Primulina eburnea: 140835181
Help
Entry
140835181 CDS
T11060
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pebu Primulina eburnea
Pathway
pebu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pebu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
140835181
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pebu03019
]
140835181
Messenger RNA biogenesis [BR:
pebu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
140835181
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140835181
NCBI-ProteinID:
XP_073056720
LinkDB
All DBs
Position
6:38709471..38711977
Genome browser
AA seq
431 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEEKLKEYFQGYGEVLQTAVMRDKISGKPRGFGFVVFSDPNIL
DRVLQDRHDIDGRTVEAKRALSREEQQVSKVGNPGGARNFGGGGSTRTKKIFVGGLPATL
SEDGFRQYFETYGMITDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKTFHELNGKQVE
VKRALPKDTNVGGGGRSMGGGAGGNSGGYQGYGSSGGNSSSYDGRMESKYTHSQNSGGGY
PSYGSSGYNAPGYGYGNGMGYGYGNYGGANTGSYANPNAGYGGGPPNAPRSSWGSQAPAA
YGYGSSQWGTPGGGGGATVLPTGQSPGGSSGFGSQGYGYGGYGGNDGGYGNQAAYGAVGG
RSATGQNGSALGDLQPGSGNYMGGGYGDGSGNLGYTNTGWRSDPSAMGSHGGQVGYGSGY
GSGSSRPGQQQ
NT seq
1296 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaaactatttataggagggatttcatgggaaacagacgaggag
aagctgaaagagtactttcaaggatatggagaagtattgcagactgcggtgatgagagac
aagatttctggaaagcctagaggctttggttttgtcgtattttcagatccaaacattctc
gacagagttcttcaggatagacatgatatagatggccgcacggtcgaggctaaaagagcg
ttatcacgagaggaacagcaagtttctaaagttggaaaccctggtggcgcaagaaatttt
ggaggtggtggaagtaccagaacaaaaaagatattcgtcgggggtttgccagcaactttg
agtgaggatggatttaggcaatattttgaaacttatggtatgataactgatgtagtaata
atgtatgaccagcaaacaaatcgtcctcgcggatttggcttcatttcattcgattctgag
gaagcagtagatagggttttacacaagacattccatgaattaaatggtaagcaagtggaa
gtgaagcgtgctcttcctaaagacactaatgttggtggcggcggccgttctatgggtggt
ggagctggtggtaacagtggtggatatcagggttatggatcttctggtggtaattcaagc
tcttatgatgggcgaatggaatctaagtacacgcattcacaaaattctggtggtggttac
ccttcttatggttcgtctgggtataatgctcctggttatgggtatggtaatggtatgggc
tatggctatgggaattatggtggtgccaatacaggaagctatgcaaatcctaatgctgga
tatggtggtggccctccaaatgctcctagaagttcatggggttcacaagctccagctgca
tatggctatggaagctctcagtggggtactcctggtggcggtggcggtgccaccgtactc
cctactggtcaatctccaggtggctcttctggatttgggagtcaaggttatggttacggt
gggtatggtggaaatgatggaggttatggaaatcaagcagcttatggagctgttggtggg
cgttcggcaactggacagaatggtagtgctcttggagatcttcaacctggttctggcaat
tacatgggtggtggttatggtgatggaagtggtaatttaggctatacaaatactggatgg
cgatctgatccatcagcaatggggtcacatggtggccaagttggctatggaagcgggtat
ggtagcggttcaagtcgaccgggtcagcagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system