Populus euphratica (Euphrates poplar): 105131678
Help
Entry
105131678 CDS
T05872
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein NUP62
Organism
peu
Populus euphratica (Euphrates poplar)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_FG
Nsp1_C
ATG17_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105131678
NCBI-ProteinID:
XP_011033063
UniProt:
A0AAJ6UNA8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1436 aa
AA seq
DB search
MSGFPFSSSSSQSSPFSLSTGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPS
TTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTT
TTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTT
PPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPP
PFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPF
GSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGS
NTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNT
SSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSS
APATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAP
ATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPAT
GFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGF
SFGSSSAPSTTTTPPPFGSNTSSAPATGFSFGSSSAPSTTTTPPSFGSNTSSAPSLSLSS
SNTFTSTPSSTLSGSSASTSSPFSFATASSSTSTTPSLFGSLSASSISPNPLFGSASSST
ANSSSSFGTTTSSSSAPAPSPLFGTSTGSSLFGTTSSSVLFGSTSSSTTSATPLFGTSSP
SPLFGSTSSTTTSASPLFGTSSPSPFSGSTSSTTTSASPLFGTRSPAPLFGSTSSTATSA
SPQFGTGASSTPSSFGTPSSASSTGSSLFGNSLSTTSSAPSLFGSSSSSSSTASTSSTTT
NLYGSSSSFSNASSAPSFSTGFSFPKTTTASAPTTASTAAIASTPAPSTTTSFSSTGFSF
PKTTTASATTTASTAAIASTPAPSTTTSFSFGTQPSAPSQPSLFGNAASSSSVKSTTVSP
LFSTVTTTTASTPASGATEVTSTSTSSTTSGLSLPAFGMTSGTTAGTGAAAASSGSAGFS
FSGFPSATTSVAASSGTTASSFTGFSLSNISPAPTSKSQTQPASSSAPLLSVPASTAAPT
TTSSTTAQTSSLGVASTSGTSSSVSTALTATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGK
FRKQATAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQANLERKLELIETHQQEVDKALQSI
EEEAERIYKDERGSLLDDEAASTRDAMYEQAEFIEREMEQMTEQIKSVIQTVNANQGGEL
DAIDGMTPLDMVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLANQGSAADRQFLGLRF
NT seq
4311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaggcttccccttctcctcttcctcttcacaatcctctcctttctccctttccacc
ggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggc
tccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctcc
accaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattc
tcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaac
acctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccacc
accacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattc
ggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcc
tccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccaca
ccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatct
tcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcc
cctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccct
cccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctcc
gctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgcc
accggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttc
ggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccc
tccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccgga
ttctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctcc
aacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccacc
accaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctca
ttcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacc
tcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccacc
acaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcgga
tcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctcc
gcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccc
cctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcc
tccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccct
gccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctccc
ttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgct
ccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccacc
ggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggc
tccaacacctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctcc
accaccaccacaccccctcccttcggctccaacacctcctccgcccctgccaccggattc
tcattcggatcttcctccgctccctccaccaccaccacaccccctcccttcggctccaac
acctcctccgcccctgccaccggattctcattcggatcttcctccgctccctccaccacc
accacacccccctccttcggctccaacacctcttccgccccttccttgtccctttcctcc
tctaataccttcacctccactccctcttccaccctgtctggctcatcagcttcaacttct
tccccattctcctttgcaacagcctcatcctccacaagtacaactccatccctgtttggc
tctctctctgcctcctccatttcccctaatcccttgtttggctccgcttcttcttctacg
gcaaactcaagttcctcctttggcacaactacttcatcatcatcagcacccgctccttcg
cctctgtttggaacaagtacaggctcatccttgttcggaacaacttcatcctcagtcttg
tttggctcaacctcctcctccacaacttccgctacgccgctgtttggcacaagctcaccc
tcgcccttgtttggctcaacttcctccacaactacttctgcttcgcctctgtttggcaca
agttcaccctctcccttctctggatcaacttcctccacaactacttcggcttcgcctctg
tttggcacacgttcacccgctcccttgtttggatccacttcctccacagctacttccgct
tctcctcagtttggaacgggtgcctcttctactccatcctcattcggcacaccttcatcc
gcatcaagtacaggttcatccttgtttggcaactctctgtccaccacaagttctgcgccg
tctctgtttggatcatcatcatcatcatcatctactgcttcaaccagcagcaccactact
aatttgtatggttcttcatcttctttctctaatgcaagctctgctccaagcttctctacc
ggattttctttcccaaaaaccactacagcttcagcaccgactactgctagtactgctgct
atcgcatccacgccagctccttcaacgacaacttctttctcgtctaccggattttctttc
ccaaaaaccactacagcttcagcaacgactactgctagtactgctgctatcgcatccacg
ccagctccttcaacgacaacttctttctcgtttgggacgcagccatcagcgccttcacaa
ccttcattatttggcaacgcagcctcttcgtcatcggtgaaatccacaactgtatcgccg
ttgttttctacagttactactacgactgcttcaactccagctagtggtgctactgaagtt
acttctactagtactagcagtactacttcggggttgagtttgcctgcatttggtatgact
tcaggaactacagctgggacaggtgctgctgcggcttcttctggctctgcggggttttct
ttttcaggttttccttctgctacaactagtgtggctgcgtcttcagggactactgctagc
tcgtttactggattttcattgtccaatatatcaccggcgcctacttcaaaatcacaaact
caaccggctagtagttctgcgcctctactcagtgtccctgcttcaactgctgcacctaca
acaacttccagcactactgctcagacatcatcgcttggtgtggcttccactagtgggaca
agttcaagtgttagcactgccttaactgctacaccaaaattgccgtctgagattacaggg
aagactgttgaggagatcatcaaagagtggaatgctgagctgcaagagcgtactgggaaa
tttcggaagcaagctactgccatagctgagtgggataaaaggatcttgcaaaatcgtgat
gttcttcttcggcttgagattgaagtggcaaaagtggttgagacccaagctaatttggag
cgaaagttggagttaattgagactcatcaacaggaggttgacaaggctttgcaaagtata
gaagaagaagctgaacgtatttacaaggatgagcgtggatcgcttcttgatgatgaagct
gcatcgactagagatgctatgtatgagcaggctgaatttatagagagggaaatggaacag
atgacagaacagataaaatcagtaattcagaccgttaatgccaaccagggtggtgaactt
gatgcaattgatgggatgactccattggacatggttgtccgaattctcaacaatcaacta
agttctttaatgtggattgatgagaaggctgaagagttttcttcacgtattcaaaagctt
gctaaccaaggttctgctgctgatcgacaatttttgggtctaagattttga
DBGET
integrated database retrieval system
