgcaaatccagcttcacagcatg
aactcagttactaattgtggtgactctcctcctgtcagtgaaggcctaagaaggaggagg
agtacttctcttaactcaaataacgatgctgggacccctgataaagaaggattacccatg
aaaaaggagcagatacttaaagaggattcgttgtacccttatgaattgcatcaatctcct
gcaacagtgaacatggaaaacccaacagtggtggagtctatgaaggattcgatggaatct
tttcattgtgagatcactgaagtcgaagatgttactgatggtgtattattttattcttca
gaaaagaaggagaaagttaaagggcaagcaaaggaaagcccactcatctctgcagttcat
ctgataggtgatggcgtttcccaggtacagtctattggaaatcaggcagttaacaaccta
gtaagctttttgaacattgaacaagagtctgatatcaacgagcactcttcagttgaggat
ggggtatatgatgagatggagagccaaaacactaagtatatgtgttttaaccgttcatct
tccctgcagtccgatacgagttctgatcccacaagtctgcagttaggaaggatctttcgt
cacatatggtcccaaatgcggtccaataatgatattgtgtgttattgttgctttgtcatt
gtcttcttgtggaacttcagtttgctttctatggtgtatctggcagcgttattcttatac
gccctatgtgtaaattctggtccaagttacatcttctgggttattatgctgatttacaca
gaagtctatattttgcttcagtatctgtaccagattatcatccagcactggggtttgagt
gttgcttcagacctacttcgtgagtggggatttcctgcacataaaatcacttcttctttt
gttgtcagttcattgcctctctttcttgtctacttatttaccctcatacagagctctata
actgcaaaagatggtgagtggatgtcgtctacggacttcgacttctataggaggagtgct
ttccatggaaaagaggttcctgtaagttatagctggagtgagaaaacaaaggagctgctg
cacataatgggaaatgcaataaaattgataatcagaagcttctttaggtactgggaatca
ctgacacagggagcagattcccctccttactttattcaggtgtctatggatgtccgctca
tggccggacgatggaattcaaccagaaaggattgagtctggagtaaatcaattgcttaga
atcatccatgatgaaaggtgcaagcagaaaacccctactccatgcccttttgctagtagg
gtgcatgttcaaagcattgaaaggagtcaagaaaatgcaaatgtagcgttggttgttttc
gaggtggtatatgcctcccccataacagagtgtgcttcggtagaatggtacaattcactt
actccagcagctgatgtggcgaaggaaattctacaagcacagaatgctggatttgttgaa
gaaataggattcccataccctatactctctgtaattgggggaggcaaaagggacgttgat
ctgtatgcctatgtgtttggtgccgatctgactgttttctttttagtcgccatattctac
caatctgtcataaaaaataaaagtgaatttctggacgtgtatcagcttgaagatcagttt
cctaaggagtttgtgttcatcttaatgatcatctttttcttgattgtccttgatcgcata
atctacctctgctcatttgccactggaaaagtaattttctaccttttcaacctcatcctc
ttcacatattcagttacagagtatgcttggcacatggagccttcccaccaacatgctgga
ggattagcacttcgtgctatatttcttgcaaaagcagtttctctggcactgcaggctata
caactccgacatggaattcctcataaaagcactttgtaccggcagtttttgaccagtgaa
atttcacgaattaattacttaggatatcgactatatcgcgctctgccattcctttatgaa
ttgagatgtgcacttgactggtcatgcacaaccacatctttgaccatgtatgattggcta
aaactggaggacatacatgcgagcttgtaccttgtcaaatgtgatgcagtcttgaataga
gcaaagcacaagcaaggagaaaagcaaacaaaaatgaccaaatgctgcaacggcatatgt
cttttttttatattgatttgtgttatttgggctccaatgctgatgtatagcagcggtaac
ccgaccaacattgaaaaccccattaaagatgccagtgttcaggttgacatcaagacagcg
agtggaaggttgagtctgtatcaaaccaccctctgtaaaaagctccaatgggataagctc
aactctgatgttaatcttgatcccaaaggttatttggatacgtataatcagaaggatgtc
cagttgatatgctgtgaagctgatgcaagtactctgtggcttatccccaatgtggttcag
acaagattcattcagtcccttgattgggacacccacatggatatatcttttacttgggtg
ctttccaggggcaggcccaaaggcaaggaagttgttaaatatgaaagaagtgtggatcct
caggatcttccaaaacaatcagacgtccagaaagttcttaatggctctataaacagcttt
aggatatacaatgtttattcaagatacttccgcgtcactggttccggggatgtaagacca
ttggaactagaggataattttgttagtgcggatcttgtcataaatcgtgctaattacatc
tggtggtccttccatgacatcaattcatccgacgtcaatggatgtggaggtttgagagga
cccatggccatcattgtatctgaggaaacaccgccagagggtattcttggtgacaccctt
agcaagttcagcatctggggtctctacataacatttgttcttgctgttggccgctttatc
agacttcaatgctctgacttaagaatgagaatcccctacgagaaccttccttcctgtgat
aggttgatagccatttgtgaggatatatatgctgcaagagcagagggtgagcttggagtt
gaagaggtcctttactggacgctggtgaagatttacaggtcaccacacatgctgctcgaa
tacacaaaacccgactag |