Paenibacillus sp. E222: HW560_28415
Help
Entry
HW560_28415 CDS
T10443
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
pezz Paenibacillus sp. E222
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLG43027
LinkDB
All DBs
Position
complement(6419467..6422991)
Genome browser
AA seq
1174 aa
AA seq
DB search
MGFTGDTGATGVTGATGVTGDMGATGVTGAPGVTGDTGATGVTGTTGSTGDTGATGVTGA
TGVTGDTGATGVTGTTGVTGDTGATGVTGTTGVTGDTGATGVTGATGVTGDAGATGVTGA
TGVTGDTGATGITGTTGSTGDTGATGATGITGDTGATGVTGATGVTGDTGATGVTGATGF
TGDTGTTGVTGATGVTGDTGSTGLTGATGVTGDTGTTGVTGATGVTGDTGATGITGATGV
TGDAGVTGVTGATGVTGDTGATGVTGTTGSTGDTGATGVTGSTGVTGDTGATGVTGSTGV
TGDTGATGVTGSTGVTGDTGATGVTGATGVTGDMGATGVTGATGVTGDTGATGVTGTTGV
TGDTGSTGATGATGITGDTGATGVTGTTGVTGDTGTTGVTGDTGATGVTGAIGVTGVTGD
TGATGITGATGITGGTGATGVTGAIGITGDTGATGLTGATGITGDTGATGVTGATGVTGD
TGETGVTGATGITGDTGETGVTGSTGITGDTGATGVTGTAGFTGDTGSTGATGTTGATGD
TGAMGVTGTTGVTGEMGSTGVTGAPGVTGNTGVTGVTGATGVTGDSGSTGVTGATGITGV
TGVTGVTGTAGVTGDTGATGVTGTTGVTGDTGATGVTGTAGVTGNTGATGVTGTTGVTGD
TGATGVPGSTGVTGDAGATGVTGATGVTGDTGATGITGATGVTGDTGATGVPGATGITGD
TGTTGVTGTTGVTGDTGATGVTGATGTGGTGSTGATGATGITGDTGATGITGATGSMGVT
GVTGATGTGATGTTGATGSTGVTGDTGATGTGTTGATGVTGETGATGTTGAGATGATGAT
GLTGVTGDTGATGIGATGATGATGSTGVTGTNGVTGVTGSTGVTGTTGPTGTGATGATGL
TGVTGDTGATGTGTTGATGSTGSTGAAGVTGATGTGTTGATGATGSTGATGVTGATGVTG
ATGIGAVGGTGATGSTGVTGATGTGTTGSTGATGTTGVTGSTGATGATGASGPNLAAQGF
SAFLANLSTATSTQLTNWGTASPYYGNANFNATTGNYTVPNTGTYSIVATINFSTTAAIS
ISLGAGVNPAFLVQRTSPTTTTLVNGLLPILNISVTLLTLRAILGSGAVTLAAEVALNAG
DVIGLFYAANGLTITLNLGIGTTNGIVWSVHELT
NT seq
3525 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atcggatttactggggatacgggtgcgacaggcgtgacgggagcaactggagttactgga
gatatgggtgcgacaggcgtaacgggagcccccggagtcactggcgatacgggtgcaaca
ggtgtaacgggaacgactggaagcactggcgatacaggagcaacgggcgtaacgggagcg
accggagtcactggcgatacaggtgcaacaggtgtaacgggaacgactggagtcactgga
gatacgggtgcaacaggtgtaacgggaacgactggagtcactggggatacgggtgcaaca
ggcgtaacgggagcgaccggagttactggcgatgcaggtgcaacaggcgtaacgggagcg
actggagtcactggcgatacaggagcaacaggtataacgggaactactggaagcactggc
gatacgggtgcaacaggagccactggaattactggcgatactggtgcgacaggcgtaacc
ggagccaccggagttactggtgacacgggagcaacaggtgtaacgggagcgaccggattt
actggagatacgggtacgacaggtgtaaccggagccaccggagtcactggcgatacgggt
tcaactggtttaacaggagcgaccggagttactggagatacgggtacgacaggtgtaacg
ggagccaccggagtcacaggagatacaggtgcaacaggtataacgggagcaaccggagtt
acaggagatgcaggtgtaacaggcgtaacgggagccaccggagtcactggcgatacgggt
gcaacaggtgtaacgggaactactggaagcactggcgatacaggagcgacaggcgtaacg
ggatcgaccggagttactggcgatacaggagcaacaggtgtaacgggatcgaccggagtt
actggcgatacaggagcaacaggtgtaacgggatcgaccggagttactggcgatacagga
gcaacaggtgtaacgggagccaccggagttactggagatatgggtgcgacaggcgtaacg
ggagccacaggagtcactggagatacgggtgcgacaggcgtaacgggcacgactggagtc
actggagatacgggttcgactggtgcaacaggagccactggaattactggcgatactggt
gcgacaggcgtaacaggaacgaccggagttactggtgacacgggaacgactggagttact
ggagatacgggagcaacaggcgtaacaggagcaatcggggttactggagttacaggagat
acaggagcaactggtataacaggagccactggaattactggaggtacgggtgcgacaggt
gtaacgggagccatcggaatcactggcgatacgggtgcaacaggcttaacgggagccact
ggaattactggagatacgggtgcgacaggtgtaacgggagcaaccggagtcactggcgat
acaggtgagacgggcgtaacgggagccaccggaattactggcgatacaggtgagacaggc
gtaacgggatcgaccggaatcactggagatacgggagcaacaggagtaacgggcacggcc
ggatttactggagatacgggttcaactggtgcaacaggaacgaccggagctactggagat
acaggggccatgggtgtaacaggaacgactggagtcactggagaaatgggttcgactggt
gtaaccggagcccccggagttactggcaatacaggagtaacaggggtaacgggggcaacc
ggagttactggggattcgggttcgacaggcgtaacaggcgcgaccggaattactggagtt
acgggtgtgacaggtgtaacgggcacggccggagttactggagatacgggtgcgacaggc
gtgacgggaacgactggagtcactggggatacgggtgcaacaggtgtaacgggcacggcc
ggagttactggaaatacgggagcgacaggcgtaacgggaacgactggagtcactggggat
acgggtgcaacaggcgtaccgggatcgaccggagttactggcgatgcaggtgcaacaggc
gtaacgggagcgactggagtcacaggagatacaggtgcaacaggaataaccggagcgacc
ggtgtcactggagatacaggtgcaacaggcgtaccgggagcgaccggaatcactggcgat
acaggaacaacaggcgtaacaggaacgaccggagtcacaggagatacgggtgcgacaggc
gtaacgggagcaaccggaactggaggtacgggttcgactggtgcaacaggagccactgga
attactggagatacaggtgcaacaggaataaccggagcgacgggctccatgggtgtaacc
ggtgtgacaggagccaccggaactggggctaccggaactacaggtgcaacgggctctacc
ggtgtaactggtgatacaggagcaacgggaacgggaacaactggagcaacgggagttacg
ggtgaaactggtgcgacaggtacaaccggagcgggggcaacaggagccactggtgcaacg
ggacttactggggtaactggtgatacaggcgcaaccggaatcggggctactggagccacc
ggcgcgacaggatcaacgggggtaactggaaccaacggcgttaccggagtcacgggttca
acgggtgtaacaggtacgacaggtcctaccggaacgggggctactggtgcaacgggactt
actggggtaactggtgatacaggcgcaaccggaacgggaacgactggagccacaggatcg
acgggctcaacgggtgccgctggtgtgacaggcgccaccggaacgggaacaaccggagct
accggcgcgacgggctcaacgggtgccactggtgtgacaggcgccaccggtgtgacaggg
gctaccggaatcggagcagttggaggtactggtgcaacaggatcaacaggtgtaaccgga
gcaacgggaacgggtacaactggctcaactggcgctaccgggacgactggagttactgga
tccacgggagccacaggggctacaggtgcatcaggccccaatttagctgcacaagggttt
tctgcatttttggctaacctatccacagcaaccagtacacagttaaccaactggggtaca
gcaagtccttactatggcaatgcaaattttaatgcaactacaggcaattacacggtgccc
aatacagggacctattcgattgtggcaaccatcaatttttctacaactgccgcgatctcc
atttcattgggtgctggtgtcaatccagcgtttctggtgcaaagaacatcccccaccacc
actactttggtcaatggactattgccaatcctgaatatcagtgtgacgctactcacattg
cgggcaatactcggtagtggagctgtaacgctagctgcggaggtggcgttgaacgctgga
gatgtaattgggttgttttacgcagcaaatggattaacgatcacactgaatttggggatt
ggaacaacgaacggtattgtatggtcagtacacgaattgacatga
DBGET
integrated database retrieval system