Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_1240400
Help
Entry
PF3D7_1240400 CDS
T00095
Name
(RefSeq) erythrocyte membrane protein 1, PfEMP1
KO
K13850
erythrocyte membrane protein 1
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa05144
Malaria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfa00001
]
09160 Human Diseases
09174 Infectious disease: parasitic
05144 Malaria
PF3D7_1240400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ATS
Duffy_binding
PFEMP
DBL_C
CIDR1_gamma
NTS
PfEMP1_CIDRalpha1_dom
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
811443
NCBI-ProteinID:
XP_001350797
PlasmoDB:
PF3D7_1240400
UniProt:
Q8I520
LinkDB
All DBs
Position
12:join(1704512..1709944,1711060..1712490)
Genome browser
AA seq
2287 aa
AA seq
DB search
MAPSTTYSSAKNAKELLDMIGKDVYNEKVKSEAQTYKEALKGDLNTANGYNSETRGTTDP
CRLVEDYRSKAIGDANSERHPCGIGKDAKGEEVPRFSDTLGGQCTDHRIKGNNRNVTGGA
CAPLRRLHVCNKNMEKMDSTKIKDKNVLLAEVCYAAKYEGKSLVEKYKEYKQPNNDSDTD
ICTALARSFADIGDIVRGKDLYLGYDDEEKKQRDELEENLKTIFKNIYGNLDKKDRYEGD
TKNYYQLREDWWYANRRQVWKAITCDAKAFNYFRNTCNGESPTKGYCRCNDDQPNADKPN
TDPPTYFDYVPQYLRWFEEWAEDFCRKKNKKLNDVKKQCRGDNGTDRYCSGNGYDCTKTI
RAIGKYAIGDECTKCSFWCRMYETWIDNQKKEFLKQKRKYDKEIEKYKNGTSNGTTTTKK
TSNGPINNFYVKEFYEKLKGGYEKVDDFLELLNNEKECKGINEQEEKINFKTADISLNKN
KNDEGTFYHSEYCKPCPHCGMKKKDGKWITKADDDKCNIKLYKPKKGATSTEIKILKSGD
EPTEIGKKLKDFCTKTQNGTGGGGGGSGGNSEKKELYDEWKCYEFKHLDKVEEGEDDEVY
EKDVKNGGGLCILKKEEEEKKEVKKTNSEKEPKEIQKTFHDFFYFWIRRFLNDSMYWRGK
VNSCINKSKREKCKEECKKECECFQKWIDKKEKEWGQIKIHFNTQDFGSKGGLLGGVMTA
DFVLKTVLNIEDLFKDIKDGYGNAKELKGIENMLEKEKQKNKEEEAGASGGEDNTTIDKL
LQHEGDEAGECLDTHKETCPDEGLGRTAAGYRPPSVTKGGDEEEELSTDEEEEEDEDDTE
ESPQAEPEEAESEDPDGESSTAETTQQEAVAPTTQDNAEKPCDIVDKLFQNPEQFKEVAC
KQKYAKNNSRLGWKCVTPSGDQKATSEGNGDANRRVARQTSESGEKSGDKDGAICIPPRR
RRLYIQKLQEWAKTVGNTVVSGEPQTQGEASSPSDKESSQSDKLREAFIQSAAIETFFLW
DRYKKEWALQKLAELQRNGDLPFFTSGAGYGMTAVVNGAQPTASPGHSNGLISLPSLVTD
SDNPQNKLNDGTIPPDFLRQMFYTLGDYRDILFGDTTMIDTLKKSGDKDMLQREQNIKEA
IDKILNSGNKEPSDEQRKTWWGDFAQYIWNGMICALTYTDSEKKDGKPQHNESVKKAFFG
ENNTDNPVTTSTQNGSPRLPTGTTGNTEGTYEKTYKYDIVKLDENSGTGDPLNNPKLKEF
VEIPTFFRYLHEWGQNFCKERKKRLKQIKVDCRGDENTNRSNDGDGFNCEQIVPDKDVFW
GDFIGSSCATSCSYYRKWINTKKAEYEKQEKIYVHQKAIAKNNKNDSAFSRTLDTYTTAG
DFLENLKNGPCSKINSAEDNGNGNEEDKLNFRQPNVTFRPATDCKPCSLNELKCNSDVCG
GNTKRKCDGKTDISAEDIETMGQPTEDIGMLVSDNSTTEIKDEGLKEACKDADIFKGIRK
DEWKCGKFCDVDVCVLENFNKDIHDKKNVLIRTLFKRWLEYFLQDYIKINAKFSHCTNNG
EGFACKNKCKDKCKCVEHWINQKRTQWGKIKERFFKQYNVTDSNDYNVRSFLQDLIPRIA
LTNDKKHFKTLDDLENIYGCNCAWKSGNREENDLVKCLLEKLKDKIGECNRFQTSANDCT
TTPTAFEEDDDYIPLEEEEENQVVQPNICPAQTPAPTPAPAPAPAPAPAPAPAPAPAPAP
SARPNHDQNPPGTGTRKITKRRQKSDKTKKTSNPTPSNVLDHPLMKPALMSSTIMWSVGI
GFAAFTYFYLKKKTKSSVGNLFQILQIPKSDYGTPTPKSKNRYIPYVSDRYKGKTYIYME
GDSDSGHYYEDTTDVTSSESEYEELDINDIYVPRAPKYKTLIEVVLEPSGNNTTASGKNT
PSDTQNDIQNDGIPSSKITDNEWNQLKDDFISNMLQSEQPNDIPNDYSSGTIPTNTNNTT
PSHDNVDNNTHPTMSRLNVDQKPFITSIHDRDLYTGEEYNYNVNMSTNIMDDIPISGKNT
VYSGIDLINDSLSGNQHIDIYDEMLKRKENELFGTNHVKQTSIHSVAKLTNSDPIHNQLE
LFHTWLDRHRDMCEKWENHHERLAKLKEEWENETHSGNTHPSDSNKTLNTDVSIQIHMDN
PKTKNEFKNMDTTPNKSTMDTMLDDLEKYNEPYYYDFYKDDIYYDVNDDDKTSMDNNNNL
VDKNNPVDSNNSTYNHRNPADINKNFVDKNNQNQHPIEKPTKIQIEMNSNNREVVEQQYP
IADIWNI
NT seq
6864 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgccatccactacatacagtagtgccaaaaatgccaaggaacttttggatatgatt
gggaaagacgtgtacaatgaaaaagtgaaaagtgaagctcaaacatataaagaggcgttg
aaaggagatttgaacacagcaaatggttataattcggaaacacgtggcaccacagatcca
tgcagacttgtagaggattatcgtagtaaggctattggtgatgctaacagtgaacggcat
ccgtgcggaataggaaaagatgcaaaaggagaagaagtaccacgtttttcggatacactt
ggtggccaatgcactgatcatagaataaaaggtaataatcgtaatgtaactggtggagca
tgtgctccactcagacgattacatgtatgcaacaaaaatatggaaaaaatggactcaacg
aaaatcaaggataaaaatgttctgctggccgaggtgtgttatgcagcaaaatatgaaggc
aaatcattagtagaaaaatataaagaatataaacaaccgaataatgattccgatacggat
atatgtacagccttggcacgaagttttgcagatataggagatattgtaagaggaaaagat
ctgtatctcggttatgacgatgaggaaaaaaaacaaagagatgaattagaagaaaatttg
aaaacaattttcaagaatatatatggcaatttggataaaaaagatcgctacgaaggtgat
actaaaaattattatcaattaagagaagattggtggtatgctaatagaagacaggtatgg
aaagctatcacgtgcgacgctaaggcttttaactattttagaaatacatgtaatggagaa
agtccaactaaaggttactgccggtgtaacgacgaccagccaaatgccgacaagccaaat
accgatcccccaacctattttgactatgtgccgcagtatcttcgctggttcgaggaatgg
gcagaagacttttgtaggaaaaaaaataaaaaattaaatgatgttaaaaaacagtgtcgt
ggagataatggtacagatcgatattgtagtggtaatggatatgattgcacaaaaactatt
agagcaataggtaagtatgctataggtgatgagtgtactaaatgttctttttggtgtcgt
atgtatgaaacttggatagataaccagaaaaaagaatttctaaaacaaaaaagaaaatat
gataaagaaatagaaaaatataaaaacggaacatcaaacggaacaacaacaacaaaaaaa
acgtcaaatggtcctattaataatttttatgtaaaagaattttatgaaaaacttaaaggc
ggctatgaaaaagtcgatgattttttggaattattaaataatgaaaaagaatgtaaaggt
attaatgaacaagaagaaaaaattaattttaaaacagctgatattagtcttaataaaaat
aagaatgatgaaggaacattttatcattcggaatattgtaaaccctgtcctcattgtgga
atgaaaaagaaagatggtaaatggataaccaaagcagacgatgataaatgcaatataaaa
ctttataagcctaaaaagggcgcaacatctactgaaattaaaatccttaaaagtggtgat
gaaccaacagaaattggaaaaaaattgaaagacttttgcactaaaacacaaaatggtact
ggtggtggtggtggtggaagtggtggtaatagcgaaaagaaggaactttatgatgaatgg
aaatgttatgaatttaaacatctggataaagttgaagagggtgaggatgacgaggtctat
gagaaggatgtaaaaaatggaggcggattatgtatattaaaaaaagaagaagaagaaaaa
aaagaagtaaagaaaaccaattctgaaaaggaacctaaggaaatccaaaagacattccat
gattttttttacttttggataagacgttttttgaacgattctatgtattggagaggaaaa
gttaacagttgtataaataaatctaaacgtgagaaatgtaaagaagaatgtaaaaaagaa
tgtgaatgttttcaaaaatggattgataaaaaagaaaaagaatgggggcaaatcaaaata
cattttaacacgcaagattttggcagtaaaggaggacttcttggcggagtaatgaccgct
gattttgttcttaaaacagttttgaacatagaggatcttttcaaagatattaaagatggt
tatgggaatgcaaaggaattaaaaggaattgagaacatgttggaaaaggaaaaacaaaaa
aataaagaagaagaagcaggtgctagtggtggcgaagataataccacaattgataaatta
ctacaacatgaaggagacgaagccggtgaatgcctagatacacacaaagaaacgtgtcca
gatgaaggcctcggtcgcactgcagcaggttacagacctccatctgtcaccaagggtggt
gatgaggaagaagaactctccacagacgaagaagaagaagaagacgaagatgacacggag
gaatcaccacaagcggagccggaggaggcggagtcggaagacccggacggggagtcgtca
accgcagagacaacacaacaagaggcggtggcacctacaacacaagacaatgcggagaag
ccatgtgacatagtggacaaactctttcagaaccccgaacaatttaaagaagtcgcatgt
aaacaaaaatatgccaaaaacaactcacgtttaggatggaagtgtgtcacaccaagtggt
gatcaaaaagccactagcgagggtaatggtgacgccaatcgtcgtgtcgcacgtcaaacc
agtgaaagtggtgaaaaaagtggtgataaggacggcgccatatgtatcccaccacgaaga
cgacgattatacatacagaaactacaggagtgggcaaaaacagtgggtaacacagtagtt
agtggtgaaccacagacacaaggtgaagcgtcgtcacctagtgataaagagtcctcacaa
agtgacaaactgcgtgaggcgttcatccaatctgcggcaatagagactttttttttatgg
gatagatacaaaaaagagtgggcgttacaaaagttggcggaactacaacgaaatggagac
ctaccctttttcacctccggagcaggatatggaatgacagcagtagttaacggagcacaa
ccaacagcatcacccggtcatagcaacggcctcatctctctcccctccctcgttacagat
agtgacaacccccaaaacaaattaaatgatggcacaatcccaccagatttcttgcgtcag
atgttttatactttaggagattatagggatatattatttggtgataccacgatgattgac
acgttaaaaaagagtggtgacaaagatatgttgcaaagagaacagaacataaaagaagct
atagataaaattttaaatagtggtaacaaagaacctagtgacgaacaacgtaaaacctgg
tggggcgacttcgcgcagtatatttggaatggaatgatatgtgctttaacctatacagat
agtgagaaaaaagacggaaaaccacaacataatgaaagtgtgaaaaaggcatttttcgga
gaaaacaacaccgacaaccctgtcacaaccagcacccaaaacggaagccctcgcctccca
actggcacaaccggcaacacagaaggcacatacgaaaaaacctacaaatacgacatagtc
aaactcgacgaaaatagtggtactggcgaccccctcaacaaccccaaattaaaagaattt
gtggaaatacctacgttttttcgttacctgcacgaatggggtcaaaatttttgtaaagag
aggaaaaagaggttgaaacaaattaaagtggattgtcgtggtgatgaaaataccaataga
tctaatgatggggatggttttaactgtgaacaaatagttccagataaggatgtattttgg
ggggatttcattggttccagttgtgccacatcttgtagttattatagaaaatggataaat
accaaaaaagcggaatatgaaaaacaagaaaaaatatatgttcaccaaaaagcaattgct
aaaaataataagaatgatagtgcattttctagaacactagatacatacactactgctgga
gattttttagaaaatttaaaaaacggaccatgttctaaaattaatagtgcagaggataat
ggaaatgggaatgaagaggataaattaaattttagacaaccaaatgtaacatttagacct
gcaacagattgtaaaccatgttctttaaatgaacttaaatgtaattcagatgtttgtggt
ggtaatacaaaaaggaagtgcgatggaaaaacggatatttctgcagaagatattgaaacc
atgggacaacctactgaagatataggtatgcttgtgagtgataacagtacaacggaaatt
aaagatgaaggtttaaaggaggcttgtaaagatgcagatatttttaaaggtattagaaaa
gatgaatggaaatgtggtaaattttgtgatgtagatgtatgtgttctggaaaattttaat
aaggatatacatgataaaaaaaacgtattaattagaacattgtttaaacgatggttagaa
tattttttacaagattatattaaaattaatgccaaattttcacattgtacgaataatggt
gaaggatttgcatgcaaaaataaatgtaaagataaatgtaaatgtgtagaacattggata
aatcagaaaaggacacaatggggaaaaataaaagaacgtttctttaagcaatataatgtt
actgattcaaatgattacaatgtgagaagttttttgcaggacttgatacctcgaattgct
cttacaaatgataaaaaacattttaaaaccttagatgatttagagaacatatatggatgt
aattgcgcttggaagtcaggaaatcgtgaagagaacgatcttgttaaatgtttgcttgaa
aagcttaaagataaaattggtgagtgcaaccgcttccaaactagtgccaacgactgtacc
accacccccaccgcctttgaagaggacgatgactatataccccttgaagaagaagaagaa
aaccaagtggtgcaaccgaacatttgtccagcacaaacaccagcaccaacaccagcacca
gcaccagcaccagcaccagcaccagcaccagcaccagcaccagcaccagcaccagcacct
agtgctagacccaaccacgaccaaaacccccccggcaccggaacgagaaaaattaccaaa
agaagacaaaaaagcgacaaaaccaaaaaaacctcgaatccaaccccctcaaatgtattg
gaccaccccctcatgaaacccgccctcatgtcttctaccatcatgtggagtgtgggtatt
ggttttgctgcgttcacttatttttatctaaagaaaaaaaccaaatcatctgttggaaat
ttattccaaatactgcaaatacccaaaagtgattatggaacacctaccccgaaatcaaaa
aatagatatatcccctatgttagtgatcgatataaaggtaaaacatatatttatatggaa
ggagatagtgatagtggacactactacgaagatacaactgatgtaacttcctcagaaagt
gagtatgaagaattggatattaatgatatatatgtaccacgtgctcctaaatataaaaca
ttgattgaagtagtactagaacctagtggtaacaacacaacagctagtggtaaaaacaca
cctagtgatacacaaaatgatatacaaaatgatggtatacctagtagtaaaattacagat
aatgagtggaatcaattgaaagatgattttatatctaatatgttacaaagtgaacaacca
aatgatataccaaatgattatagtagtggaactattccaacaaataccaataatactacc
ccatcacatgataatgtggataataatacccatcctaccatgtcacgtcttaatgtggac
caaaaaccttttattacatctatacatgatagggatttatatactggagaagaatataat
tataatgttaatatgagtactaatattatggatgatattccaataagtggtaaaaatact
gtatacagtggtatagatttaattaatgattcactaagtggtaatcaacatattgatata
tatgatgaaatgttgaaacgaaaagaaaatgaattatttggaacaaatcatgtgaaacaa
acaagtatacatagtgttgccaaactaacaaatagtgaccccatccacaaccaactggaa
ctattccatacatggttagatagacatagagatatgtgcgaaaagtgggaaaatcatcac
gaacgattagccaaattgaaagaagagtgggaaaatgagacacatagtggtaacactcac
cctagtgatagtaacaaaacgttgaatactgacgtttctatacaaatacatatggataat
cctaaaacaaagaatgaatttaagaatatggatacaacccccaacaaatctactatggat
actatgctggatgatctagaaaagtataacgaaccctactactatgatttttataaagat
gatatctattatgatgtaaatgatgatgataaaacatctatggataacaacaataacctt
gtagataagaataaccctgtggatagtaacaactccacctataaccaccgcaaccctgca
gatattaacaaaaattttgtggataaaaacaaccaaaaccaacaccctatagaaaaacct
accaaaatacaaattgaaatgaattcaaataatcgggaagtggtcgaacagcaatatcct
atagcggatatatggaatatatga
DBGET
integrated database retrieval system
