Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_0827000
Help
Entry
PF3D7_0827000 CDS
T00095
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase DBP10, putative
KO
K14808
ATP-dependent RNA helicase DDX54/DBP10 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pfa03009
]
PF3D7_0827000
Enzymes [BR:
pfa01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PF3D7_0827000
Ribosome biogenesis [BR:
pfa03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
PF3D7_0827000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
2655364
NCBI-ProteinID:
XP_001349256
PlasmoDB:
PF3D7_0827000
UniProt:
Q8IBA2
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(1167579..1171448)
Genome browser
AA seq
1289 aa
AA seq
DB search
MKNKKKLFGPSSSNNTKSNKKKINKSKNKSKSKKNEKNEKRINIKKNNGLKKSKEDVSKR
KDIDLLQNNKKKNILIKTNKNISKNKNGTKRYQWLFSDKDKKKEKVEESDLNNYSSSCSY
DDKKKEKKKFVLYKKKKNKSNNNSNNSNNKKKKKKVILNSFQQLGLSENMCRSIASNLKY
NKPTNIQKLCITKILHRRDVICISKTGSGKSLVYLCTLIDILKEHNKYYGIRGLIILPTK
ELVIQIYKLCKKICKNYFHLNINIIIGGVSIIKQFDILNQNLDILLCTPGRLSFLLQETK
LSLEKVEILIIDEADRLLELNYYNDMNVIYKSLNNTSKQTILVSATLPTNVENYFKLKLN
NPDVLFLTSDNTINEKVHLHFLFCRSYEKYALLLRLILIFKKKKLGKTMIFFCTKYHILF
FSNILKHFKIHHSILYGNSDTSFRFEQINNFTKNEHIQFLLVTDVASRGINITSVQNVIN
YNLPFSPKLFIHRIGRACRTDISGYGISLLTYQDILYAYEICFFIGKKLKFFKKEKSVLD
NDMEDISSKGFTSKGMDIEANTVVNEMSNVTNMNNDNDNKCGDNECGDNKCGDNECGDNK
CGDNKCGDNYCGDNYCGDNYCGDNECVDKVYYGDDKNKRDKSYTCSHKNNTNDIVYMGCV
PHLNDYIEYIEDLKKRDTELMSLNKSILASYKLYYSMRPKVSKYVSTKCINKINKIGGLY
KLSLYNHPHWIYENERCLPEDMRSTNENTTHEFLENEKEMDYTNDCVNNNNNNNNNNNNN
NNNNDNNDGDVYMCNDQLNDEVDILFNNLINYISHNNNNNNISNENITNDLVQNEIKSDD
QENDTTEIQNNEHYEESNIENVNANYDYSKNKLISIIHNFENKNSNNKIKTISDELKQKL
NQLKEKNERYKSRRNYVLSNDVNEFMDTLTYQISDEEDENADIKNIPEMWKKIFLHSQGN
NNSTSMNINDPSEHYMENKKKLSKRALKKLKKNENNDSNEFNNNNNINNNDNVNNIKNIS
FDDVLRIINEKKMKNDMRYNNTSTLDIKNPGFDLPPDETEELNKQRFVKKQIWDKKKRKF
VLTEIDTFQTDEFGIKKKVNKNKDDKTNSITNLYEKWVKSTKKRIKNVGELEDENDIIPK
TKLNKNKNKNKKGKKNKNQNKYNNDISDNNDNNSENEEKQYNINMLKLMHPEISEALSKN
NKLTKKQQRIYKKYISGKYINATTQKDTNTLHNTAKQRKKQLQNRLRTDKKFRTKYLKIK
KKKFENKMKRKHNLSSARERSLIILKNKK
NT seq
3870 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaacaagaaaaagctctttggcccttccagctcaaataataccaaatcgaataag
aaaaaaataaataaaagtaaaaataaaagtaagtcgaaaaaaaatgagaagaatgaaaaa
agaattaatataaaaaaaaataacggattaaaaaagagtaaagaagatgtatcaaaaagg
aaagatattgatttattacaaaataataagaagaagaacatattaataaaaacaaataaa
aatatttcaaaaaataaaaatggtaccaaaagatatcaatggcttttttctgataaagat
aagaaaaaagaaaaagtagaagaatcagatttgaataattatagttcaagttgttcctat
gatgataaaaagaaggaaaagaagaaatttgtcttgtataaaaagaaaaagaataaaagt
aataataatagtaataatagtaataataaaaaaaaaaaaaaaaaagtaatattaaattct
tttcaacaattaggattaagtgaaaatatgtgcagaagtatagcatcaaacttgaaatat
aataaaccaacaaatatacagaaattatgtattactaaaatattacatagaagagatgtt
atatgtattagcaaaacagggtcaggaaaatcattagtttatttatgtacccttatagat
atattaaaagaacataataaatattatggtattagaggtttaattatattacctacaaaa
gaattagttatacaaatatataaattatgtaaaaaaatttgtaaaaattatttccattta
aatattaatataattattggtggtgttagtattatcaaacaatttgatatacttaatcag
aatttagatattttattatgtacaccagggagattatcttttttattacaagaaacaaaa
ttaagtctagaaaaagtagaaatactaattattgatgaagcagatagactattagaacta
aattattataatgatatgaatgttatatataaaagtttaaataatacttcgaaacaaacc
attctagttagtgccaccttacctacaaatgttgaaaattattttaaattaaaattaaat
aatcctgatgtactcttcctaacttcggataatacaataaatgaaaaagttcatttacat
tttctattttgtagatcttatgaaaaatatgcacttcttcttagattaatacttatattt
aaaaaaaaaaaactaggcaaaaccatgatttttttttgtacaaaatatcatattttattt
tttagtaatatcttaaaacattttaaaatacaccattctatattatatggaaattcagat
acgtcattccgttttgaacaaatcaataattttacaaaaaatgaacatattcaattcttg
ctcgttaccgatgtagcatctagaggaataaatataacatctgtgcaaaatgtaattaat
tataatttacctttctcgccaaagttatttattcataggattggtcgagcttgtcgaacg
gatataagtggttatggtatctctcttttgacatatcaagatatactctatgcctacgaa
atttgtttcttcataggaaagaaattgaagttttttaaaaaggaaaaatcggtgctcgac
aatgatatggaagacatatctagcaaggggttcacctccaaagggatggatattgaagcg
aacactgtggtaaatgaaatgagtaatgtgacgaatatgaataatgacaatgataacaaa
tgtggtgataacgaatgtggtgataacaaatgtggtgataacgaatgtggtgataacaaa
tgtggtgataacaaatgtggtgataattattgtggtgataattattgtggtgataattat
tgtggtgataacgaatgtgttgataaggtttattatggtgatgataaaaacaaaagagac
aaatcatatacctgttcacataaaaataatacaaacgatattgtatatatggggtgtgta
ccacaccttaatgattatattgaatatatagaagatttaaaaaaaagggacactgagtta
atgtcattaaataaaagtatactagcatcatacaaactatattattcaatgagacctaag
gtatctaaatatgtaagcacgaagtgtataaataagataaataaaattggaggtttatat
aagttatccttatataatcatcctcactggatatatgaaaatgagagatgtctacctgaa
gatatgcgttcaacaaatgagaatacgacacatgaatttttagagaacgaaaaggaaatg
gactacacaaatgattgtgtaaataataataataataataataataataataataataat
aataataataatgataataatgatggtgatgtttatatgtgcaatgaccaacttaacgac
gaagtggatatccttttcaataacttaataaattatatatcacacaataataataataat
aacataagtaatgaaaacattacaaatgatttggtacaaaacgaaataaaaagtgatgat
caagaaaatgatacaaccgaaatacaaaataatgaacattatgaagaaagtaatatagaa
aatgtgaatgctaattatgattattcaaaaaacaaattaatatctattattcataatttt
gaaaataaaaattcaaacaataaaataaaaaccatatctgatgaattaaaacaaaaatta
aatcagctcaaagaaaaaaatgaaagatacaaaagtagacgtaattatgtattatcaaat
gatgtaaacgaatttatggatacattaacctatcagataagtgacgaagaagatgaaaat
gcagatattaaaaatatcccagaaatgtggaaaaaaatatttttacattcacaaggaaat
aacaattcaacgtctatgaatataaatgatcccagtgaacattatatggagaacaagaaa
aaattaagtaaaagagcattaaaaaaattaaaaaaaaatgaaaataatgatagcaacgaa
tttaataataataataatattaataataatgacaatgtgaataatataaaaaatatatcc
tttgatgatgttttaagaattatcaatgaaaaaaaaatgaaaaatgatatgcgttataat
aacacatccacgttagatattaaaaatcctggtttcgatttacctccagatgaaaccgaa
gaattaaataaacaaagatttgtaaaaaaacaaatttgggataaaaaaaaaagaaaattt
gtccttacagaaattgataccttccaaactgatgaattcggtattaagaaaaaagtaaat
aaaaacaaagatgataaaactaatagtattacgaatttatatgaaaaatgggttaagtca
actaaaaaaagaattaaaaatgtaggagaattagaagatgaaaatgatattataccaaaa
acgaaattaaacaaaaataaaaataaaaataaaaaaggaaagaaaaacaaaaaccaaaac
aaatataataatgacattagtgataataatgataataactcagaaaacgaggaaaaacaa
tataatattaatatgctgaaattgatgcacccagaaatttcagaagctttatcaaaaaat
aataaactaaccaaaaaacaacaaagaatttataaaaaatatatctctggaaaatatata
aacgcaaccacacaaaaagatacaaacacattacataacactgctaaacaaagaaaaaaa
caattacaaaatagattaagaacagacaaaaaatttagaaccaaatacttaaaaattaaa
aagaaaaaattcgaaaataaaatgaaacgaaaacataatttaagcagtgctagggaaaga
tcacttattattctaaagaataaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
