Peptostreptococcus equinus: O0R46_06895
Help
Entry
O0R46_06895 CDS
T08671
Symbol
addA
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddA
Organism
peb
Peptostreptococcus equinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
DEAD
ResIII
AAA_12
Allexi_40kDa
FliH
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAW14332
LinkDB
All DBs
Position
complement(1389952..1393884)
Genome browser
AA seq
1310 aa
AA seq
DB search
MANKWTENQLKVINSRGSNLLVSAAAGSGKTAVLIERIIKLILDEDKPIDIDRLLVVTFT
NSAASEMRERVAIAIEKALEKEPDNQRLQEQILLLNKSDITTIDSFCKKIIKNNFHSINI
DPAIKIGDDAEVGIIQSEVIEKLFEELYNAKDQEFLSLVEAYSSKRNDDSLINLVFMINN
FLGSTPFPEKWLEESTEFFNSKDKDKIFYQEHYINKFLKDAKISLLLTKEAIGEEVDNLS
FYSELDRYRFNNLELIASIDEILNAINNEDKEKENNEIIECLDKFQTLQKSLTFRISAKA
EPEIKEAYNSSKDKINSSLKELKKSLENLIIDIDMLKAESDLIYPYMRALSNLTIKFRSA
YQDKKNRLGIMDFSDIEHFALKILSKEDENGKIVPSDIAISYKNYYEEIFTDEYQDSNLV
QETILSLIAREDRPNRFMVGDVKQSIYKFRQSMPEIFMEKYDRYKLYDSANRTNEEKILL
YNNFRSRAEVLEACNYIFSQIMRVSTGELDYTDEERLNPSAIFSSDYLEEDLLGGPVEVY
LVDNKADTKNIDKDKTDETLINNNLIPSSDFEGLSFEDAEKFELESMKISHIIESLVSSD
KPYLVFDKEINRYRKCKYKDIVVLLRAANGKGPILEEVLKRYSIPVYSNTGQGFYSALEI
DLLINLLKIIDNPIQDIEILSVMRSPIFNFTTNDMAMIRLLEKNASIYQILKYIYTEDNM
LGGNEDSIDKEILDEILLKGNLTNKINYFMEKISLYRKKSITYTVSQLIWYILKDTAYYI
YVGKQEMGSQKQNNLLLFFEKARQFEKSSYKGLFSFIDYIERVKLRAKEPQEAKTISADE
DNVNIMSIHKSKGLEFPIVIVADLGKEFYIKSNDSRLSLHQTMGYGPNVIDIDKRVSFPS
MRKIMIESKYREESLAEEMRLLYVAMTRAKEKLIFTANINDYDKKEEKWLSPPRNEMGLL
EDSDILSSKSYLDWIMPNILRLDKKGIFINSMKEEKNYQGFGQNRWYIQVDKSKKIFDDY
NKNILLNENSYDNKDSLIDFDEESSINKKLDFLYPFNTSLNKPSSISVSEIKKLVEESEE
DYMHENLYSKFRISDLKTPKFIHSGDMKVEFNSAERGTIFHLLMQVLDFSSFEKYLKNQQ
LTFDLFVDNNMDNQIIDEIKRQIDGFIDKDVLSVEEANTININWVLRFIKSSIFIDILDA
QNKGKLYKERAINYNLKINQIYRDQDIIDSEKMMMVGIIDLFFENDNGDLILLDYKTDFV
NKENKKIVIDRYKTQLDYYRKAIEDISGKKVVGSFIYLMSIGELVEYKEN
NT seq
3933 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaataagtggacagaaaatcaactgaaagtgataaattctagaggatctaatctg
cttgtatcagctgctgccggatctggtaaaacagcagtattaatagaaagaattataaag
ttaattttagatgaagataaacctatagatatcgataggctattagtagttacatttaca
aattctgctgctagtgaaatgagagaaagagtcgctatagcaatagaaaaggccctggaa
aaagaaccagacaatcaaaggttacaagaacaaatactacttttaaataaatctgatata
actactatagattcattttgtaaaaaaataataaaaaataatttccattcaataaatata
gatccagcaattaaaattggagatgatgcagaagttgggataatacaaagtgaagttata
gagaaattatttgaagaactatacaatgcaaaggaccaagagtttttatctctagttgag
gcatattcttcaaaaagaaatgatgattcactaataaatttagtttttatgataaataat
tttctgggatcaacaccttttccagaaaaatggttagaagaatcaacagagttttttaat
agcaaagataaagataagatcttttatcaggaacattatataaataagtttttaaaagat
gcaaaaatatctttattgttgacaaaagaagctataggtgaggaagtcgacaatctatca
ttttatagtgaattagatagatatagatttaataatttagaattaatagctagtatagat
gaaattttaaacgctataaataatgaagataaagaaaaagaaaataacgaaattatagaa
tgcttagataaatttcaaacactacaaaaatctttaacattccgtatatcggcaaaagca
gagcctgaaataaaggaagcttacaattcttctaaggataaaataaattcttcattaaaa
gagttgaagaagagtttagaaaatttaattatagatattgacatgttaaaggcagagagt
gatttgatatatccatatatgagagcactttcgaatcttactataaaatttagaagtgct
tatcaagacaaaaaaaatagactaggaattatggatttttcagatatagagcattttgct
ttaaagattttatcaaaagaagatgaaaatggaaaaattgtgccatctgatattgctata
tcatataaaaattattatgaagaaatatttaccgatgaatatcaggatagtaacttagtt
caagagactattttgtcacttatagctagagaagataggccaaataggtttatggtaggt
gatgtaaagcagagtatatataaatttagacaatctatgcctgaaatttttatggaaaaa
tatgatagatataaattatatgatagtgctaatagaactaatgaagaaaaaatactttta
tataataattttagaagtagggcagaagttttggaggcatgcaactacatatttagtcaa
ataatgagagtttccacaggagagcttgattatactgatgaggaaagactaaatccttct
gctatattttcaagtgattatttggaagaagacttgttaggaggtcctgtagaagtttat
ttagtagataacaaagctgacacaaaaaatatagataaggataagacagatgaaactctt
ataaataataatttaataccttcatcagattttgaaggtttatcatttgaagatgcagaa
aaatttgagcttgaaagcatgaagataagtcatataattgagagcttggtatcctcagat
aaaccgtatttggtatttgataaagaaataaatagatatagaaaatgcaaatacaaagac
attgtagttttattaagggcagctaatggaaaaggacctattttagaggaagtactaaaa
agatattctataccagtgtactcaaacacgggtcagggattttattcagctcttgaaata
gatttattgattaatttgttgaagataatagataatcctatacaagatatagaaatttta
tcagtcatgagatcgccaatatttaattttactactaatgatatggctatgattaggcta
ttagaaaaaaatgctagtatatatcagatacttaaatatatatatacagaagataatatg
ttaggtgggaatgaagattcaatagataaggaaatacttgatgaaattttgttaaagggt
aatttaacaaataagattaattattttatggaaaaaattagtctatatagaaaaaaatct
attacttatacagtaagccagttaatttggtatatattaaaagatacagcctattatatt
tatgttggaaaacaagaaatgggtagtcagaaacaaaataatttacttttattctttgag
aaggcaagacaatttgaaaaatcctcatataaaggtttattctcttttattgactatata
gaaagggtaaaattaagagcaaaagagccacaagaggcaaagactatttcagctgatgaa
gataacgtaaatattatgagtatacataagagcaagggtttggaatttccgattgtaata
gttgctgatttaggtaaggaattttatatcaagtccaatgattcaaggcttagccttcat
caaactatgggatacggaccgaatgtaatagatatagacaaaagagtatcatttccgagt
atgagaaaaataatgattgaatcaaaatatagagaggaatcattggcagaggagatgaga
cttttgtatgttgctatgaccagagcaaaagaaaagttgatttttacagctaatataaat
gactatgataagaaagaagaaaagtggttatcaccgcctagaaatgaaatgggattatta
gaagattccgatatattatcttctaaaagctatttagattggataatgccaaatatttta
agattggataaaaaaggaattttcattaattcaatgaaagaagaaaaaaactatcaaggt
tttggacaaaatagatggtacatacaagtagataagagtaagaaaatatttgatgattat
aacaaaaatatactcttgaatgaaaatagttatgataataaagatagtttaatcgatttt
gacgaagaaagttctataaataaaaaattagactttttatatccatttaacacatctcta
aataaaccatctagcatttctgtatctgaaataaagaaattagtagaagaatctgaagaa
gattatatgcatgaaaatttatattcaaagtttaggatttcagatttgaaaactcctaag
tttatacatagtggagatatgaaagtagaatttaattcagcagaaaggggtacaatcttt
catttattaatgcaggttttggatttttcatcttttgaaaaatatctaaaaaatcagcag
ttgacctttgatttatttgtagataacaatatggataatcaaattattgatgaaataaaa
aggcaaatagatggatttatagataaagatgttttaagtgttgaagaagctaatactata
aatataaactgggttctaagatttataaaatcatctatttttatagatatattagatgca
caaaataagggtaaattatataaagaaagagccataaactataatttaaaaattaatcaa
atatatagagatcaagatattattgattctgaaaaaatgatgatggtaggtattattgat
ttattttttgaaaatgataatggagatttaatattacttgattataaaacagattttgtg
aataaggaaaataaaaaaattgtgatagatagatataaaacacaattagattactataga
aaagctattgaagatatttcgggtaaaaaagtagttggaagttttatttatcttatgagc
ataggggaattagtagaatataaggagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
