Pedobacter sp. D749: KYH19_02730
Help
Entry
KYH19_02730 CDS
T10701
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pev Pedobacter sp. D749
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pev00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pev02000
]
KYH19_02730
Transporters [BR:
pev02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KYH19_02730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXU42532
LinkDB
All DBs
Position
complement(667302..669611)
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MATNLLYAQNNHEQVGEYLITGSVTNLSTHLALVGANLSLSVPSSATHSDQNGNYKFSVK
QGIYHLKCDFIGYIPLDTLVQVNSNVVLNLSLTISQQNLKEVKVKGTGSPKEIATQSLSI
LEGEQLDHTRGFSLGESLKSITGVTTFQTGPSIAKPIIHGLYSNRILILNNGVRLEAQQW
GSEHAPEIDPFIANRLEVIKGAASIRYGSDAIGGVILAEPKALPKNPGMDGEINAIGMSN
SRLGAFSGMLEGAFDKKLTGLSYRLQGTFKIAGNSSTPNYLLANTGLREQDGSAAVQYHH
KNYGFEAYYSVFNTKLGIFQGAEVGSIADLKLAIEQTEPLTPSFFTYAIDRPYQTVNHQT
LKLNSFYNFENGSKLRFQFANQTNTREEYDFLPLNGRINPELYLKINTQTADINYEHKDL
GNFSGSFGFNGITQGNIRKYEYLIPNYRNYGGGAYFIEKYTHGNLLLEAGLRYDYRWLRA
YKLNNNTALIETPTTHYQSASYTIGTTYSITDALKLSGNYSSAFRAPTVNELYSNGIHQS
LVSYEIGNPDLHTERANNFNINLDYTTSRLLINVQAYYNSINNFIFANPTNQYTRTVRGP
ALVFNYTQADVYFRGLDFNLILKPVDSLELNSKTSLIYAYNKTIHDYLIYTPPSRFQNSI
GYHFGNLSGLKRIFFSVEDVYVSKQSRVPVGQDYVLPPAGYNLINLQLSFRVNYLHNYAD
VSFAVNNLTNTAYRDYLDRFRYFTDEPGRNFIVRLKVPFKISKTTHTNR
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcaactaacttattgtatgcgcaaaataaccatgaacaggtaggagaatatctgata
acgggaagcgtaacaaatcttagcactcatttggctctggttggtgccaatcttagcctc
tcggttccttcgagtgcaacgcactcagatcagaacggaaattataaatttagcgttaaa
cagggtatttatcacttgaaatgtgattttataggatatattcctttagataccttagtc
caggttaattctaatgttgtacttaatctatcattaaccatttcccaacaaaatttaaaa
gaggtcaaggtaaaaggtactggttcccctaaagaaatcgctacccaaagcctatctata
ttggagggagagcagctggatcatacccgaggatttagccttggagaatcgttaaaatct
attacaggtgtcactacttttcaaacaggtccttccattgccaagcctattatccatggt
ttatatagcaaccgaattctgattttaaacaatggcgtacgactggaggctcaacagtgg
ggatctgaacatgctccggaaattgatccttttattgctaaccggcttgaagtgatcaaa
ggtgctgccagcatccgttatggatcggatgctataggtggggtgattcttgctgaacct
aaagcgctgcctaaaaaccccggaatggatggagaaataaacgccattgggatgtctaat
agtagacttggcgcattttcaggtatgctggaaggcgcttttgataaaaagcttaccgga
ttaagctaccgtttacaaggaactttcaaaattgcgggaaacagcagtacgcctaattat
ctgcttgcaaataccggactgagagaacaggatggttctgcagcagtacagtaccatcat
aaaaattatggatttgaggcttactatagtgtgttcaatacaaagctaggtatctttcag
ggagcagaagtaggctccattgcagatttaaaattagctattgaacagactgaaccttta
acaccatctttttttacttacgccattgatcgcccctaccaaactgtaaatcaccaaacc
ttaaaactgaatagcttttacaattttgaaaatggcagtaagctgcggtttcaatttgct
aatcagaccaatacccgggaagaatatgactttttgccacttaatggaagaatcaatcca
gaattatatcttaaaatcaatacacagactgcagatatcaattatgaacataaagattta
ggcaatttctcaggctcatttggttttaatggtattactcagggcaatattcgaaaatat
gaatacctcatccctaattacaggaattatggaggaggagcttactttatagagaaatat
acacacggtaatttattgctggaagcgggtttaaggtatgattaccgctggcttagggcg
tataaactgaataacaatacagctttaatagagacacctacaactcactatcagagtgcc
agctatacgattggtaccacgtatagtataaccgatgcattaaaattaagtggcaattac
agttcagctttcagggcaccaacagttaacgaattatactccaacggaatacaccagagc
ttagtctcctatgaaattggaaatccagatttacatacggagcgtgccaacaattttaat
ataaatttagattataccacttcaaggttattaataaatgttcaggcttattataacagc
atcaataactttatctttgcaaatccaacaaatcaatatacacgcaccgttcgtggacct
gcattggttttcaattacacacaagctgatgtttactttaggggactggattttaactta
atcctaaagccggtagattctctggaacttaattcaaaaacgtcactgatttacgcttac
aataaaaccattcatgattatctgatttatactcctccaagtcgctttcaaaatagtatc
ggttatcattttggtaatttatcaggcttaaagcgtattttctttagtgtggaagatgtt
tatgtaagtaagcaatcccgggtaccagtggggcaggattatgtgttgccacctgctggt
tataatctgattaatttacaactgagctttagggtaaactacctgcacaattatgccgac
gtcagctttgccgttaataatttaaccaatacagcttaccgtgattacctggaccgcttc
cgttatttcacggatgagcccggaagaaactttattgttcgcctcaaagtaccttttaaa
atctcaaaaaccacccataccaatcggtaa
DBGET
integrated database retrieval system