Pedobacter aquae: FYC62_13350
Help
Entry
FYC62_13350 CDS
T06312
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
pej
Pedobacter aquae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_8
TPR_2
TPR_1
TPR_17
TPR_16
TPR_11
TPR_19
TPR_12
TPR_14
CFAP70_TPR_C
TPR_6
TPR_7
ANAPC3
TPR_CcmH_CycH
TPR_10
RMD1-3
TPR_9
PRP6_TPR
ARM_TT21_C
CFAP70_mid_TPR
TPR_15
TPR_Psidin_N
ChAPs
HIR3_bundle
TPR_20
ARM_TT21_5th
TPR_Slam
DUF1955
ARM_TT21_2nd
TPR-S
TPR_YpiA_C
T7SS_EccA1_N
ARM_TT21
TPR_MalT
HAT_PRP39_N
FAT
DUF7017
NatA_aux_su
TPR_NPHP3
ARM_TT21_4th
TPR_INTS8_3
TPR_3
Coatomer_E
GCP_C_terminal
DUF6340
IFT56
HAT_Syf1_CNRKL1_N
Fis1_TPR_C
TPR_Atp25_C
Suf
TPR_EMC2
TPR_YpiA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEK52530
UniProt:
A0A5C0VMN6
LinkDB
All DBs
Position
3046736..3048142
Genome browser
AA seq
468 aa
AA seq
DB search
MEEEEFDFEFSEDPKQSVERYEEMVRNQDQYFFDAHVFENIIDYYIEKNDPVKALQVIDY
AVLQHPFAAMFLIKQAQLYVFTNEIDKAFASLDRAELLEPSEGDIYLIRGNIYESLERHE
DALENLLKALEMAESKDEVLMQIAYVYQNMGDYDEAVNYLKRCLENNMENQDALYELAFC
YDVLDKQDESIQFYKQYIDNEPYSFAAWYNLGNAYHKIGLFEKAIDAYDYAILIKENFSS
AYFNKGNALVQLDKYAEAIEVYKQTFEYEPPNADTYCAIGECYEKLEKMDEARSYYKKAV
KMDTKLADAWYGIGVTLDFEERYFESLHFYKKALNLDDQNPDFWFAMADAYYKLNNLEES
VKAYEKVVELNPLDVEAWLDYSSIVFEQSNLKLCIEIIAEGIKNNPDSAELYYRLVAYLF
ADGQYNEALTQLQLALNTDIDKHYLLFEYLPQLQDNKVIIDIINRFSK
NT seq
1407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaagaagaatttgactttgaattttctgaggatccaaaacaatccgtagagcgt
tatgaggaaatggttcgtaaccaggatcagtatttttttgatgcccacgtttttgaaaat
atcattgattactacatagagaaaaacgaccctgtaaaagccttacaggtgatagattat
gccgtattgcagcatccttttgcggcaatgtttttaattaaacaggcacaattgtatgtt
tttacaaatgaaattgacaaagcctttgcttctttagacagagcagagttattagaaccc
tcagaaggtgatatctacctcattagaggaaacatctacgaaagcttagaacgtcatgaa
gatgctttagaaaatcttttaaaagcattagaaatggccgaatctaaagatgaggtttta
atgcaaattgcttatgtataccaaaacatgggcgattatgatgaggctgtaaattaccta
aaacgctgtttagaaaataatatggaaaaccaagatgcactttacgagttggcattttgt
tatgatgtattagataaacaagacgaaagcatacagttttataagcaatatattgataac
gagccttactcttttgctgcttggtacaatttgggtaacgcttaccataaaattggcctt
tttgaaaaagctattgatgcttacgattatgctattttaattaaagaaaacttctcatct
gcctactttaacaagggcaatgctttggtacaattagataaatatgccgaagctatagaa
gtttataagcaaacttttgaatacgaaccgccaaatgccgatacctattgcgctattggc
gaatgttacgagaagttagagaaaatggatgaagcccgttcttattacaaaaaagctgtt
aaaatggataccaaactggctgatgcctggtatggtattggcgttacgcttgattttgaa
gaacgctattttgaatcgctacatttctataaaaaagcccttaatttggatgatcaaaac
ccagatttttggttcgctatggctgatgcttactacaagttaaacaacttagaagaatct
gtaaaggcttatgaaaaagtggttgagcttaatcctttagatgtagaagcttggttagat
tattcgtcaatagtttttgaacagagcaatcttaagctttgtatcgaaattattgcagaa
ggcattaaaaataatccagattctgccgagctttattaccgcctggtagcctatttattt
gccgatgggcagtataatgaggctttaacacagttgcaactggcattaaatacagatata
gataaacattatttattgtttgaatatctgcctcagctgcaagacaacaaggttattatc
gatatcattaacagattctctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system