KEGG   Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_0630300
Entry
PF3D7_0630300     CDS       T00095                                 
Name
(RefSeq) DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, putative
  KO
K02324  DNA polymerase epsilon subunit 1 [EC:2.7.7.7]
Organism
pfa  Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa03030  DNA replication
pfa03410  Base excision repair
pfa03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    PF3D7_0630300
   03410 Base excision repair
    PF3D7_0630300
   03420 Nucleotide excision repair
    PF3D7_0630300
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:pfa03032]
    PF3D7_0630300
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pfa03400]
    PF3D7_0630300
Enzymes [BR:pfa01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     PF3D7_0630300
DNA replication proteins [BR:pfa03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   DNA polymerase epsilon complex
    PF3D7_0630300
DNA repair and recombination proteins [BR:pfa03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    Long Patch-BER factors
     DNA polymerase epsilon complex
      PF3D7_0630300
SSDB
Motif
Pfam: POL2_thumb zf_DPOE_2 zf-DPOE PHD
Other DBs
NCBI-GeneID: 3885768
NCBI-ProteinID: XP_966285
PlasmoDB: PF3D7_0630300
UniProt: C6KTD8
LinkDB
Position
6:complement(join(1260398..1260601,1260774..1266852,1267051..1269283,1269389..1269596))
AA seq 2907 aa
MSTQTRTKGWEKESKINPDYEYERLLKLENKFHIKAWINKGEKEGYLYNIVPTTMNVVAK
NSNKSHKKTGVHMYFVSDNNKTWRLTLFYRPYFYLKTKNIHNYEQVTKFLKKELDKYNVE
IDYVKKEDLSLYDHLNKKRSYLSNIFFKLSYDTIENLMNARDFLVKIIERNKKQNKNYNN
SNNDKHIFNNEDLSYSQLEFSYKNEYSYNKYDDQKENTQKQQFTTNITEEDDKKRILNAK
SNDNNNNNNNNTHNSNNNNNILNMNDIIVTTKKQILSKEEIMNEIIEIYEYDVKYLTRIC
IDKNIRCGLWYKVKREEDELYTELIQFEILNKKVLAPLNILAWDIECYKDELKFPDKEKD
EIILISYMYNAQGYLIVNRNVMSKNIREFLYKPNEEYSGAGTFKIFNEKNEYFLLKRFLE
HIRLLKIHIFVTYNGDFFDIPYLYRRCEINNLSVSREIGFIMNNKQECSCNFILNIDAYK
WVERDSYLPNGSRTLKSVCKIKLKYNPTEVDPELMVPIAKNNPQHLAVYSVSDAVATFYL
YDKFIHNFLFALSSIIPMNPDNVLRQGSGTLCEQLLMAEAYRKNILFPNKSKPIYNQYFT
DPENKKKYFIYDDSFVGGTVQSLKCGIYRDDLKEFFSLDVDTYKYLYNSIDHIIDFWIQK
DLNKNANINDTKYINKNQIINLDQIKQDIKNKLNFFIENPNINICPNIYHLDVAAMYPNI
ILSHRLQPNAIITPDHCFNCSFYKQRHLCQKKMIWKRKLEISPIDYGHVLSLKQDLKTRL
FFPQKSFYKMQNKEESDSTENENSMDINASKKKSWNELTDKQQHDELMKVIKDCSQKVFK
KTKVSKEVDASSLVCQRENPFYVDAVKTFRDRRYVYKKGLKECEHEKRELLKQSKIDYIK
IQELDDKILLNDSLQLAHKCILNSFYGYVKRRSSRWYSDQMGAIVTYTGSQIINGAFNLI
NKIGIPMELDTDGIWCMLPKNFPEMYDVYILDKKELNKKKDYETKSEEELKNDNNVKKVD
FEFPTNILNFEMHKKWTNDQYLVYNEHTDDYECISKNEIFFELDGPWHGMFLPASEKSDD
LLKKRYVVFNNKYKISELKGFEIKRRGELRIIQRFQSEIFNHFLKGKTKEESYYHASLTA
NKWKNLIDTKAIDIDNDDELFDLILAKKVLNKSVKEQPNAKSFGITTAKRLSELLNNASY
IEDNNVSTQFIVVSKPIGSDITFRAIPIQIFKTNIDTQIHYLSKWLGTKFPPNVPVNVRD
IIDWDYYKQKLEVQILKLVIIPAIKQNINNPITSISVPDWLKKQINISEGKQKKITSFFV
KKNIKKEDTTSPLHSADVKLVNDIHDFKDSNETTNTPLHYTQKESMKNKEHISNQSMEKK
SPFPIEGENTITNPSSSILTQSEETLKNKKRKLIKQYLLDNFISKKQKLIILYDNNQSNN
NNSNIMSGATPKTSKLISSVAYKKINSFENYGENNNNIIIIDHEKINISNLKYKDLHNLF
HSNFKNWMLINNKIWKNNRTQIKKIRIEDKKQKKKNSISFKEQEDEETNKEKKNYEKISN
LDSKYLHTIQNSMDIVYIYKKIKKKKKNHKKKNANIQLNNLKNDKQTLLKPYLKYFKHEA
NSDSDSNSDDSSSHKKESRNENYHINEKVDNNDYYNDDDDDDDDDGIYYALVSLKNMNKF
YKIKIQVYRHIYINNYDQLNIKSNSKITIKLISSNNDDNGVFKSKAYANCFLPRNIKVFN
LYEFIMTEKYFNQYIINTLNANYHESIISVYETKIPLYFDFLSRYGNSVEIDSNDYNYIF
DENKCFKSHCFSKVENNSKSTKNVSANYLDDVHIVYIHIFHTLIDNICNRIFINVYDQFD
EHNQDHLLGNKIMFSGIGQKDNNFDPYDTFIKFLQMDKYCNDNTLNETNKNINMNINSTH
DGQNKNILNINHIHNTFDNNNNNNNDVEYLNNIEKEKIKKDMLLKNLFNKEFFINSVEKD
LLFLYHYRKFDVYYEDNTNVYKVLEYLDLYLNKYRTNMITGKQKYIFYVSSTIDKKKLGW
WATNKYFPCYFYKFDNTNKYQNVPRLNYQNDIFNLSLNLFFENYHRVEEDLNFSRISNIP
LFNLFNVQNKNQKHKFIYDILYASFIKKYKGILWLSYFGNYDLGIPCLNINNFCDYDLAK
KNNDIINQGIYRGYIVHLFFNESLIFNSVRLFTKYSNLDKNTNEYNNTITNTNTNINNYH
NNNIINRNNEHTTFMQNKKKNVKRTLENNTNHMNKLNNKSNHINKNDSIDQKEQLNDEDI
STADENNNMNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSVNVNFSSNNDNVIIQS
SAELNQKKNLIQNKYDINSIVERNAHVSQFSNFAFKLLGQSLEYLISKISSLSMLITNKT
FESISDIFTSFYSWISNNSSLLYDVALYNKVLECSEIYQNNLINIMKKKFNANIIFADLR
NLVISFNEYSIISGRNILKNLIKYFSHSDSIYANVPFYIKNEYIAACQFDKYNFIRYKKY
SDPNEENTDENLKIIEYLPPICESFLRYVLDIIILNPLHDIILSYDNNKQNGINPYQSDD
QKINHINDISTCEKNYYNVILKNDKLTDKINLAQKAKLKYIFDKSFDDLEEVCESFSLIN
ENVDVLAYKIEEKLKDLWFMPGIIYKKVKKAIKYKKYLIENYWPYEDDEIGENNINYAPF
LFPQTLGNLAKRDNNWRLEIVKFCIFLMQNDKLLNLENENSNEAFHEKRHELYEIVGDSE
YNKKNSLWKSPCHELILKDIFCDHCSSVYHMNVVTSLVEAEISGKPSFIWLCKNCNFKFD
NEFIELKILSLLQETFDAYNAQDLVCNNCNAIKSFHRRPICKCGQIFTPRLEINNWMQTL
EIVENLASMLNMPLLTDVLTSMKTHLI
NT seq 8724 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctacacaaacaaggacaaaaggatgggagaaggaatcaaaaattaatccagattat
gaatatgagagattgttaaaattagaaaataagtttcatataaaagcatggattaataaa
ggagagaaagaaggatatctttataatatagttcctactactatgaatgtagtagcaaaa
aattcaaataaatcacataaaaaaacaggtgtacacatgtattttgtgtcagacaataac
aagacgtggagattaactcttttttatagaccctacttttatttaaaaaccaagaatata
cataattatgaacaagtaacaaaatttttaaaaaaggaactagataagtataacgttgaa
attgattatgtaaaaaaagaggatttaagtttatacgatcatttgaataagaaaagaagt
tatttaagtaatatcttttttaaattatcctatgatactattgaaaatttaatgaatgct
cgagatttcttagtcaaaattattgaacgaaataaaaagcaaaataaaaattataataat
tcaaataatgataaacatatttttaataatgaagatttgtcctatagtcaattagagttt
tcttataaaaatgaatattcttataataaatatgatgatcaaaaagaaaacacacaaaaa
caacaatttactacaaatataacagaggaagatgataaaaagaggatattaaatgcaaaa
agtaatgataataataataataataataataatacacataatagtaacaataataataat
atattgaatatgaatgatatcatagttactacaaaaaaacaaattttaagtaaagaagaa
attatgaatgaaataatcgaaatatatgaatatgatgtaaaatatttaactagaatttgt
atagataaaaatatcagatgtggattatggtataaagtaaaaagagaagaagatgaactt
tatactgaattaattcaatttgaaattttaaataaaaaagtattagcaccattaaatata
ttagcatgggatattgaatgttataaagatgaattaaaatttccagataaagagaaagat
gaaatcatattaatatcttatatgtataatgctcaaggatatttaattgttaatagaaat
gttatgagtaaaaatataagagaattcttatataaaccaaatgaagaatattctggtgca
ggtactttcaaaatttttaatgaaaaaaatgaatattttttattaaaacgatttcttgaa
catatcagattattaaaaatacatatttttgttacatataatggtgacttttttgatatt
ccatatttatatagaagatgtgaaatcaataatttaagtgtttccagagaaataggtttt
attatgaataataaacaagaatgttcatgtaattttattttaaatatcgatgcatataaa
tgggttgaaagagattcatatctaccaaatggttcgagaactttaaaaagtgtatgtaaa
attaaattaaaatataatccaacagaagtggatcctgaacttatggttcccattgctaaa
aataatcctcaacatttagctgtttacagtgtatctgatgcagttgcaactttttattta
tatgataaatttattcataatttcttattcgcattatcatcaattataccaatgaaccct
gataatgtattacgacaaggaagtggaaccttatgtgaacaattattaatggcagaagcc
tacagaaaaaatatactttttcctaacaaatccaaacctatatataatcaatattttaca
gatccagaaaataaaaaaaaatattttatttatgatgattcatttgttggcggtacagtt
caaagtttaaaatgtggtatttatagagatgatcttaaagaatttttcagcttagatgta
gatacatataaatatctatataacagtattgatcatattattgatttctggattcaaaaa
gatttaaataaaaatgcaaatataaatgatacgaaatatattaataaaaatcaaataata
aatttagatcaaattaaacaagatattaaaaataaactaaatttcttcatagaaaatcca
aatataaatatatgtcctaatatttatcatctagatgttgctgctatgtatcctaatatt
attttatcacatcgtttgcaacctaatgctatcatcacaccagatcattgttttaattgt
tctttttataaacaaagacacttgtgtcaaaaaaaaatgatatggaaacgtaaattagaa
atttctcctatagattatggtcatgtcttatcactaaaacaagatttaaaaactaggctt
tttttcccgcaaaaaagtttttacaaaatgcaaaacaaggaagaatctgatagtactgaa
aatgaaaactcgatggatattaacgcatcaaaaaagaaatcgtggaatgaactcacggat
aaacaacaacacgatgaattaatgaaagtcataaaagattgctctcaaaaggtttttaaa
aaaaccaaagtatcgaaagaagtagatgcatccagtttagtgtgccaacgagaaaaccca
ttttatgttgatgctgttaaaacttttagagacagaagatatgtgtataaaaaaggactg
aaagaatgtgaacatgaaaaaagggaattattaaaacaatcaaaaatagattatattaag
attcaagaattagatgataaaatattattaaatgattcattacaactagcacataaatgt
atattaaatagtttttatggatatgttaaaagaagaagcagtagatggtattctgatcaa
atgggtgctattgttacgtatacaggttctcaaataatcaatggagcatttaatttaata
aataaaattggtataccaatggaattagatactgatggtatttggtgcatgcttccaaaa
aatttcccagaaatgtatgatgtatatattttggataaaaaagaattaaataaaaaaaaa
gattatgaaacaaaaagtgaagaagaattaaaaaatgataacaatgtgaaaaaagtagat
ttcgaattcccaacgaatatattaaatttcgaaatgcataagaaatggacaaatgatcaa
tacttagtgtataatgaacatactgatgattatgaatgtattagtaaaaatgaaatattt
tttgaattagatggaccatggcatggtatgtttttacctgcatctgaaaaatccgatgat
ttattaaaaaaaagatatgttgtttttaataataaatataaaataagtgaacttaaaggt
tttgaaattaaacgaagaggagaattaagaattattcaaagatttcaaagtgaaattttt
aatcatttcttaaaaggaaaaacaaaagaagaatcatattatcatgcatcattaacagca
aataaatggaaaaatttaatagatactaaagcaatagatatagataatgatgatgaatta
tttgatttaattttagctaagaaagttttaaataaatcagttaaagaacaaccaaatgct
aaaagttttggtattactacagcaaaaagattaagtgaattattaaataatgctagctat
attgaagataataatgtatcaactcagtttattgttgtatccaaacctattggttcagat
attacctttagagctatacctatacaaatattcaaaacaaatattgatactcaaatccat
tatttaagtaaatggttaggtaccaaatttcctccaaacgtacctgttaatgttagagat
attattgattgggattattataaacaaaaattagaagttcaaattttaaaattagttatt
attccagctattaaacaaaatattaataatccaataacttccatatcagttcctgattgg
ttaaaaaaacaaattaatatctcagaaggaaaacagaaaaaaatcacatccttctttgta
aaaaaaaacataaaaaaagaagataccacttcacctttacattctgccgatgttaaacta
gtaaatgatattcatgattttaaagattcaaatgaaacaaccaacacaccattacattat
acacaaaaagaaagtatgaaaaataaagaacatatatctaatcaatctatggaaaaaaaa
agcccctttccaatagaaggagaaaatacaataacaaatccatcatcatccatattaaca
caatcagaggaaacattgaaaaataaaaaaagaaaattaataaaacaatatctcttagat
aattttatatccaaaaaacaaaaattaataatattatatgataataatcaatcaaataat
aacaatagtaatattatgtctggtgctactccaaaaactagtaaacttatctcatcagta
gcttacaaaaaaataaattcatttgaaaactacggagaaaataataataatattattatt
attgatcatgaaaaaatcaatatcagtaatttaaaatataaagatttacataatttattt
cattcaaattttaaaaattggatgcttattaataataaaatatggaaaaataatagaaca
caaattaaaaaaatacgtattgaagataaaaaacaaaaaaaaaaaaatagcatatcattt
aaagaacaagaagatgaagaaactaataaggaaaaaaagaattatgagaaaatatctaat
ttagattctaaatatttacatactattcaaaattcaatggatattgtatatatatataaa
aaaattaaaaagaaaaagaaaaatcataaaaaaaaaaatgcaaatatccaattaaataat
ttaaaaaatgataaacaaaccttattaaaaccatatttaaaatattttaaacatgaagca
aattcagattcagattcaaattcagatgattcatctagtcataagaaagaatctagaaat
gaaaattatcatatcaatgaaaaggttgataataatgattattataatgatgatgatgat
gatgatgatgatgatggaatttattatgcattagtttcattaaagaatatgaataaattt
tataaaattaaaatacaagtatatagacatatatatattaataattatgatcaattaaat
attaaaagtaatagtaaaataactataaaattaattagttcaaataatgatgataatggt
gtatttaaatcaaaggcatatgctaattgttttcttccaagaaatattaaagtttttaat
ttatatgaatttataatgacagaaaaatattttaatcaatatattattaatactctaaat
gcaaattatcatgaaagtattatatctgtatatgaaacaaaaataccattatattttgat
ttcttaagtagatatggaaattctgttgaaattgattcaaatgattataattatatattt
gatgaaaacaaatgttttaaatctcattgttttagtaaagtagaaaataatagtaaaagt
actaaaaatgtatcagccaattatttggatgatgtacatattgtttatatacatatattt
catacgcttatagataacatttgtaatcgtatttttattaatgtatatgatcaatttgat
gaacataatcaggatcatctacttgggaataaaataatgtttagtggtattggacaaaag
gataataattttgatccttatgatacttttataaaattcttacaaatggataagtattgt
aatgataatacattaaacgaaacaaataaaaatataaatatgaatataaattctacacat
gatgggcaaaataaaaatatacttaatataaatcatatacataatacatttgataataat
aataataataataatgatgtggaatatttaaacaatattgaaaaagaaaaaataaaaaaa
gatatgttattaaaaaatttatttaataaagaattttttataaatagtgttgaaaaagat
ctattatttttatatcattatagaaaatttgatgtttattatgaagataatacaaatgta
tataaagtattagaatatcttgatctatacttaaataaatatcgtactaatatgataaca
ggaaaacaaaaatatatcttttatgtatcatcaactattgataaaaaaaaattaggttgg
tgggctaccaataaatatttcccatgttatttttataaatttgataatacaaataaatat
caaaatgttccaagattaaattatcaaaatgacatttttaatttatctctaaatctattt
tttgaaaattatcatagagtagaagaagatttgaatttttcacgaatatcaaatatacca
ttatttaatttattcaatgttcaaaacaaaaatcaaaaacataaatttatatatgatatc
ttatatgcatcttttattaaaaaatataaaggaatattatggttatcatattttggtaat
tatgatctaggaatcccatgtttaaatattaataatttctgtgattatgatttagctaaa
aaaaataatgatataataaatcaaggaatatatagaggatatattgtccatctatttttt
aatgaatcattaatatttaatagtgtacgcctttttacaaaatattcaaatcttgacaaa
aacacaaatgaatataataataccataaccaatacaaatacaaacataaataattatcac
aataataatattattaatcgtaataatgaacatactacttttatgcaaaacaaaaaaaaa
aatgtcaagagaaccctggaaaataatacaaaccatatgaataaattaaacaataaaagt
aatcatataaataaaaacgactcaatagatcaaaaggaacagttgaatgatgaagatata
tcaacagctgacgaaaataataatatgaatagcaacaataataataataacaacaataat
aataacaacaataataataacaacaataataataataataacaacaataataataataat
aataataatagtgtgaatgtaaatttttcttccaataatgataacgtcatcatacaatca
tcagctgaattaaatcaaaaaaaaaacctcatacaaaataaatatgatatcaattcaatt
gttgaaagaaatgctcatgtttcccaatttagtaattttgcctttaaactattaggtcaa
tcgttagaatatttaatatctaagatttcctctttatctatgctaattacaaataaaaca
tttgaaagcatatcagatatatttacatccttctattcatggatttctaataattctagt
ttattatatgatgttgcattatataataaagttttagaatgttctgaaatttatcaaaat
aatttaataaatattatgaagaagaaatttaatgctaatattatttttgctgacttaaga
aatcttgttatatcattcaatgagtattctattatatcaggaagaaatatattaaagaat
ttaataaaatatttttcacacagtgattcaatatatgcaaatgtacccttctatattaaa
aatgaatatattgcagcatgtcaatttgataaatataattttataagatataaaaaatat
tcagatccaaatgaagaaaatacagatgaaaatctaaaaattattgaatacttacctcct
atatgtgaatctttcttgagatatgttcttgatattataatattgaatccattacatgat
attatactttcatatgataataataaacaaaacggtataaatccatatcaatcagatgat
caaaagataaatcatataaatgatatatctacatgtgaaaaaaattattataatgttata
ttaaaaaatgataaattaacagataaaattaatttagcacaaaaagccaaattaaaatat
atatttgataaatcatttgatgatcttgaagaagtctgtgaatcattctccttaatcaat
gaaaatgtagatgtactagcttataaaattgaagagaaattaaaggatttatggtttatg
ccgggaattatttataaaaaagtgaaaaaagcaatcaaatataaaaaatatctaatagaa
aattattggccatatgaagatgatgaaatcggtgaaaataatattaattatgcaccattc
ttatttcctcaaacattaggaaatctagctaaaagagataataattggagactagaaatt
gttaaattctgtatcttcttaatgcaaaatgataaattattaaatttagaaaatgaaaac
tcaaatgaagcctttcatgaaaaaagacatgaactatatgaaattgtaggagatagtgaa
tataataaaaaaaattcattatggaaaagcccatgtcatgaattaattttaaaagatatc
ttttgcgatcattgttcatcggtatatcatatgaacgtagtaacaagtttagttgaagca
gagataagtggaaaaccatcttttatttggttatgcaaaaattgtaactttaaatttgat
aatgaatttattgaattaaaaatattatctttattgcaggaaacattcgacgcatacaat
gctcaagatttggtatgtaataattgtaatgcaataaaatctttccacagaagacccata
tgtaaatgtggtcaaatatttacacctcgtctagaaattaataactggatgcaaacatta
gaaattgtagaaaatttagctagcatgctaaacatgccattattaacagatgtgttgaca
tccatgaaaacccatcttatataa

DBGET integrated database retrieval system