Pedobacter sp. PACM 27299: AQ505_11860
Help
Entry
AQ505_11860 CDS
T04140
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
pep
Pedobacter sp. PACM 27299
Pathway
pep02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pep00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
AQ505_11860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
Big_12
Big_6
MBG_2
Big_3_3
CHU_C
DUF4998
fn3
HL_N-beta
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALL06127
UniProt:
A0A0P0NGE3
LinkDB
All DBs
Position
complement(2824534..2833128)
Genome browser
AA seq
2864 aa
AA seq
DB search
MPVPDLALNKSVKQIIKLIIMRYLKTIILLWVAILASLTANAQSANSHTISSSGGTFPLP
GGNTINFTIGEPVIETIGSNPVFTQGLHQTLLFFSIIDVNSPNTVTLYKAGAVIPITVTF
NQPVFVTGTPELALNSGGKGLYTTGSGTTTLTFNYTVGPGETSADLDYAAIGSLTLAGGT
IQNSLGAAAPLTLPVPGTAGSLGGNKDFVIDTTAPAAPSTPSLATLSDSGPSNSDHITNV
TTPVFTGTAEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGVATGGNWSITASTLTEGVHTITANATDAAGN
TGLASTGLPVTIDLTSPTLVITSNVATLKASETATITFTFSEDPGTTFAWDGTTGDVVVT
GGTLAAISGSGLTRTATFTPTSLVNGGTASITVAAGTYTDLAGNNGGAGTTPSLTYDTFP
PVSPSTPDLAAASDSGISNSDNVTNVTTPVLTGTAEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGAATGG
NWSITASTLTEGVHTITAKATDAAGNTSLASTGLAITIDLTSPTLAITSNAAQLKSGETA
TITFTFSEDPGTTFAWDGTTGDVVVTGGTLAAISGSGLTRTATFTPAAATNAGTASITVA
AATYTDAAGNNGGAGTTPLLNFDTSTPNAPSAPVLAAASDSGVSNSDNLTNVTTPVFTGT
AEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGAATGGNWSITASTLAEGIHTITAKATDAAGNTSLASSGL
AITIDLTSPTLAITSNVAQLKSGETATITFTFSEDPGTTFAWDGTTGDVVVTGGTLAAIS
GSGLTRTATFTPTAGTNAGAASITVAAATYTDAAGNNGGAGTTPVLNFDTSAPNAPSAPV
LAAASDSGVSNSDNLTNVTTPVFTGTAEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGVATGGNWSITLST
LAEGIHTITAKTTDAAGNTSLASTGLAITIDLTSPTLAITSNVAQLKSGETATITFTFSE
DPGTTFAWNGTTGDVVVTGGTLAATSGSGLTRTATFTPTAGTNAGTAGITVAAATYTDAA
GNNGGAGTTPVLNFDTSAPNAPSAPVLAAASDSGVSNSDNMTNVTSPVFTGTAEAGSTVT
LYDTDGTTVLGTGVATGGNWSITASTLAEGIHTITAKTTDAAGNTSVASTGLAITIDLTS
PTLAITSNAAQLKSGENATITFTFSEDPGTTFAWDGTTGDVVVTGGTLAAISGSGLTRTA
TFTPTAGTNAGTAGITVAAATYTDAAGNNGGAGTTPVLNYDTSTPNAPSAPVLAAASDSG
VSNSDNLTNVTTPVFTGTAEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGVATGGNWSITASTLAEGIHTI
TAKTTDAAGNTSVASTGLAITIDLTSPTLAITSNVAQLKSGETATITFTFSEDPGTTFAW
NGTTGDVVVTGGTLAAISGSGLTRTAIFTPTAGTNAGTASITVAAATYTDAAGNNGGAGT
TPVLNFDTSAPNAPSAPVLATASDSGFSNSDNLTNVTTPVFTGTAEAGSTVTLYDTDGTN
VLGTGVATGGIWSITASTLAEGIHTITAKATDAAGNTSLASTGLAITIDLTSPTLAITSN
AAQLKSDETATITFTFSEDPGTTFAWDGTTGDVVVTGGTLAAISGSGLTRTATFTPTAGT
NAGIASITVAAATYTDAAGNNGGAGTTPLLNFDTSAPNAPSAPVLAAASDSGVSNSDNLT
NVTTPVLTGTAEAGSTVTLYDTDGTTVLGTGVATGGNWSITTSTLTEGVHTITAKATDAA
SNSSIVSSGLIITINTTIPTVISIALADPNPTLATSVNYTVTFTKDVFNVDVNDFATVLS
GTTGTIANIAHSDNRVFSVTVNSITGDGTIGLNLNNTGTGITDVAGNSIAAGFTGDFYTF
DHSIPTLAGVNIISDNSNPVFAQVGNTATLTFTSSETIQTPVVTIAGHSVTPVASGNNWT
ATYTFTAADPEGLVPYQISFQDLIGNVGTPVSTGSGSVTLDKVLPTLTNVNILSDNAIPT
IAKAGNTATLTFTASEVLQTPVVTIGGHAVVPTASGSNWTATYTFTAADPDGLVAYNISF
SDLAGNAGTPVSTGTGSVTLDRTAPAIPANLAAVSGDTQIILNWAANTESDLAKYRIFYG
TSAAPTTLLADIPAGTTNYTNIGLTNGTTYYYRIQAVDQAGNSSALSTDVSQVPRGNQSI
TFNAIAAKTYGDIVFSLGNLNSSAGLPVIYTATDPSIVSITGNMATILKSGSTTITASQP
GNTIFNAAANVQQTLTVNTATLTIVNNNRSKVYGDVLNGLDFTGTITGIQNGDNITITRN
SLGAPAAAATGTYPTVATLIDPDNRLANYTVNNPDGTLTITQKALTITASNLSKAYGDLP
VFTGTEFTANGLINGDVITSVSLNSLGAAANASVAGSDYDIVASAAVGTGLSSYNIVYIK
GKLTVNRKTLTIIADEKEKFLAEVNPALTATYSGLANGENSSALSSSPVLTTTATTNSPV
GTYDINISGAAADNYAITYQKGTLTVKTDAPTTISLASVPLYENAAVGSAAGTLSSTSDY
PGALFTYSLVTGSGDTDNTAFAINGNQLQTTAILDFETKSVYKVRVRSTTQNNTSLEKEL
TINLTDVNESPTLSAIGDLALCATTTTQTIALTGISAGPESSQTTTLTVNSTNSSLFETL
KVVGSGATGTLTYKLRNSASGAATVTVLVKDNGGTANGGVDTYSRSFVLTVNASPAISIS
SNLGNQVSKGATVLLTATGGTNYVWANSNGILNGLNSAVLTVRPKETTTYTVTSTNANGC
SQTQTFTLGILDDLALIKGTNIITPNGDGYNDKWIVDNIDFYPNNEVKVFDKAGRILYTK
KGYDNSWDATVNGHPLEEGTYYYIIDFGTNKLRFKGFITVVREN
NT seq
8595 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagtgccggacttagcattgaataaatcagttaagcagatcattaaacttattatc
atgagataccttaaaacaattatattgttatgggttgcgattttagctagcttaactgca
aatgctcagtctgcaaatagccatacgattagttccagtggcggcaccttcccgttgcct
ggtgggaacactataaacttcacgattggggagccggtcattgagacaataggctcaaac
cccgtatttacgcagggcttacatcaaactttattgtttttttcaataattgatgtgaac
tctccaaatacagttacgctttataaagcaggagctgtcatccccataacggttacgttt
aatcagccagtcttcgtaacaggaaccccagaactcgctttaaatagtggtggaaaaggg
ttatataccactggatctgggactacgacacttacctttaattacaccgttggccctgga
gaaacttccgctgatttagattatgccgcgatcggctcacttacccttgcaggcggaacc
attcagaatagccttggtgcggccgctcccctgactttaccagtaccgggtaccgcaggc
tcattagggggaaataaagatttcgttatcgatactacagccccagcagcaccatcaacg
ccttctttagctacactaagtgacagcggtccatccaatagcgatcacattaccaatgtc
actactccagtatttacaggtactgcagaagcaggatcaacagtaaccctttacgatacc
gatggtacaactgtgcttggaactggtgttgccactggaggaaactggtcaattaccgca
agcaccttaaccgaaggtgtgcataccattactgcaaatgcaacagatgcagccgggaat
acaggtcttgcttcaaccgggcttccagttaccatagatctgacttcacctacgttggtc
atcaccagcaatgtagcaacattgaaagccagtgaaacagccaccattacctttactttc
tctgaagatccgggaaccacatttgcatgggacggaacaaccggagatgtggtggtaacg
ggaggtacactagctgcaatttctggttcaggattaacacgtacggcaacttttacgcca
acatcactggtaaacggaggtacagcaagtatcaccgtagcagcaggtacgtatacagat
ctggcaggtaacaatggtggtgcaggtacgacgccttcgctgacttacgataccttccct
cctgtttcaccatcgactcctgatttagcagcagcaagtgacagtgggatatcgaatagt
gacaacgttaccaatgtcactacccctgtacttactggtactgcggaggcaggatcaaca
gttacgctttacgataccgacggcaccactgtgcttggaacgggtgctgctactggagga
aactggtcgattaccgcaagcactttaacggaaggtgtacataccatcaccgcaaaagca
acagacgccgctgggaataccagtttagcttctactggccttgccatcacgattgatttg
acttcgcctaccctggccattaccagtaatgcagcgcaattgaaatctggtgaaacagcc
accattacctttactttctctgaagatccgggaactacatttgcatgggatggaacaacc
ggagatgtggtggtgacaggtggaactttagccgcaatttcaggttcaggactaacacgt
acggcaacttttaccccagctgcagcaacaaatgcaggtacagcaagcatcactgtagca
gcagctacttatacagatgcggcaggtaacaacggcggtgcaggcacaactccgttattg
aactttgatacttctacgcctaacgcaccatctgctccagttctggcagcagcaagtgac
agcggggtatctaacagcgataacctgaccaacgtcactacacctgtatttacaggtact
gcagaagcaggatcaacagtaaccctttacgataccgatggtacaactgtgcttggaacg
ggtgctgctactggaggaaactggtcaattaccgcaagcacattggctgaaggaatacat
accatcaccgcaaaagcaacagacgccgctggtaataccagtttagcttctagcggcctt
gccatcacgattgatttgacttcccctaccctggccattaccagtaatgtagcgcaattg
aaatctggtgaaacagccaccattacctttactttttctgaagatccgggaaccacattt
gcatgggacggaacaaccggagatgtggtggtgacaggtggaactttagctgcaatttca
ggttcaggactaacacgtacggcaacttttacgccaactgcaggaacaaatgcaggtgca
gcaagcatcactgtagcagcagctacttatacagatgcggcaggtaacaacggcggtgca
ggaacaactccggtattgaactttgatacttctgcgcctaacgcaccatctgctccagtt
ctggcagcagcaagtgacagcggggtatctaacagcgataacctgaccaatgtaactaca
cctgtatttacaggtactgcagaagcaggatcaacagttacgctttacgataccgacggc
accactgtacttggaacgggtgttgctactggtggaaactggtcaattactttaagcaca
ttggctgaaggaatacataccatcaccgcaaaaacaacagacgccgctggcaataccagt
ttagcttctaccggtcttgccatcacgattgatttgacttcccctaccctggccattacc
agtaatgtagcgcaattgaaatctggtgaaacagccaccattacctttactttttctgaa
gatccgggaaccacatttgcatggaacggaacaaccggagatgtggtggtgacaggtgga
actttagctgcaacttcaggttcaggactaacacgtacggcaacttttacgccaactgca
ggaacaaatgcaggtacagcaggcatcactgtagcagcagctacttatacagatgcggca
ggtaacaacggcggtgcaggcacaactccggtattgaactttgatacttctgcgcctaac
gcaccatctgctccagttctggcagcagcaagtgacagtggggtatctaacagcgataac
atgaccaatgtaacttcacctgtatttacaggtactgcagaagcaggatcaacagtaacc
ctttacgacaccgacggcaccactgtgcttggaacgggtgttgctactggaggaaactgg
tcgattactgcaagcacattggctgaaggaatacataccatcactgcaaaaacaacagat
gccgctgggaataccagtgtagcttctactggtcttgccatcacgattgatttgacttcg
cctaccctggccattaccagtaatgcagcgcaattgaaatctggtgaaaatgctaccatt
acctttactttctctgaagatccgggaaccacatttgcatgggacggaacaaccggagat
gtggtggtaacgggaggtacattagccgcaatttcaggttcaggactaacacgtacggca
acttttacgccaactgcaggaacaaatgcaggtacagcaggcatcactgtagcagcagct
acttatacagatgcagcaggtaacaacggcggtgcaggcacaactccggtattgaactat
gatacttctacgcctaacgcaccatctgctccagttctggcagcagcaagtgacagtggg
gtatctaacagcgataacctgaccaatgtaactacacctgtatttacaggtactgcagaa
gcaggatcaacagttacgctttacgataccgacggcaccactgtgcttggaacgggtgtt
gctactggtggaaactggtcaattactgcaagcacattggctgaaggaatacataccatc
accgcaaaaacaacagacgccgctggcaataccagtgtagcttctaccggtcttgccatc
acgattgatttgacttcccctaccctggccattaccagtaatgtagcgcaattgaaatct
ggtgaaacagccaccattacctttactttctctgaagatccgggaaccacatttgcatgg
aacggaacaaccggagatgtagtggtaactggaggtacactagctgcaatttctggttca
ggactaacacgtacggctatttttacgccaactgcaggaacaaatgcaggaacagcaagc
atcactgtagcagcagctacttatacagatgcagcaggtaacaacggcggcgcaggcaca
actccggtattgaactttgatacttctgcgcctaatgcaccatctgctcctgttctggca
acagcaagtgacagtgggttttcgaatagtgacaacctaaccaatgtaactacacctgta
tttacaggtactgcagaagcaggatcaacagtaaccctttacgataccgacggcaccaat
gtgcttggaacgggtgttgctactggaggaatctggtcgattactgcaagcacattggct
gaaggaatacataccatcaccgcaaaagcaacagacgccgctggtaataccagtttagct
tctactggccttgccatcacgattgatctgacttcgcctaccctggccattaccagtaat
gcagcgcaattgaaatctgatgaaacagctaccattacctttactttctctgaagatccg
ggaaccacatttgcatgggacggaacaaccggagatgtggtggtaacgggaggtacatta
gccgcaatttcaggttcaggactaacacgtacggcaacttttacgccaactgcaggaaca
aatgcaggtatagcaagcatcactgtagcagcagctacttatacagatgcggcaggtaac
aacggaggtgcaggcacaactccgttattgaactttgatacttctgcgcctaacgcacca
tctgctccggttctggcagcagcaagtgacagcggggtatctaacagcgataacctaacc
aatgtaactacacctgtacttacaggtactgcagaagcaggatcaacagtcacactttac
gataccgatggtacaactgtacttggaaccggtgttgctactggtggaaactggtctatt
actacaagtactttaactgaaggtgtacataccatcaccgcaaaagcaacagatgcagct
agtaacagcagtatagtttcatcaggattaataatcaccattaacaccacaattccaact
gtaattagtatcgcgcttgcagatcctaacccgacactggcaacaagtgtaaactatacg
gtaactttcactaaagacgtgtttaatgtggatgtaaatgattttgcgactgtactttca
ggtactacaggaacaattgcaaacattgcccattctgacaacagagttttcagtgtaacg
gtgaattccatcaccggagacggaacaatcggactgaacctgaacaacactggaacagga
attaccgatgttgccggaaatagtattgcagcaggtttcactggtgatttttacaccttt
gaccatagcatacctactttagccggagtaaatattatatccgataacagcaatccggtc
ttcgcacaagttggcaacactgcaactttaacctttacttccagtgagaccatccaaact
ccggtagtgacgatcgctggtcatagtgtaacacctgttgcatctggaaataactggact
gcaacttacacttttacagcggcagatccagaaggtttggtgccttaccagatcagcttc
caggatttgattggtaatgttggaaccccggtttctacaggttcaggctcggtaacttta
gataaagttttgcctactttaactaatgtcaacatcctgtctgacaatgccattcctaca
attgcaaaggcaggaaacacggctacattaacctttacagcaagtgaagtgttgcaaact
ccggttgtgactattggaggtcatgctgtggtgccaactgcttcaggaagcaactggacg
gcaacttacactttcactgccgcagatccggatggcttagtggcttataacatcagcttt
agtgatctggcaggaaatgcaggaaccccggtttctacaggtacgggttcggtaacatta
gacagaaccgcaccggccatcccggccaaccttgcagcagtttccggtgatacacaaatc
atattgaactgggctgcaaatacggaaagtgacctggctaaataccgtatcttttatggc
acaagtgctgcgccaaccacactgctcgccgatatacctgcaggtacaactaactacacc
aatattgggttaacaaacggcaccacttactattaccgcattcaggcagtcgatcaggct
ggtaattcaagtgcattaagcacagatgtttcacaggttccaagaggcaatcaaagcatt
actttcaatgcgattgctgcaaaaacttacggagacatcgtcttcagccttggaaatcta
aattcatcagccggtcttccagtgatctacactgcgactgacccttccattgtatcaatt
acaggcaatatggccactatattgaaatcaggaagtacaacgattactgcaagtcagcct
ggtaataccatctttaatgcagcagcaaatgtgcagcaaacattaaccgtaaatactgca
acgctgacgattgtgaacaataaccgttctaaagtctatggtgatgtactcaacggtctt
gacttcacaggaacgattaccggaattcaaaacggtgacaatatcaccattaccaggaat
agtcttggtgcaccggcagccgctgcaacaggtacatatccaactgttgccacattaatc
gatccggataacaggttagctaattatacagttaataatccggatggcacactgaccatt
acacagaaagcactgaccatcaccgcttcaaatctgagtaaagcctatggtgatttacct
gtatttactggtactgaatttacagctaatggtctgattaatggagacgtcattacctca
gtaagcctaaacagccttggtgcagccgcaaatgcaagtgttgcaggctctgattatgac
attgttgcttcagcagctgttggaacaggtttaagcagttataacatcgtttatatcaaa
ggtaaattaacagtgaacagaaagactttaacgatcattgctgatgaaaaagagaagttt
ttggctgaagtcaatccagcgcttaccgcgacttattcaggtctggcaaatggagaaaat
agttcagcactcagcagctctcctgtcttgactactacggcaaccaccaatagcccggtt
ggtacttacgacatcaatatcagtggtgctgcagcagacaattatgccattacttatcaa
aaaggaacgctgactgttaaaacggatgcgccaaccaccatcagccttgccagcgtacca
ttgtacgaaaacgccgctgtgggatcggctgccggaacactaagcagtacatctgattat
ccgggtgcattatttacctattcattagtgacaggttccggggatacagataatactgca
tttgccatcaatggcaatcagcttcagaccactgcaatcctggatttcgaaacaaaatct
gtttacaaagtgagggtacgttctacgacacaaaataatacgtcgctggaaaaagaactg
accattaatttaacagatgtgaacgagtcccctacactatctgccataggcgatcttgct
ttgtgtgccacaacaaccacacaaactattgccttaacaggaatcagcgctggtccggaa
agcagtcaaaccactacactaacggttaatagtaccaattcaagtctttttgaaacgtta
aaagttgtgggtagcggtgctacaggaaccttaacttacaaattgagaaacagtgcatca
ggtgcagccacggtgactgtattagtgaaagacaatggaggtaccgcaaatggaggagta
gatacctacagtcgttcatttgtacttactgtcaatgcttcacctgcgatctctatcagc
agtaatttaggtaatcaggtaagcaaaggggcaacagtgctcttaactgcaacaggcgga
acaaattatgtttgggcaaacagtaatggcatcctgaatgggctaaattcagcagtgctt
acagtaaggccaaaggaaacgactacctacacggtaacttcaaccaatgccaatggctgt
tcacaaacccaaacatttaccttgggtatactggacgatctggcgctgattaaaggaacc
aatatcatcacccctaacggagatggttataatgacaagtggattgtagataacatcgat
ttctatccgaataatgaagtgaaggtttttgacaaagctggaagaattctttatactaaa
aagggatatgataacagctgggatgccacggtaaatggccatcctttagaggaaggaacc
tactattacatcattgacttcggaacaaacaagcttagattcaaaggctttattactgtt
gtcagagaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system