Populus euphratica (Euphrates poplar): 105125922
Help
Entry
105125922 CDS
T05872
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
peu
Populus euphratica (Euphrates poplar)
Pathway
peu03015
mRNA surveillance pathway
peu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
peu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
105125922
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105125922
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
peu03041
]
105125922
Spliceosome [BR:
peu03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
105125922
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105125922
NCBI-ProteinID:
XP_011024900
UniProt:
A0AAJ6U850
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
452 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQDGDSGPPSYGGGGGYGGYGGDGGGRGGYGGRGGGGGGGRGGGGGGYGGHSQSR
GGGYQGGDRGGRGGGGGGRGGGRGGSGREGDWPCPKPGCGNLNFARRVACNKCGTPAPAA
GQNDRSDGDGGYRGGSGGGYGGNRGGRGGDSYDGNRNSNYNDGSRGGGYDNRSGSRGGSY
SGNQGRDDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGNYPPAPNSYGGNANYGMEAVPPPTSYTGGPTSY
PPSYGGPASGYGGDATGEVRSGGRGGQPGGYEGGRGGGGSRYQGGSGYGAAPADAPAKIK
QCDDNCDDTCDNARIYISNLPPDVTIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
DENGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDFRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGG
YGGGGRRRDNYRDGGNSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgggatgtatggtcaagacggtgattcaggtcctccgtcttacggtggcggaggt
ggatatggaggttacggaggcgatggtggcggacgtggtggatatggtggtcgaggaggt
ggtggaggcggggggagaggcggaggaggaggaggatatggtggtcattcgcaaagtcga
ggaggtggataccaaggaggagatcggggaggcagaggcggcggaggcggcggaagaggt
ggtggccgtggtggaagcggcagggaaggtgattggccttgccctaaaccaggttgtggg
aatttgaactttgcaagaagagttgcttgtaataaatgcggtactcctgctcctgctgct
ggccaaaatgatcgcagtgatggtgatggtggttatagaggaggaagtggtggaggatat
ggtggtaatagaggaggaagaggtggtgatagttatgatggtaatagaaatagtaattat
aacgatggaagcagaggaggtggttatgataatagaagtgggagtagaggtgggtcttac
agtggtaatcaaggaagagatgatagtggatacaatcaagctccaccaccatctctccct
tcatatggtggtggtggaggtaattatccaccggctccgaactcgtatggtgggaatgct
aattatggaatggaagcagttcctccacctacaagctataccggtgggcccacgtcatac
cctccatcttatggtggtcctgctagtggttatgggggtgatgctacaggtgaggtgagg
agtggtggacgaggtggtcaacctggtgggtatgaaggtggacgtggtggtggcggttct
cgatatcagggaggtagtggttatggggctgctcctgctgatgccccagctaaaattaag
cagtgcgatgataattgtgacgatacttgtgacaatgcaagaatatatatatctaattta
ccacctgatgtgaccattgaagagctgagagagctttttggcggcattggacaagttggg
aggattaagcagaagcggggctataaagatcaatggccctggaatataaagatatacacc
gatgagaatggaaacaacaaaggtgatgcctgtttggcatatgaagacccatctgctgct
cactctgctggcggtttttacaacaattatgatttcaggggctataaaatcaatgttgca
atggcagaaaagtcagctccgaggcaacctgcacatgaccatggtggtggtagaggtggc
tatggtggtggaggtcgacgcagggataattaccgtgatggtgggaattctggtccagac
aggcatcaacatggtggaaatcgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
