Primulina eburnea: 140829480
Help
Entry
140829480 CDS
T11060
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pebu Primulina eburnea
Pathway
pebu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pebu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
140829480
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pebu03019
]
140829480
Messenger RNA biogenesis [BR:
pebu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
140829480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140829480
NCBI-ProteinID:
XP_073048844
LinkDB
All DBs
Position
4:44735714..44740170
Genome browser
AA seq
439 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEEKLKEYFQGYGEVLQTAVMRDKISGKPRGFGFVVFSDPNIL
DGVLQDRHVIDGRTVEAKRALSREEQQVSKVGNPGGARNFGGGGSTRTKKIFVGGLPATL
SEDGFRQYFETYGMVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKTFHDLNGKQVE
VKRALPKDANVGGGGRSMGGGAGGNSGGYQGYGSSGGNSSSYDGRMESKYMHSQNASGGY
PTYGSSGYNAPGYGYGNGIGYGYGNYGGANPGYSGPAGGGYANPNTGYGGGPPNAPRSSW
GSQAPAAYGYGSSQWGTPGGGGAGNNVLPTGQSPVGSSGFGNQGYGYSGYGGNDGGYGNQ
AAYGAVGGRSATGQNGSAPGDLQSGSGSYMGGGYGDGTGNIGYGNAGWRSDSSAMGSHGG
QVGYGSGYGSGSNRSGQQQ
NT seq
1320 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagcttttcataggtggaatttcatgggaaacagatgaggag
aagctgaaagagtactttcaaggatatggagaagtattgcagacggcggtgatgagagac
aagatttctggaaagccaagaggctttggttttgtcgtattttcagatccaaacattctt
gatggagttcttcaggataggcatgttattgatggccgcacggtcgaggctaaaagagct
ttatcacgagaggaacagcaagtttctaaagttggaaaccctggtggcgcaagaaatttt
ggaggtggtggaagtaccagaacaaagaagatattcgttgggggtttgccagcaactttg
agtgaggatggatttaggcagtatttcgagacttatggtatggtaactgatgtagtgata
atgtatgaccagcaaacaaaccgccctcgcggatttggcttcatttcatttgattctgag
gaagcagtagatagggttttacacaagacatttcatgacttaaatggcaagcaagtggaa
gtgaagcgtgctcttcccaaagacgccaatgttggtggtggtggccgatctatgggtggt
ggggctggtggtaacagtggaggatatcagggttatggatcttctggtggtaattcaagt
tcttatgatgggcgaatggaatcaaagtatatgcattcacaaaatgctagtggtggttat
cctacttatggttcgtctgggtataatgctcctggttatgggtatggcaatggtataggc
tatggctacgggaattatggtggtgccaacccagggtatagtggtcctgctggtggaggc
tatgcaaatcctaatactggatatggtggtggccctccaaatgctcctagaagttcatgg
ggctcacaagctccagctgcatatggctatggaagctctcagtggggtactcctggcggc
ggcggcgcaggtaacaatgtgcttcctactggtcaatctccagttggttcttctggattc
gggaatcaaggttatggttacagtgggtatggaggaaatgatggaggttatggaaatcaa
gcggcttatggagctgttggtgggcgttcggcaaccggccaaaatggtagtgctcctgga
gatcttcaatctggttctggcagttacatgggtggtggttatggcgatggaaccggtaat
ataggctatggaaatgctggatggcgatctgattcatcagcaatggggtcacatggtggc
caagttggctatggaagcgggtatggtagtggttcaaatcgatcgggtcagcagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
