KEGG   Pseudonocardia dioxanivorans: Psed_4870
Entry
Psed_4870         CDS       T01479                                 
Name
(GenBank) penicillin-binding protein transpeptidase
Organism
pdx  Pseudonocardia dioxanivorans
SSDB
Motif
Pfam: FTSW_RODA_SPOVE Transpeptidase PBP_dimer DUF6136
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEA27014
UniProt: F4CJY9
LinkDB
Position
complement(5230471..5233383)
AA seq 970 aa
MQGLRGSRTRSWGNRRLSAWASERRRRRVPRWRLPGEPTFDVLAILAAGVLVAIGLANLA
AVGGVGTAVRQGGIAAAGFALLLASRRVRVRVLGVLAVLSYTVAVVMLAAVPLLGNRTKG
ATRWLDAGAFTFQPSELAKLGLLLLVAALLASARPAWQRFAGSLVVAAVPIVLTVLQPDL
STTALLVVVVVALMVIGRVPARFLLPVAAAAAVAAPLAVGLLRPYQVQRLGSFLAGSSQA
AGGAGWAASQARIAVASGGWFGRAGHPLTDVLERYLPERSSDLAPASLVEQFGWVAGLAV
LVAALVLVWRLATAARGARTSHGALVAGGLAVLIGAEVVVSVGGNLGLLPLAGVPFPLVS
NGGTAMVVHLAAIGTVLGVRRDGARRALWAAPGRLRPRLVQSSAMVLTGVLVTFAVAGGQ
VQAQQRPSLVAAGQEQMVRCLRVAAPRGEITARDGTVLAQDSAATDTGSAAVGVVPALVT
PAELELVADVTGRPLDQLRAAVAAAPRTTLDLEVGTAPAGRAGVLRGSPDVIVTDEARRS
YPTGELLAPVLGFVGVATAEQTARDPSLAPGTVVGRLGLEATYDAVLRGVDGRRCWYVTP
AGVPVAPGPQLPAVPGADLRTALDLPLQRRLTDSLRVSLAGQPDPRAVGAAVAMDPRDGQ
VLAMASLPSYDDNIYGPPVDASALAALDARPGSPGLNHVTQVAVPPGSTFKLVVGAADMV
TGTIPPMQVVPTGASFTLGGHTFANWRPMGPMNLPQAIGWSNDVYFYQLAARMGPGPIIQ
TARALGVGEPTGIDLPGEAAGYLGSPDTGEPWYGGTTVILGIGQGPLQVTPLQNARWTAA
ITTGLLVTPHLGLAVVTPGGATTAVPVSPARPLPFAATLGPVRDGMRAAVRSGTAGWLAP
LPVDSGAKTGTAQDGSLRAGSYDNWTTVAAPLDAPTVVVTSLVQGPGQGANSAGRIVVDG
LSGYLAAPPP
NT seq 2913 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgcaggggttgcgggggagccgtacgcggtcgtggggcaaccggcggctgtcggcgtgg
gcgtccgagcgacggcggcgccgggtgccgcggtggcggctgccgggggaaccgacgttc
gacgtgctggcgatcctcgccgccggtgtgctggtcgccatcggcctcgcgaacctggcg
gccgtcgggggcgtcgggaccgccgtgaggcagggtggcatcgccgcggccgggttcgcg
ctcctgctcgcgtcccgccgggtgcgcgtccgcgtgctcggggtgctcgcggtgctcagc
tacaccgtcgccgtggtgatgctcgccgctgtcccgctgctcgggaaccggacgaagggc
gcgacccggtggctcgacgcgggcgcgttcaccttccagccgtcggagctggcgaagctg
ggcctgctcctgctggtcgcggccctgctggcctccgcccggcccgcctggcaacggttc
gccgggtctctcgtcgtggcggcggtcccgatcgtgctgacggtcctgcagccggatctg
agcacgaccgcactgctcgtggtcgtcgtcgtcgcgctcatggtgatcgggcgggtgccc
gcccggttcctcctgccggtcgcggccgctgccgcagtggcggccccgctcgccgtcggg
ctgttgcggccgtaccaggtccagcgtctcggcagcttcctggccggctcgtcccaggcg
gccgggggcgccggctgggccgcgtcgcaggcccgcatcgcggtggcctccggcgggtgg
ttcgggcgtgcgggtcatcccctcaccgatgttctcgagcgctacctgcccgagcgttcg
tcggacctcgcgccggcgagcctggtcgagcagttcgggtgggttgcgggcctggcggtc
ctcgtcgcggcgctcgtcctggtctggcggctcgcgacggcggcgcgcggagcccgcacg
agccacggtgcgctcgtcgcgggcgggctcgcggtcctgatcggtgccgaggtcgtggtg
tccgtcgggggcaacctcggcctgctgccgctcgccggtgttccgtttcccctggtcagc
aacggcggaacggcgatggtggtgcatctcgccgccatcggcaccgtcctgggggtgcgc
cgggacggggcgcggcgcgcgttgtgggccgcgcccgggcggctgcgcccccgactcgtg
cagagctccgcgatggtgctcaccggggtcctcgtgaccttcgccgtcgcgggtgggcag
gtccaggcgcagcagcggccgtcactggtggccgcgggccaggagcagatggtgcgctgc
ctgcgggtcgccgcgccccgcggcgagatcacggctcgcgacggcacggtcctggcgcag
gattccgcggcgaccgatacgggctccgcagccgtcggtgttgtccccgcgctcgtgacg
cccgcggagctcgaactggtcgccgacgtcacgggccgtccgctcgaccagctgcgcgcg
gcggtcgccgcggcaccgaggacgacgctcgacctcgaggtcggcacggctcccgccggt
cgagcaggggtgctgcgcgggtcgccggacgtgatcgtgacggacgaggcgcgccgcagc
tacccgacgggagaactgctcgcgccggtgctcggcttcgtcggcgtcgccacggccgag
cagacggcccgggatccgtcgctggcaccagggacggtggtgggccgtctcggtctggag
gcgacctacgacgccgtgctgcggggtgtcgacggccggcgttgctggtacgtgaccccg
gccggcgtgccggtggccccgggcccgcaactgcctgcggtccccggcgccgacctgcga
accgccctggatctgccgctgcagcggcggctcaccgactcgctgcgggtgtcgctcgcg
ggccagccggacccccgcgccgtcggggcggccgtggcgatggatccgcgggacggccag
gtcctcgccatggcgagcctcccgtcgtacgacgacaacatctacggcccgccggtggac
gcgtccgcgctcgccgccctcgacgcacgccccggcagccccggcctgaaccacgtcacc
caggtcgccgtgccaccgggctccacgttcaagctcgtggtgggcgcggccgacatggtg
acgggcaccatcccacccatgcaggtcgtcccgaccggggcgagcttcaccctgggcggc
cacaccttcgccaactggcgtccgatgggcccgatgaacctcccgcaggccatcggctgg
tcgaacgacgtgtacttctaccagctggcagcccggatgggtccgggtccgatcatccag
accgcacgcgccctgggcgtcggcgagccgaccgggatcgacctccccggcgaggcggcg
ggctacctcggcagtccggacaccggggagccgtggtacggcggtaccaccgtcatcctc
ggtatcggccagggcccgttgcaggtcacgcccctgcagaacgcccgctggacggcggcg
atcaccaccggcctgctggtcacgccgcacctgggactggccgtcgtcaccccgggcggt
gcgacgacggcggtgccggtgtcgccggcacggccgctaccgttcgccgccacgctcggg
ccggtgcgcgacggcatgcgtgccgccgtgcggtccggcaccgccggatggctcgccccg
ctgccggtggactcgggagccaagaccggcacggcccaggacggaagcctgcgggccggc
agctacgacaactggacgaccgtggccgcgccgctggacgccccgacggtggtggtgacg
agcctggtccagggtccggggcagggtgccaacagtgcgggccggatcgtggtggacggt
ctgagcgggtacctggcggcgccgccaccctga

DBGET integrated database retrieval system