Pedobacter sp. KBS0701: FFJ24_010975
Help
Entry
FFJ24_010975 CDS
T06361
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
pek
Pedobacter sp. KBS0701
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pek00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pek02000
]
FFJ24_010975
Transporters [BR:
pek02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FFJ24_010975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
DUF1414
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDW25304
LinkDB
All DBs
Position
complement(2732822..2734855)
Genome browser
AA seq
677 aa
AA seq
DB search
MIKIKGVLLNIGFYFAFAFILSIGIFLPGISVAQIDTAKANQLQEVKITEYKNSRVNLSP
TPVQILIGSELKRLNSLSVADAIRYFAGVQLKDYGGIGGLKTINIRSMGSNHTAVFYDGI
QLGNAQNGQVDLGRFSLDNLEEIAVYVGQKPELLMPARGFAAASALYLKTAQPIFSSGKK
YGFGASFKTGSFGLINPNLSYKQKISNKISFLIDVSYLESNGKYRFRYKELAYDTTIIRN
NSDVKSARAEATLFGLLPDSSKWSIKLYNYNSARGLPGAIVSNRFTFTQRQWDDNSFVQA
SYQNKKSARYNFMFNTKYAYSFMRYLDPEFKIQNGFLDNRYTETEWYISAANLYKISKIW
ELSLATDYSLQRLNANLYDFAYPSRNTGLVVLASAINLNSLIIQGNILTTLIAEQVKNGD
QSANRQEYTPSLMASWQPLQTKDFRIRSFYKSIFRMPTFNDLYYTFIGNTKLKPEYTNQY
DLGFTYGHTSNGKRLAYLSIQADAYYNLVKDKIVAIPGNNLGRWTMVNLDRVQIKGFETN
VQTVWDLAAQLKLKASANYTFEKAVDISATAFRYGDQIPYIPVHSGSARFGIDYKKLVFN
YSYIYTGERYSQKANIAANYVKPWYTHDVSIGANFAYQQTRFFFNAEINNVFNQYYDVVL
NYPMPGRNYRFTLSTNF
NT seq
2034 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaattaaaggtgttttattaaacatcgggttttattttgcttttgcattcata
ttgagtattggcatttttttgcccggtatttcggtagcacaaatagatactgcaaaggcc
aatcaacttcaggaagttaaaataactgaatataaaaattcaagggttaacttatcacca
actccggtacaaatccttatcggatcggaattaaaacgcttaaacagcctgtcggttgct
gatgccatacgttattttgcgggcgtacaattaaaagattacggaggtattggtggttta
aaaaccattaatattaggagcatgggcagtaaccatacggctgtattttacgatggtatt
cagttgggtaatgcccaaaacgggcaggtagatttaggcagattttcgttagataatctg
gaagaaattgccgtttacgttggtcagaagcccgagttactgatgccggccagaggtttt
gcagcagcaagtgcactttatctcaaaactgcgcaacctatttttagttccgggaaaaag
tatggttttggcgctagttttaaaacaggttcgtttggattaattaatcccaatctcagt
tataaacaaaaaatcagcaataaaatctccttccttatagatgtgagctatttagaatcg
aacgggaaatataggttcaggtataaagaactggcttatgatacgaccattatccggaac
aatagcgatgttaaatcggcaagagcagaagctactttgtttggattattacctgatagc
agtaaatggagcattaaactatataactacaattcggcccgcggactgcccggagctatt
gtttcgaacaggtttacctttacgcaacgccaatgggatgataatagttttgttcaggct
tcgtaccaaaataaaaaaagtgcacgctacaattttatgttcaacacgaaatatgcgtac
agttttatgcgttacctcgatccggaatttaaaatacaaaatggctttttggataaccgc
tataccgaaaccgaatggtacatttctgcagccaatctgtataaaatatcgaaaatctgg
gagctttccctcgccacagactacagtttacaaagactgaatgccaatttatacgatttt
gcttatccaagccgcaatactggtttggtggtgttggctagtgccataaatttaaacagc
ttaatcattcagggcaatattttgacaaccctgattgcagagcaagttaagaatggcgat
cagtctgccaacaggcaagaatatacaccgagtttaatggcctcgtggcaacctcttcaa
accaaagatttcagaattcgcagtttttacaaatctattttccgcatgccaacttttaac
gatctgtactatacatttattggcaataccaaactcaaaccagaatataccaaccagtac
gatttaggttttacttacggacatacatcaaatggtaaacgtttggcttatttatctatt
caggctgatgcctactacaatctggtaaaagataaaattgtggccattccgggtaataat
ttaggccggtggacgatggttaacctcgatcgcgtgcagattaaaggtttcgaaacgaat
gttcaaactgtttgggatttggctgcccagctaaagttgaaagcaagtgctaattatact
ttcgaaaaggcagtagatattagtgcaacagcttttcggtatggtgatcagatcccttac
attcctgttcacagcggatctgcaaggtttggcattgactataaaaagctggtgtttaat
tatagctacatctacaccggcgaaaggtatagtcaaaaagctaatatcgcggctaactat
gtcaaaccctggtatacgcacgacgtgtccattggtgcaaatttcgcgtaccagcaaacc
aggttctttttcaatgctgaaatcaataatgtttttaaccagtattacgatgtggtactg
aattatccgatgccgggacgaaactaccgttttactttatccactaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
