Peribacillus sp. JNUCC41: JNUCC41_04670
Help
Entry
JNUCC41_04670 CDS
T11068
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
perj Peribacillus sp. JNUCC41
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOS91053
LinkDB
All DBs
Position
complement(946347..948752)
Genome browser
AA seq
801 aa
AA seq
DB search
MPEFFDGRTSQNASYANSINIPTSSAYQLFGQVGLNVSEANPTSMIRVQFDGIITLKVNP
EASVPVHFVEIKIVRGTNPNANIIFSGIKTMVLNGSEVGSQEYAFSASDYNVPKGSGLLV
YTAFVRNITGSADTDVTRVGPESFNASASGITGATGNPGATGATGATGATGATGNPGATG
ATGATGSTGATGNPGATGATGATGVTGAMGDPGATGSTGATGDPGAAGATGVTGATGAAG
ATGATGSTGATGAAGETGSTGATGSTGATGSTGAAGSTGVTGATGDPGVTGATGATGDQG
ATGATGATGATGATGVTGATGDPGATGVTGATGAAGSTGATGATGSTGATGATGATGATG
STGATGATGAAGVTGSTGATGSTGAAGATGATGSTGATGATGSTGATGSTGATGATGATG
STGVTGATGAAGSTGATGVTGATGDPGATGSTGSTGATGTTGAAGSTGAAGATGSTGSTG
AAGATGSTGATGSTGAAGVTGSTGATGSTGAAGVTGSTGATGTTGATGATGATGATGSTG
ATGTTGTAGATGATGATGATGTTGAAGSTGATGTTGTAGATGATGTTGAVGAMGSTGATG
TTGAAGVTGSTGATGTTGAVGATGSTGATGTTGAAGATGATGATGAAGSTGVTGATGAAG
ATGATGATGATPQLTFAEVDGPVALTTTGTETSVVTMNVPTIIGQNVKVDYAVSIDVVTT
ANSNFTFQTRLYRNGTLVDTRSVQRSITAAGTSRFPVASTNVNTAAITGTSTYEVRIAYT
VASNVTSSSAINADINAIRFP
NT seq
2406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagaattctttgatggaagaacatctcaaaatgcttcctatgccaactccattaac
attcccacttcgtctgcttatcaattatttggacaagttggccttaatgttagcgaagca
aatcccacttcaatgattcgggttcaatttgacgggatcatcaccttaaaagtaaatccg
gaagcaagtgttcctgtacattttgttgaaattaaaattgttagagggaccaatcctaat
gctaatataattttttccggtattaagactatggttcttaatggctctgaggtcggatct
caagagtacgcattttcagcttcagattacaatgtcccaaaaggttcaggacttttagta
tatacagcttttgttcgtaacattactggttcagctgatacagatgtaacgcgtgttggc
ccagagagctttaatgcgtcagctagtggaattacaggcgcaacgggaaatccaggagca
acaggagccacgggagcgacaggagccacgggagccacgggaaatccaggagcaacagga
gcaacgggtgcgacgggatcaacgggtgcgacaggaaatccaggagcaacaggagcgaca
ggagccacaggagtaacgggagccatgggagatccaggagcaacaggatccacgggagcg
acgggagatccaggtgcggcaggagcaaccggagtaacgggagcaacaggcgccgcagga
gccacgggtgcgacaggatccaccggagcaacaggagccgcaggagagacgggatcaacg
ggagcaacaggatcaacgggagcaacaggatccaccggagcagcaggatccaccggagta
acgggagcgacgggagatccgggagtaacgggtgcaacaggtgcgacgggagatcaaggg
gccacgggagccacaggagcgacgggtgcaacaggagccacaggagtcacgggagcgacg
ggagatccaggagcaaccggagtaacgggtgcaacaggggccgcaggatccacgggagcc
accggagccacgggatcaacgggtgcgacaggagccaccggagccaccggagcgacggga
tcaacgggtgcgacaggagccaccggagccgcgggagtgacgggatcaacgggagcaaca
ggatccaccggagcagcaggagccacaggagcaacaggatccaccggagcaacaggagcg
acgggatcaacgggtgcaacaggatccaccggagcaacaggagcgacgggagcaacagga
tccaccggagtaacgggagcaacaggagccgcaggatccacgggagcaaccggagtaacg
ggagccaccggagatccaggagccacgggatccacgggatccacgggtgcaacaggaacc
accggagcagcaggatccacaggagccgcaggagccacgggatcaacaggatccaccgga
gccgcaggagcgacgggatcaacgggtgcaacaggatccaccggagccgcgggagtgacg
ggatcaacgggtgcaacaggatccaccggagccgcgggagtgacgggatcaacgggtgca
acaggaaccaccggagccacgggtgcgacaggagccacgggtgcaacaggatccaccgga
gcaacaggaaccaccggaacagcaggagcgacgggagcaacaggagcaacaggagcaaca
ggaaccaccggagccgcaggatccaccggagcaacaggaaccaccggaacagcaggagcg
acgggagcaacaggaaccaccggagccgtaggagccatgggatcaacgggtgcaacagga
accaccggagccgcgggagtgacgggatcaacgggtgcaacaggaaccaccggggccgta
ggagccacgggatcaacgggtgcaacaggaaccaccggagccgcaggagcaacaggagcg
acgggagcaacaggggccgcaggatccaccggagtaacgggtgcaacaggggccgcagga
gccacgggagccaccggagcaaccggagcaactcctcaattaacttttgcagaagtggat
ggtccagtcgctctcacaactactggaaccgaaacgtcagtggttacaatgaatgtacca
actattattggccagaacgttaaagtggactatgcggtatcaattgatgtggtcacaacg
gccaactcaaatttcacctttcaaactaggctatatcgtaatgggactttagttgataca
cgttccgttcaaagaagtataactgctgcaggtacgtcaagatttcctgttgcatctact
aatgtgaatactgccgctattactggaacttcaacatatgaagttagaatcgcttataca
gtagcatcaaatgtaacctcttcaagtgctataaatgccgatattaacgcaatacgcttt
ccataa
DBGET
integrated database retrieval system
