Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_0609900
Help
Entry
PF3D7_0609900 CDS
T00095
Name
(RefSeq) conserved Plasmodium protein, unknown function
KO
K15201
general transcription factor 3C polypeptide 3 (transcription factor C subunit 4)
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pfa03021
]
PF3D7_0609900
Transcription machinery [BR:
pfa03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
Basal transcription factors
TFIIIC
PF3D7_0609900
TFIIIC, fungi type
PF3D7_0609900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BUD22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3885879
NCBI-ProteinID:
XP_966089
PlasmoDB:
PF3D7_0609900
UniProt:
C6KSU6
LinkDB
All DBs
Position
6:425805..431858
Genome browser
AA seq
2017 aa
AA seq
DB search
MMDENHKDDNIHYDKESSLFIYDINSDKEKDEEKKLGESNKYSNIEQNNVNNNKLENNVD
DVNNDDVLKYYNIVKNNKINDEILQLQIQHLLNFNKKSETYEEKQKRVMLGYLNDDDIDY
MLYDKSDEEFLSNFMEDLNNFKNIHLIEKHESNIKKNGIIYSIDYEKIIYKERRLPDINN
MNINNILYYYFYSNQEYLMNIKNRNIYTYDSYIFENDQMSDFSQDEKYNSYSDSQSTISD
EDLLLLRYDDNSEYDDEAKIYMNKKRRKNKRDRKKNKRGKGNKKKMIPVEKRRHHNNMYD
NNNNNNYDDDDDDDNDNDNDNDDYKSYKYNDKKKKYNEKLLKTAEPSKMNKEIEAMMNKA
NNCYINQNFNECIILLEKVIKKSPCLHDPFHLLGLIYEREYKNLKKAINYYLIAAHLSHG
DFLSWYNIIDLCKIEKEYNVVIYCLYKVLKFYKRKKYKCKKNYVEYDENNEWQHNQNFIS
NNITYDTVNLHDNILNMCDDVVWGNKEINTHKENNNDDGNNNVDGNNNDDDNNNNDDNNN
NNCNNNNFYGYNKKDDYSLNNQFDNFMRHIYFNLAFTYILLEDYKNALKNLFILKNNNYS
SYDLIIDIYICICLVHINNASDCYNFLKNIYVYNICKRKNEENYSYSYQEKVLICLLMQT
QILNNKYDECIFVYKTLTKENDYVHIDIFLQFIKAVIMRGHMESSYLIRTHFLQIILASY
YLFEDIIYSLGDTYYLKNMFEGAIYFYTLIYKKRKHTYFKNIRSIKNGHKTNSGNNKIND
NRNNKINDNRNNKINESINDYVNFNVNNNPQNNHTSGWNTHLMTSLKNENSTKHPNFSNI
YLENEEMNNMMYSQMDNIIWFDNKINFIQVIYKLVKSYYYIENYIKAEKIILKILNNEHI
EKNNIEIDLKTLYIDILYKLKKYNESINVLLSIREKKLRFICSIPKPLNNKEREILLLKI
LNKKNKLLLYTQHNNYILHIFYIYKQNKNYNSTNYQYDNYLLNKDINDIIQIQKNICFCY
FCVKYNFVILNYIYLYNIFHILYNKQINSSSFMKNKQILWNIYKFRKYLQYLTSSFSILK
KGKKVLYDWDIIHKNFQSKETKLFYKGVMIIDIKNFIYDNKKNNRNDDINRYDDINRYDD
INRYDDINRYDDINHYDDINHYDDINHYDDINHYDDINCYDKGDVNVYQNIKENKIEEHK
KKEDGEEPFPCAQKLSNASLINNNNNKDDHHINDKKNNVIIEEFYKNIYKYKCNIESEIL
NSKIIMKFYKFSYNFFYLLYEMERDFNRIQTYMEKENLNFRSKNNQKNNVEMNKKKNNEY
DDHKRNEEAPSYGKKILMDNKMDDGDDDDDYYYYDDNYFNDKYSDKENDHDNYTHMNVHL
ENIEKSLINKTNTKNMQRFRRISFLLTKKRLNFFSFESYLGLYFSLLFLEECFFLISIMN
LYEDSIHMLSVYLRNRKSNKMKSLTYFKSIKNEFKKYHINNNLLNLNFYFFDNVYTNNIR
NEIKNEYCNLKHMNKYIDCKYYIFRINLLLNKLYISAGNYDKQIKCLNDIYIFNKKQKEE
YKILKYYSDIVLTGKFCHDFLTSISKSKNKNILISFRLFLVRSIHYKKSNPFLLYLIGHI
CNISCMITNAVHEFTRAYTFLLKNRRENKEKMDNFRNQDVKWMKKNKHEMVNEEEDQEVD
DDDDDDDNDGDDSDGDDNDGDDSDGDDNDGDDSDGDDNDGDDSDGDDNDGDDSDEFLYDY
PYNRNIQQEKLITGRQFDDANSYDNSDKGDQGEHDDNEDRFLFADLKLSSNNNKEKDEEY
INSFENICDNINFLFSLTVSYFNYSSCFRVENRESVIMTSFCLLNEYIYKRYEQKILNKK
KKYKKYSLFYKIYKYIYLAEILYNLARALHHLSYYNECMKLYLTVIDLIKAADKEILWVI
KRNNLNINERFIYNYVINMNKCMCFTCLNFSFRNNKSCYNKLINYFLNLNTKYSNFYLLF
FDKKHLLFSASYNLSVIFRKFNRFEQAKYILNNIIWD
NT seq
6054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggatgagaaccataaagatgataacattcattatgataaagagtcttctttattt
atttatgatataaacagcgataaagaaaaagatgaagaaaaaaaacttggtgaaagtaat
aaatatagtaatattgagcagaataatgtaaataataacaaattagaaaataatgtggat
gatgtgaataatgatgatgttttaaaatattataatattgtaaagaacaataaaataaat
gacgagattttacaacttcaaattcaacatttattaaattttaataagaaaagtgaaaca
tatgaagaaaaacaaaaaagagttatgttaggttatttaaatgatgatgatattgattat
atgttatatgacaagagcgatgaagaatttctttctaattttatggaagatttgaataat
tttaaaaatatacatttaatagaaaaacatgagtcgaatataaaaaaaaatggtataata
tattctattgattatgaaaagataatatataaagaaagaagattaccagatataaataat
atgaatataaataatatcttgtattattatttttattctaatcaagaatatttaatgaat
ataaaaaatagaaacatttatacatacgattcatatatatttgaaaacgatcaaatgagt
gatttttcacaagatgaaaaatataattcttatagcgatagtcagagtactattagcgat
gaagatttattattattaagatatgatgataattctgaatatgacgacgaggcaaaaata
tatatgaataagaaaaggagaaaaaataaaagagatcggaaaaaaaacaaaaggggaaaa
ggaaataaaaagaagatgattcctgttgaaaaaagaagacaccataataacatgtacgat
aataataataataataattatgatgatgatgatgatgatgataatgataatgataatgat
aatgatgattataaatcatataaatataatgataaaaaaaaaaaatataatgaaaaactt
ttaaaaacagctgaaccatctaaaatgaataaagaaattgaagcaatgatgaataaagct
aataattgttatattaatcaaaattttaatgaatgtattatacttttagaaaaagttata
aaaaaatcaccatgtttacatgatccttttcatttattaggattaatatatgaaagagaa
tataaaaatttgaagaaagctattaattattatttaatagcagcacatttatcgcacgga
gactttttatcttggtataatattattgatttatgtaaaatagaaaaagaatataatgta
gttatatattgtttatataaagtattaaaattttataaaaggaaaaaatataaatgtaaa
aaaaattatgttgaatatgatgagaataatgaatggcaacataatcaaaattttattagt
aataatataacgtatgatactgttaatctgcatgataacatattaaatatgtgtgatgat
gtggtatggggaaataaagaaattaatacccacaaagaaaataataatgatgatggtaat
aataatgttgatggtaataataatgatgatgataataataataatgatgataataataat
aataattgtaataataataatttttatggttataataaaaaggatgattattctttgaat
aaccagtttgataattttatgagacacatatattttaatttagcctttacatatattttg
ttagaagattataagaatgccttaaaaaatttattcatcttgaaaaataataattattct
tcctatgatcttattatagatatatatatatgtatttgtttagtacacataaataacgct
agtgattgttataattttttaaagaatatatatgtatacaatatatgtaaaagaaaaaat
gaagaaaattattcatattcatatcaagaaaaagttcttatatgtttgttaatgcaaaca
caaatattaaataataaatatgatgaatgtatatttgtatataagacattaacaaaagaa
aatgattatgtacatatagatatttttttacaatttataaaagcagttattatgagaggt
cacatggaatcatcttatttaattcgaactcattttttacaaataatattagcaagttat
tatctctttgaagacattatatattctttaggggacacatattatttgaaaaatatgttt
gaaggagcaatatatttttatacacttatatataaaaagaggaagcatacatattttaaa
aatattaggagtataaagaatggacataaaacaaactcaggaaataataaaataaatgac
aatagaaataataaaataaatgacaatagaaataataaaataaatgaatctatcaatgat
tatgtcaatttcaatgtaaataataatcctcagaataatcatacatctggatggaataca
catttgatgacgagcttaaaaaatgagaattcaactaaacatcctaatttttctaatatt
tatttagaaaatgaagaaatgaataatatgatgtatagtcaaatggataatattatttgg
ttcgataataaaattaattttatacaagtaatttataaacttgtaaaaagttattattat
atagagaattatataaaagcagaaaagatcattttgaaaatattaaataatgaacatata
gaaaaaaataatattgagatagatttaaaaactttatatattgatatattatataaatta
aaaaaatataatgaatcaattaatgtcttattaagtataagagaaaaaaagttaagattt
atatgttccattcctaaacctttaaataataaagaaagagaaattttgttattaaaaatt
ttaaataaaaaaaataaattattattatatacacaacataataattatatattacatata
ttttatatttataaacaaaataaaaattataatagtacaaattatcaatatgataattat
ttattaaataaagatattaacgatattatacaaattcagaaaaatatatgtttctgttat
ttctgtgttaaatataattttgtaatattaaactatatatatctatataatatctttcat
attttatataataaacaaatcaactcttcctcttttatgaaaaataaacaaatactatgg
aacatttataaatttagaaaatatttacaatatcttacctcatccttttctattcttaaa
aagggaaaaaaagttctatatgattgggatattattcacaaaaattttcagtcgaaagaa
acgaaattattttataaaggtgttatgataatagatatcaaaaattttatatatgataat
aaaaagaataatcgtaatgatgatattaatcgttatgatgatattaatcgttatgatgat
attaatcgttatgatgatattaatcgttatgatgatattaatcattatgatgatattaat
cattatgatgatattaatcattatgatgatattaatcattatgatgatattaattgttat
gataagggtgatgttaatgtttatcaaaacataaaggagaataaaatcgaagagcataaa
aagaaagaggatggagaagagccttttccatgtgctcagaaattatctaatgcaagtctt
attaataataataataataaggatgatcatcatattaatgataaaaagaataacgtaatt
atagaggaattttataaaaatatttacaaatataaatgtaatatagagtctgaaatatta
aacagcaaaataataatgaaattttataaattcagttataattttttttatttattatat
gaaatggaacgtgacttcaatagaatacaaacatatatggaaaaagaaaatttaaacttt
cgatcaaaaaataatcaaaagaataatgttgaaatgaataagaaaaaaaataatgaatat
gatgatcataagaggaatgaagaagcaccaagttatggaaagaaaattcttatggataat
aaaatggacgatggtgatgatgatgatgattattattattatgacgacaattactttaat
gataaatatagtgataaagaaaatgatcatgataattatacacatatgaatgttcattta
gaaaatattgaaaaatcacttatcaacaaaacgaacactaaaaatatgcaaagatttaga
cgaatttcatttttacttacaaaaaaaagattaaattttttttcttttgaaagttattta
ggtttatattttagcttattatttcttgaggaatgcttttttttaataagtattatgaat
ttatatgaagattctatacatatgctaagtgtatatttaagaaataggaaatctaataaa
atgaaaagtttaacatactttaaatctattaaaaatgaattcaaaaaatatcatattaat
aataatttactaaatttaaacttttatttttttgataatgtatatacaaataatataaga
aacgaaatcaaaaatgaatattgtaatttaaaacatatgaacaaatatatcgattgtaaa
tattatattttcagaataaacctattattaaataaattatatatatcagctggtaattat
gataaacaaattaaatgtctaaacgatatctatatatttaataaaaaacaaaaagaagag
tataaaattttaaaatattatagtgatatagttttaacagggaaattttgtcatgatttt
ttaacatccatatcaaaatcaaaaaataaaaacattttaattagctttagactttttctt
gttaggtctatacattataagaaatctaatccattcctactatatttaataggacacatt
tgtaatatctcttgtatgatcactaatgctgttcatgaatttacgagagcatataccttt
ctcttaaaaaataggagggaaaataaagaaaaaatggataattttaggaaccaggacgta
aaatggatgaagaagaataaacatgaaatggtaaatgaggaggaagaccaagaagtggac
gacgatgatgatgatgatgataacgatggagatgacagtgacggggatgataacgatgga
gatgacagtgatggggatgataacgatggagatgacagtgatggggatgataacgatgga
gatgatagtgatggggatgataacgatggagatgatagtgatgaattcttatatgattat
ccatataatagaaatatacaacaagaaaaacttataacaggtaggcaatttgatgatgct
aatagttatgacaacagtgacaaaggagaccagggagaacatgatgataatgaagataga
tttttgtttgctgatttaaaattaagtagtaataataataaagaaaaagatgaagaatat
ataaacagttttgagaatatatgtgataatattaattttttatttagcttaactgtttca
tattttaattattcgagttgttttcgagtggaaaatagggaatcagttattatgacttcc
ttttgtttattaaatgaatatatatataaaagatatgaacagaaaatattaaataagaag
aaaaaatataaaaaatattcacttttttataaaatctataaatatatatatttagctgaa
attttatataatcttgcaagagccttacatcatttatcttattataatgaatgtatgaaa
ttatatttaactgttattgatttgataaaagcagcagataaagaaattctttgggttata
aaaagaaataatttaaatattaatgaaagatttatatataattatgttattaatatgaac
aaatgtatgtgttttacatgtttaaacttttcttttaggaataacaaatcatgttataat
aaacttataaattattttcttaatttaaataccaaatattcaaatttttatctcctcttt
tttgataaaaaacatcttcttttctcagcgtcttataacttgagtgttatttttagaaaa
ttcaatcgttttgagcaagccaaatatatattaaataatatcatctgggattaa
DBGET
integrated database retrieval system