Candidatus Pelagibacter sp. RS39: B5L73_03050
Help
Entry
B5L73_03050 CDS
T11425
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pela Candidatus Pelagibacter sp. RS39
Pathway
pela03030
DNA replication
pela03430
Mismatch repair
pela03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pela00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
B5L73_03050
03430 Mismatch repair
B5L73_03050
03440 Homologous recombination
B5L73_03050
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pela03032
]
B5L73_03050
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pela03400
]
B5L73_03050
Enzymes [BR:
pela01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
B5L73_03050
DNA replication proteins [BR:
pela03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
B5L73_03050
DNA repair and recombination proteins [BR:
pela03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
B5L73_03050
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
OB_MCM10
HHH_3
SF3a60_bindingd
DUF7597
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARJ47782
LinkDB
All DBs
Position
572340..575756
Genome browser
AA seq
1138 aa
AA seq
DB search
MQEFNSENFNHLKIHTQFSICEGAIKIDDLKDISKDKKLKALGLCDTSNLCGALEFAEKL
SKSGSQPIIGTQINFKLNDTIGLLPLFALNEDGYKTIIQLSSLSFLKNDDLSDPHLDINE
LLNNTEGVAIFSGTINGLFGQLFNKGKFSEIGEIFSKLKANYGDRFYIEIQRHGDQNEKE
FEKFNLINSKKLDIPLIATNEVFYINKDMHEAHDALICIKNKTYVNEKNRVRFSNHHYLK
SSAEMVDLFADLPEALENNYHFPFRCNFRPLSSKPILPNISSDKGISADEILKKDSLDGL
NKKFIKIFNLDNKDFVSDKNYLKYKDRLDHELEIIIKMNYASYFLIVSDYIKWAKENDIP
VGPGRGSGAGSLVAWCLSITDVDPIKFNLIFERFLNPDRISMPDFDIDFCEEKRDLVFEY
LTKKYENSVAHIITFGKLKARMVIRDVGRVLGLAYGFVDSISKMIPFDPSRPQNLTECIA
GEPRLQKLINEDSRVKKLTDLSLKLEGLNRNVATHAAGVVIADKKLTEIVPLYKDATSDL
LLPSTQFDMYSAENAGLIKFDFLGLKTLTVINNTQKLIRKKDKKFNIENINFEDQKVFDL
LSSGKTVGLFQIESAGMREALMQMKPNHIEDIIALVALYRPGPMSNIPIYNDCKHGKKTP
DYLHPLLEDILRPTYGVIIYQEQVMQIAQKLSGFTAGQADILRRAMGKKKRAELEKQKQS
FISGAVNNGISKDVAAGIFLKIEPFAEYGFNKSHAAAYAIISYQTAYLKTYYPQEFIAAS
MTMDISNQNKLSEFYEELKRLKIKIVRPDINECYADFRTDGEKFYYALGAIKAVGYEAVS
NIVEERIKNGKFSSIDNFLNRVNPKDINKLQLEGLVKAGAFDNINLNRQSLFNSIPNFIT
KSKNIYENKSANQIDLFGENNTPDSEVITKIDDWKFEERLSKEFESVGFFISDHPLNQFK
EIFADYDIKDYLNFNNGNEIINSNIAATLLKIQERKTAKGNPYAVLKLTDLTSVFELFIF
SEVLEKNREILKEGSSIILTLAKSVSDEENRFKRINVQKIASLSELINKPIEEVFFNLKS
INELNEISKIIQKDGNTIVKIKLRDQNNELDFTLKNKRNIDRKMLNIIRNKEISAIIR
NT seq
3417 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagagtttaattctgaaaattttaatcatctaaaaatacatactcagttttctatt
tgtgaaggagctattaagatagatgatttaaaagatatttctaaagataaaaaactaaaa
gctctagggttatgtgatacatctaatctatgtggagcattagagtttgctgaaaaacta
tctaaatctgggtctcaaccaataattggaacgcaaatcaattttaaattaaatgataca
ataggtctattacctctatttgctttaaatgaggatggatataaaacaataatacagttg
tcatcattgtcttttctaaaaaatgatgacctttctgatcctcatttagatataaatgaa
ttattaaataacactgaaggtgtagcaatattctccggaacaattaacggtttatttgga
cagttgtttaataaaggtaaattttcagaaattggtgaaattttttcaaaactaaaagct
aattatggagatagattttacattgaaattcaacgtcatggtgatcaaaatgaaaaagaa
tttgaaaaatttaatttaataaactcaaaaaaattagatattcctttaatcgcaactaat
gaggtattttacatcaataaagacatgcatgaagcacatgatgcattgatttgtataaaa
aataagacctatgttaacgaaaaaaatagagttagatttagtaaccatcattacctcaaa
agtagtgcagaaatggttgatttatttgctgatttgccagaggcattagaaaataattat
cattttccgtttcgatgtaattttagacctttatcttctaaacctattttacctaatata
agttctgacaaaggtattagcgcagatgaaatcttaaaaaaagattcattagacggtctt
aataaaaaatttataaagatatttaatttagacaataaagattttgtatctgacaagaat
tatttgaaatataaagatagattagatcatgagttagaaattataattaaaatgaattat
gcaagttattttttaattgtatctgactatataaaatgggcaaaagaaaatgatattcca
gttggacctggtagaggatctggtgctggttccttagtcgcttggtgtctttcaataact
gatgttgacccaataaaatttaacttgatttttgagagatttttaaatccagacagaatt
tcaatgcctgatttcgatatagacttctgtgaagaaaaaagagatttagtttttgaatat
ttaacaaaaaaatatgaaaatagtgttgctcatataatcacatttgggaaattaaaagct
cgaatggttataagagatgttggacgtgttttaggactggcttatggttttgttgatagt
atatcaaagatgatcccatttgatccatcaaggccacaaaatctcacagaatgtattgct
ggagaaccaagacttcaaaaattgataaatgaagatagtagagtaaaaaaacttacagat
ctttcgttaaaattagaaggattaaatagaaatgttgcaactcatgctgctggtgttgtg
atagctgataaaaaattaactgaaatagttccattatataaggatgcaacttctgactta
ttgctaccttcaacacaatttgacatgtactcagctgaaaatgcaggattaattaagttt
gattttttgggattaaaaactttaacagttataaataacactcaaaaactaataagaaaa
aaagataaaaaatttaatattgaaaacataaattttgaagatcaaaaagtttttgatcta
ttgtcatctggcaaaactgttggtttatttcaaattgaaagtgctggaatgcgtgaagca
ttgatgcaaatgaaaccaaatcatatagaagatattattgctttagtagcactttataga
ccaggtccaatgagtaatataccaatttataatgattgcaaacatggaaaaaagacacca
gattatttacatcctttgcttgaagatattttacgacctacctatggggtaataatttac
caagaacaagtaatgcaaattgcacaaaaactatctggtttcactgctggtcaagcagat
attttaagaagagcgatgggtaaaaagaaaagagctgaattagaaaaacaaaaacaaagt
tttatttctggtgctgtaaacaatggtattagcaaagatgttgcggcgggaatcttttta
aaaattgagccatttgcagaatatggatttaacaaaagtcatgcagctgcatacgcaatt
atttcctatcaaacagcttatttaaaaacttattatccgcaagagtttattgctgcatca
atgacaatggatatttctaatcaaaataaattaagtgaattttacgaggaattaaaaaga
ttaaaaataaaaatagtaagaccagacataaatgagtgttatgcagattttagaacagat
ggagaaaaattctattatgcattaggagctattaaagctgtgggatatgaagcggtttca
aatattgttgaggaaagaatcaaaaatggaaaatttagttctattgataattttttaaac
agagtaaatccaaaagatatcaacaagttacaattagaaggtttagtaaaagcaggagct
tttgataatataaacttaaatagacaatcgttatttaattcaataccaaactttataaca
aaatcaaaaaatatttatgaaaataaatctgccaatcagattgatttatttggtgaaaat
aataccccagatagtgaagttataacaaagattgatgactggaaatttgaggaaagattg
tctaaagaatttgagtcagttggcttttttatatctgatcatcctctaaatcaatttaaa
gaaatatttgcagattatgatataaaagactacctaaattttaataatggtaatgaaata
attaactcaaatattgccgcaactttattaaaaatacaagaaagaaaaactgccaaaggg
aatccttatgcagttttaaaattaactgatctaactagcgtttttgaattattcattttt
tctgaagttttagaaaaaaatcgcgaaatattgaaagaaggatcatcaataatattaact
ttggcaaaatctgtttcagatgaagaaaatcgttttaagagaattaatgttcagaaaata
gcctcactttcagagttgattaataaaccaattgaagaggtatttttcaacttaaaatca
ataaatgaattaaacgaaatctcaaaaattatccaaaaagatggaaatacaattgttaaa
attaaattacgagaccaaaataatgaattagattttacgcttaagaataagagaaatatt
gacagaaaaatgttaaatataattagaaataaagagatttctgcaattattcgataa
DBGET
integrated database retrieval system
