Phascolarctobacterium faecium: PFJ30894_01441
Help
Entry
PFJ30894_01441 CDS
T05784
Symbol
prn_7
Name
(GenBank) Pertactin autotransporter precursor
Organism
pfac
Phascolarctobacterium faecium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBG63807
LinkDB
All DBs
Position
1438774..1442478
Genome browser
AA seq
1234 aa
AA seq
DB search
MKEDESESFKQKGNDIVADNIVCISGGGTSALPIAEASMVDGNTVHGVVKSYSDNSTLTG
ANIVIYAGSSETTDITAEGKLKLENTSANVPVIGTVSNGKINLNGDTITVENTGNDYSNS
VVFAESGSNITFNNETTNIISSTNNRKKFIGGAGNIVFSDTATTLNIGNMNESSSISGCI
GITVSGQGSFAFNNTDGIVNIGGFAGTVFDMSGGTIKLEGAETNVSSNGGFLLYLSNQRY
GGTQNKIDFNAQKTTIKGTSKGIYADTNSINNHVSFKGDVDIEVQGNGYYDGIAVALGTN
AALDLNFDKGATIKAHQNSAADDLFAVNLAAGSDLKVKGDIDLISTAVGGGTGNNYGIYS
AGGDAAFDGMRLQVTGGKNIYGVYLSGNNADFKNLVINANNAEGSDACGIFAKSNSVVQI
AGDTEITVNVGNSGYDSRAVRIKDAEISLAGSLQAVVSGGQTALGILIESDAENAVFSTG
ATGMTDISVKNGSDGSYGLAVESFDTKKVTSDFNNAARIDVSGAMDVFGIKGWGGATEIN
FKENSLITALGTEGNNSTSSTVSAISLEKDAANVGGTITFNKNVLLQATAVNKAQISSGL
NIDNGVAAFKGAFTGITVKSNGENSYGIINNNGGKADVEGALVVDAQGQDYVFGINNANG
SKIDIKGVAAITVNSANTKNAYGIYSTGANSDIAFHSDTILTTNGPAAVQVEAGGKVLFA
RGLVSESGAYIFAVDSGSSIQINSEGGGLVKVIGNIFAQDGGTLDFKMDNSESYLEGAAD
GVNMDMQNGSVWRVTGDSNSQKLNLENAAVDLTTDGVGATKFVIADYSGTGGNFIMDTDL
AAETGDKVNITNAAAGTTYVQVKDASLVNGHTVTGAKNLLLITDASQNVNFVGKNLNAGG
LWDVTPTLENGENVTLTNGSQGTKDQWYLTKMAKQVNNDTKVLLESGDGNYALWRNTGDT
LRKRLGDLHNYRDTKVESDGIWSRYIGGKFGSGNFDGSFNMYQLGYDKAANAKSIYGFAV
ENGSGHTSYSYGSGKDKLFAGSIYGTWHGDNSSYTDVVARFGQFDTDIRSYGDYPDKAKA
KSHAYSLSVEYGKTIELNKAQGTFIEPQAQLIVGRLGSSSYTTDRGNNVYMGGVNSCIGR
LGVVAGKKDASGNDVYLKVNMLHEFGGNRDVRMLAGNGETLSESQDYGDTWFELGLGGNI
KLGNSSHLYGDIERSFGADIQKKWQVNAGVRFEF
NT seq
3705 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaagaagatgaatcagaaagttttaagcaaaaaggtaatgatatcgttgctgacaat
atcgtgtgtatatctgggggggggacatccgcgctcccgatagcagaggcttctatggtg
gatggcaacacagtacatggagtggtaaaaagctacagtgataacagcacattgacagga
gcgaatatcgttatttatgccggatccagcgaaacgactgatattacggcagaaggtaag
ctgaagctggaaaataccagtgcgaatgtcccggttattggaaccgtgtctaatggcaaa
attaatttgaatggtgatactattactgtagaaaatacagggaatgattattccaacagt
gtcgtttttgctgaaagtggcagtaatattacttttaataatgaaaccacaaatattata
agcagcaccaataacaggaaaaaatttatcggcggagcaggaaatattgtgttttccgat
acagccacgactttaaatatcggcaatatgaacgaaagcagcagtatcagtggttgcata
ggtattactgtcagtggtcagggaagttttgcatttaataatactgatgggatagtgaat
attggcggttttgcaggaacagtatttgatatgtccggcgggaccataaaacttgaaggg
gctgagacgaatgtcagctccaatggtggctttttattgtatctgtcaaatcagcgttat
ggtgggacgcagaataaaatagattttaatgcgcagaaaacaactatcaagggtaccagc
aagggcatatatgcggacaccaacagtatcaataatcatgtcagcttcaagggtgatgtc
gatattgaggtgcagggtaatggctattatgatggtattgctgtggctttaggaactaat
gcggcattagatcttaattttgacaaaggcgcgactattaaagcgcaccaaaattcggct
gctgatgatttatttgctgttaatcttgctgcaggaagcgacctgaaggtcaaaggtgat
atagacttaatctctacagctgtcggtggcggaactggtaacaattatggtatttattct
gctggcggtgatgctgcttttgacggaatgcgtttgcaagtaacaggaggcaaaaatatt
tatggagtttatttaagtggtaataacgctgattttaagaatttggtgattaatgccaat
aatgctgaaggcagtgatgcctgtggaatttttgcgaagagcaattcagtagtgcaaata
gctggtgatactgagatcacagttaacgtcggtaatagtggatatgatagtagggctgtt
agaatcaaagacgctgaaataagcttagcaggctcattgcaagcagttgtcagcggcgga
caaactgcactggggattcttattgaatcagatgcagaaaatgcagttttttctacagga
gcaacaggtatgactgatattagtgtaaagaatggcagtgatggaagctatggtctagct
gtagaaagctttgatactaaaaaagttacatctgattttaataatgcagccaggatcgat
gtcagcggtgcgatggatgtttttggtatcaaaggctggggcggcgctacagaaatcaac
tttaaggaaaatagtttgatcacagcactgggaacggaaggtaataatagtaccagttcg
acagtaagcgctatatctttagaaaaagatgcagccaatgttggcggaactattactttt
aataaaaatgttttattgcaggcgacagctgttaacaaggctcaaatcagcagcggcttg
aatattgataacggcgttgctgcttttaaaggagcgtttaccggtatcacagtaaagagt
aatggtgaaaacagttacggtattataaataataatggtggcaaggcagatgtagagggt
gcgttagtagttgatgcacaggggcaggattatgtttttgggataaacaatgccaatggc
agcaagatagacataaaaggggttgccgcaattactgtaaattctgccaacacaaagaac
gcttatggaatttacagtacaggtgcaaacagtgacattgcatttcatagtgatactatt
ttgacgaccaatggccctgctgcagtgcaggtagaagctggtgggaaagtgctttttgct
agaggtctggtttcggaaagtggtgcctatatttttgccgttgacagtggcagcagtata
caaatcaatagtgagggcggcggtcttgtcaaagtaattggcaatatttttgctcaagat
gggggaacattagattttaagatggacaatagtgagtcatacctggaaggtgctgcggat
ggggtcaatatggatatgcagaatggttctgtctggagagtgacaggggactcaaacagc
caaaagcttaatttggaaaatgctgctgttgatttaacaactgacggtgttggggcaaca
aagttcgttattgccgattacagcggcactggcggtaactttattatggacactgattta
gccgctgaaaccggcgataaggtaaatatcactaacgcagcagccggcaccacctatgta
caggtcaaagatgccagtctggtcaatgggcatacggttaccggtgctaagaatttactt
ttaataaccgatgccagccaaaatgtaaattttgtaggcaaaaaccttaatgccggcggc
ttgtgggatgtgacaccgacgcttgaaaatggtgaaaatgttacgttgacaaatggctcg
cagggaaccaaagatcaatggtatttaacgaagatggccaaacaggtcaacaatgataca
aaagttttgttagaaagtggagatggtaattatgcgctttggcgtaatactggcgatact
ttacgtaagcgtttgggcgatctgcataattatcgagatactaaagtagagagtgacggt
atctggagccgttatatcggcgggaagtttggcagcggtaattttgacggcagctttaat
atgtatcagcttggttatgataaggcagccaatgccaaaagcatttatggttttgcagtt
gaaaatggcagcggacatacgagttacagttatggcagcggtaaagacaagctttttgca
ggcagtatttatggaacctggcatggcgataacagcagctatacagatgtagtggctcgc
ttcggacagtttgatacggacatcagatcctatggcgattatccggataaggccaaggca
aaaagccatgcgtatagcctgagtgtggaatatggaaaaaccatagagctgaataaagca
caggggacttttatcgaaccgcaggctcagcttatcgtaggacgattaggcagcagcagc
tacacgactgatcgtggcaataatgtttatatgggcggtgtaaacagctgcatcggacgt
ttgggcgtagtagcaggcaaaaaagatgcgtcaggcaacgatgtatatctgaaagtgaat
atgctgcatgagtttggcggtaaccgtgatgtcagaatgctggcgggcaatggggaaaca
ttgagtgaatcgcaggattatggcgatacctggtttgagcttggtttgggtggtaatatc
aagctgggcaacagcagtcatttatacggcgatatcgaacgcagctttggcgccgatatc
caaaagaaatggcaggtaaatgcaggagtaaggtttgaattttga
DBGET
integrated database retrieval system