KEGG   Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_0505500
Entry
PF3D7_0505500     CDS       T00095                                 
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein MSH6, putative
  KO
K08737  DNA mismatch repair protein MSH6
Organism
pfa  Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    PF3D7_0505500
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pfa03400]
    PF3D7_0505500
DNA repair and recombination proteins [BR:pfa03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     PF3D7_0505500
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_I MutS_IV MutS_II nSTAND_NTPase5 AAA_29
Other DBs
NCBI-GeneID: 812907
NCBI-ProteinID: XP_001351613
PlasmoDB: PF3D7_0505500
UniProt: Q8I447
LinkDB
Position
5:complement(join(239456..240271,240644..243880))
AA seq 1350 aa
MASSNKKQSSILSFFKSNEEKTNKSSCLNEINNKVGDGKGHKQNEINNNVPEKRKSGDDK
SGVDSKNKNEKENLGSNKKINMLDMFLSKGEMYNKPKIIDNINKEPINGDMLSTDKNMNV
NKTNKMHNLFLDEEKTDMSKTKCSNDDVYDNNVYNNNVYDNNVHNNNVHNNNVRNNNVHN
NNIHNNNNYGNIYRNDNCVVKSNECNNNGVELDEDSNYQNMVHNQMLEGRNYMDNLESST
EDDIIIKKKRKIILDSVSDKECSDAKENNINKNNCSVDNKLTNLLYEPNKEIDDNLLLLD
DNNNNNIKKCIEKRKGDDSKKSQELDGLRNKYLNLPISITNDKFRLYIEHYFLYCNTFEF
PKWIQPQYIRDINLRTPDHADYDSSTIWTPPPDHKWAIEYKQAHYTPGMQQFWKIKSRNF
DKIIFFKMGRFYEIFYIDACLMHTICSLNWMSGEHKPHLGFPEQSLHFYAKKVINSGHKV
VVIEQMETPKELEQRNKESIGPKDKAIKREINEIYTKGTILHDNMLSAETKYLVCFYFDE
IENMTNVNNNIKDNDDDHNNIKDNDDDHNNIKDNNDDHNNIKDNNNYTFSQYDNKNKCNF
GFVVSDIATSYIAVGYCNDDESRIVLRTILAQLCPAEILYSSKNINKEVLSIFKNIPTSP
ELTCLNSFPNIISSFDEINKYFENMPSNLEIYKEQTSVICAFGGFIVYLRSLLLDKKIFR
FCKIEKYDLFKRETYMVLDATALKHLEILETQSGDTKNSLYDYVNKTCTNFGARNLRRWI
CSPLLDCEKIRERLDVVDFLKNNEQILSLIRMKLKKLPDIERLLNKICIQASQSERGAVF
FDNVVNTKLKEFVTFLNAFKEIDTMLIDVNRIERDGELPSRLFQICNTPDICKDNIKGSY
PNIGLITNEFLEKIYFDGDKEYKPAEGCDEDIDKINEKEKNVENKLNNVLEHMRTQLKIP
TLKFVHAKFKYEVECPDNIPKSFLKNVEITSAKKGYVRIHNDEIKSLVEKLEDIEQEKKD
AIYPFFQKLFHLFYAHYEKYVSACRLVAELDCLQSFAYVVLNTAFPLTRPILHPMDSKQG
EEKTPFLILEDNIHPVVAMLMPNFISNNIYMGCDKEKQSTLLLTGPNMGGKSTLLRQTAI
SVILAQIGAFVPCTYCELTVVDKIFTRLGSSDNLFEGKSTFLVELEDISNLLKQSTKYSL
AILDELGRGTSSFDGTAIALSTLEQISDVIKCRCIFSTHYHLLVEEVKHNKNISNYHMSL
SIDDEQEKIIFLYKFIKGVCPKSFGIHIAKLAGLPKEIIDLAHEKSLLFENVTDEFCKII
KYKNITRSLLNEEADEKLVTLFHKYKKEFA
NT seq 4053 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcatcatctaacaaaaagcagtcctctattttaagtttttttaaaagcaacgaagaa
aaaacaaataaatcatcttgtttaaacgaaataaataataaagttggtgatgggaaaggt
cataagcaaaatgagataaataacaacgtgccagaaaaaagaaaaagtggtgatgataag
tccggagtggattctaagaataaaaatgaaaaagagaatttgggttcaaataaaaagata
aatatgttagatatgtttttatccaaaggagaaatgtataataaacctaaaataatagat
aatataaataaggagccgataaatggagatatgttatctacggataaaaatatgaatgtg
aataaaactaataaaatgcataatctttttcttgatgaagagaagacagatatgagtaaa
acaaaatgttctaatgatgatgtttatgataataatgtttataataataatgtttatgat
aataatgttcataataataatgtccataataataatgttcgtaataataatgttcataat
aataatatccataataataacaattatggtaatatttatagaaatgataattgtgttgtt
aaatcgaacgaatgtaataataatggagtggagttagatgaagatagtaattatcaaaac
atggttcataatcaaatgttggaaggtcgaaactatatggataatttagaatcgagtaca
gaggatgatataattataaaaaagaaaaggaagataattttagatagtgttagtgataaa
gaatgttcagatgcaaaagaaaataatataaataaaaataattgtagtgtagataataaa
ttaacgaatttattatatgaaccgaataaagagattgatgataatttattattattagat
gataataataataataatataaaaaaatgtatagaaaaaagaaaaggagatgatagtaaa
aaatcacaagaattagatggtttaagaaataaatatctaaatctacctataagtataaca
aatgataaattccgtttatatatagaacattactttttatattgtaatacatttgaattt
cctaaatggattcaaccacaatatattagagatataaatctaagaactccagatcatgct
gattatgactcatcaactatatggacccctccacctgatcataaatgggccatcgaatat
aagcaagcacattatactccaggtatgcaacaattctggaaaatcaaatcaagaaatttt
gataaaatcatattttttaaaatgggcagattttatgaaatcttttatatagatgcatgt
ctaatgcatacaatttgttccttaaattggatgagtggtgaacacaagccacatttaggt
ttccctgaacaatccttacatttttatgctaaaaaagttattaacagtggtcataaagta
gttgtcattgaacaaatggaaacaccaaaagaattagaacaaagaaataaagaatctata
ggacctaaggataaagctataaaaagagaaattaacgaaatatatactaaagggaccatt
ttgcatgataatatgttaagtgctgaaacgaaatatttagtatgtttttactttgatgaa
attgaaaatatgacaaatgttaataataatataaaagataatgatgatgatcataataat
ataaaagataatgatgatgatcataataatataaaagataataatgatgatcataataat
ataaaagataataataattataccttttcccaatatgataacaaaaacaaatgcaacttc
ggttttgttgttagcgatatcgctacttcttatattgccgttggatattgtaatgatgac
gaatcaagaattgttctaagaactattttggctcaattatgtcctgctgaaattttatat
agctctaaaaatataaataaagaagttttatcaatatttaaaaatattcctacttctcca
gaattaacttgtctaaatagctttccaaatatcattagctcatttgatgaaataaataaa
tactttgaaaatatgccatctaatttagaaatatataaagaacaaaccagtgtcatatgt
gcttttggtggtttcattgtttatttaagatctttacttttagataaaaaaatatttaga
ttctgtaaaattgaaaaatatgatctcttcaaaagagaaacttatatggttctagatgct
acagctttaaaacatctagaaattttagaaacacaatcaggagatacaaaaaattcttta
tacgattatgtgaataaaacgtgtacaaatttcggtgcaaggaatttgaggagatggatt
tgtagtccattattagattgtgagaaaataagagaacgtttagatgtagtcgacttctta
aaaaacaatgaacaaattttatcccttataagaatgaaactaaaaaaattacctgacata
gaaagattattaaataaaatatgtatacaagcttcacaaagtgaaagaggagctgttttt
tttgataatgtagtaaatacgaaattaaaagaatttgtgacttttctcaatgcattcaaa
gaaatcgataccatgttaatagatgtgaatagaattgaaagagatggagaattacctagt
cgcctttttcaaatttgtaatacacctgatatatgtaaagataatataaaaggttcttat
ccaaatataggattaataacaaatgaatttttagaaaaaatttatttcgatggagacaaa
gaatataaaccagcagaaggatgtgatgaagatattgataaaatcaatgagaaggagaaa
aatgtagagaataaattaaataatgttttagaacatatgagaacacaattaaaaattcct
accttaaaatttgtgcatgcaaaatttaaatacgaagttgaatgtccagataatatacca
aaatcatttttaaaaaatgtagaaattacatcagcaaaaaaaggatatgttcgtatacat
aatgatgaaattaaatctttagtagagaaattggaagatatcgaacaagaaaaaaaagac
gctatatatccattcttccaaaaactgtttcatttattttatgctcattatgagaagtat
gtatctgcatgtagattagtggcagaacttgattgtttacagtcttttgcttatgtagtc
ttgaatacggctttccccttaacgcgtcctattctacatcctatggattctaagcaggga
gaggaaaagacgccatttttaattttggaagacaacatccatcctgtggttgctatgtta
atgcccaattttatttcgaacaatatttatatgggatgtgataaagaaaaacaatctaca
ttattattgacaggtcctaatatgggtggtaaaagtaccttattacgtcaaacagctatt
tctgtaatattagctcaaataggtgcatttgtcccttgtacttattgtgaattaacagtt
gtagataaaatatttactcgtttaggttctagtgataatttatttgaagggaaaagtacc
tttttagtagaattagaagatatttctaacttactaaaacaaagtactaaatatagccta
gctatattagatgaattaggtagaggtacttcttcttttgatggtacagcaattgctcta
tccacgttagaacaaatatctgatgttataaaatgtagatgcatattttcaacacattat
catttattagtcgaagaagtgaaacataataaaaatatttcaaattatcatatgagccta
agtattgatgatgaacaagaaaaaattatatttttatataaatttattaaaggtgtatgt
cctaaatcgtttggtatacatatagccaaattagctggactacctaaagaaattattgac
ttagctcatgaaaaatcattactgtttgaaaatgttacagatgaattctgtaaaattatt
aaatataaaaatataactcgatctttgttaaatgaagaagctgatgaaaaactcgtaacc
ttatttcataaatataaaaaggaattcgcataa

DBGET integrated database retrieval system