Pedobacter aquae: FYC62_04335
Help
Entry
FYC62_04335 CDS
T06312
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
pej
Pedobacter aquae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pej00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pej02000
]
FYC62_04335
Transporters [BR:
pej02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
FYC62_04335
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEK50985
UniProt:
A0A5C0VE84
LinkDB
All DBs
Position
complement(976975..978324)
Genome browser
AA seq
449 aa
AA seq
DB search
MKRIYNKYKPHYKENLTLAIPVVISQLGHTLVHTADSIIVGQFAGTIPLAAVSLVNSIFM
IIMVLGIGISYGLTPLVAQENGKNNFEECGKLLSNSLIINIFTGIALFCFIYFGSVLFID
HLDQSPEVVYHAKPYLNLLGLSVIPLMVFLTFKQFAEGLGFTKQAMMISIWGNVINIILG
IIFVKGLFGISPMGVKGVGYSTLIDRSIMAIVMVIYVFKSVHFRKYLKNFVWNFIDKIRL
KRIFKQGAPTAMQYTFEVSAFSGAAILIGTIGAVEQAAHQVAINLAATTYMMASGISAAA
TIKTGNNFGKSDFQYLRLSAISSYHIVLIFMSITAALFMGLNNILPAFYSKDTAVIEIAA
GLLLIAAIFQLFDGAQVVGLGILRGMGDVNLPTLITFMAYWVFGLPVGYYLGITLNFGVS
GIWIGLTLGLLVASILLFLRFQKLSKKLI
NT seq
1350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaatttacaataaatataaacctcactataaagagaatttaacgctggctatt
ccggtagtgatttctcaattagggcatactttagtacacacggcagatagtattatcgtt
ggtcagtttgctggcactattccccttgctgctgtttctttagtcaacagtattttcatg
attatcatggtattgggtattggcatttcgtatggcttaacccctttggtagctcaggaa
aacggtaaaaacaattttgaagaatgtggtaagctcttaagcaatagtttaatcatcaat
atctttaccggtattgctttgttttgcttcatttactttggttcggtattgtttatagac
catttagaccaatctccggaagttgtttaccatgcaaaaccatacctcaatttattaggc
ttatctgttatcccattaatggtatttcttacttttaagcagtttgcagaaggattaggc
tttaccaaacaagccatgatgatttctatttggggtaatgttatcaatattattttaggg
ataatctttgtaaaaggtttatttggtatcagtcccatgggtgttaaaggtgttggctac
agtacgcttattgatagaagtattatggctattgtgatggtgatttatgtattcaagtcg
gttcacttcagaaaatatcttaaaaactttgtttggaattttattgataaaatcaggtta
aaaagaatatttaagcaaggtgcaccaacagccatgcaatacacttttgaagtgagtgct
tttagtggggccgctattttaattggaaccattggcgctgtggagcaagctgcgcaccaa
gttgctatcaatttagcggcaacaacttatatgatggccagcggaatatcggcggcagcc
accattaaaaccggaaataattttggcaaaagcgacttccaatacctacgcttatctgcc
attagcagttaccacattgttttgattttcatgagtataacagcagccctatttatggga
ctaaacaatattttacctgctttttattctaaagataccgctgttatagaaattgcggca
ggtttattactgatagctgctattttccaattatttgatggcgcacaagtagttggctta
ggcattttaagaggtatgggcgatgtaaacttacctactcttattacttttatggcttat
tgggtatttggcttaccggttggctattatttaggtataacactaaattttggtgtaagt
ggtatttggataggtcttactttgggcttattggtagccagtattctcctttttttacgt
tttcaaaagctttctaaaaaattaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
