Pedobacter sp. WC2423: AB3G38_10035
Help
Entry
AB3G38_10035 CDS
T10715
Name
(GenBank) CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
pedo Pedobacter sp. WC2423
Brite
Transporters [BR:
pedo02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AB3G38_10035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDC13186
LinkDB
All DBs
Position
complement(2498725..2503104)
Genome browser
AA seq
1459 aa
AA seq
DB search
MLSKLIKFSIHNKLVIGLFTLALIAWGVYSLKQLPIDAVPDITNNQVQVITLSPSLASEE
VERLITFPVEQTMSTIPEIEQVRSISRFGLSVVTIVFHDHVDIYWARQQVNEKLSEAKNN
IPQGIGNPEISPISTGLGEIYQYVIHAKPGFEKTYDARELRSIQDWIVRRQLLGTPGIAE
VNSFGGLLKQYEIALDPNKLNSYNLSISDVFKALERNNQNTGGAYIDKKPNAYFIRSEGL
VGNIEDINKIVVRNTSSGLPVLVRDIANVQLGNAIRYGALTRTMAKSHGEAVGGIVMMLK
GSNANDVVKKVKEKIARINKTLPNGIVVEAFLDRSALVDRAIGTVAKNLIEGALIVIFVL
VLFLGNFRAGVVVASVIPLAMLFAISLMNVFGVSGNLMSLGAIDFGLIVDGAVIIVEATM
HLLGASQLTRKMTQDEMDQQVEQSATRMMSAAAFGQLIILIVYLPILALVGIEGKMFGPM
AQTVSFAILGAFLLSLTYVPMMSSLLLSKKPVVKKNFSDRMMDFFQKYYTPLITGALRKR
ITVVVLSVVLLVISIFLFTRMGGEFIPTLEEGDFAVETRLLTGSSLSQTIDKVNQASKIL
LNEFPEVIEVIGKVGSAEIPTDPMPMEATDLTIILKDKKDWVTTKSREELADKMAAALDK
VTGVTFGFSQPIQLRSNELISGVRQDIGIKIFGDDLETLTAISQKIGKIVTTVKGAKDLY
LEQATGLPQIVVKINRDQLARYGIDIETVNQTINSAFAGQSAGLVYEGERRYDMVVRLSE
QNRQGIDDVKNIYISAPNGTKVPLIQLASVEFRIGPNQIQREDTKRRIIVGLNVRGQDIA
TVVGEIEQKVNEKIKLPPGYYITYGGQFENLKAAKQRLTIAVPVALSLILLLLYFSFGSV
KQSVLIFSAIPMAAIGGIFALLLRGMPFSISAGVGFIALFGVAVLNGIVLITEFNRLKAS
GISNLREIVLKGTALRLRPVLMTATVASLGFLPMALSTAAGAEVQKPLATVVIGGLLTST
ILTLLVLPVLYTYFENFKKGKKEITTVTVALLIGLFCMPSKMMAQSPVNSRVITVQQAVE
IALANNQSVKSSQLQISKQQAIQGTAFDLGKTNLNLQYGQFNSIKRDNNISVQQNIPFPG
LIKNQRNLYDAQVRSSELNLSVTQNALIRQVKSIYAQLSYFKALQKLYKSQDSIFSNFLK
ASSLRYQTGETNMLERTTAETQLNEVRNQSEKNRADISIYSVELQRLLNTKEMIDVSSDY
LKKENWNLIAPDSLANTSLLALQQQQVEIADQSLRVERAKAGPDFTVGYFNQSIIGSQTI
NGQDRIFSAGKRFQGIQAGISIPIFYKPFAGRIKAAKIEKQIAQTEFSLFQTNLQTQYKQ
AEQDLLKNSHSVDYYEKNALPNVNLILKQSQIAFQSGDIGYLEFSQALRTYSDIRFSYLQ
AINQYNQSVYTLQYLIDLK
NT seq
4380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaagtaagctcataaaattttccattcacaataaattggtgattggtctgtttacc
ctggcgctgattgcgtggggggtatattcactgaaacaattacctattgatgctgtgccg
gatattaccaataaccaggtacaggtgatcactttaagcccttctcttgcttcagaagaa
gtagaacggttaattacctttcccgtggaacaaacgatgtctaccattccggaaatcgag
caggtacgttctatttcccgctttggtttatctgtagtgaccatcgtttttcatgatcat
gtggacatctactgggcgagacaacaggtcaacgaaaagctctccgaagcgaagaataat
atacctcagggaatcgggaatccggaaatttctcctatctctactggtttaggggagatt
tatcaatatgtaattcatgcaaaaccgggttttgaaaagacttatgatgccagggaatta
agaagtattcaggattggattgtcagaaggcagcttttaggaacgcctggaattgctgag
gtgaacagtttcggtgggttacttaagcaatacgagatcgctttggatcccaataaactg
aatagttataacttaagtatcagtgatgtatttaaagcactggaaagaaataatcaaaat
acaggtggggcatatattgataaaaagcccaatgcctattttatccgtagtgagggattg
gttgggaatatagaagatattaataagattgtagttaggaataccagttcgggccttcct
gttttagtccgtgatatcgcaaatgtacagctgggaaatgcgatacgttatggtgcttta
accagaacaatggcaaaaagtcatggggaggcggttggcggaatcgtaatgatgctgaaa
ggctcaaatgccaatgatgtagttaaaaaggtcaaagagaagattgcaaggattaataaa
acacttccaaatggtattgttgtggaagcgtttttagacagaagtgctttggtagaccgt
gcaattggtacggtggcaaagaatctgattgagggagcgctaattgtcatctttgtatta
gtcttgttcctggggaatttccgggcaggtgtcgtagtggcatccgtgatcccattggca
atgctattcgctatttccctgatgaatgtgtttggggtttctggtaacctgatgagttta
ggagctatcgactttgggttgattgtagatggggcagtgattattgtagaggctacaatg
caccttttgggcgcaagtcagctgacccggaaaatgacacaagatgaaatggaccagcag
gtagaacaatctgctacccggatgatgagcgccgctgcttttggacagcttattattttg
attgtatatctgccgattcttgcattggtgggtattgagggtaaaatgtttggcccaatg
gctcagactgtttcctttgctattttgggtgcatttttattgtcattgacttatgtgccg
atgatgtcttctttgttactgagtaaaaagccagttgttaaaaagaatttctctgaccgg
atgatggatttctttcagaagtattatacaccgttaattacgggtgctttgcgtaaacgt
ataacagttgttgttttatcagttgttttactggtcatcagtatctttttgtttaccagg
atgggaggagagtttattcctactttggaagagggtgattttgctgtggaaacacgttta
ttgaccggaagttcattgagtcagacgattgataaggttaatcaggcatcaaaaatctta
ttaaatgagtttcctgaagtgatagaagtgattggtaaagtcggttctgctgaaattcca
acggatcctatgccaatggaagctactgatttaacgattatactgaaggataaaaaggat
tgggtcactacaaaatccagagaggaattagctgataaaatggccgcagcactggataag
gttactggggttactttcggtttctcccaaccgattcagctaagatctaatgaactgatt
tcgggagtgagacaggatattggaattaaaatatttggagatgatctggagaccctgaca
gctatttctcagaaaatagggaaaattgtgactactgttaaaggggcaaaagatttatac
ctggagcaagctactggtcttccgcaaattgtggtgaaaatcaacagggatcagctggca
cgttatggaatagatattgaaaccgttaaccagactattaattctgcttttgcgggacag
tcggcaggattggtttatgagggggaaagaaggtatgatatggtggtacgtttatctgag
caaaacaggcaagggatagatgatgtgaaaaacatctatatttctgcgcctaacgggact
aaagttccattgatccagttggcttcggtcgagttcaggatcggcccaaatcagattcag
agagaggatactaaacgcagaatcattgttgggttaaatgttcgtggtcaggatattgcc
actgttgttggagagattgagcaaaaggtaaacgagaaaattaaattgcctccgggttat
tatattacttatggtggtcagtttgagaatcttaaagcggcaaaacagcgtttgacaatt
gctgtcccggtagcattgtcgcttattttattattgctgtacttctcttttggatcagtg
aaacaatcggtcttgattttttctgctattccgatggctgctataggtggcatattcgcg
ctgttattgcggggcatgccattcagtatctctgctggggttggctttattgctttattc
ggtgtggccgtgttaaacgggattgtgctgatcactgagtttaacaggttgaaagctagc
gggatcagcaatctcagggagattgtgttgaagggtacagcgctgagattaagacctgta
ttaatgacagcgacagtggcctcactgggttttcttccgatggcactttctactgctgcg
ggcgccgaagtacaaaagccactggctactgtagtgatcggaggcttattaacttctaca
attttaactttactcgttttacctgtgttatatacttatttcgaaaatttcaaaaagggc
aaaaaggaaattacaactgtaacggttgctttgctgattggtttattttgcatgccgtca
aaaatgatggcacaaagcccggtaaacagcagggttatcactgtgcagcaagctgtagaa
attgcattggctaacaatcagtcggtcaagtcttctcaattgcaaatcagtaaacagcag
gccattcaaggtactgcatttgatttggggaagaccaacctgaatttgcagtacggacag
ttcaatagtatcaaaagagataataacatatcagtgcagcagaatatcccatttccggga
ttgattaaaaaccagcgtaatttatatgatgcgcaggtccgcagcagcgagctaaatctt
tcagtgacacaaaacgcacttattcgccaggtaaagagtatttatgcacaattaagttat
tttaaagcgcttcaaaagttgtataaaagccaggattctatcttcagtaattttctgaaa
gcatcttctctgcgctatcagactggagaaacaaatatgctggaacgtactacagccgaa
acccaattgaatgaagtgcgtaatcagtcggaaaagaatagggctgatatatcaatttat
agtgttgaattacaacggttgctgaatacaaaggagatgatagatgtaagcagtgattat
ttgaagaaagagaactggaatctgattgctcctgatagtctggctaatacttctttgttg
gctttacaacagcagcaggtagaaatcgctgatcaatctttaagggtagagcgtgcaaag
gcaggccctgattttacagtaggttattttaatcagtcgattattggcagtcagactata
aatggacaagatcggatttttagtgcaggtaagcgttttcaggggatacaggcaggtatt
tccatcccgatattttataagccatttgcagggaggattaaagctgctaaaatagagaaa
cagattgcgcagactgagttcagcttatttcaaactaatctgcaaactcaatataagcag
gccgaacaggatttgctgaagaattcacacagtgttgattattatgagaaaaatgctttg
ccaaatgtcaatctgatactgaagcagtcacaaattgcttttcaaagtggtgatatcggc
tatctcgaattttcacaggctttacggacttattctgatatccggtttagctatttgcaa
gcaattaatcaatataatcaatcggtttatacacttcagtatctgattgacttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system