Candidatus Pelagibacter sp. RS39: B5L73_03840
Help
Entry
B5L73_03840 CDS
T11425
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
pela Candidatus Pelagibacter sp. RS39
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pela00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pela02000
]
B5L73_03840
Transporters [BR:
pela02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
B5L73_03840
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARJ47928
LinkDB
All DBs
Position
complement(714147..715517)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MSKSIKLTKDPIWTLLRKVTIPASVGSLFQTFYNLVDTWFAGRISAEAISAIAKSFPIYF
TIIAVGVGLGAATNALIGNSIGEKKERVASMYVAQSLIFAFTVSILVTVFGLNASNYLLG
VMGSDAAGIALTREYLDIIFYGTFIVLIQISLNGTLNAQGDTKSYRNVLIFSFFLNIFLN
PLFIWGYGFIPGFGIAGLAIATVISQLIGTIYLAYKVNNCKIREYLKAKCFIPKFDYLKP
LTEQAVPVMFSMLFIGVGIFNILYFIGQFGDLATAGYGAALRVEQVFLLPVIGLNTAVLS
IGGQNFGAKAYDRIRELYTKALLFGSSFMAIAGMIIFFGAEFFVSLFTDNQEAVVSGAIY
LKVAALIGPIYPVFFITTAVFQAVKKPLYSLYLSILRLTAFPFLSLWYVINIRGGDYKDI
FYTIMATNWVMGIVVLIFIGYFLNNVFKQNKPLFSY
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtctaaatcaataaaattaactaaagatccgatttggacactattaagaaaagtcact
atacctgcaagtgttggttcattgtttcaaaccttttataatttagttgatacttggttt
gctggaagaatttctgctgaagctataagtgctattgcaaaatcatttccaatttatttt
actattattgctgttggtgttggattaggagcagctacaaatgctttaattggtaattcc
attggtgaaaagaaagagagagttgcatcgatgtatgttgctcaatctttaatttttgca
tttacagtttccatacttgtaacagtatttggtttaaacgcgtctaattatcttttaggt
gttatgggatctgatgctgctggtatagctctaactagagaatatctagatattatcttt
tatggaacttttattgtactaatccaaatatcattaaatggaactttaaatgcgcaaggt
gatacaaaaagttatagaaatgttttaatatttagtttctttctaaatatctttttaaat
cccctttttatttggggatatggatttattcctggatttggcatagctggattggcaata
gctacagtaatttcacaattaatcggaacaatctacttagcatataaagtaaataattgt
aagattagggaatatcttaaagccaaatgttttattcctaaatttgattacttaaaacca
ctcactgaacaagcggtgcctgtaatgtttagtatgttatttattggagtaggaatattt
aatattttatatttcattggtcagtttggtgatttggcaacagctggttacggagcagca
ttaagagtggaacaggtatttttactcccagtgataggactgaatacagcagttctttct
attggtggtcaaaattttggagctaaagcatacgatagaattagagagctttatacaaag
gctctgctatttggctcttcatttatggcaatcgctgggatgataatattttttggtgca
gaattttttgtttcattatttactgacaatcaagaagcagttgtgagtggagctatttat
ttaaaggttgcagctttaattggacctatttatccagttttttttattactacagctgta
tttcaagctgttaaaaaacccctatatagtctttatttaagtatattgagattaactgcg
tttcctttcttaagcttgtggtatgtaataaatatcagaggtggtgattacaaggatata
ttctatacgataatggctacaaattgggttatggggattgttgttttaatatttattggt
tattttttaaataatgtatttaaacaaaataaacctctttttagttattag
DBGET
integrated database retrieval system