Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_1005500
Help
Entry
PF3D7_1005500 CDS
T00095
Name
(RefSeq) regulator of nonsense transcripts 1, putative
KO
K14326
regulator of nonsense transcripts 1 [EC:
5.6.2.5
5.6.2.3
]
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa03013
Nucleocytoplasmic transport
pfa03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
PF3D7_1005500
03015 mRNA surveillance pathway
PF3D7_1005500
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pfa03019
]
PF3D7_1005500
Enzymes [BR:
pfa01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.3 DNA 5'-3' helicase
PF3D7_1005500
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
PF3D7_1005500
Messenger RNA biogenesis [BR:
pfa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Surveillance complex
PF3D7_1005500
mRNA cycle factors
Common to processing body (P body) and stress granule
PF3D7_1005500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
UPF1_Zn_bind
AAA_11
UPF1_1B_dom
AAA_30
AAA_19
ResIII
NAT10_TcmA_helicase
AAA_22
NPHP3_N
SRP54
DEAD
AAA
ATPase
AAA_16
AAA_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
810215
NCBI-ProteinID:
XP_024329085
PlasmoDB:
PF3D7_1005500
UniProt:
A0A143ZY29
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(237506..242245)
Genome browser
AA seq
1579 aa
AA seq
DB search
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NT seq
4740 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gatcaaaaattaaattgtgataacttgaaaaaggtatctgaaaatacgcatataaattag
DBGET
integrated database retrieval system
