KEGG   Pedobacter endophyticus: IZT61_09935
Entry
IZT61_09935       CDS       T07452                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
pex  Pedobacter endophyticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pex00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pex02000]
    IZT61_09935
Transporters [BR:pex02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   IZT61_09935
SSDB
Motif
Pfam: CarbopepD_reg_2 TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarboxypepD_reg TTR_TEN1-4 SpaA DUF3869 CooC_C DUF7382 Dockerin_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: QPH41547
UniProt: A0A7S9L307
LinkDB
Position
complement(2482210..2485170)
AA seq 986 aa
MKVFYLLKQGLLMLLVFSALIVKAQTGSISGKVLDETGQPLPGASVIVKGTTRTTSTDAN
GVFKLSGLSNGSVTVAASFIGYQTLEKTVNVAANTTADFQLVPDAQNLNEVVVIGYGTAE
RKNLTGSIATVNSKDFQKGTITTPEQLIQGKVAGVNIISGGGSPGGGSTIRIRGGASLNA
SNDPLIVVDGVPFSGNAIGNAPSPLSLINPNDIETFTVLKDANATAIYGSRASNGVILIT
TKKGTSGAPQINFNTNNSIATVAKKVDLLSADEVRAFVNANGNAAQKALLGTANTDWQDE
IYQNAFSTDNNLSIAGSFKGVPYRVSAGYLDQEGVVITSKLKRATGAISISPKLFTDHLK
IELNLKGALTDSQYPNDGAIGSAIQFDPTQPVYATNKFGNYFEWITSAGVPNPNAPRNPV
ALIRQQDNHGNAARSFGNAKFDYSFHFLPELHAVVNVGYDYSKGYGRTIVPIYAAQSFST
EGSFTRRLNTEINKFSEAYLTYAKTIGKSRFDVTGGYGYYDDAVTNYNFASYRGTGVLQT
TPVFPFSVDQNKLLSYYGRFNYTFADKYILSGTMRADASSKFAEDNRWGYFPSVGFTWRI
IDENFLKDSKVLSDLKLRLTYGETGNKDGIGNYDYLSKYYANSNQGQYQVGDTFYNYYSP
AGYDPDLRWETTTTYNAGLDYGFMQGRIYGSVDVYYKKTKDLLSKVTIPVGTNFSNELTT
NVGNMEVRGAEVSLNYVAVKTENTTWDIGVNAAYNKRKVTNLTLNPNSGFKIDAGDITGG
TGIHLKYNAVNQLPGSFFVYKQVYNANGKPLEGVYEDLNGDGSVNAADQYFYKSPDPVVT
LGFNTSFTYKRWTASTVLRANIGNYIYDNISSNFGIRNNVLSTQGILNNSTTDLYNTNFS
GGSGVQYLSDYFIRNASFLKMDNAGLSYNVGKLSKNGNMSMRISANCQNVFVVSKYKGID
PESVSGIDYNLYPRPRTYTLGLNVGF
NT seq 2961 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagtattttacctgttaaaacaggggcttttgatgctgttggttttctcagcatta
atcgtaaaagcacaaaccggatctatatctggaaaggtgcttgatgaaactggccaacct
ttgccaggtgcttcggtaattgtaaaaggtacaacaagaactacatcgacagatgcaaat
ggtgttttcaaattgtcgggcctttctaatgggtcggtaacggttgctgccagctttatc
ggttaccaaacactcgaaaaaacagttaatgttgcggcaaataccactgccgattttcag
ttggttccggatgcgcagaatcttaacgaggttgtggtaattggttacggtaccgcagag
cggaagaaccttaccggttcaatcgctaccgtaaattcaaaagatttccaaaaaggaaca
attactacacctgaacaattaattcagggtaaggttgccggtgtaaacattatctcgggc
ggcggttcgccaggtggtggtagtaccattcgtattcgtggtggtgcatcgcttaacgcc
agtaacgaccctttaattgtggtagatggagttccctttagcggcaacgccattggcaat
gcgccaagcccgctttcgttaatcaatcctaacgatattgaaacgtttaccgttttaaaa
gatgcaaacgcgactgcaatttatggttcgcgtgcatcaaatggggtaatcttaattacg
accaaaaaaggaacgtcgggcgctcctcaaatcaacttcaacacaaacaactccattgca
acagttgcaaaaaaagtagatttattatctgccgatgaagttcgtgcctttgttaacgca
aacggtaatgctgcgcaaaaagcgcttttaggtacggcaaataccgattggcaagatgag
atttatcaaaacgctttttctacagataacaatttgagcattgcaggttcatttaagggc
gtgccttaccgcgtatcagcaggttacttagatcaggaaggcgtggtaattaccagcaaa
ttgaaaagagcaaccggggcaatttcaatatcaccgaaattattcaccgatcacttaaaa
atcgagttgaacttaaaaggtgctttaaccgattctcagtatccgaatgatggtgcaatt
ggttcggccattcagttcgatccaacccaacccgtttatgcaaccaacaagtttggcaac
tacttcgagtggattaccagtgcaggcgttccaaacccaaatgcaccgcgtaacccggtt
gccttaatcagacaacaagataatcatggtaatgcggcaagaagtttcggtaacgcaaag
ttcgattattcgttccatttcttaccagagttacatgcagtggttaatgtgggttacgat
tactcgaaaggctacggacgtaccatagtgccaatttatgcggcgcaaagcttctctacc
gaaggatcgtttacaagaaggttaaatacagagatcaacaaattctcggaagcttactta
acctatgccaaaacaattggcaaaagtagatttgatgtaacgggtggttatggttattac
gatgatgccgttaccaattataatttcgccagctacagaggtacaggcgttttgcaaact
acacctgttttccctttttctgttgaccaaaacaagttactttcttactacggccgtttc
aactacacgtttgctgataaatatattttatcaggaacgatgcgtgcggatgcttcctct
aaattcgctgaagacaatcgctggggttatttcccgtcagttggttttacctggagaatt
atcgatgagaatttcttaaaggatagcaaggtgctttctgatttgaaattgaggttaact
tatggcgaaaccggtaataaagatggaattggtaactacgattatctatctaagtactac
gcgaatagcaatcaaggacagtaccaggttggcgatactttttataactactatagccct
gcaggttacgaccctgatttaagatgggaaaccacaacaacttataacgctggtttagat
tacggttttatgcaaggcagaatttatggtagcgttgatgtttactataaaaaaaccaaa
gatttgttaagcaaggttaccattccggtaggaacaaactttagcaatgagctaacaacc
aacgttggtaacatggaagttagaggtgctgaggtaagcttaaactatgtagcagttaaa
accgaaaataccacatgggatattggtgttaacgcggcttacaacaaaagaaaggttacc
aacctgacattaaacccaaattcgggcttcaaaatcgatgcgggtgatattacgggcggt
acaggtattcatttaaaatacaatgcagtaaaccagttgccaggctcattctttgtttat
aaacaagtttacaatgccaatggaaaaccattagagggagtttacgaagatttaaatggc
gatggttctgttaatgctgccgatcagtatttttataaatcgccagatccggttgttacc
ttagggtttaatacctcgtttacttacaaaagatggactgcgagcactgttttaagagct
aatattggtaactatatttacgataatatttcttcaaacttcggtatcagaaacaacgtt
ttaagtacacaaggcattttgaacaactctacaaccgatttgtacaacactaacttttct
ggcggatctggtgttcagtatttgagcgattactttatcagaaatgcctcattcttaaaa
atggataacgcaggtttatcgtataacgtaggcaagctttccaaaaatggcaacatgtcg
atgcgcatttctgcaaactgccaaaatgtgttcgtggtatcaaagtataaaggaatcgat
ccagaatcggtaagtggaatcgattataatctttatccacgtcccagaacttacactttg
ggcttaaacgttgggttttaa

DBGET integrated database retrieval system