Pedobacter endophyticus: IZT61_08925
Help
Entry
IZT61_08925 CDS
T07452
Name
(GenBank) response regulator
Organism
pex
Pedobacter endophyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
Response_reg
HTH_18
HATPase_c
Y_Y_Y
HisKA
HTH_AraC
PorZ_N_b_propeller
Chordopox_G3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPH41358
UniProt:
A0A7S9Q077
LinkDB
All DBs
Position
complement(2256560..2260714)
Genome browser
AA seq
1384 aa
AA seq
DB search
MNRVFIFLSFIAGLFCASGAHAVDVEPPNSFYYRQLDNRNGLSNSSINTIFQDRDQLLWI
GTWDGLNRYDGANFSVYNHNIDQRQNSIGSNVIQSIKEDHKNNIWISTIGGVSRYNKVSG
KFSRYFYKNTAIQKIRENEYELIISKAGEVFCFAANGMLRKYDDAKDQFLDYQHFNDAES
IIKTCFIGDRLCFLDKSGRLLVAKIGPKKLQVLKTIAIPGGVNNLVAANDKVVFSNINDE
HFSIDAKLSAQRLPLPSRKIRSIAFYQSHYVIAWENQGIQIVDNRFQPTTFLASEAEKVA
NLKITALSVGENSVLWLGTDGNGLIQIYPNENYFGLMTKINGVNINKPIRAFAEDNGNLW
VGTKGNGLFILKDFWNAGKSPQKTQKIDVSNGLENNAVFAIKKGSGELIYIGTDGKGLSI
YDKRTNKIVNWANIKGADRYPEFRSVYAILEDADGSVWLGTSGFGLVHLKISRQSNQALA
LTYFKQYYSSSKETNGPVNDIIYALAQGKDDRLWIACRYGGLSVINKKNGQFTTYKASGY
EGSLSHSDVLSLFYDSKNRLWVGTSYGLNYLSYSESLKSEPRFNKITMNSGLPNNTIHAI
QEDGAGNIWLSTNKGIAKINPQNNSVANYQESDGLQSNEFSDGATFKASNNNLFFGGIYG
FNYFLPKHITENTKQPNLLISDLQMGGKAFFNNQYLVIKANQQAVESFDIERKSNFFQFS
FNALNYFNASKNEFAYQLKGLDQSWRYTGTDGKIAYYNIPPGQYELVVRWSNGEGVWTKD
VVALRLHVKQYFWLTLPAYACYFVLLVIAGYAFHRYRKNKLEMKFKLERESLFRQKDEEN
HRQRINFFTNIAHEIQTPLTLILGSVEHFMQKENSSGKPTGQSYFLSLIHQHTARLTYLV
HQLLEFRKAEAGYLKRSDDYFDISKLLTSLSQLFVPASTKKEQTFTRHIEDGIAGFIDKD
KFEKVLFNLLSNAFKHSGEREEVVFTATYDQHSQELEIVVSNSGCRLAESDLEDIFKEFQ
VGKSSDLNNFSTGIGLAFTKELVAIMDGELNASLKNDWISFSFKLKLQQAIEGKKDEVVT
SAPSSLFESILKPYEQEPIASVEENNKVALIDDLKAVCTHSVLVVEDDLALRFLIKNILK
DHYNVYEAENGVSALSFLKNNTPDIIISDVMMPDMDGLELCKHIKTVPATCHIPFIMLSA
KGTEENKTEGYETGADAYIAKPFNVNYLQMRVRKLLDYRERMNHLIKDRNINNQFVDVDL
EQGDKEFLNALVKAVEDNLAEPDLDAAKLEDALCISKMQLYRKLKSLAGMTPSEFIKRIR
LKHAAVLLQNSKLNVSEIFYLTGFNNKSYFFREFKKIYHLAPNEYRQKQYQADESPLPSD
SYRI
NT seq
4155 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccgtgtgtttatctttctgtcctttattgccgggctgttctgcgctagcggagcc
catgccgtagacgttgagccacctaactcattttattacagacagctcgataatcgaaac
ggactttcgaacagttctatcaatacgatttttcaagatagagatcagctattatggatt
ggaacctgggatggtttgaaccggtacgacggagcaaattttagtgtttacaaccacaat
atagatcagcgccagaacagcattggcagcaatgtaatccaatcgataaaagaagaccac
aaaaataacatttggatcagcaccattggcggcgtttcgcggtacaacaaggtttcgggc
aagttcagcaggtatttttataagaacacagcaatccagaagatccgcgaaaacgaatat
gagttgattatcagcaaggctggcgaagtattttgcttcgcggcaaacggcatgcttcgt
aagtacgatgatgcaaaagaccagtttctcgattatcaacattttaatgatgcagaaagt
attataaagacctgttttattggcgataggctgtgttttttagataagagcggacgtttg
ctagtggctaaaattgggcccaagaaattacaagttcttaaaacgatagctattcccgga
ggcgtaaataatctcgttgctgcaaatgataaggtcgttttttctaacattaacgacgaa
cattttagtattgatgcaaaattatcggcacaacgccttccgttaccgtcgcggaaaatc
agatccatagctttctatcaatcccattatgtgattgcatgggaaaatcagggcattcaa
atcgtcgacaacaggtttcagccaacgacgtttctggcaagcgaggcagaaaaggtagca
aaccttaaaattactgcgttaagcgtgggcgaaaatagcgtactgtggctcggtaccgac
ggaaacggacttatccagatttatccaaacgaaaactatttcggcctgatgaccaaaatt
aacggcgtaaacattaacaagccgattagggcctttgccgaagacaatggcaatttgtgg
gttggcacaaaggggaatggcctgtttattttgaaagatttctggaatgcgggtaagtcg
ccgcagaaaacgcaaaaaattgatgtgagcaacgggctcgagaacaatgctgtttttgcg
ataaaaaagggctcgggcgaattgatttatatcggcaccgatggcaaggggctatcaata
tacgataaacgaacaaataagatcgttaattgggcaaacatcaaaggggcagatcgctat
cccgaatttcggtcggtttatgccatactggaagatgccgacggttcggtttggcttggc
accagtggttttggccttgtacacttaaaaatctcccgccaaagcaatcaggcgcttgca
ttaacctattttaaacaatattattcttcatcaaaggagaccaacggacctgtaaacgac
attatttatgccttggcccaaggcaaagatgatcgcctctggattgcctgccgttatgga
gggctcagtgtgatcaataaaaagaacggccagtttaccacttacaaagcttcgggttac
gaaggcagtttgtcgcatagcgatgtgctttctctattttacgacagcaaaaatcggctt
tgggtgggcaccagttacggtttaaattaccttagctacagtgagtcgcttaaaagtgag
ccgcgttttaataagattacaatgaacagtggcttgcccaacaatactatacatgccatt
caagaagacggggcgggcaacatttggctcagtacaaataaagggattgcaaaaataaac
ccgcaaaataatagtgttgccaattatcaggaaagcgatggtttacaaagcaacgagttt
agcgatggcgccacgtttaaggcatcgaacaataacttgttttttggagggatttacggt
ttcaactactttttgccaaagcacattaccgagaataccaaacagcccaatttgttgatt
tccgacttgcaaatgggtggaaaggcatttttcaataatcagtatctcgttataaaagcc
aatcaacaagctgttgaaagctttgatattgagcgaaaaagcaacttttttcagttctct
tttaatgccttaaattattttaacgcatcaaaaaacgaatttgcatatcagcttaagggc
ctcgaccaaagctggcgatacaccggtaccgatggaaagattgcgtattacaatatcccg
ccggggcaatatgaattggttgtacgctggagtaatggcgaaggcgtttggacaaaagac
gttgttgcgctgcggctgcatgtgaagcaatatttctggcttactttgccggcttacgct
tgttattttgtgctcttggttattgccggatacgcctttcaccgctaccggaaaaataag
ctcgaaatgaagtttaagctcgaacgcgagtcgttgtttaggcaaaaagacgaagagaat
catcgccaaaggatcaatttctttaccaacatagcccatgagattcagaccccgttaacc
cttattttaggttccgtagagcatttcatgcaaaaagaaaattcatccggcaaaccgact
ggccaaagttattttctttcgcttattcatcagcataccgcccgtttaacctatttggtg
catcaactgctcgaatttcgcaaggctgaggccggctatttgaaacgtagtgatgattat
ttcgacatttctaagctactcaccagtttgagtcagctttttgttcccgcttcaaccaaa
aaggagcagacctttacccggcatatcgaagacggaattgcgggcttcattgataaggat
aagtttgaaaaagtgcttttcaatctcctttccaatgccttcaaacattcgggcgaaaga
gaagaagtagtttttacagctacatacgatcagcatagccaggagctggagattgttgta
tcgaactcgggctgcaggcttgcagaaagcgatctggaagatatttttaaggaatttcag
gtggggaagagtagcgacctgaataatttcagtaccggaattggtcttgcgtttacaaaa
gagcttgttgccattatggatggcgaattaaacgcttctttaaaaaacgattggatttcg
ttcagttttaaactgaaattacaacaagctatcgagggtaaaaaagatgaggtggtaacc
tcggcgccttcgtcgctattcgaatcgattttgaaaccttacgaacaagaacctatagcc
tcggtggaagaaaataataaggtggcgttgattgatgatttaaaggccgtttgcacccac
agcgtgctcgtggttgaagatgatttggcgctgcggttcctaattaaaaacatcttaaaa
gatcattacaatgtttatgaggctgaaaatggcgtttcagcactctcatttctgaaaaat
aacacgcccgatattattatcagcgacgtgatgatgcccgatatggatgggttggaactc
tgtaaacacattaaaaccgttcctgcaacctgtcatatcccctttattatgctctcggca
aaaggcactgaggaaaacaaaaccgaaggttacgaaaccggggccgatgcctatattgct
aagccgtttaacgtgaactacctgcaaatgcgggtgcgaaaactgctggattaccgcgag
cggatgaaccatttaattaaagacagaaatattaacaatcaatttgtagatgttgatttg
gagcaaggggataaggaatttttgaatgcattggttaaggcagtagaggataacctcgca
gagcccgatctcgacgcggccaagttagaagatgcattgtgcatcagtaaaatgcagttg
taccgcaaactaaaatcgctggcggggatgacaccatctgaatttattaagcgcattcga
ttaaaacacgctgcggtattactgcaaaatagcaagcttaatgtgtctgaaattttttac
ctaaccggctttaataataagtcatatttctttagggagtttaagaaaatttaccacctg
gcgccgaacgaatatcggcaaaagcaatatcaggctgatgagagcccattgccatccgat
agctatcggatctga
DBGET
integrated database retrieval system
