KEGG   Pseudoalteromonas espejiana: PESP_a0419
Entry
PESP_a0419        CDS       T04989                                 
Symbol
mshQ
Name
(GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
pea  Pseudoalteromonas espejiana
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pea00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:pea02044]
    PESP_a0419 (mshQ)
Secretion system [BR:pea02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   PESP_a0419 (mshQ)
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 H_lectin
Other DBs
NCBI-ProteinID: ASM48673
LinkDB
Position
I:418426..422166
AA seq 1246 aa
MKKYFWLSLCLLSLLGSYRVFAVLPKIEGRFIELQDTYTSPVWTKINFQQQYITPPAVFM
LSTNQGGNPAIVRIRNVTTTGFEALPLEPSGEDGEHITMGAHYLAVEYGVHEFPDGTIME
VGSTDLMLELQYGSKSGFAPLTPQGYKSLTFAQPFAVRPNFFHSLQTLNSLDSNPPSQAL
VPFLTVAVETGSLSTTGVNIALEASETALGIIENETVAYLAVEPGSNRSFLDDSGAEVSW
ESFFTGFEVDGWNDGCNFFSFTNDFDVAPLVVASKNSRLEEDGGWLRSCNLRTDRLGIVV
DEDRNADNERTHVKEEASILAMTSTFVLNGSVLSCDRLFPGAIATYNNGEVQLVQGVEVT
DNNGQFITTTSLIATALTNPPLCNGQSCLASGQNSLDPNEASQVPTVTNDGSSTGDVPVT
LAGDYFYDALQLSMLEDTYKVAAPTRIFLKDTSSLISTSFLNIGKTNIDVANGAYLAIYV
DGAVAIAADANIAAYIVATGEVRIAQNVTYQGSITSGTQVITEGSSTFDALTVPDNIPGF
CGIFTPVSLDHYRLSLSDNQGLTCEAKEMTLTACANDACDLLFDEPTALNLSPDNNGQQS
WVTGENITFTGSAIIELAKRTTGTATLGYNTADPSAPLRCYIGGNNVGLGGCKVVFADAG
FIFNNETANTTGIPTQLSGKPSDVGFNAARLSIQAVKTNTTTGVCEAAFPAGGEVDLDLA
YTCSAGASCSDPVALSNSGNTHNVQQAYQTFPLTFDQDSKALIAINYPDAGKLSLNARTN
IVLDPVTNLSVSLTGSSNEYVVKPFGLAMQVASDGYAETANDSLFRLTGESFDLKMNAVQ
WLAGQDNNSDGIPDNYNSIHSNPIAKHFISEAPLVTSSLQLPTPGNEGQLAALATNAFAD
TGSLSESISQYAYDQVGIINLFSGLQDADYFGVGDVNGQLSNVGRFAPSHYQVLGIQASA
QCTQLGSHLTYLDQPFELGFTVQALNQNNQVMVNYKNGFEKAQVQVNAENNQAGNYIPAS
TLTSRLSSIGSNSWNSASDGQWQMSELNTILTRLAINNPDGPFSMVNLMATVSNIEGATL
IDANDEPNTQASCGSNCNSVRLNAVPIDFRFGRLALGNNAGSDLDPLLVPMQAQYFNGSG
FVLNTEDNCSVFEHPKITQISPSTPVLNYDYGLGAAGTLETGSYPANNAIYAQPNGAGTF
TLEYETQNWLKWDWLGDNSQLDPHAILQFGRFRGNDRVIYWRETRE
NT seq 3741 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaatacttttggttgagcttatgcttgttgagcctgttaggtagttatagggta
tttgctgtattacctaaaattgaagggcgctttatagagctgcaagatacatatacctca
ccggtttggacaaaaataaattttcagcagcaatatataacgccgccagctgtgtttatg
ctttcgaccaaccaaggtggaaacccagccattgtaagaatacgcaatgtgaccactaca
ggatttgaggctctgccgttagagccttcaggagaggatggtgagcacattacaatgggg
gcacattatttagctgttgaatacggcgtacatgaatttcccgatggcaccattatggaa
gttggcagcactgatctaatgttagagctgcaatatggttctaaatcaggttttgcacca
ttaacgccacagggttataaatcacttacttttgcacaaccgttcgctgtaaggccaaat
ttttttcattctttacaaaccttaaatagtttagatagcaacccaccatcacaagcgtta
gtcccctttttgactgtagcggtagaaacagggagtttatcaactacgggagtaaacata
gcattagaagcctccgaaacggctttgggtattattgaaaatgaaaccgtagcataccta
gcagtagagcctggcagtaatcgttcatttttagatgacagcggcgctgaagttagttgg
gaaagtttttttaccggatttgaagtggatggctggaatgatggatgtaacttttttagt
tttactaatgactttgatgtagccccattagttgttgcgagtaaaaactcgcgcttagag
gaagatggtggctggttacgcagctgtaacttacgaacagaccgcttaggtatcgttgtt
gatgaggaccgaaacgcggataacgaacgtactcatgtaaaagaagaagcttctattctt
gccatgaccagcacctttgttctaaatggcagcgtattaagctgtgaccgattattccct
ggagccattgctacatacaataatggggaagtgcagttagttcagggcgttgaagtaaca
gataataatggccagtttattaccacaacaagcttaattgccacggcgctgacaaacccg
cctttgtgtaatgggcaaagttgtttagccagtggtcaaaactctttagaccctaatgag
gcctctcaagtccccacagttacaaatgatggcagctcaaccggcgatgtccccgtgaca
ttggctggcgattacttttacgacgcattgcaattaagtatgttagaagatacttataaa
gtagcagccccaactcgtatatttttaaaagatacatcatcgttaatatctacctccttt
ttaaatattggtaaaactaatatcgatgttgctaatggcgcttacttggcaatttatgtt
gatggagctgtcgctatagcggctgatgccaatattgcagcgtatattgttgctactggt
gaagtaagaattgctcaaaatgtcacttatcaaggctctattacctctggtacacaagtg
attaccgaaggcagctcaacttttgatgccttgactgtaccagacaatattccggggttt
tgcggcatttttacacctgtatcgcttgatcattaccgactatcgttaagtgacaatcaa
ggtttaacatgcgaagcaaaagaaatgaccctcacagcctgtgctaacgatgcgtgcgat
ttattgtttgatgaaccaacagcacttaacctctcacccgataataacgggcaacagagc
tgggtaacaggcgaaaatattacctttacaggctctgcaattatagagctggcaaaacgt
acaacaggtactgctacgcttggttataataccgcagacccttctgcaccgctgcgttgt
tatataggaggtaataacgtggggttaggtggctgtaaggtggtttttgctgatgcagga
tttatttttaataacgaaacggccaataccacaggtattcccactcaattatcgggtaag
ccttcagatgtaggttttaatgccgctaggttatccattcaagcagtaaaaacaaatact
accacaggggtatgtgaagctgcatttcctgcaggtggggaggtagatttagaccttgcg
tatacgtgtagtgcaggtgctagctgctcagacccagtcgcgcttagtaatagcggcaat
acacataatgtgcagcaagcttatcaaacatttccgcttacatttgatcaagactccaag
gcgcttattgcaattaactatcccgatgcaggtaagttaagcttaaatgctcgaacaaat
atagtgctagaccctgtaactaacttatcggtgagtttaacaggcagctcaaacgaatat
gttgtaaagccatttggcttagcgatgcaggttgccagtgatgggtatgcagaaactgca
aatgatagcttatttaggctcactggtgagtcgttcgatttaaaaatgaatgcggtgcag
tggcttgctgggcaagataacaatagcgacggtatccctgataactacaatagtattcat
agtaatcctattgctaaacactttattagcgaagcgcctttagttactagcagtttgcaa
ttaccaactcccggaaatgaagggcaactagcagcattggcaacaaatgcgtttgctgat
acgggtagcttgagtgaatctatatcgcaatacgcttatgaccaggttggcattataaac
ttattttctgggttacaagatgctgattactttggtgtaggtgatgtaaacgggcagctc
agtaatgttggccggtttgccccttcgcactatcaagtattgggtatccaagcttctgca
caatgtacacaactaggcagtcatttaacctatttagatcagcccttcgaacttggcttt
accgtacaagcactcaatcaaaataaccaagtaatggttaattataaaaatggttttgaa
aaagcgcaggtgcaggtaaacgctgagaacaatcaggcgggcaattatataccggcaagc
acgttaacaagcagattgtctagtataggtagtaacagttggaatagtgcatctgatggg
cagtggcaaatgagcgagctaaataccatactcacacggttagctataaataaccccgat
ggcccatttagcatggtcaatttaatggcaacagtatctaacatagaaggagctacttta
attgacgcgaatgatgaacctaatacacaagcaagctgtggtagtaattgtaatagtgtg
cgtttaaacgctgtaccaatagattttaggtttggtcgtttagcattaggtaataatgca
ggctctgatttggacccactacttgtgcctatgcaggctcaatactttaatggcagtggt
tttgtgctaaatactgaagataactgcagcgtgtttgaacacccaaaaataacgcaaata
tcaccttcaactcctgtattgaattatgactatgggttaggtgcagcaggcacattagaa
accggaagctacccagctaacaacgctatttatgcccagcctaatggagcgggtactttt
acattagagtacgaaactcaaaattggctaaaatgggactggcttggcgataattcgcag
ctcgatccacatgccattttacaatttggtcgctttagaggaaatgatcgggttatttac
tggcgtgaaacaagggaatag

DBGET integrated database retrieval system