Populus euphratica (Euphrates poplar): 105129419
Help
Entry
105129419 CDS
T05872
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
peu
Populus euphratica (Euphrates poplar)
Pathway
peu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
peu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105129419
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
peu03019
]
105129419
Messenger RNA biogenesis [BR:
peu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
105129419
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105129419
NCBI-ProteinID:
XP_011029769
UniProt:
A0AAJ6XT06
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLGEYFTQYGDVLQTVVMKDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDTHTIDGRTVEAKRALSREEQQTNARAGNLNPARNTSSGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTDDGFRQYFEAFGLVTDVVIMYDQSTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQRTFHDLNGKQV
EVKRALPKEANPGGGGRSMGGSYQSYGGSGGNTNSYDGRMDSNRYMQPQGTGGGFPPYGS
SGYNAAGYGYGPASNGVGYGGYSSYTGAGAGYGGPAGAVYGNPNVPNPGYASGPPGAPRS
SWNSQGSSGYSAMGYGSAASWGASSAGAGSGPGSASAGQSPGGATGYGNQGYGYGSYGGN
DGSYVNPVGYGAVGGRSGGASNSNAGGPGGAELQGSGGGGGYMGSGYGDANGNSGYGNAS
WRSEQPQTSGNYGGPQANGPGGYGGSYGGSQARQTQQQ
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggggggatttcatgggagacgtcagaggag
aagctcggggaatattttacgcaatatggcgacgttttgcagactgtcgttatgaaagat
aagactacaggcaggcctagaggctttggctttgtcgtttttgcagacccttccgttctc
gatagggttcttcaagatacgcacactattgatggtagaacggttgaggcaaagagggca
ttatcaagagaggagcagcaaacgaatgccagggctggaaacttgaatcctgctagaaac
accagcagtggtggaaatattcggaccaaaaagatatttgttggaggattgcctcctact
ctaactgacgatgggtttcgccagtattttgaagcctttggccttgtaactgatgtagta
ataatgtacgaccagagcacccagcgacctcgtggatttggttttatttcctttgattct
gaagatgcagttgaccgggtgttacagagaacattccacgatttgaatggtaagcaagtt
gaagtaaaacgagctcttcctaaagaggccaatcctggtgggggtggccgctctatgggt
ggcagttaccagagctacggtggatctggtggcaacacaaactcatatgatggtcgaatg
gattcaaataggtatatgcagcctcaaggcactggaggtggttttcctccttatgggtca
tctggctataatgcagctggatatggatatggtcctgccagtaatggtgttggttatggt
ggctatagcagctatactggagctggtgctggttatgggggacctgctggtgcggtctat
gggaatcctaatgttccaaatcctggctatgcaagcggtcctcctggggcacccagaagt
tcatggaacagtcaaggttcatctggctatagtgctatgggttatgggagtgctgcttct
tggggtgcttcaagtgctggtgctggcagtggtcctggttcagcatctgctggtcaatct
cctggtggagccactgggtatgggaatcaaggttatgggtacggtagttatggtggaaat
gatggatcttatgtgaatccagttgggtatggtgctgttggaggacgttctgggggtgct
tcaaacagtaatgctggtggtcccggcggggcagaactacagggtagtggcggcggcggc
ggctacatggggagtggatatggtgatgcaaatggaaattctgggtatggaaatgcatca
tggagatcagagcaaccacaaacttctggaaattatgggggtcctcaagcaaatggtcct
ggtggttatggtggtagttatggcggttctcaggcccgacaaacccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
