Candidatus Pelagibacter giovannonii: E5R92_05495
Help
Entry
E5R92_05495 CDS
T06537
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
peg
Candidatus Pelagibacter giovannonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
AAA_19
CMS1
Cas3-like_C_2
Utp25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIZ21234
UniProt:
A0A6H1Q327
LinkDB
All DBs
Position
1005378..1007222
Genome browser
AA seq
614 aa
AA seq
DB search
MENFKLLKIEDSLKNSLEKMKFTKPTPIQAMAIPVALEGKDILGTAQTGTGKTLAFSVPL
INKLILDKNAFALVMCPTRELATQVMAAIKSIISDKINIKTALLIGGEAMQKQLRQLGNR
SRIIVGTPGRINDHLKRKSLNLSATKYLVLDETDRMLDMGFTPQIELILKFVPKDHQTLL
FSATLPQNIVRISERYLNKPQRISTGSTSVPIAKIKQETLQVFKENKYDQLVDQFITRKG
SILVFVKTKRGADKMVKRLKEEGHSADAIHGDLRQSKRDRVITSFRKGLKRILIATDVAA
RGLDIPLIQHVINFDLPQVPEDYVHRIGRTARAGTEGSALTFLTPDDRSMWNEISKLIDP
NFKPAPRGARGDSRGGKRGKAPYNKKRKFRDEKKSFGKGRPDRSSRDGEKKSFGYKGKSS
FGDKSKPSSYGRSSSSSRDGEKKSFGYKGKSSFGDKSKPSSYGRSSSSSRDGEKKSFGYK
GKSSFGDKSKPSSYGRSSSSSRDGEKKSFGYKGKSSFGDKSKPSSYGRSSSSSRDGEKKS
FGYKGKSSFTKKDNSKPTGFTNNPKYFGKKTSESSFTSGEKKSSSFNGKKKFKSRSDRPK
TFTFKKHSQKRAKV
NT seq
1845 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaattttaagttactaaaaatagaagattcgttaaagaattcattggaaaaaatg
aagtttacgaaaccaactccaattcaggctatggcaatacctgttgctttagagggaaaa
gatattttaggaacagcacaaacaggaacaggaaaaaccttagcttttagtgttccttta
attaataaattaatattagataaaaatgcatttgcattagttatgtgtccaactagagag
cttgcaactcaagtaatggctgcaattaaaagcattattagtgataaaattaatattaaa
actgctttgcttattggtggagaggcaatgcaaaaacagcttagacaattgggtaataga
tcaagaataatagttggcactcctgggagaattaatgaccacttaaaaagaaaaagttta
aatctatcggctactaaatatctagtactagatgaaactgacagaatgttagatatgggt
tttacccctcaaatagaattaattttaaaatttgttccaaaagatcatcaaactttatta
ttttctgcaacactacctcagaatattgttagaatttctgaaagatatcttaataagcct
caaagaatttcaacagggtcaacatcagtgccgattgcaaaaattaaacaggaaactctt
caagtttttaaagaaaataaatatgatcaactagtagatcaatttataacaagaaaagga
tcaatattagtttttgttaaaactaaaaggggtgctgataaaatggttaaacgccttaaa
gaagagggtcattcagctgatgctattcatggagatcttcgtcaaagtaaaagagatcgt
gtaatcacttcatttagaaaaggccttaaaagaatattaatagcaactgatgttgctgca
agaggactagatattccattaatccagcacgtaattaattttgatcttccacaagttcca
gaagattatgttcacagaattggaagaacagctagagctggaacagaaggttctgcttta
acttttcttactccagatgatagatcgatgtggaatgaaattagtaaattaattgatcca
aattttaaacctgcaccacgtggtgcaagaggagactcaagaggaggaaaaagaggaaaa
gctccttacaataaaaaaagaaaatttagagatgaaaaaaaatcttttggcaaaggaaga
cctgacagatcatcaagagatggagagaaaaaaagtttcggttacaaaggaaaatctagt
tttggcgataaatcaaaaccttctagttatggaagatccagttcatcatcaagagatgga
gagaaaaaaagtttcggttacaaaggaaaatctagttttggcgataaatcaaaaccttct
agttatggaagatctagttcatcatcaagagatggagagaaaaaaagtttcggttacaaa
ggaaaatctagttttggcgataaatcaaaaccttctagttatggaagatctagttcatca
tcaagagatggagagaaaaaaagtttcggttacaaaggaaaatctagttttggcgataaa
tcaaaaccttctagttatggaagatctagttcatcatcaagagatggagagaaaaaaagt
ttcggttacaaaggaaaatctagttttacaaaaaaagataactcgaaacctacaggattc
acaaataatccaaaatactttggaaaaaaaacatctgaaagttcatttactagtggagag
aaaaaaagctctagttttaatggaaagaagaagtttaagagtagaagtgatagacctaaa
acctttaccttcaaaaaacatagtcaaaaaagagctaaagtctaa
DBGET
integrated database retrieval system