Pedobacter sp. D749: KYH19_14020
Help
Entry
KYH19_14020 CDS
T10701
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
pev Pedobacter sp. D749
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
CHU_C
TIG
Big_13
Por_Secre_tail
ChitinaseA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXU40125
LinkDB
All DBs
Position
complement(3486128..3494860)
Genome browser
AA seq
2910 aa
AA seq
DB search
MMRKFYLLICLLIVQLTLYGQTRTLDFANVSGDPVNGTKLGTTSFTQTTAAQESWTFTMA
ANSPGFWTYNDQTLWLQSGDPTPTATGNAKTSIKRADGQNFNFKTINFVTFSQDQYIRIE
GKKSGTVKYTQNVYLENANAPYSYNFTGWSDVDEVILTITTNAQFPNNTNAADFYVGLTS
FTYDPSPRITTNAASSVAATSAVFNGNLVSAGFATITEKGFVYSTTLNPTTADTKRIVAG
TALGTYSYNETTLSSSTTYHVRAYAINSVGTSYGADQQFTTSVQVAAPTVTALSPTSGPT
GGGTSVTITGTNFSGTTAVTFGATSATGFTVNSATQITATAPAGTGTVDVRITTTGGTSA
TSASDQFTYVAAPTVTALSPTSGPTGGGTSVTITGTNFSGTTAVTFGATAATGFTVNSAT
QITATAPAGTGTVDVRITTTGGTSATSASDQFTYVQSATATPVVASPSNGNLITTTTPTY
TGTATADATVTVYVDGASIGFKTATGGNWSFTQPTSLTQGSHTVYATAQVTGNAVSANSP
IITFTVDSQRPSVVITSTAGASGGSTSTSPIPFTVTFSETVTGFVAGDITPGNATISGFS
GSGTTYTFNSTPTANGAVTINVSANIAQDAAGNSNTAASPFSITYTQASQITASAGTFPS
ALSTTYGTASTSTSVNVSGTGLTAGITATPSSTANFEVSADGINFGTSAIIGTSGTVSGT
VYVRLTATATANTNITGNITLTSTGTNSPVITIPTSAVAQRVITVTAAAKSKTYGDADPG
LSYTPSPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALSGNYTLTYVGADLTIGAKPIT
VTAAAKSKTYGNADPGLSYTRSSALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALSSNYT
LTFVGADLTIGAKPITVTAEAKSKTYGNADPGLSYTPSSALVTGDSFSGSLSRSPGENVG
TYAINQGTLALSSNYTLTFVGADLTIGAKPITVTAAAKSKTYGDADPGLTYTPSPALVTG
DSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALSSNYTLTYVGADLTIGAKPITVTAAAKSKTYGD
ADPGLSYTPSPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYISADLTIGA
KTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALN
GNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLSRSPG
ENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPS
LVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSK
TYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYIGADL
TIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGT
LALNGNYTLTYIGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLS
RSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYT
SAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAA
AKSKTYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYV
GADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAI
NQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPVLTYTSAPSLVTGDSFS
GSLTRSPGENVGTYAINQGTLALSSNYTLTYVGADLTIGAKTITVTAAAKSKTYGDADPV
LTYTSAPALVTGDSFSGSLTRLPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYISADLTIGAKTVT
VTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLTRSPGENVGTYVINQGTLALNGNYT
LTYISADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVG
TYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTG
DSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGD
ADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGA
KTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPSLVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALN
GNYTLTYIGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPG
ENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYIGADLTIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTSAPA
LVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADLTIGAKTVTVTAAAKSK
TYGDADPALTYTSAPALVTGDSFSGSLSRSPGENVGTYAINQGTLALNGNYTLTYVGADL
TIGAKTVTVTAAAKSKTYGDADPALTYTFAPALVGTNTFTGSLTRSPGENVGTYAINQGT
LALNGNYTLTYIGANLTITKSVLTVTAINAVMCQSDGFPTFGVTYAGFKAGDTENSLSTK
PTVSTTANRNVAGNYVLVASGGASNNYSFVYVNGTLTINAVPSVSIVSSKGTEISKGETT
VLTASGGTAYSWSTASGIVSGQNTAFLSVRPAQTTTYTVRVTNASGCNSSKSITIKVAED
YKLVANNILTPNGDGINDTWLVQNIDMYPGNEVRIFDRNGREMYSKKSYDNSWNGTIGGN
DLAEGTYYYIITYGPNKLVQKGFITIIRNR
NT seq
8733 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgagaaaattttacttattaatttgtttgttgattgttcagttgaccttatatggg
cagacaaggacactcgattttgctaatgtatcaggtgatcctgttaatggaacgaaattg
ggaacaacatcttttacgcagactactgcggctcaggaaagctggacatttacaatggca
gctaatagcccaggtttttggacgtataacgaccagacgctttggctccaatcgggagat
ccaactcctacggcaactggtaatgccaaaacatccataaagcgagctgatggtcagaat
tttaattttaagacgattaattttgtcacttttagccaggatcagtatatcaggatcgaa
ggtaaaaaatcaggaacagtaaagtatactcaaaacgtttatctggaaaatgcaaatgcc
ccgtattcatataattttacaggatggagcgatgttgatgaagtaatattgacgattacc
acaaatgcccaatttccaaataatactaatgctgccgatttctatgttggcttaaccagt
tttacatacgatccttccccacgaataactactaatgctgcaagttcggtagcagctact
tctgcagtatttaatggtaatttggtaagcgctggttttgccacaataacagaaaaaggc
tttgtttattcaacaacccttaatcctaccactgccgataccaaaagaatagttgcagga
acagcattaggtacatattcctataatgaaacaacactgtcaagttctacaacctatcat
gtacgtgcttatgccataaatagtgttggtacttcctatggtgcagatcaacaatttacc
acttcagtacaggtcgccgcaccaacggtaacggctttgagcccaaccagtggcccgacc
ggaggaggcactagcgtgaccattaccggcaccaacttcagcgggactacggcggtgacc
tttggagctacttcggctacaggcttcaccgttaactcggcaacacaaatcacggcgacc
gcaccagcaggaacaggcaccgttgatgtccgcatcactacaacaggaggcaccagtgcg
accagtgccagcgaccagtttacctatgtcgccgcaccaactgtaacggctttgagccca
accagtggcccgaccggtggaggcactagcgtgaccattaccggcaccaacttcagcggg
actacggcggtgacctttggcgccacggcggctacaggcttcaccgttaactctgcaaca
cagatcacggcgaccgcgccggcaggaacaggcaccgttgatgtccgcatcactacaaca
gggggcaccagtgcaaccagtgccagcgaccagtttacctatgtacagtcagcaacagcc
acaccggtagtagccagcccttccaatggcaatttaatcactacgaccaccccaacttat
acaggaactgcaacagcagatgcaaccgttacggtatatgtagatggagcatctataggt
ttcaaaacagcaactggcgggaactggtcattcactcagccaacttcactgacacaaggt
tcgcatacggtttatgcgactgcacaggttactggtaatgcagtgagcgcaaacagtcct
atcattacttttacggttgactcgcagcgtccatccgttgtgattacgagcactgcgggt
gcatccggtggatcaaccagcacttcgccaattccatttacagttactttttcggagacc
gtaacaggatttgtagcaggagatattacaccaggaaatgccaccatcagtggtttttca
ggaagcggaactacttatacttttaattccacgccaacagcaaatggtgcagtaacgata
aatgtttcggccaatatagcacaggatgctgcaggcaatagcaacacggctgcaagtccg
ttttctattacctacactcaggcatctcaaattaccgcttcagccgggacttttccatca
gcgttaagcacaacttacggaaccgcatcaacatcaaccagtgtgaacgtatcgggtaca
ggattaactgccggtattacggccacgccttcatcaacagctaattttgaagtaagtgct
gatggtataaattttggtacttctgctatcatcggtacttcgggtacggtatcgggtaca
gtttatgtaaggttaacagcaactgcaactgctaatacaaatattacagggaatataaca
ttaaccagtacgggcactaacagtccagttatcactataccgaccagtgctgttgcgcaa
agagttattacagtaacggcggcagcgaaaagcaaaacctatggcgatgcagatcctgga
ctgtcttataccccttcacctgcattggtaacaggcgatagcttcagcggaagcctgagc
aggtcacctggagaaaacgtgggtacgtatgcaatcaaccagggcacacttgcactaagt
ggcaattataccttaacttatgttggtgctgatttaacaatcggtgcaaaaccgataaca
gtaacagctgcagcgaaaagcaaaacctatggcaatgcagatcctggactgtcttatacc
cgttcatctgcattggtaacaggcgatagcttcagcggaagcctgagcaggtcacctgga
gaaaatgtgggtacatatgcgatcaaccagggcacactggccttgagcagcaactatact
ttaacttttgttggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaccgataacagtaactgccgaa
gcgaaaagcaaaacctatggcaatgcagatcctggactgtcttataccccttcatctgca
ttggtaacaggcgatagcttcagcggaagcctaagcaggtcacctggagaaaacgtgggt
acctatgcgatcaaccagggcacactggctttgagcagcaactatactttaacttttgtt
ggtgctgatttaacaatcggtgcaaaaccgataacagtaacagctgcagcgaaaagcaaa
acctatggcgatgcagatcctggactgacttataccccttcacctgcattggtaacaggc
gatagcttcagcggaagcctgagcaggtcacctggagaaaacgtgggtacgtatgcgatc
aaccagggcacacttgccttgagcagcaattataccttaacttatgttggtgctgattta
acaatcggtgcaaaaccgataacagtaacagctgcagcgaaaagcaaaacctatggcgat
gcagatcctggactgtcttataccccttcacctgcattggtaacaggcgatagcttcagc
ggaagtctaagcagatcacctggtgaaaacgtgggtacttatgcgatcaatcaaggtaca
cttgcactaaatggtaactatactttaacctatattagtgctgatttaacgatcggtgca
aaaacagttacagtaacagcggcagcgaaaagcaaaacctatggcgatgcagatcctgca
ctgacttatacctctgcaccttcactggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagc
agatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcaatcaatcaaggtacgcttgcactaaat
ggtaactataccttaacttatgttggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacg
gtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacc
tctgcaccttcactggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctgga
gaaaatgtgggtacatatgcaatcaatcaaggtacgcttgcactaaatggtaactatacc
ttaacttatgttggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgca
gcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcaccttca
ctggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggt
acatatgcaatcaatcaaggtacgcttgcactaaatggtaactataccttaacttatgtt
ggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaa
acctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcacctgcactggtaacaggc
gatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcgatc
aaccagggaacactggcattgaatggcaactataccttaacttacattggtgctgattta
acgattggtgcgaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgat
gcagatcctgcactgacttatacctctgcacctgcactggtaacaggcgatagcttcagc
ggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcgatcaaccagggaaca
ctggcattgaatggcaactataccttaacttacattggtgctgatttaacgatcggtgcg
aaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgca
ctgacttatacctctgcacctgcactggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagc
agatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaat
ggcaactataccttaacttatgttggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacg
gtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctacggcgatgcagatcctgcactgacttatact
tctgcacctgcattggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctgga
gaaaatgtgggtacgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaatggcaactatacc
ttaacttatgttggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgca
gcgaaaagcaaaacctacggcgatgcagatcctgcactgacttatacttctgcacctgca
ttggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggt
acgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaatggcaactataccttaacttatgtt
ggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaa
acctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcaccttcactggtaacaggc
gatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcaatc
aatcaaggtacgcttgcactaaatggtaactataccttaacttatgttggtgctgattta
acgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacggcagcagcgaaaagcaaaacctatggcgat
gcagatcctgtactgacttatacctctgcaccttcactagtaacaggtgatagcttcagc
ggaagtctgaccagatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcaatcaaccagggaaca
cttgctttgagcagcaactataccttaacttatgttggtgctgatttaacaatcggtgca
aaaacgataacggtaacggcagcagctaaaagcaaaacctatggcgatgcagatcctgta
ctgacttatacctctgcacctgcactggtaacaggggatagcttcagcggaagcctgacc
aggttacctggcgaaaatgtgggtacttatgcgatcaatcaaggtacacttgcactaaat
ggtaactatactttaacctatattagtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacagttaca
gtaacagcggcagcgaaaagcaaaacctatggcgatgcagatcctgcactaacttatacc
tctgcaccttcactagtaacaggtgatagcttcagcggaagcctgaccagatcacctggt
gaaaacgtgggtacttatgtgatcaatcaaggtacacttgcactaaatggtaactatact
ttaacctatattagtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacagttacagtaacagcggca
gcgaaaagcaaaacctatggcgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcacctgca
ttggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggt
acgtatgcaatcaaccagggtacgcttgcactaaatggtaactataccttaacttatgtt
ggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaa
acctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcaccttcactggtaacaggc
gatagcttcagcggaagtctaagcagatcacctggtgaaaacgtgggtacttatgcgatc
aatcaaggtacacttgcactaaatggtaactataccttaacttatgttggtgctgattta
acgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgat
gcagatcctgcactgacttatacctctgcaccttcactggtaacaggcgatagcttcagc
ggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggtacatatgcaatcaatcaaggtacg
cttgcactaaatggtaactataccttaacttatgttggtgctgatttaacgatcggtgca
aaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgca
ctgacttatacctctgcaccttcactggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagc
agatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaat
ggcaactataccttaacttacattggtgctgatttaacgattggtgcgaaaacggtaacg
gtaacagccgcagcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacc
tctgcacctgcactggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctgga
gaaaatgtgggtacgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaatggcaactatacc
ttaacttacattggtgctgatttaacgatcggtgcgaaaacggtaacggtaacagccgca
gcgaaaagcaaaacctatggtgatgcagatcctgcactgacttatacctctgcacctgca
ttggtaacaggcgatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggt
acgtatgcgatcaaccagggaacactggcattgaatggcaactataccttaacttatgtt
ggtgctgatttaacgatcggtgcaaaaacggtaacggtaacagccgcagcgaaaagcaaa
acctacggcgatgcagatcctgcactgacttatacttctgcacctgcattggtaacaggc
gatagcttcagcggaagtctgagcagatcacctggagaaaatgtgggtacgtatgcgatt
aaccagggaacactggcattgaatggcaactataccttaacttatgttggtgctgattta
acgatcggtgcgaaaacggtaacggtaacagcagcagcgaaaagcaaaacctatggtgat
gcagatcctgcactgacttatacctttgctccggctttagttgggacaaatactttcacg
ggaagtttaaccaggtcacctggagaaaacgtgggtacgtatgcgatcaaccagggtacg
cttgcattgaatggtaactatactttaacttacattggtgctaacctgaccattactaaa
tctgtacttactgttacggcaataaatgcggtaatgtgccagtcagacggtttcccaacg
tttggagtaacttatgccggttttaaagcaggtgatactgaaaattcattgagtacaaaa
ccaactgtaagcactactgccaatagaaatgtagcaggcaattatgtactggtagcatct
ggtggtgcatctaacaattatagttttgtatatgtaaacggtacattaacaatcaatgca
gttccatcggtaagtattgtaagtagtaaaggtactgaaatcagtaagggtgaaacaacg
gtattaactgccagtggaggcacagcctacagctggtctacggcaagtggtattgttagc
gggcagaatactgctttccttagcgttcgtccggcacaaaccacaacgtacacggttcgg
gtaaccaatgcgagcggttgcaatagttctaaatcgatcaccattaaggtagctgaagat
tataaattggttgcgaataatatcttaacgccaaatggagatggtataaatgatacctgg
cttgtacagaacattgatatgtatccaggtaacgaagttcggatatttgatcgcaatggc
agggaaatgtacagtaaaaaatcatatgataacagctggaatggaactatcggaggaaat
gaccttgcggaaggaacttattattacatcattacttatggcccaaataaattggttcaa
aagggatttattacgattatcagaaaccgctaa
DBGET
integrated database retrieval system