Pseudoalteromonas distincta: FFU37_13230
Help
Entry
FFU37_13230 CDS
T08139
Name
(GenBank) ROK family transcriptional regulator
Organism
pdv
Pseudoalteromonas distincta
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ROK
MarR_2
HTH_24
HTH_IclR
HTH_Crp_2
SoFic-like_C
Phage_rep_O
HTH_9
TrmB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCU75360
UniProt:
A0A4P9J355
LinkDB
All DBs
Position
L1:complement(2962757..2963914)
Genome browser
AA seq
385 aa
AA seq
DB search
MFSLNNSNLLRSGFELGKGEKLFQDIERDIIKVVFWEKCVTQSHIVSATRIPQQTVSRLL
KSLTQHGVIVQTDTLIPNKKGKPGFGIALNPDYGFTFGLAILLDAISLAVMDFTGKVVYT
HMQLMSDMSINNVLKCAQKLVEDISAERDISSEKVLGMGVGISGFFSSMDGKMNTHHMLE
EWSQVDIIDIVSQHFQLPTWVVNDATGAAAGEGVAGIGREYKNFVYMFVSAAFGGGIVNN
GDVLRGTYGNAGELGDMLPPKLYAHPNLELLKRILKKNGVAVTSIYDLHDNFDPDWPGVE
EWLFKVQDSFDLVATCCSALLDAEAIIIGGHIPKELAEKVIARTEVYAQFRRGAKRPMPK
LVVSNIDNFPVSIGAATLPFRELCL
NT seq
1158 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcgttaaacaacagtaacttattacgctctggttttgagcttggaaaaggcgaa
aagctatttcaagatattgagcgcgatattataaaagtggtgttttgggaaaagtgcgta
actcaaagtcatattgtgagcgcaactcgtattccacagcaaactgtgtcgcgtttactt
aagtcgttaacccaacacggtgtaattgtacaaactgatacgctaattcctaataaaaaa
ggcaaacctggatttggcattgcccttaatcccgattacggatttacctttggcttagct
attttgcttgatgctatttcgcttgccgtaatggattttacgggaaaggtggtttatacc
catatgcagctaatgtcggatatgagcattaataatgtgcttaaatgtgcacaaaagctg
gtagaagatataagcgctgagcgtgacatttcaagtgaaaaagtactgggaatgggtgtg
ggtatctctggcttttttagctcaatggatgggaaaatgaatacccaccatatgctagaa
gagtggtcgcaggttgatattatcgatattgtgtcgcagcattttcaactccctacttgg
gttgttaacgatgctacaggcgcagccgcaggtgagggtgttgctggtattggacgcgag
tataaaaactttgtttatatgtttgtgtcggccgcatttggtggcggtattgtaaataat
ggcgacgtactgcgcggtacatacggaaatgcaggtgagcttggcgacatgctaccgcct
aaattatatgcccaccccaatcttgaattactaaaacgtattttgaaaaaaaatggcgta
gcggttacttctatttacgacctgcatgacaactttgaccccgattggccaggtgttgaa
gaatggctgtttaaagttcaagactcatttgatttagtggcaacctgttgctctgcatta
ttagatgctgaagcgattattattggtggccatattccaaaagagttggctgaaaaagtt
attgcacgaactgaggtttatgcacaatttagacgtggcgctaaacgccctatgccaaag
ctggtggtatctaatattgataattttccggtatcaattggcgcagccacattgccattt
agagagttgtgtttgtag
DBGET
integrated database retrieval system
