Petroclostridium sp. X23: QKW49_25380
Help
Entry
QKW49_25380 CDS
T09049
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
petr
Petroclostridium sp. X23
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
dCache_1
GGDEF_2
HTH_3
BTHB
Alpha-amyl_C
HTH_6
BORCS8
UPF0122
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHH59079
LinkDB
All DBs
Position
5425101..5427425
Genome browser
AA seq
774 aa
AA seq
DB search
MKRKYVNDYKFNSIFVKTLLVLMMFSLIPLIATNAVIYRRSIAIIQKQAHNINMNMLVKT
NEAVDLIFKQVDDIVQQIAKDSDVVELVIDPASESFTNSHKIIGKLMNVSYASNYISSVY
VYNTYNDKIYSSTGGVYKFSDFYDKDWFKDYNKFIIGTSKLETRKISDALGNQFNCITFI
RNIPFSSWSKLGAVIVNINEEKLYELVSGVNTEDNGVLYVVNRDGKILLHKEKSKLRTYF
SDDPSMNAILKDDSGYVIQHVNGKKMLVTYTTSGYNGWKYIYSIPLEELQKDSKIISKMI
KISAIIYILFALVFSFLISKGMYEPIERLINLILASSKDEFFTKGITAKDEYEFLNYAYN
DVIDKNKSMEDAIKSIKPMVKEKLFTNLIMGKRTSLEEILEKLKLLSIDFHSTNFIVVVM
QIDNYSEFCKKFDEIDRSIYKINLMAMAETVISSRNKGVCIEIESDKIAAIINCTNEGIS
MQARDELLLMIEKIKNEVKKHFPFTITQGVGRVYKSIVDIKLSYNEAIIALKYKLYQGTN
EVINIDDIEVQSEELYYHNSEKEKMIVNNLRIGQYKEVETLVEEMAGEILNNRSISYESV
QQVFVRLVNGIVELIINMGMTVDEIFGKQANLYEQLAAQETIEDIKVWLMKICRTISDEI
NSTNSDKSQKNAERILEYINENLSKDISLNEVADLIGFSRAYVSKIFKDYTGKNYTDYVN
GNRIEKAKQLLKDSQLSIKEVGFRVGFNSIQTFMRTFKKYEGITPGQYRDNIRI
NT seq
2325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaaatatgtaaatgactataaatttaatagtatttttgtcaaaaccttactt
gtacttatgatgttttcacttatacctttaatagctaccaatgcggtgatttatagacgg
tctatagcgatcatacaaaagcaagcgcataatatcaatatgaatatgctggtgaaaacc
aatgaagcggtagatttgatttttaagcaggtagatgatatcgtacagcagattgccaag
gactctgatgttgtagaattagtcattgaccctgcaagtgagtcgtttactaatagtcat
aagatcattgggaagctgatgaatgtttcatatgcctcgaattatatatcctctgtttat
gtctataatacatacaatgataaaatttacagctcaacaggaggggtttataagtttagt
gatttttatgataaagattggtttaaagactataataaatttattattggcacatcaaaa
cttgagactagaaagatatccgatgctttgggcaaccaatttaattgtattacgtttata
aggaatattccgttttcatcatggagcaagttgggtgcggtgatagtcaatattaatgaa
gaaaagctgtatgaattggtgtcgggagtaaatacagaagataatggggttctttatgta
gtcaatcgtgatggaaaaatactgcttcataaagagaaaagtaaattaagaacatatttt
agtgatgaccctagcatgaatgctattttaaaagatgacagcggatacgttattcaacat
gtcaatggtaaaaagatgttggttacatatactacttccggatataatggatggaaatac
atttattccattccattggaagagttacaaaaggattctaaaattatatcaaaaatgatc
aaaatttcagcaatcatttatatcctatttgctttggtattttctttcttgatttcaaaa
ggtatgtatgaacctattgagagattaatcaatcttattttagcgtcctcaaaagatgag
ttttttaccaaaggcattacagccaaagatgagtacgaattcttaaattatgcttataat
gatgtcattgataaaaacaaaagtatggaagatgctatcaaaagtataaaacccatggta
aaagaaaaattatttacgaatttgatcatggggaagagaacgagtttggaagagatcctt
gaaaaactaaaattgctaagtattgatttccattcaacaaattttattgttgtagtcatg
caaatagataattacagcgaattttgcaaaaaattcgatgagattgatagaagtatttat
aaaattaacctgatggccatggcggaaacagtcatttcaagtagaaataagggagtatgt
attgaaatagagtctgataaaatagccgcaatcattaattgcaccaatgaaggtatttca
atgcaagcaagagatgaattactactgatgatagaaaagataaagaacgaggttaaaaag
cactttccttttaccattacacaaggggtcggaagggtgtataagagtattgtcgatatt
aagttatcctacaatgaagcaattattgctcttaaatataagttgtaccagggtacaaat
gaggtaatcaatatagatgatatagaagtacaatcagaagaactatactatcataattca
gaaaaagaaaaaatgattgtaaataaccttagaattggccaatataaggaagtagaaaca
ttagttgaagaaatggccggtgagattttaaataaccgcagtatttcatatgaaagtgtt
caacaggtatttgtaagattggtcaatggcattgtggaactgataatcaatatgggaatg
acggtagatgagatttttggaaaacaagcgaatctgtatgaacaattggcggctcaagag
acaatagaagatattaaagtttggcttatgaagatctgccggaccatctcggatgaaatc
aacagcacgaatagtgataaaagccaaaaaaatgcagagagaatattggaatatattaac
gagaatttaagtaaggatatttcattaaacgaagttgcggatttaattggttttagcaga
gcatacgtcagtaagatatttaaagactatacagggaaaaactataccgattatgtaaat
ggaaaccgtatagaaaaagccaaacagcttcttaaggattctcaactatccataaaagaa
gtaggatttagagttggatttaacagcattcagacttttatgagaacttttaaaaaatac
gaaggtattactccggggcaatatagagataatatccgtatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
