Pseudoalteromonas espejiana: PESP_b0003
Help
Entry
PESP_b0003 CDS
T04989
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pea
Pseudoalteromonas espejiana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
AAA_22
ERCC3_RAD25_C
HDA2-3
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM51644
LinkDB
All DBs
Position
II:2815..5958
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MSANLSKNDLLAIFEEIKNEQATLFPLSERFIKKLFRPNVLDKGKEYYKNGQISWLEHSS
DFSVIDSTVQGDSGSSFNQRIEINKIPTGYSVDTHCTCNAKTKCRHLAAILFKLKIEHSG
EYGEDYFINDWFSELAALKSVNSNPPSQVLLFVLDIENNKVFLTPKIANYDKNNNYTLGR
NLTEQQLNSFVTPNDLLESDFRLFSWIRSQNAVGNIELKGQWGFSALQQLIATERLFLQR
SRVAIKAQTGQALSFNWQQQNELSQLIIELEHSKNWALIKTTPPAYLDLEHFKVGRIRTQ
LSADEIAHLQSIPALHDANFDRIYKQLADNFGAGVIPHPNNEQAVIKQLGNAVLKVTMAE
QELKLSLLFKYKNKNYLAGSAPANLINSAFENTVTNELVNLGFEFCKGGLQSEFVFNKQS
PIHLHWLVYEVFPAFKKRGWQVSQTKVNIADPQGVVTLDVNRAAGHQMHCKVHLSDAKAS
ALFNTDDAVYQSLNRQSELFYYYPVGRQFGVISKEAINLLNEFKQRFEFVKTRDEFNIPL
SYLPELVKHTAVNITLHDESLERYLNELNTTEHAMPAVALHGLNDSVTLRDYQQQGVDWL
SFLKRHQLGGILADDMGLGKTLQVIAFLASSFNRPQAGPTLIVCPTSLVSNWQNEITKFA
KSLKVTTIFGSQRNEPLQHLAQAQCILTTYPLLKRDIAYYSPLYFENIILDEAQYIKNDT
AQVSRLVKRLNADFKLCLSGTPIENNLFELKSLLDFAMPSLLGSQAHFKQHFQTPIEREA
DSERAEQLKALIMPFILRRTKAQVAQELPQKTELLKEFEFEPKQKEMYQGITRALEEKLI
DLFAEQGAQKSKLAFLEALLKLRQICCHPKLIEPETQASSAKLEWLSTHLPLMLSLGRKV
IIFSQFTSALDLIAARLNEININFSMLTGQTRHRDKVIDEFTSGKTSVFLISLKAGGTGL
NLTQADTVIHFDPWWNPAVEKQATDRAYRIGQTNPVFVYKLIMSNSIEQKVFKMQQDKQA
LVDALFTDKSMSFTSFDEQQMLSLIKS
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgctaacttatcaaaaaatgatttactggctatttttgaagaaataaaaaatgag
caggcaactttgtttcctctttctgagcgttttattaaaaaactgtttagacccaatgtg
ctcgataagggtaaagaatattataaaaatggccaaatcagctggttagaacacagcagt
gatttttcggttattgattccaccgttcaaggcgatagcggatcatcatttaaccaacgt
attgagatcaataaaataccaactggttattcggtagatacccactgtacatgtaacgct
aaaactaagtgtcgccacttagctgctattttgtttaaacttaaaatagagcactcgggt
gaatacggtgaagactactttattaacgactggtttagcgagcttgcagccctaaaaagt
gttaattcgaacccaccctcgcaagtacttttgtttgtacttgatatagaaaacaataaa
gtttttttaaccccaaaaatagccaactatgataaaaataataactacacgttgggtcgt
aatttaactgagcagcaattaaatagctttgtaacacctaacgatttactcgagagcgac
tttagattgttcagttggatacgctctcaaaatgcagtcggaaatattgagttaaaagga
caatggggctttagtgcactgcagcaacttatagcaaccgaacgattatttttacaacgc
tctcgtgttgctataaaagcccaaacaggccaggcacttagttttaattggcagcagcaa
aacgaattatcgcagcttataatagaacttgagcacagtaaaaattgggcgctcattaaa
actaccccccctgcttatttagatcttgagcattttaaagtgggccgtatccgcactcaa
cttagtgccgacgaaatagctcatttacaatcaataccggcattgcacgacgcaaacttt
gaccgtatttataagcaacttgctgataactttggtgccggtgttattcctcatccaaac
aacgagcaagctgttataaagcagcttggcaatgctgttttaaaagtaacaatggctgag
caagagcttaagttatcgttattgtttaaatataaaaataaaaactatttagctggttct
gcgcctgctaatttaattaatagtgcatttgaaaataccgtaaccaatgagttagtaaat
ttgggttttgagttttgtaaagggggtttacaaagcgagtttgtatttaataaacaatca
cctatccacttacactggttagtttatgaagtatttcctgcgtttaaaaaacgcggttgg
caggttagccaaactaaagtaaatattgcagatccgcaaggcgttgtaacgctcgatgta
aaccgagctgctggacatcaaatgcattgcaaagtacatttaagtgatgccaaagcaagt
gccttatttaatactgatgatgctgtttatcagtcgttaaatcgccaaagtgaattgttt
tattactacccggttgggcgtcaatttggggttattagtaaagaggctattaatttacta
aacgaatttaaacaacgctttgagtttgtaaaaactcgcgatgaatttaatattcctctt
tcttatttacctgaactggtaaaacacactgctgtaaatattacgcttcatgatgaatcg
ttagagcgctaccttaatgaattaaataccactgagcatgctatgcctgcggttgcttta
catggtttaaacgactcagtaacgcttcgagactatcagcagcaaggggttgattggtta
agctttttaaagcgccatcaattaggcggcatactggcagacgatatgggcttgggtaaa
acactgcaagttattgcctttttagccagtagctttaaccgcccccaagcaggccctact
cttatagtatgccctaccagtttggtaagtaactggcaaaacgaaataacaaaatttgca
aaaagccttaaagtcaccactatttttggctcgcaacgtaatgagccattacagcattta
gcgcaagcacagtgtattttaactacctatccgcttttaaagcgcgatattgcttattac
tctccgctttattttgaaaatattattttagatgaagcgcaatatattaaaaacgacaca
gctcaggtttcgcgcctagttaaacgtttaaacgccgattttaagttatgcttaagtggc
accccaatcgaaaataacttgtttgagcttaaatcgttactcgactttgccatgccctcg
ttattaggctcgcaggctcactttaaacagcattttcaaacgcctattgaacgcgaggcc
gactcagagcgagcagaacaattaaaagcgcttataatgccgtttattctgcgccgcacc
aaagcgcaagtagcacaagaactaccgcaaaaaaccgagttattaaaagagtttgagttt
gagcctaaacaaaaagaaatgtaccaaggcataactcgtgcgctcgaagaaaagctcata
gatttatttgctgaacaaggcgcacaaaaaagtaaactcgcatttttagaggcgctttta
aagctaaggcaaatttgttgccaccctaaattaattgagccagaaacccaagcaagctct
gcaaaattagagtggctgtctactcacttaccgttaatgcttagccttggacgtaaggtt
attatttttagccaatttacctctgcgcttgatttaattgcagcgcgcttaaacgaaata
aacataaactttagtatgctcacagggcaaacacgccatcgagacaaagttatagatgaa
tttaccagtggcaaaacatcggtatttttaattagtttaaaagcgggaggcactggcctt
aacttaacccaagccgatacggttattcactttgatccatggtggaaccccgctgtagaa
aagcaagcgaccgatcgtgcgtaccgtataggtcaaacaaaccctgtgtttgtgtataag
ctaataatgagcaactcaattgagcaaaaagtatttaaaatgcagcaagataaacaagcc
ttggttgatgcattatttaccgataaatcaatgagcttcacatcgtttgatgaacaacaa
atgctatcacttataaaaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
