Candidatus Pelagibacter giovannonii: E5R92_02500
Help
Entry
E5R92_02500 CDS
T06537
Name
(GenBank) LPS-assembly protein LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
peg
Candidatus Pelagibacter giovannonii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
peg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
peg02000
]
E5R92_02500
Transporters [BR:
peg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E5R92_02500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RTC4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIZ20655
UniProt:
A0A6H1Q337
LinkDB
All DBs
Position
441118..443562
Genome browser
AA seq
814 aa
AA seq
DB search
MKNKFATCFLVIIFTLCNLSKVLGEEFIFEVSDLEIVDNGNTYKGNNRGTIRTDSQLKLI
SDNFEYLKKINRLEANGNVQLFDLNNDISINAQQIFYLKNEEKIFTLGKTLIKISNKYDI
EGFDLIFFKNKMILSSKKNAIITDSESNTYKLEQFQYSIDKEILKGENIVAITNDKKNKS
DEFSFKTGFFDLKKNKFLGKNIIAKFHKNLFGNNENDPRISAVSGYGNKFNTYFEKGVFT
SCKKTDKCPPWKITSNKIHHDKIKKQITYKNAWLEVYDFPVAYFPKFFHPDPTVERQSGF
LKPEFGSSDNLGGSVYMPYFIAISDDKDLTIKPRLFGDNKFLLQSEYRLKTKNSLTISDF
SFVNGHDSSTQDKGDTRSHLFTNTLVDLSLDNFRKSMLQVQYQKVSNDNYLKVFDLQSPL
LLDDNSVLETKIELDLEHENYDLTTSFEMYETLEGSNSDRYQYVLPSYDFSKNYIFENIK
GSFNFNSYGDNTLNDTNVATSSISNDLNYSALNKFFDNGIKTNFEVALKNINTVGKNNPT
YKNSPQSELMSAYTYNASLPLIKKNPKTFNTLEPKLSLRLSPHEMKNNSNESRRIDVSNI
FSSNRLSLGNSFEAGESITLGLNFKKEKVNTSNKINEIEEYIDFKLASVFRLDEEKNIPT
NSTLNKKNSNIFGQFNFKPVKNISLGYNFSLTEDLNTFEYSSLITQMEFGNFVTQFDYLE
ERGVVGSTNIIKNTTKYNFDDQNSILFNTRRNRKLDLTEYYDLIYEYKNDCLVAGIKYRK
NYYNDADIKPVEELFFSITIVPLGTFSPDKMALK
NT seq
2445 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaatttgcaacctgctttcttgtaatcatatttactctttgcaaccttagt
aaagttcttggagaagagtttatttttgaagtttctgatttagaaatcgtcgataatgga
aatacatataaaggcaataatagaggtacaattagaactgatagtcagctcaaattaata
tcagataattttgaatatttaaaaaagattaacagactagaagcaaatggcaatgttcag
ctttttgatttaaataatgatataagtattaatgctcaacaaattttttatcttaagaat
gaagaaaaaatttttacgctaggtaaaacattaataaagatttcaaataaatacgatatc
gaaggatttgatttgattttttttaaaaataaaatgattttatcatcgaaaaaaaatgca
attattactgacagtgaatcaaatacttataaactggaacagtttcaatactctatagac
aaagaaattcttaaaggtgaaaatatagttgctataacaaatgataaaaaaaataaaagt
gatgaattttcgtttaagactggtttttttgatttaaaaaaaaataaatttttgggaaaa
aatatcattgcaaagttccacaaaaatttatttggtaataacgaaaatgatccgagaata
agtgcagtttcaggttatggtaataaatttaatacatactttgaaaagggtgtttttaca
tcttgtaaaaaaacagataagtgtcctccatggaagattacatctaataaaattcaccat
gataaaattaaaaaacaaattacatataaaaatgcttggcttgaagtctatgattttcca
gttgcttactttcctaagttttttcatccagacccaacagtagaaagacaatctggattt
ttaaagccagaatttggaagttcagataatcttggtggttcagtttatatgccttatttt
atagcaatatctgatgacaaagacttaacaataaaaccgaggctttttggtgataataaa
tttttattacaaagtgaatatagactaaaaactaaaaattcattaacaatatcagatttc
agtttcgttaatggtcatgactctagcactcaagacaagggggatacaaggtctcatctt
ttcactaatacgttggtagatttgtcattagacaactttagaaaaagcatgcttcaagtt
caataccagaaagtatcaaatgataactatttaaaagtatttgatttacagtctcctctt
ctactagatgacaatagtgttcttgaaactaaaattgaattagatctagaacatgaaaac
tatgatctaacaacctcatttgaaatgtatgaaaccttggaaggttccaatagtgacaga
tatcaatatgttttacctagttatgatttttcaaaaaattacatttttgagaatattaaa
ggtagttttaatttcaactcatatggagataatactttaaatgatacaaatgttgctaca
tcttcaatatcaaatgatttaaattactctgctttaaataagttctttgataatggaatt
aagacaaattttgaagttgctctaaaaaatatcaatactgttggtaaaaataatcctaca
tataaaaatagtccacaatcagaactgatgagcgcatatacatacaatgcttcattacca
ctaattaaaaaaaaccccaaaacattcaatactttagaaccaaaactatctttaaggctt
agccctcatgaaatgaaaaataatagcaacgaatctagaagaattgatgttagtaatatt
ttttcctctaatcgattaagtttaggtaactcatttgaggcaggtgagtctattacatta
ggtttaaactttaaaaaagaaaaagttaatactagtaataaaataaatgagattgaagaa
tatattgactttaaacttgcttcagttttcagattagatgaagaaaaaaatatccctaca
aatagtactttaaataaaaaaaactccaatatatttgggcaatttaattttaaacctgtt
aagaatatttcgttaggctataatttttccttaacagaagatttgaatacttttgaatac
agttctttaataacccaaatggagtttggaaattttgttactcaatttgattatttagag
gaaagaggtgttgttggcagtaccaatataattaaaaatactacaaagtataactttgat
gatcaaaattctatattatttaacacaagaagaaatcgaaaacttgatttaacagaatac
tatgatttgatatatgaatataaaaatgattgtttagttgctggtataaaatacagaaaa
aactattataatgatgctgatattaaaccagttgaagaattatttttttctataactata
gttccacttggaactttttcaccagataaaatggctttgaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
