Pedobacter sp. D749: KYH19_18625
Help
Entry
KYH19_18625 CDS
T10701
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
pev Pedobacter sp. D749
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DEAD
ResIII
ERCC3_RAD25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXU40991
LinkDB
All DBs
Position
4573986..4576877
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MLRVDSSKACKVVYSLCKHEYLGYLIEPHVVQLNPQGDFSFTYQRIFTHTAEEFNACLSD
IDYKLIKILDDIEQDSLIKKYYKKLIRPTEFFTKIFDDKFYENVRPKIEKKLAEALEILK
VKNELYVMDKDGWPVERKIELADEPASILFHFRRNETETRYFPTIKYQNLRIEFMFKEAQ
IISNKPAWLLLNDVLYFFDQDIEGKKLQPFLNKRFIAIPKTTEATYFEKFVAPLIEKHHV
YAEGFEIRTEQFEATPVIKVLYVDGGLSQIQLYFKYGEYTFPVENAHKVTVRLEKTADNY
IFHRIKRSAEWEKKQFNLLLSLGLKKTSSLFSNLEVASADENPSYGAINWVNEHIEILEA
SGFEIEQATGQKKFVLGASKIDLEVKEGNDWFDIHAVVWFGKYQIPFLSLKQHILHKKRE
FLLPDGEVAIIPDKWFTQYGSLFSLAEAGQTLKLKKHHIGLINDLAEDSLANVTLERKLQ
RLSDFEDIADTQMPVHFKGTLRDYQKAGYNWFSFLREYNFGGCLADDMGLGKTIQTLAML
QKVKEDDQLLDTQTTSLIIMPTSLIYNWLTEAKKFTPKLKILAHTGTNRNKDVANFANYD
IIITTYGVTRVDVDEMKNFYFNYIILDESQNIKNPASKSFKAVRSLKSKNKLILSGTPVE
NSVSDLWSQLTFLNPGLLGTQAFFFEEYVQAIEKKKDEEKARKLQSIIKPFVLRRTKEQV
AAELPPKTEQVIYCDMSEDQAAYYEKTKSAYRNDLLQSMDDGTFAKKQVQLLQGLTALRQ
LANHPVMIDGEYISDSGKFENVIHTLDNVLKGGHKVLVFSQFVKHLDIFKKHFEAEHIPF
AYLDGSTRNRGEIVSEFQQNTDLKVFLISIKAGGVGLNLTQADYVFILDPWWNPAVEQQA
IDRTHRIGQDKKVFIYKFIAKDTVEEKILALQNRKKSLANSLITTEESFFKSLSKEDIRD
ILN
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttacgtgtcgatagttctaaagcctgtaaagtggtgtactctttgtgcaaacatgag
tacctgggctatttaattgagccacacgtagttcagcttaatccacagggcgatttttct
tttacctaccaacggatttttacccacacagcagaagagtttaatgcctgcttaagtgac
atcgattataagctgatcaaaattttagatgatattgaacaggattcgctgattaaaaag
tattacaaaaaattaatcaggcctactgaattcttcaccaaaattttcgacgataagttt
tatgaaaatgttcgtcctaaaattgaaaagaaacttgccgaagctttagaaatcttaaag
gttaaaaatgagctttatgtaatggataaagatggctggcccgttgaacgtaagattgaa
cttgctgatgagcctgcatccatcctgttccatttccggagaaatgaaactgaaacccgt
tattttccgaccatcaagtatcagaacctgcggattgagtttatgtttaaagaagcgcag
attatcagcaacaaacctgcctggttattgctgaacgatgtgttatacttttttgatcag
gatattgaaggaaaaaaactacaaccgtttttaaataaacgttttattgccataccgaaa
acaaccgaagctacctacttcgaaaaatttgttgcccctttaatcgagaaacaccatgtg
tatgcagaaggtttcgaaatcaggacagaacagttcgaggctacacctgtaatcaaggtt
ttatatgtagatggcggtctttcgcaaatccagttgtactttaaatatggcgaatatact
ttccctgtcgaaaacgcacataaagtaaccgttcgtttagaaaaaacggccgataactat
attttccaccgcattaaacgttcggctgaatgggagaaaaaacagtttaatttattgtta
tctttaggactaaaaaaaacgagttcattattcagtaaccttgaagtagcttcagcggat
gaaaatccgagctatggagcaataaattgggtaaatgagcatatcgaaatcttagaggca
tcgggttttgaaattgaacaggccaccgggcagaaaaaatttgtattaggggccagtaaa
atcgatctggaagttaaggaaggaaacgattggttcgatatccatgccgtggtttggttt
ggcaaatatcagattccttttctatcgttaaaacagcatattttacataaaaagcgtgag
tttttattacctgatggagaagttgccattatccccgataaatggtttactcaatacggc
agcctgtttagtttggcagaagccggccaaacgctcaaattaaagaaacaccatatcggc
ttaatcaacgatctggccgaagatagtttggctaatgttaccctcgagcgtaaacttcag
cgtctttcggattttgaagatatagcggatacgcagatgcccgttcactttaaaggaact
ttgcgcgattatcaaaaggcaggctataactggtttagctttttacgcgagtataatttt
ggcggctgtttagctgatgatatgggtttgggtaaaaccatccagaccttggccatgctg
caaaaagttaaagaagacgatcaactgctggacacacaaaccacctcgctgatcattatg
cccacctctttaatttataactggttaacagaggcaaaaaagtttacaccaaagcttaaa
atattagcccatacaggtaccaaccgcaataaagatgtcgctaattttgctaattacgac
attatcatcactacttatggagttacgagggttgatgtggatgaaatgaaaaatttctat
ttcaattatattattctcgacgaaagtcagaacattaaaaaccccgcatccaaatcattc
aaagccgttagaagcttaaaatcgaaaaacaaactgattttgagcggtacaccggtagaa
aattcagtaagcgatttatggtcacagttaactttcttaaatccaggactcttgggcacc
caggcatttttcttcgaagaatatgtgcaagcgatcgaaaagaaaaaagacgaagaaaaa
gcacgtaaactgcaatcaatcatcaaaccttttgtactccgcagaacgaaagaacaagtg
gccgcagagttaccgccaaaaacggagcaggtaatttattgcgacatgagtgaggaccag
gccgcttattacgaaaaaaccaaatcggcctatcgtaacgatctattgcagagcatggat
gatggaacttttgcgaaaaaacaggtgcagcttttacagggcttaaccgctttacgccag
ctggccaatcaccctgtgatgatcgatggcgagtacatctccgattcgggcaaatttgaa
aatgtaatccacactttagataatgtgcttaagggcggacacaaagttttggttttttct
cagtttgtaaaacacctggatatctttaaaaaacattttgaagcagagcatataccattt
gcttatttggacggatcaacccgtaaccgtggagagatcgtttctgaatttcagcagaat
accgacttaaaggttttcctgatttcgataaaagccggtggcgtaggtttaaaccttaca
caggccgattatgtttttattttagatccatggtggaaccctgcagtagaacaacaagct
attgacagaacgcaccgtatcggtcaggacaaaaaagtttttatctataaattcatcgca
aaagatactgttgaagagaaaatcctggctttacagaaccgcaaaaaatcgttggcaaac
tctctaattaccacagaggaaagtttctttaaatcgctgagtaaagaggatattagggat
atactgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
