Pedobacter aquae: FYC62_13075
Help
Entry
FYC62_13075 CDS
T06312
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
pej
Pedobacter aquae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pej00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pej02000
]
FYC62_13075
Transporters [BR:
pej02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FYC62_13075
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
TIG
Por_Secre_tail
PliI
Itfg2
TIG_SUH
DUF3244
Lactonase
BBS1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEK52484
UniProt:
A0A5C0VN82
LinkDB
All DBs
Position
complement(2983008..2986388)
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MITIFTCKSLLKFKVNKVLISLFALIFASINVSAQVPSITSFNPLSAKPGDAVTITGTNF
NTTTTNNVVFFGATKAAVTAATTTSLIVTVPTGATFAPITLLNTATGLATQSLGSFNPIY
SPEKTNITTADFAAEQVLAAGNAPHLIAVSDLDGDGKSDLAVANKNSNTVSVYHNISNIG
NITSASFATKVDFATENEPFAVAIRDLDGDGKPDLVVTNYGSSSISVFRNISTTGLLDAG
SFDNKIDFTTGSSPRIASIGDLDGDGKPDLAVVNESSGDISILRNTSTTGSLSFAPKVDV
VAGSSSRFIAIGDLNADGKLDLAVTNFGSNNFSVFLNASSIGNVNFNPKVDFTAGTRPIA
VAIDDFDGDGKSDLAILNRNSSNISVFLNASSNGNFNLNPKIDVTTGNIHEYFSIGDLDG
DSRPDFIVPVLGSNTFSLLRNTSSSGMLSFSSSVSLSIGNNPHSVVIADLDGDHKPDLVT
SHYLSNTISILRNTDLPPTITSFSPLNAKPGDAVTITGTNFNTTTTNNVVFFGATRATVT
AATATSLTVTVPVGATYDYLNVLNTGTTLAAQSLKKFHPLFSPSKAGVFTTDDKVDFAAG
DSPIFTASGDLDGDGKADLVVANYVGNTISVLRNTATNGSISSSSFADKIDLSTVLPINV
IISDIDGDGKPDVIVSNSASANISIFRNTSTSGNISFAAKEFLVVNASFYSWFTIGDFNS
DGKPDIAVAKDGEILVYPNSSSSGSISFSSAITIVGQLYTYNITAADIDGDNLLDLVLGG
DTGFTVYRNTSINGVVSFENGVFIRTREYDVSMVIGDLDGDTKLDVAVTYGFDSRFSCFL
NTSTPGNINFAAKVDFLLGSHDSFALGDIDSDGKPDLLTANNSFVNVFPNTSSIGSINFG
SVVQITAGLVTRNVIVGDIDGDTKPDLIVANEFSDNVSVIRNADIVPLPVSLISYQAKLQ
TNGTVQLNWLTASETNNSYFEILKSTDGKNFSSIAKVNGSGNSTQQAQYDYTDTRPASGS
NYYQLIQYDDNGKQTDLGVRAVNVTLGSKELTVYPNPASSLINLSFEADVYQKLEVIDLT
GKILMSQTIQKQENSISLDINKLSTGFYHIRLTGTGKITTKQIIKQ
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattacaatttttacttgtaaatctttacttaaattcaaagtaaataaagttttaatc
tcacttttcgctttaatatttgcttccattaatgttagcgcacaagtgcctagtattact
tcgtttaatccattaagcgccaaaccaggcgatgcagttacaattactgggacaaatttc
aatactacaactacaaataacgtggttttctttggagcaacaaaggcagctgtaacagcg
gcaactactacgagcttaatagtaacggtacccactggagcaacttttgcacccataact
ttattaaatacagccactggtttagctacacaaagcttaggtagttttaatccgatttat
agtcctgaaaaaacaaatattacaacggcagattttgcggcagagcaagttttagcggca
ggtaatgctcctcatcttatagcagttagcgatttggatggagatggaaaatctgatttg
gcggttgctaacaagaattcaaatacggtttctgtatatcacaatatcagtaatattgga
aatatcacatcagccagttttgcaactaaggtagattttgcaacagaaaatgaaccattt
gcagtagcgataagagatttagatggagatggtaaacctgatttagtagttaccaactat
ggttcatctagtatttcggtatttcgtaatataagcacaactggtttgttagatgcaggt
tcatttgataataaaatagattttacaacgggcagtagtcctcgtatagcatctattggt
gatttagatggagacggaaagcctgatttagcagttgttaacgaatcatctggcgatatt
tccatacttcgtaacaccagtactactggtagtcttagttttgcacctaaagtagatgtt
gttgcaggatcttcctcaagatttattgctattggagacttaaatgccgacggaaagctt
gatttagctgttactaattttggctccaataatttttctgtattcctgaacgcaagtagt
attggtaatgttaactttaatccaaaagttgattttactgccggaactagaccaattgcg
gttgctattgatgactttgatggagacggaaagtctgatctagcaatactcaatcgtaac
tcgagtaatatttctgtctttcttaatgccagcagtaacggtaactttaatcttaatcct
aaaattgatgttacaactggtaatattcatgaatatttctctataggtgatttagacggg
gacagtaggcctgactttatagtgcctgttttggggtcaaatacattttcattgttacgt
aataccagtagtagcggaatgttaagttttagctcttcggtaagcttgagcattggaaat
aatcctcattctgtagtcatcgcagatttagatggtgatcataaacctgatttggttaca
tctcattatctgagtaatacaatttctatattgagaaatacggacctacctccaactatt
accagtttctccccgttaaacgccaaaccaggagatgcagtaaccataacaggcactaac
tttaataccacaactacaaataatgtggtgttttttggagctaccagagcaactgttaca
gcggcaacagcaactagtttaacggttactgtgccagtgggagcaacttacgattatctt
aatgttttaaatacaggtacaactttagcggcccaaagtttaaaaaagttccatccactt
tttagtcctagcaaagcaggtgtattcactaccgatgataaagtagactttgcagctggc
gatagccctatatttacggcaagtggtgatttagatggagacggcaaagccgatttggtg
gttgcaaattatgttggcaatacaatatcagttctaagaaacactgcaactaatggaagt
atttcatcaagcagttttgctgacaaaattgatcttagcactgttcttcctattaatgta
attattagcgatatagatggagatgggaagcccgatgtaattgtatctaattcagctagt
gccaatatttcaatatttagaaatacatcaaccagcggcaacattagctttgctgcaaaa
gaatttttggttgttaacgctagcttttattcttggtttaccattggggattttaatagc
gatggtaaacctgatattgcagttgccaaagatggggagattttggtatatcctaactca
tcctcaagcggaagcataagttttagtagcgctataactattgttgggcagctttacacc
tataatattaccgcggcagatatagacggagataacctattagacttggtattaggagga
gatacgggatttaccgtgtatcgtaatacatctataaatggggtggtaagttttgaaaat
ggagtttttattcgtaccagagaatatgatgtttctatggtaattggtgatttggatgga
gatacaaaacttgatgtggcggtaacttatggttttgattcaagattttcatgttttctc
aatacctctacacccggaaacatcaactttgccgcaaaggttgattttttattaggttct
catgattcttttgctttaggcgatatagatagcgatggaaaaccagatttgttgactgct
aataatagctttgtgaatgtttttccaaacacttctagcattggtagcattaacttcggt
tctgtagttcaaattacggcgggtctcgtaactagaaacgtcattgtaggtgatatagat
ggagacaccaaacccgacttaatagttgcaaatgaattctctgataatgtttcagttatt
aggaatgcagatatagttcctttaccagtatcattaataagttaccaagccaaacttcaa
actaatggaacagtgcagttaaattggctaacagcatcagaaacgaataacagctatttt
gaaattttaaaatcaacagatggtaaaaattttagttccatagctaaagtaaacggttca
ggaaactcaacacaacaagcacagtatgattatacagacactagacctgctagtggttca
aattattatcaattaatacaatatgatgataatggtaaacaaacagatttaggtgtaaga
gctgtaaatgtaacgcttggttcaaaagagttaacagtttaccctaacccagcaagcagt
ttaattaatttaagttttgaggctgatgtttaccagaaattagaagtcatagacctaact
ggtaagatattaatgagtcaaactattcaaaagcaagaaaacagcatcagtttagatatc
aataaacttagcacaggattttaccatatcaggttaaccggaacaggaaaaataacaact
aagcaaattattaaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system