Pedobacter sp. KBS0701: FFJ24_013610
Help
Entry
FFJ24_013610 CDS
T06361
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
pek
Pedobacter sp. KBS0701
Pathway
pek02024
Quorum sensing
pek03060
Protein export
pek03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pek00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
FFJ24_013610
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
FFJ24_013610
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FFJ24_013610
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pek02044
]
FFJ24_013610
Secretion system [BR:
pek02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
FFJ24_013610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
ACR_tran
DUF6520
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDW25801
LinkDB
All DBs
Position
3367740..3370721
Genome browser
AA seq
993 aa
AA seq
DB search
MQGKGFIKFIAIVLAIVCAYALSFTLVASKVEKDAKNAAKGDLAKEKAYLDSMSTVKVYP
VVGFTYQEVKAKEINLGLDLKGGMNVTMEISLAELVKSLAGNPTDANFNKAIQNAQIQLN
AGGKDYIKIFVDEFEKLSPGVKLADYFSNQDNASQLKPSASNSDVESFLEKEATSAIDRS
FTVLRSRIDGFGVVSPNMQKQEGSNRILIEMPGVQDKERIAKLLQGSAELQFWQVYQVQE
VAPLLENINKILAATLKADAPAAKDTTAAPAAGGKLAGLEKAAAKDTTAKGGKLAGLGKK
DSSAVKAELIKSNPLYAVLNLPIYQGENGQQQLMPGAVVGMSLQKDTAKVNAYLKLPEVA
ASIPSTMKFMWSVKPREGSKIFELYAIKVVSADGKPDLGGEAISDSRADFDQKGKPEVTM
YMTSEGSAKWKKITAEAAADPNNKKSIAIVLDNQVYSAPTVQNEIAGGVSSITGNFTQAD
TKDLSNILKAGKLPAPARIAGSYVVGPTLGAQAIHDGLISFVIAFIVILIFMALYYHRAG
WVANFALLINLFFIIGILVSLGAVLTLPGIAGIVLTIGLSVDANILIFERVREELAHGKN
TATAIKEGFKHAMPSIIDSNVTLFILGAILYVFGSGPVQGFATTLCIGILSSLFAAVAIS
RVVFESLLNRKIEVSFDNSLTRNAFKNLAFNFVGRRKIYYIISTIIIVAGIGMYFKNGGL
NLGVDFKGGRTYLVHFDKAVNTEDLKAKLNPVFGNETPEVKTAGEDSQVKITTTFHIEDQ
DIKTDKVVEDALNKGLAGSKYEIVSSQKVTPIIASDIVNGAFYAVLISCLFMFIYIVVRF
KKWQYGLGAVIALFHDVLMVLSFYTILDGIMPFSLEIGQDFIAAILTVMGYTMTETVVVF
DRIREKLKESGKEDLHGEARNNLINFALNSTLSRTILTSLTVFFVLLVIFIFGGDSIRGF
IFALLIGRIIGTYSSLCISTPIVIDLGSSAEKK
NT seq
2982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaggaaaaggttttattaagtttatagcgatagtattggctatcgtttgtgcgtat
gcactttcttttacgttggtagcatccaaggtggaaaaagacgcaaaaaacgctgcgaag
ggtgatttagccaaagaaaaggcttacttagattcgatgagtaccgtaaaagtttatcca
gtagttggatttacttaccaagaggtaaaagcgaaagagattaatttgggtctggactta
aaaggcggaatgaacgtaacgatggagatatcgttggcggagttggtaaaatcattagcg
ggtaaccctactgatgcgaacttcaataaagcaatccaaaacgcacaaatccaattaaat
gccggtggtaaagattacatcaaaatttttgttgatgaattcgaaaaattaagccctgga
gtaaaactagcagattatttttctaaccaggataatgcatctcagttaaaacctagcgca
agtaatagcgatgttgaatctttcttagaaaaagaagcaaccagtgctatcgatcgttca
tttacagttttacgttctcgtattgatggttttggagtagttagtccgaacatgcaaaaa
caagaaggcagtaaccgtatcttaatcgaaatgccaggcgtacaagataaagagcgtatt
gctaaacttttacagggttctgccgaattacagttctggcaggtataccaggtacaagaa
gttgcacccctactcgaaaacattaataaaattttagcggcaacattaaaagctgatgct
ccagctgctaaagatacaacggctgctccggctgctggtggtaaattagctggtttggaa
aaagctgcagctaaagacactacagctaaaggtggcaaacttgctggcttaggtaaaaaa
gattcgagtgcagttaaagccgaactgattaaatctaatccattgtatgctgttcttaac
ctaccgatttatcaaggcgaaaacggacaacaacaattaatgcctggtgcagttgttggt
atgtcgttacaaaaagatactgcaaaagttaatgcttatttaaaacttcctgaagttgct
gcatctattccatctacgatgaaatttatgtggagtgttaaacctagagaaggttcgaaa
attttcgaattatatgcaatcaaagttgttagtgccgatggtaaaccagatttaggtggt
gaggcaatcagcgattcgcgtgcagattttgaccaaaaaggtaaaccagaggtaaccatg
tacatgaccagtgaaggttctgcgaaatggaaaaaaattactgctgaagctgctgctgat
ccaaacaacaaaaaatctattgccattgtattagataaccaggtttattctgctcctact
gttcagaatgaaattgctggtggtgtttcttcaatcacgggtaactttacccaggcagat
actaaagatttatcaaacatcttaaaagctggtaaattgcctgctcctgcgcgtatagca
ggtagctacgtagttggtccaactttaggtgcacaagctattcacgatggtttaatctca
ttcgtaattgcctttatcgtaatcttaatcttcatggcgctgtattatcaccgtgcaggt
tgggttgcaaactttgcattgttaatcaacttattcttcatcattggtatcctggtatca
cttggcgcagtgttaaccttacctggtattgctggtatcgtattaaccattggtttatcg
gtagatgcaaacatccttatctttgagcgtgtacgtgaggagcttgcgcatggcaaaaac
acggctactgcaattaaagaaggttttaaacatgcaatgccgtcgattattgactcaaac
gtaaccttattcattttaggagctatcctttacgttttcggtagcggaccggttcaaggt
tttgccactaccttgtgtatcggtatcctttcatcattatttgctgctgtagccatttcg
agagtagttttcgaatcgttgttaaaccgcaaaatcgaggtaagtttcgataatagctta
acccgtaatgcatttaaaaacttagccttcaactttgttggccgtcgtaaaatctattac
attatctctaccatcattattgttgccggtattggtatgtacttcaaaaatggcggttta
aacttaggtgtagattttaaagggggtagaacttatttggttcacttcgataaagcagtt
aacactgaagatttaaaagctaagttaaacccggttttcggtaacgaaacgccagaggtt
aaaactgcaggtgaagatagtcaggtaaaaattaccactactttccacatcgaagatcag
gacattaaaaccgataaagttgtagaagatgcgttaaataaaggtttagctggatccaaa
tatgaaatcgtaagctcacaaaaggtaacgccgattattgcaagcgatatcgtaaacggt
gctttctatgcagtattgatctcgtgtttattcatgtttatctacatcgttgtacgattc
aaaaaatggcagtatggtttaggtgcggtaatcgccttattccacgacgttttaatggta
ttatctttctatactattttagatggtattatgccattctcattagaaattggtcaggat
tttatcgcagcaattttaacggtaatgggttacaccatgacagagacagttgttgtattt
gaccgtatccgtgagaaattaaaagaatcaggtaaagaagatttacatggtgaagcgcgt
aacaacttaattaacttcgcattgaacagcacattaagtcgtaccattttaacctcatta
accgtattcttcgtgttattggtaatctttattttcggaggcgatagcatccgcgggttt
atcttcgcattgctgattggccgtatcattggtacatactcatcattatgtatttctact
cctatcgtaattgatttgggtagttcagccgagaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
